SAXSdb — 7mue

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DotF

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 72	Type IV secretion protein IcmK × 18 （A0A2S6FBG9） Unknown protein fragment × 18 IcmE protein × 18 （O53087）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	O54615_LEGPN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 AF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 BF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 CF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 DF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 EF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 FF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 GF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 HF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 IF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 JF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 KF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 LF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 MF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 VF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 WF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 XF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 YF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269 作者链 ZF； PDB构建体 1–269； UniProt 1–269

Type IV secretion protein IcmK

物种未注明

UniProt A0A2S6FBG9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 72	DotF × 18 （O54615） Unknown protein fragment × 18 IcmE protein × 18 （O53087）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A2S6FBG9_LEGPN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 AH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 BH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 CH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 DH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 EH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 FH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 GH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 HH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 IH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 JH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 KH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 LH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 MH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 VH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 WH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 XH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 YH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361 作者链 ZH； PDB构建体 1–361； UniProt 1–361

IcmE protein

物种未注明

UniProt O53087

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 72	DotF × 18 （O54615） Type IV secretion protein IcmK × 18 （A0A2S6FBG9） Unknown protein fragment × 18	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	O53087_LEGPN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 AG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 BG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 CG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 DG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 EG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 FG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 GG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 HG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 IG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 JG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 KG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 LG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 MG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 VG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 WG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 XG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 YG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048 作者链 ZG； PDB构建体 1–1048； UniProt 1–1048

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7mue
沉积日期 deposition_date	2021-05-14
结构标题 title	Legionella pneumophila Dot/Icm T4SS PR
关键词 keywords	Dot/Icm, Secretion, T4SS, TRANSLOCASE; TRANSLOCASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7mue__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7mue__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7mue__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	76.44 Å
Rg（电子密度）	75.78 Å
总 Rg	75.93 Å
原子数	40266
残基数	5490
排除体积	714520 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7mue__assembly_1__model_1`	72-meric （72）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DotF
分子量 formula_weight	29730.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	18

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AF,BF,CF,DF,EF,FF,GF,HF,IF,JF,KF,LF,MF,VF,WF,XF,YF,ZF
原子数 atom_count	40266

MMAEHDQNNDEYKFAELDSYDMDQAGESDLDSEASYQSGKEGLTKKKDIKRNALIAIGAVVFIMVMYKIIGWMFFSDKSSQVTSKPAIPPVTQVATPQPVQTIPTTTPIQQVQPTTIIEDDPDLKKKVSAIEMTQQSLRSEVNALSEQINAVNNNIKNLNAQIVNLNQIIGNMSNQIARQSEVINVLMARTTPKKVVKVSRPIVQARIIYYIQAVIPGRAWLIGSNGSTLTVREGSKIPGYGMVKLIDSLQGRILTSSGQVIKFSQEDS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Type IV secretion protein IcmK
分子量 formula_weight	38958.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	18

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	XH,YH,ZH,AH,BH,CH,DH,EH,FH,GH,HH,IH,JH,KH,LH,MH,VH,WH

MMKKYDQLCKYCLVIGLTFSMSCSIYAADQSDDAQQALQQLRMLQQKLSQNPSPDAQSGAGDGGDNAASDSTQQPNQSGQANAPAANQTATAGGDGQIISQDDAEVIDKKAFKDMTRNLYPLNPEQVVKLKQIYETSEYAKAATPGTPPKPTATSQFVNLSPGSTPPVIRLSQGFVSSLVFLDSTGAPWPIAAYDLGDPSSFNIQWDKTSNTLMIQATKLYNYGNLAVRLRGLNTPVMLTLIPGQKAVDYRVDLRVQGYGPNAKSMPTEEGIPPSANDLLLHVLEGVPPPGSRRLVVSGGDARAWLSNEKMYVRTNLTILSPGWLASMTSADGTHAYEMQKSPVLLVSWHGKVMQLKVEGL

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Unknown protein fragment
分子量 formula_weight	4103.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	18

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	AX,BX,CX,DX,EX,FX,GX,HX,IX,JX,KX,LX,MX,VX,WX,XX,YX,ZX

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	IcmE protein
分子量 formula_weight	107911.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	18

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	IG,AG,BG,CG,DG,EG,FG,GG,HG,JG,KG,LG,MG,VG,WG,XG,YG,ZG

MASKKENLKSLFSNTRTRVIIIFTAALLIIAVVIGFFKIRGATTGSIAAAEVSTVPGGIQSIPGVLDPTAQYAKLQEEQNITQAQVAEKTGGSAIPTIIRTQALGEGVGVIGSQSGVGFAALAQEELGGPQRSLWIQELQDGSCSKSVITKVVNQGAQLTDLKAACSCVQLKDSGYGLQELEQVCECKELKSAGYNARQLKEAGYSAGRLRNCGFDACELRNAGFTAQEMKDGGFSDGELKGAGFSDAEIAKASGLPDGITADDVRKAGCGAAALAKLRQAGVSASAIRKISGCTAEQLKAAGYTAKELKDAGFSAADLRRAGFSAAELKDAGFTARDLLNAGFTPADLAKAGFSDAQIKAAQAELPPGITPQDVKNAGCDVEALKKEREAGVSAALIRQYAGCSAQALKAAGFTDADLANAGFTPAQISAATPLSDAEIKAAGCDPDKLKKLFSAGVSAKRIKELNGCSAEALKAAGYDAQSLLAAGFTPQELLAAGFTPKQLEDAGLNPVSIIADGRVADCSVESLKKARAAGVSALTIKQTLGCSAAALKAAGYTAKELKDAGFTAAELKAAGFSAKELKDAGFTAKELRDAGFSAQELKDVGFSAKDLKDAGFSAAELKAAGFTAAQLKAAGFSAKDLKDAGFSAAELKAAGFSAKELKDAGFSASDLKNAGFSAKELKDAGFSASDLKSAGFSASELKNAGYSADELKKAGYTSAELRNAGFSPQESAVAGLQGPDLQQLDSSITGIPSIPGATPRPTTSDAASSAEQLQAILQKQNEQLAEQKYQQEIQQRTSDMLTAATQLVQDWKQVETQVYTEGTEETKTSGGESAVPGTGTGTGSNNQPVDQGAVSAQNQAIIKTGDIMFAVLDTSVNSDEPGPILATIVTGKLKGSKLIGSFNLPSNADKMVITFNTMSIPGAEKTISISAYAIDPNTARTALASRTNHHYLMRYGSLFASSFLQGFGNAFQSANTTITIGGTGGGNNITVANGVGRSTLENAVIGLATVGKAWSQQAQQLFNTPTTVEVYSGTGLGILFTQDVTTI

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	2.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	43907

Legionella pneumophila Dot/Icm T4SS PR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DotF

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Type IV secretion protein IcmK

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

IcmE protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7mue__assembly_1__model_1

7mue__assembly_1__model_1 | I(q)

7mue__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

Legionella pneumophila Dot/Icm T4SS PR

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DotF

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Type IV secretion protein IcmK

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

IcmE protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7mue__assembly_1__model_1

7mue__assembly_1__model_1 | I(q)

7mue__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)