7jsx

EPYC1(106-135) peptide-bound Rubisco

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 144.5 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–475 链 C； UniProt 1–475 链 E； UniProt 1–475 链 G； UniProt 1–475 链 I； UniProt 1–475 链 K； UniProt 1–475 链 M； UniProt 1–475 链 O； UniProt 1–475	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Ribulose bisphosphate carboxylase small chain 2, chloroplastic × 8 （P08475） EPYC1 × 8 （A0A2K3DA85）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6.8；200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.06 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7JSX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1UZD Chlamydomonas,Spinach Chimeric Rubisco 提交 2004-03-11	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–475（475 aa）链 B 1–475（475 aa）链 E 1–475（475 aa）链 H 1–475（475 aa）链 K 1–475（475 aa）链 O 1–475（475 aa）链 R 1–475（475 aa）链 V 1–475（475 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 54	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；291 K；50 MM HEPES PH 7.5, 8-12% PEG 4 50 MM NAHCO3, 5 MM MGCL2, 50 UM 2-CABP, 18 DEG C, 10-15 MG PROTEIN	分辨率 2.40 Å R-free 0.230
7JN4 Rubisco in the apo state 提交 2020-08-03	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 A 1–475（475 aa）链 C 1–475（475 aa）链 E 1–475（475 aa）链 G 1–475（475 aa）链 I 1–475（475 aa）链 K 1–475（475 aa）链 M 1–475（475 aa）链 O 1–475（475 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8；200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.68 Å

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A218N8A3_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 C； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 E； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 G； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 I； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 K； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 M； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475 作者链 O； PDB构建体 1–475； UniProt 1–475

Ribulose bisphosphate carboxylase small chain 2, chloroplastic

物种未注明

UniProt P08475

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–185 链 D； UniProt 1–185 链 F； UniProt 1–185 链 H； UniProt 1–185 链 J； UniProt 1–185 链 L； UniProt 1–185 链 N； UniProt 1–185 链 P； UniProt 1–185	未记录	Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （A0A218N8A3） EPYC1 × 8 （A0A2K3DA85）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6.8；200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.06 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7JSX	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1IR2 Crystal Structure of Activated Ribulose-1,5-bisphosphate Carboxylase/oxygenase (Rubisco) from Green alga, Chlamydomonas reinhardtii Complexed with 2-Carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate (2-CABP) 提交 2001-09-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 I 46–185（140 aa）链 J 46–185（140 aa）链 K 46–185（140 aa）链 L 46–185（140 aa）链 M 46–185（140 aa）链 N 46–185（140 aa）链 O 46–185（140 aa）链 P 46–185（140 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 GOL GLYCEROL × 20	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG4000, HEPES-KOH, glycerol, NaHCO3, MgCl2, DTT, 2-carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate (2-CABP), EDTA, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.84 Å R-free 0.181
1IR2 Crystal Structure of Activated Ribulose-1,5-bisphosphate Carboxylase/oxygenase (Rubisco) from Green alga, Chlamydomonas reinhardtii Complexed with 2-Carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate (2-CABP) 提交 2001-09-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 1 46–185（140 aa）链 2 46–185（140 aa）链 3 46–185（140 aa）链 4 46–185（140 aa）链 5 46–185（140 aa）链 6 46–185（140 aa）链 7 46–185（140 aa）链 8 46–185（140 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 8 CAP 2-CARBOXYARABINITOL-1,5-DIPHOSPHATE × 8 GOL GLYCEROL × 20	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG4000, HEPES-KOH, glycerol, NaHCO3, MgCl2, DTT, 2-carboxyarabinitol-1,5-bisphosphate (2-CABP), EDTA, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.84 Å R-free 0.181
7JFO EPYC1(49-72)-bound Rubisco 提交 2020-07-17	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric	链 B 1–185（185 aa）链 D 1–185（185 aa）链 F 1–185（185 aa）链 H 1–185（185 aa）链 J 1–185（185 aa）链 L 1–185（185 aa）链 N 1–185（185 aa）链 P 1–185（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8；200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.13 Å
7JN4 Rubisco in the apo state 提交 2020-08-03	聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric	链 B 1–185（185 aa）链 D 1–185（185 aa）链 F 1–185（185 aa）链 H 1–185（185 aa）链 J 1–185（185 aa）链 L 1–185（185 aa）链 N 1–185（185 aa）链 P 1–185（185 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 6.8；200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.68 Å

共 3 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RBS2_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185 作者链 D； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185 作者链 F； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185 作者链 H； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185 作者链 J； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185 作者链 L； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185 作者链 N； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185 作者链 P； PDB构建体 1–185； UniProt 1–185

EPYC1

物种未注明

UniProt A0A2K3DA85

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 24 PDB 声明：24-meric（24）与蛋白拷贝数一致	链 q； UniProt 106–135 链 r； UniProt 106–135 链 s； UniProt 106–135 链 t； UniProt 106–135 链 u； UniProt 106–135 链 v； UniProt 106–135 链 w； UniProt 106–135 链 x； UniProt 106–135	未记录	Ribulose bisphosphate carboxylase large chain × 8 （A0A218N8A3） Ribulose bisphosphate carboxylase small chain 2, chloroplastic × 8 （P08475）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 6.8；200 mM sorbitol, 50 mM HEPES, 50 mM KOAc, 2 mM Mg(OAc)2.4H2O and 1 mM CaCl2 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.06 Å

数据库中的同蛋白其他状态

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2K3DA85_CHLRE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 q； PDB构建体 1–30； UniProt 106–135 作者链 r； PDB构建体 1–30； UniProt 106–135 作者链 s； PDB构建体 1–30； UniProt 106–135 作者链 t； PDB构建体 1–30； UniProt 106–135 作者链 u； PDB构建体 1–30； UniProt 106–135 作者链 v； PDB构建体 1–30； UniProt 106–135 作者链 w； PDB构建体 1–30； UniProt 106–135 作者链 x； PDB构建体 1–30； UniProt 106–135

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7jsx
沉积日期 deposition_date	2020-08-16
结构标题 title	EPYC1(106-135) peptide-bound Rubisco
关键词 keywords	Rubisco, Pyrenoid, PLANT PROTEIN, Lyase; PLANT PROTEIN, Lyase
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	47.80 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	46.87 Å
零角强度 I(0) i0	4175060000.00
分子量 molecular_weight	535920.0 kDa
排除体积 excluded_volume	667170 Å³
包络体积 envelope_volume	822690 Å³
水化壳体积 shell_volume	131690 Å³
包络直径 envelope_diameter	155.5 Å
壳层 Rg shell_rg	60.23 Å
包络 Rg envelope_rg	46.87 Å
形状 Rg shape_rg	46.87 Å
总 Rg total_rg	47.19 Å
总原子数 total_atoms	37672
残基数 n_residues	4824
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	144.5 Å
Rg (实空间) rg_real	47.34 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.48 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.1750e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.9870e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	47.80 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	4177000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8860
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	65.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.029
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.518
角度范围 angular_range	— – 0.1650 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0007
最高正则化参数 α highest_alpha	2218000000.0000
实空间数据点数 n_real_points	34
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.897; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.937; Smooth: 0.885

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Ribulose bisphosphate carboxylase large chain
分子量 formula_weight	52607.8 kDa
EC 编号 ec_number	4.1.1.39
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E,G,I,K,M,O
原子数 atom_count	38813

MVPQTETKAGAGFKAGVKDYRLTYYTPDYVVRDTDILAAFRMTPQPGVPPEECGAAVAAESSTGTWTTVWTDGLTSLDRYKGRCYDIEPVPGEDNQYIAYVAYPIDLFEEGSVTNMFTSIVGNVFGFKALRALRLEDLRIPPAYVKTFVGPPHGIQVERDKLNKYGRGLLGCTIKPKLGLSAKNYGRAVYECLRGGLDFTKDDENVNSQPFMRWRDRFLFVAEAIYKAQAETGEVKGHYLNATAGTCEEMMKRAVCAKELGVPIIMHDYLTGGFTANTSLAIYCRDNGLLLHIHRAMHAVIDRQRNHGIHFRVLAKALRMSGGDHLHSGTVVGKLEGEREVTLGFVDLMRDDYVEKDRSRGIYFTQDWCSMPGVMPVASGGIHVWHMPALVEIFGDDACLQFGGGTLGHPWGNAPGAAANRVALEACTQARNEGRDLAREGGDVIRSACKWSPELAAACEVWKEIKFEFDTIDKL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Ribulose bisphosphate carboxylase small chain 2, chloroplastic
分子量 formula_weight	20668.0 kDa
EC 编号 ec_number	4.1.1.39
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D,F,H,J,L,N,P

MAAVIAKSSVSAAVARPARSSVRPMAALKPAVKAAPVAAPAQANQMMVWTPVNNKMFETFSYLPPLSDEQIAAQVDYIVANGWIPCLEFAESDKAYVSNESAIRFGSVSCLYYDNRYWTMWKLPMFGCRDPMQVLREIVACTKAFPDAYVRLVAFDNQKQVQIMGFLVQRPKSARDWQPANKRSV

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	EPYC1
分子量 formula_weight	3294.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	q,r,s,t,u,v,w,x

RSSSASKKAVTPSRSALPSNWKQELESLRS

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1141

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

结构域编号 domain_id	d7jsxa1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.9 — RuBisCO, large subunit, small (N-terminal) domain
家族 Family family	d.58.9.1 — Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

结构域编号 domain_id	d7jsxa2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.14 — RuBisCo, C-terminal domain
家族 Family family	c.1.14.1 — RuBisCo, large subunit, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d7jsxb_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.73 — RuBisCO, small subunit
超家族 Superfamily superfamily	d.73.1 — RuBisCO, small subunit
家族 Family family	d.73.1.1 — RuBisCO, small subunit

结构域编号 domain_id	d7jsxc1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.9 — RuBisCO, large subunit, small (N-terminal) domain
家族 Family family	d.58.9.1 — Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

结构域编号 domain_id	d7jsxc2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.14 — RuBisCo, C-terminal domain
家族 Family family	c.1.14.1 — RuBisCo, large subunit, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d7jsxd_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.73 — RuBisCO, small subunit
超家族 Superfamily superfamily	d.73.1 — RuBisCO, small subunit
家族 Family family	d.73.1.1 — RuBisCO, small subunit

结构域编号 domain_id	d7jsxe1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.9 — RuBisCO, large subunit, small (N-terminal) domain
家族 Family family	d.58.9.1 — Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

结构域编号 domain_id	d7jsxe2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.14 — RuBisCo, C-terminal domain
家族 Family family	c.1.14.1 — RuBisCo, large subunit, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d7jsxf_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.73 — RuBisCO, small subunit
超家族 Superfamily superfamily	d.73.1 — RuBisCO, small subunit
家族 Family family	d.73.1.1 — RuBisCO, small subunit

结构域编号 domain_id	d7jsxg1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.9 — RuBisCO, large subunit, small (N-terminal) domain
家族 Family family	d.58.9.1 — Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

结构域编号 domain_id	d7jsxg2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.14 — RuBisCo, C-terminal domain
家族 Family family	c.1.14.1 — RuBisCo, large subunit, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d7jsxh_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.73 — RuBisCO, small subunit
超家族 Superfamily superfamily	d.73.1 — RuBisCO, small subunit
家族 Family family	d.73.1.1 — RuBisCO, small subunit

结构域编号 domain_id	d7jsxi1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.9 — RuBisCO, large subunit, small (N-terminal) domain
家族 Family family	d.58.9.1 — Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

结构域编号 domain_id	d7jsxi2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.14 — RuBisCo, C-terminal domain
家族 Family family	c.1.14.1 — RuBisCo, large subunit, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d7jsxj_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.73 — RuBisCO, small subunit
超家族 Superfamily superfamily	d.73.1 — RuBisCO, small subunit
家族 Family family	d.73.1.1 — RuBisCO, small subunit

结构域编号 domain_id	d7jsxk1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.9 — RuBisCO, large subunit, small (N-terminal) domain
家族 Family family	d.58.9.1 — Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

结构域编号 domain_id	d7jsxk2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.14 — RuBisCo, C-terminal domain
家族 Family family	c.1.14.1 — RuBisCo, large subunit, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d7jsxl_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.73 — RuBisCO, small subunit
超家族 Superfamily superfamily	d.73.1 — RuBisCO, small subunit
家族 Family family	d.73.1.1 — RuBisCO, small subunit

结构域编号 domain_id	d7jsxm1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.9 — RuBisCO, large subunit, small (N-terminal) domain
家族 Family family	d.58.9.1 — Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

结构域编号 domain_id	d7jsxm2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.14 — RuBisCo, C-terminal domain
家族 Family family	c.1.14.1 — RuBisCo, large subunit, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d7jsxn_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.73 — RuBisCO, small subunit
超家族 Superfamily superfamily	d.73.1 — RuBisCO, small subunit
家族 Family family	d.73.1.1 — RuBisCO, small subunit

结构域编号 domain_id	d7jsxo1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.9 — RuBisCO, large subunit, small (N-terminal) domain
家族 Family family	d.58.9.1 — Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase

结构域编号 domain_id	d7jsxo2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamily	c.1.14 — RuBisCo, C-terminal domain
家族 Family family	c.1.14.1 — RuBisCo, large subunit, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d7jsxp_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.73 — RuBisCO, small subunit
超家族 Superfamily superfamily	d.73.1 — RuBisCO, small subunit
家族 Family family	d.73.1.1 — RuBisCO, small subunit

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8. 引用文献 (1)

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分辨率 resolution	2.06 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	152839

fit	/app/data/saxs_computation/js/7jsx/7jsx.fit
pddf	/app/data/pr_computation/js/7jsx/7jsx.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/js/7jsx/7jsx.dat

EPYC1(106-135) peptide-bound Rubisco

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribulose bisphosphate carboxylase large chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Ribulose bisphosphate carboxylase small chain 2, chloroplastic

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

EPYC1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

SCOP 2.08 (24 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)