SAXSdb — 7mzt

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Complement C1r subcomponent heavy chain

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Fibronectin-binding protein BBK32 × 1 （O50835） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C1R_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1, 2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–164； UniProt 300–463 作者链 B； PDB构建体 1–242； UniProt 464–705

Fibronectin-binding protein BBK32

Borrelia burgdorferi (strain ATCC 35210 / B31 / CIP 102532 / DSM 4680)

UniProt O50835

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Complement C1r subcomponent heavy chain × 1 （P00736） Complement C1r subcomponent light chain × 1 （P00736） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	O50835_BORBU
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 6–148； UniProt 206–348

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7mzt
沉积日期 deposition_date	2021-05-24
结构标题 title	Borrelia burgdorferi BBK32-C in complex with an autolytic fragment of human C1r at 4.1A
关键词 keywords	Lyme disease spirochete, Borrelia burgdorferi, complement system, classical pathway, protease inhibitor, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7mzt__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7mzt__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7mzt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	33.31 Å
Rg（电子密度）	33.45 Å
总 Rg	33.68 Å
原子数	4120
残基数	513
排除体积	73366 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7mzt__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Complement C1r subcomponent heavy chain
分子量 formula_weight	19210.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4120

LRYTTEIIKCPQPKTLDEFTIIQNLQPQYQFRDYFIATCKQGYQLIEGNQVLHSFTAVCQDDGTWHRAMPRCKIKDCGQPRNLPNGDFRYTTTMGVNTYKARIQYYCHEPYYKMQTRAGSRESEQGVYTCTAQGIWKNEQKGEKIPRCLPVCGKPVNPVEQRQR

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Complement C1r subcomponent light chain
分子量 formula_weight	27125.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

IIGGQKAKMGNFPWQVFTNIHGRGGGALLGDRWILTAAHTLYPKEHEAQSNASLDVFLGHTNVEELMKLGNHPIRRVSVHPDYRQDESYNFEGDIALLELENSVTLGPNLLPICLPDNDTFYDLGLMGYVSGFGVMEEKIAHDLRFVRLPVANPQACENWLRGKNRMDVFSQNMFCAGHPSLKQDACQGDSGGVFAVRDPNTDRWVATGIVSWGIGCSRGYGFYTKVLNYVDWIKKEMEEED

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Fibronectin-binding protein BBK32
分子量 formula_weight	16922.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

GSTGSSNRYQSYLEGVKYNVDSAIQTITKIYNTYTLFSTKLTQMYSTRLDNFAKAKAKEEAAKFTKEDLEKNFKTLLNYIQVSVKTAANFVYINDTHAKRKLENIEAEIKTLIAKIKEQSNLYEAYKAIVTSILLMRDSLKEVQGIID

来源 Source

来源生物 organism	Borrelia burgdorferi (strain ATCC 35210 / B31 / CIP 102532 / DSM 4680)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	224326
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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晶胞边长 a length_a	113.619 Å
晶胞边长 b length_b	96.989 Å
晶胞边长 c length_c	108.330 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	orthorhombic

分辨率 resolution	4.070 Å
最低分辨率 resolution_low	44.260 Å
R 因子 r_factor	0.3693
R_work r_work	0.3690
R_free r_free	0.3725

Borrelia burgdorferi BBK32-C in complex with an autolytic fragment of human C1r at 4.1A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Complement C1r subcomponent heavy chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Fibronectin-binding protein BBK32

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7mzt__assembly_1__model_1

7mzt__assembly_1__model_1 | I(q)

7mzt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Borrelia burgdorferi BBK32-C in complex with an autolytic fragment of human C1r at 4.1A

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Complement C1r subcomponent heavy chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Fibronectin-binding protein BBK32

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7mzt__assembly_1__model_1

7mzt__assembly_1__model_1 | I(q)

7mzt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)