SAXSdb — 7f4t

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MT-a70 family protein

Tetrahymena thermophila SB210

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Ptep2 × 1 （A0DWP1） S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Ptep2 × 1 （A0DWP1） S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Ptep2 × 1 （A0DWP1） S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Ptep2 × 1 （A0DWP1） S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q22GC0_TETTS
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–247； UniProt 182–428 作者链 E； PDB构建体 1–247； UniProt 182–428 作者链 H； PDB构建体 1–247； UniProt 182–428 作者链 K； PDB构建体 1–247； UniProt 182–428

Ptep2

Paramecium tetraurelia strain d4-2

UniProt A0DWP1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MT-a70 family protein × 1 （Q22GC0） S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MT-a70 family protein × 1 （Q22GC0） S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MT-a70 family protein × 1 （Q22GC0） S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 water × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MT-a70 family protein × 1 （Q22GC0） S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0DWP1_PARTE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128 作者链 D； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128 作者链 G； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128 作者链 J； PDB构建体 1–128； UniProt 1–128

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7f4t
沉积日期 deposition_date	2021-06-21
结构标题 title	Crystal structure of SAM-bound TthMTA1-Ptep2 complex
关键词 keywords	Protein Complex, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7f4t__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7f4t__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7f4t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	25.48 Å
Rg（电子密度）	25.05 Å
总 Rg	25.86 Å
原子数	2738
残基数	343
排除体积	48765 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7f4t__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`7f4t__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`7f4t__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`7f4t__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MT-a70 family protein
分子量 formula_weight	28481.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,E,H,K
原子数 atom_count	10725

DDYLDRLPKSKKGLQGLLQDIEKRILHYKQLFFKEQNEIANGKRSMVPDNSIPICSDVTKLNFQALIDAQMRHAGKMFDVIMMDPPWQLSSSQPSRGVAIAYDSLSDEKIQNMPIQSLQQDGFIFVWAINAKYRVTIKMIENWGYKLVDEITWVKKTVNGKIAKGHGFYLQHAKESCLIGVKGDVDNGRFKKNIASDVIFSERRGQSQKPEEIYQYINQLCPNGNYLEIFARRNNLHDNWVSIGNEL

来源 Source

来源生物 organism	Tetrahymena thermophila SB210
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	312017
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Ptep2
分子量 formula_weight	15096.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,G,J

MSTISREEYAKKMRLALSDNHICKPDGTVNHQYFLVKKGQYWGEEKIQYLIEQLEKIGVGNWKQMQKGLLEQTSEIELELRTCLLFKTTDIQPYMDKKFTKIEIEQIAQQNIEKAQQLSKLKYGVFVV

来源 Source

来源生物 organism	Paramecium tetraurelia strain d4-2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	412030
宿主生物 host_organism	Escherichia coli K-12

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	S-ADENOSYLMETHIONINE
分子量 formula_weight	398.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

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晶胞边长 a length_a	98.130 Å
晶胞边长 b length_b	110.193 Å
晶胞边长 c length_c	102.636 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	91.64 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	monoclinic

分辨率 resolution	3.680 Å
最低分辨率 resolution_low	49.040 Å
R 因子 r_factor	0.2857
R_work r_work	0.2835
R_free r_free	0.3288

Crystal structure of SAM-bound TthMTA1-Ptep2 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MT-a70 family protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Ptep2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7f4t__assembly_1__model_1

7f4t__assembly_1__model_1 | I(q)

7f4t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of SAM-bound TthMTA1-Ptep2 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MT-a70 family protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ptep2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7f4t__assembly_1__model_1

7f4t__assembly_1__model_1 | I(q)

7f4t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 引用文献 (1)