7m2t

Crystallographic Structure of the Monoclinic Form of Satellite Tobacco Mosaic Virus

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Coat protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	同源多聚体	蛋白 60 RNA 158	;RNA (5'-R(PAPAPAPAPAPAPAPAPAPAPAPA)-3') ; × 60 RNA (27-mer) × 98 MAGNESIUM ION × 12 PHOSPHATE ION × 12 SULFATE ION × 10 water × 160	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	COAT_STMV
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 B； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 BB； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 C； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 CC； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 D； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 DD； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 E； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 EE； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 F； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 FF； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 G； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 GG； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 H； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 HH； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 I； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 II； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 J； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 JJ； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 K； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 KK； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 L； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 LL； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 M； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 MM； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 N； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 NN； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 O； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 OO； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159 作者链 PP； PDB构建体 1–159； UniProt 1–159

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7m2t
沉积日期 deposition_date	2021-03-17
结构标题 title	Crystallographic Structure of the Monoclinic Form of Satellite Tobacco Mosaic Virus
关键词 keywords	VIRUS-RNA complex; VIRUS/RNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7m2t__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7m2t__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7m2t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	69.66 Å
Rg（电子密度）	70.81 Å
总 Rg	70.67 Å
原子数	80852
残基数	9308
排除体积	1385900 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7m2t__assembly_1__model_1`	218-meric （218）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Coat protein
分子量 formula_weight	17533.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	30

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,BB,CC,DD,EE,FF,GG,HH,II,JJ,KK,LL,MM,NN,OO,PP
原子数 atom_count	49909

MGRGKVKPNRKSTGDNSNVVTMIRAGSYPKVNPTPTWVRAIPFEVSVQSGIAFKVPVGSLFSANFRTDSFTSVTVMSVRAWTQLTPPVNEYSFVRLKPLFKTGDSTEEFEGRASNINTRASVGYRIPTNLRQNTVAADNVCEVRSNCRQVALVISCCFN

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;RNA (5'-R(PAPAPAPAPAPAPAPAPAPAPAPA)-3') ;
分子量 formula_weight	3905.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	30

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,a,b,c,d,QQ,RR,SS,TT,UU,VV,WW,YY,ZZ,bb,cc,dd,ee,ff,gg

AAAAAAAAAAAA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	RNA (27-mer)
分子量 formula_weight	8221.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	49

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	e,f,g,h,i,j,k,l,m,n,o,p,q,r,s,t,u,v,w,x,y,z,1,2,3,4,5,6,7,8,hh,ii,jj,kk,ll,mm,nn,oo,pp,qq,rr,ss,tt,uu,vv,ww,xx,yy,zz

UUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUU

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2797

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晶胞边长 a length_a	175.760 Å
晶胞边长 b length_b	169.860 Å
晶胞边长 c length_c	244.560 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	92.69 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	196

空间群 space_group	I 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.710 Å
最低分辨率 resolution_low	49.950 Å
R 因子 r_factor	0.1316
R_work r_work	0.1292
R_free r_free	0.1767

Crystallographic Structure of the Monoclinic Form of Satellite Tobacco Mosaic Virus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Coat protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7m2t__assembly_1__model_1

7m2t__assembly_1__model_1 | I(q)

7m2t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 引用文献 (1)

Crystallographic Structure of the Monoclinic Form of Satellite Tobacco Mosaic Virus

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Coat protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7m2t__assembly_1__model_1

7m2t__assembly_1__model_1 | I(q)

7m2t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 引用文献 (1)