SAXSdb — 7jxa

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

S-arrestin

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–404 链 B； UniProt 1–404 链 C； UniProt 1–404 链 D； UniProt 1–404	未记录	I3P D-MYO-INOSITOL-1,4,5-TRIPHOSPHATE × 4 NA SODIUM ION × 3 ETX 2-ETHOXYETHANOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；281 K；0.1 M Bis-Tris propane, 35% 2-Ethoxyethanol, 0.0025 M NaCl; 0.005 M IP3 overnight soak	分辨率 2.40 Å R-free 0.249

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7JXA	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AYR ARRESTIN FROM BOVINE ROD OUTER SEGMENTS 提交 1997-11-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–367（367 aa）链 B 1–367（367 aa）链 C 1–367（367 aa）链 D 1–367（367 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.2；pH 7.2	分辨率 3.30 Å R-free 0.316
1CF1 ARRESTIN FROM BOVINE ROD OUTER SEGMENTS 提交 1999-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–404（404 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
1CF1 ARRESTIN FROM BOVINE ROD OUTER SEGMENTS 提交 1999-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–404（404 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
1CF1 ARRESTIN FROM BOVINE ROD OUTER SEGMENTS 提交 1999-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–404（404 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
1CF1 ARRESTIN FROM BOVINE ROD OUTER SEGMENTS 提交 1999-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–404（404 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
1CF1 ARRESTIN FROM BOVINE ROD OUTER SEGMENTS 提交 1999-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–404（404 aa）链 D 1–404（404 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
3UGU Crystal Structure of p44 (Splice Variant of Visual Arrestin) 提交 2011-11-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–370（370 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292.15 K；14% PEG 4000, 0.1M MES, 50 mM KH2PO4, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292.15K	分辨率 1.85 Å R-free 0.214
3UGX Crystal Structure of Visual Arrestin 提交 2011-11-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–404（404 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 8 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；294.15 K；18mM PIPES,0.5M KCL,30% EG, 8% PEG 6000, 18% PEG200, 6% PEG 1000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.15K	分辨率 2.65 Å R-free 0.253
3UGX Crystal Structure of Visual Arrestin 提交 2011-11-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–404（404 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 2 NA SODIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 IMD IMIDAZOLE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；294.15 K；18mM PIPES,0.5M KCL,30% EG, 8% PEG 6000, 18% PEG200, 6% PEG 1000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.15K	分辨率 2.65 Å R-free 0.253
3UGX Crystal Structure of Visual Arrestin 提交 2011-11-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–404（404 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；294.15 K；18mM PIPES,0.5M KCL,30% EG, 8% PEG 6000, 18% PEG200, 6% PEG 1000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.15K	分辨率 2.65 Å R-free 0.253
3UGX Crystal Structure of Visual Arrestin 提交 2011-11-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–404（404 aa）	未记录	PTD PENTANEDIAL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 IMD IMIDAZOLE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；294.15 K；18mM PIPES,0.5M KCL,30% EG, 8% PEG 6000, 18% PEG200, 6% PEG 1000, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294.15K	分辨率 2.65 Å R-free 0.253
4J2Q Crystal structure of C-terminally truncated arrestin reveals mechanism of arrestin activation 提交 2013-02-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–369（369 aa）片段：UNP residues 1-369 链 B 1–369（369 aa）片段：UNP residues 1-369	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；30% polyethylene glycol 200, 10 mM HEPES, 100 mM lithium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.279
4PXF Crystal structure of the active G-protein-coupled receptor opsin in complex with the finger-loop peptide derived from the full-length arrestin-1 提交 2014-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 67–77（11 aa）	未记录	BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 6 PLM PALMITIC ACID × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；3.2 M (NH4)2SO4 in 0.1 M 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES), pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.75 Å R-free 0.251
4ZRG Visual arrestin mutant - R175E 提交 2015-05-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–404（404 aa）	突变：R175E	CO2 CARBON DIOXIDE × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292.15 K；100mM Tris, 8-18% (w/v) PEG 4000	分辨率 2.70 Å R-free 0.241
7F1W X-ray crystal structure of visual arrestin complexed with inositol hexaphosphate 提交 2021-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–404（404 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293.15 K；40 mM PIPES pH 7.2/0.6 M KCl/22% ethylene glycol/5.7% polyethylene glycol 6000/13% polyethylene glycol 200/4% polyethylene glycol 1000	分辨率 3.10 Å R-free 0.241
7F1W X-ray crystal structure of visual arrestin complexed with inositol hexaphosphate 提交 2021-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–404（404 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293.15 K；40 mM PIPES pH 7.2/0.6 M KCl/22% ethylene glycol/5.7% polyethylene glycol 6000/13% polyethylene glycol 200/4% polyethylene glycol 1000	分辨率 3.10 Å R-free 0.241
7F1W X-ray crystal structure of visual arrestin complexed with inositol hexaphosphate 提交 2021-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–404（404 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293.15 K；40 mM PIPES pH 7.2/0.6 M KCl/22% ethylene glycol/5.7% polyethylene glycol 6000/13% polyethylene glycol 200/4% polyethylene glycol 1000	分辨率 3.10 Å R-free 0.241
7F1W X-ray crystal structure of visual arrestin complexed with inositol hexaphosphate 提交 2021-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–404（404 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293.15 K；40 mM PIPES pH 7.2/0.6 M KCl/22% ethylene glycol/5.7% polyethylene glycol 6000/13% polyethylene glycol 200/4% polyethylene glycol 1000	分辨率 3.10 Å R-free 0.241
7F1X X-ray crystal structure of visual arrestin complexed with inositol 1,4,5-triphosphate 提交 2021-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–404（404 aa）	未记录	I3P D-MYO-INOSITOL-1,4,5-TRIPHOSPHATE × 1 PTD PENTANEDIAL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；40 mM PIPES pH 7.2/0.6 M KCl/22% ethylene glycol/5.7% polyethylene glycol 6000/13% polyethylene glycol 200/4% polyethylene glycol 1000	分辨率 3.00 Å R-free 0.239
7F1X X-ray crystal structure of visual arrestin complexed with inositol 1,4,5-triphosphate 提交 2021-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–404（404 aa）	未记录	I3P D-MYO-INOSITOL-1,4,5-TRIPHOSPHATE × 1 PTD PENTANEDIAL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；40 mM PIPES pH 7.2/0.6 M KCl/22% ethylene glycol/5.7% polyethylene glycol 6000/13% polyethylene glycol 200/4% polyethylene glycol 1000	分辨率 3.00 Å R-free 0.239
7F1X X-ray crystal structure of visual arrestin complexed with inositol 1,4,5-triphosphate 提交 2021-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1–404（404 aa）	未记录	I3P D-MYO-INOSITOL-1,4,5-TRIPHOSPHATE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；40 mM PIPES pH 7.2/0.6 M KCl/22% ethylene glycol/5.7% polyethylene glycol 6000/13% polyethylene glycol 200/4% polyethylene glycol 1000	分辨率 3.00 Å R-free 0.239
7F1X X-ray crystal structure of visual arrestin complexed with inositol 1,4,5-triphosphate 提交 2021-06-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1–404（404 aa）	未记录	I3P D-MYO-INOSITOL-1,4,5-TRIPHOSPHATE × 1 PTD PENTANEDIAL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293.15 K；40 mM PIPES pH 7.2/0.6 M KCl/22% ethylene glycol/5.7% polyethylene glycol 6000/13% polyethylene glycol 200/4% polyethylene glycol 1000	分辨率 3.00 Å R-free 0.239
7JSM CRYSTAL STRUCTURE OF NATIVE BOVINE ARRESTIN 1 提交 2020-08-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–404（404 aa）链 B 1–404（404 aa）链 C 1–404（404 aa）链 D 1–404（404 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；281 K；0.1 M Bis-Tris propane, 35% 2-Ethoxyethanol, 0.001 M Magnesium acetate	分辨率 2.50 Å R-free 0.233
7JTB CRYSTAL STRUCTURE OF NATIVE BOVINE ARRESTIN 1 IN COMPLEX WITH INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE 提交 2020-08-17	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–404（404 aa）链 B 1–404（404 aa）链 C 1–404（404 aa）链 D 1–404（404 aa）	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；281 K；0.1 M Bis-Tris propane, 35% 2-Ethoxyethanol, 0.001 M Magnesium acetate, 0.0009 M Phytic acid sodium salt	分辨率 2.60 Å R-free 0.238
7MOR CRYSTAL STRUCTURE OF NATIVE BOVINE ARRESTIN 1 IN COMPLEX WITH 5-METHYLENEBIPHOSPHONATE INOSITOL PENTAKISPHAOPHATE (5-PCP IP5) 提交 2021-05-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–404（404 aa）链 B 1–404（404 aa）链 C 1–404（404 aa）链 D 1–404（404 aa）	未记录	5A3 Methylenebisphosphonate inositol pentakisphosphate × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；281 K；0.1 M Bis-Tris propane, 35% 2-Ethoxyethanol, 0.001 M Magnesium acetate, 10 mM 5-Methylenebisphosphonate inositol pentakisphosphate	分辨率 2.80 Å R-free 0.246
7MP0 CRYSTAL STRUCTURE OF NATIVE BOVINE ARRESTIN 1 IN COMPLEX WITH 1D-MYO-INOSITOL 5-DIPHOSPHATE PENTAKISPHOSPHATE (5-PP IP5) 提交 2021-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–404（404 aa）链 B 1–404（404 aa）链 C 1–404（404 aa）链 D 1–404（404 aa）	未记录	ETX 2-ETHOXYETHANOL × 1 I7P (1r,2R,3S,4s,5R,6S)-2,3,4,5,6-pentakis(phosphonooxy)cyclohexyl trihydrogen diphosphate × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；281 K；0.1 M Bis-tris propane pH 7, 35% 2-Ethoxyethanol, 0.001 M Magnesium acetate, 5 mM 1D-myo-inositol 5-diphosphate pentakisphosphate	分辨率 2.60 Å R-free 0.248
7MP1 CRYSTAL STRUCTURE OF NATIVE BOVINE ARRESTIN 1 IN COMPLEX WITH 1,5-DI-METHYLENEBISPHOSPHONATE INOSITOL TETRAKISPHOSPHATE (1,5-PCP-IP4) 提交 2021-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–404（404 aa）链 B 1–404（404 aa）链 C 1–404（404 aa）链 D 1–404（404 aa）	未记录	4WZ {[(1R,3S,4S,5R,6S)-2,4,5,6-tetrakis(phosphonooxy)cyclohexane-1,3-diyl]bis[oxy(hydroxyphosphoryl)methanediyl]}bis(phosphonic acid) × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；281 K；0.1 M Bis-Tris propane pH 7.0, 35% 2-Ethoxyethanol, 0.001 M Magnesium acetate, 5 mM 1,5-DI-METHYLENEBISPHOSPHONATE INOSITOL TETRAKISPHOSPHATE (1,5-PCP-IP4)	分辨率 2.66 Å R-free 0.248
7MP2 CRYSTAL STRUCTURE OF NATIVE BOVINE ARRESTIN 1 IN COMPLEX WITH 1D-MYO-INOSITOL 1,5-BISDIPHOSPHATE TETRAKISPHOSPHATE (1,5-PP IP4) 提交 2021-05-04	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–404（404 aa）链 B 1–404（404 aa）链 C 1–404（404 aa）链 D 1–404（404 aa）	未记录	I8P (1R,3S,4R,5S,6R)-2,4,5,6-tetrakis(phosphonooxy)cyclohexane-1,3-diyl bis[trihydrogen (diphosphate)] × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；281 K；0.1 M Bis-Tris propane, 35% 2-Ethoxyethanol, 0.001 mM Magnesium acetate, 5 mM 1D-MYO-INOSITOL 1,5-BISDIPHOSPHATE TETRAKISPHOSPHATE	分辨率 3.00 Å R-free 0.245
9C6E High-resolution structure of bovine (3-367)Arrestin-1 in a pre-activated conformation 提交 2024-06-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–367（365 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 GOA GLYCOLIC ACID × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M imidazole, 0.1 M MES pH 6.5, 10% PEG 4000, 20% glycerol, 20 mM sodium formate; 20 mM ammonium acetate; 20 mM sodium citrate tribasic dihydrate; 20 mM potassium sodium tartrate tetrahydrate; 20 mM sodium oxamate	分辨率 1.40 Å R-free 0.180

共 16 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ARRS_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–404； UniProt 1–404 作者链 B； PDB构建体 1–404； UniProt 1–404 作者链 C； PDB构建体 1–404； UniProt 1–404 作者链 D； PDB构建体 1–404； UniProt 1–404

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7jxa
沉积日期 deposition_date	2020-08-26
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF NATIVE BOVINE ARRESTIN 1 IN COMPLEX WITH INOSITOL 1,4,5-TRIPHOSPHATE
关键词 keywords	GPCR, rhodopsin, phototransduction, inositol, inositol triphosphate, IP3, InsP3, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	43.17 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	42.81 Å
零角强度 I(0) i0	380991000.00
分子量 molecular_weight	164330.0 kDa
排除体积 excluded_volume	207770 Å³
包络体积 envelope_volume	296100 Å³
水化壳体积 shell_volume	57397 Å³
包络直径 envelope_diameter	145.9 Å
壳层 Rg shell_rg	47.97 Å
包络 Rg envelope_rg	42.16 Å
形状 Rg shape_rg	42.82 Å
总 Rg total_rg	43.04 Å
总原子数 total_atoms	11557
残基数 n_residues	1454
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	141.3 Å
Rg (实空间) rg_real	43.10 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.36 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.8100e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	6.3090e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	43.17 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	381000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8987
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	57.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.183
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.607
角度范围 angular_range	— – 0.1850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	46650000.0000
实空间数据点数 n_real_points	38
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.932; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.886

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	S-arrestin
分子量 formula_weight	45334.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	11771

MKANKPAPNHVIFKKISRDKSVTIYLGKRDYIDHVERVEPVDGVVLVDPELVKGKRVYVSLTCAFRYGQEDIDVMGLSFRRDLYFSQVQVFPPVGASGATTRLQESLIKKLGANTYPFLLTFPDYLPCSVMLQPAPQDVGKSCGVDFEIKAFATHSTDVEEDKIPKKSSVRLLIRKVQHAPRDMGPQPRAEASWQFFMSDKPLRLAVSLSKEIYYHGEPIPVTVAVTNSTEKTVKKIKVLVEQVTNVVLYSSDYYIKTVAAEEAQEKVPPNSSLTKTLTLVPLLANNRERRGIALDGKIKHEDTNLASSTIIKEGIDKTVMGILVSYQIKVKLTVSGLLGELTSSEVATEVPFRLMHPQPEDPDTAKESFQDENFVFEEFARQNLKDAGEYKEEKTDQEAAMDE

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	D-MYO-INOSITOL-1,4,5-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	420.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	2-ETHOXYETHANOL
分子量 formula_weight	90.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	206

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	7jxaA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	840 —

结构域编号 domain_id	7jxaA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	640 —

结构域编号 domain_id	7jxaB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	840 —

结构域编号 domain_id	7jxaB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	640 —

结构域编号 domain_id	7jxaC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	840 —

结构域编号 domain_id	7jxaC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	640 —

结构域编号 domain_id	7jxaD01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	840 —

结构域编号 domain_id	7jxaD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	640 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	167.782 Å
晶胞边长 b length_b	187.278 Å
晶胞边长 c length_c	90.540 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.400 Å
最低分辨率 resolution_low	49.140 Å
R 因子 r_factor	0.2120
R_work r_work	0.2100
R_free r_free	0.2489

fit	/app/data/saxs_computation/jx/7jxa/7jxa.fit
pddf	/app/data/pr_computation/jx/7jxa/7jxa.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/jx/7jxa/7jxa.dat

CRYSTAL STRUCTURE OF NATIVE BOVINE ARRESTIN 1 IN COMPLEX WITH INOSITOL 1,4,5-TRIPHOSPHATE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

S-arrestin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction