SAXSdb — 7nnl

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium-transporting ATPase potassium-binding subunit

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–557	未记录	Potassium-transporting ATPase KdpC subunit × 1 （A0A037YI39） Potassium-transporting ATPase KdpF subunit × 1 （P36937） Potassium-transporting ATPase ATP-binding subunit × 1 （A0A024L5I2） K POTASSIUM ION × 10 CDL CARDIOLIPIN × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7NNL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7NNP Rb-loaded cryo-EM structure of the E1-ATP KdpFABC complex. 提交 2021-02-25	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–557（557 aa）	突变：G232D	RB RUBIDIUM ION × 8 CDL CARDIOLIPIN × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.20 Å

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UniProt名称	A0A2S5ZPF1_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–557； UniProt 1–557

Potassium-transporting ATPase KdpC subunit

Escherichia coli

UniProt A0A037YI39

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–190	未记录	Potassium-transporting ATPase potassium-binding subunit × 1 （A0A2S5ZPF1） Potassium-transporting ATPase KdpF subunit × 1 （P36937） Potassium-transporting ATPase ATP-binding subunit × 1 （A0A024L5I2） K POTASSIUM ION × 10 CDL CARDIOLIPIN × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7NNL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7NNP Rb-loaded cryo-EM structure of the E1-ATP KdpFABC complex. 提交 2021-02-25	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–190（190 aa）	未记录	RB RUBIDIUM ION × 8 CDL CARDIOLIPIN × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.20 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	A0A037YI39_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190

Potassium-transporting ATPase KdpF subunit

Escherichia coli

UniProt P36937

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–27	未记录	Potassium-transporting ATPase potassium-binding subunit × 1 （A0A2S5ZPF1） Potassium-transporting ATPase KdpC subunit × 1 （A0A037YI39） Potassium-transporting ATPase ATP-binding subunit × 1 （A0A024L5I2） K POTASSIUM ION × 10 CDL CARDIOLIPIN × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7NNL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5MRW Structure of the KdpFABC complex 提交 2016-12-27	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；20% (w/v) PEG3350, 0.5-1.0 M NaCl, 0.05 mM sodium citrate pH 5.5.	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
5MRW Structure of the KdpFABC complex 提交 2016-12-27	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；20% (w/v) PEG3350, 0.5-1.0 M NaCl, 0.05 mM sodium citrate pH 5.5.	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
5MRW Structure of the KdpFABC complex 提交 2016-12-27	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 PX4 1,2-DIMYRISTOYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 BOG octyl beta-D-glucopyranoside × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；291 K；20% (w/v) PEG3350, 0.5-1.0 M NaCl, 0.05 mM sodium citrate pH 5.5.	分辨率 2.90 Å R-free 0.275
6HRA Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in an E1 outward-facing state (state 1) 提交 2018-09-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.012% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
6HRB Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in an E2 inward-facing state (state 2) 提交 2018-09-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.012% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7BGY Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2Pi state with MgF4 提交 2021-01-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	PEV (1S)-2-{[(2-AMINOETHOXY)(HYDROXY)PHOSPHORYL]OXY}-1-[(PALMITOYLOXY)METHYL]ETHYL STEARATE × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 MF4 TETRAFLUOROMAGNESATE(2-) × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；A 10x stock solution of MgF4 was added to the protein mixture containing all other buffer components to produce final concentrations 1 mM MgCl2 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 2.90 Å
7BH1 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E1 state with K 提交 2021-01-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.38 Å
7BH2 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2Pi state with BeF3 and K+ 提交 2021-01-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；The beryllium fluoride in the buffer was added to the protein mixture containing all other buffer components in the form of a pre-incubated mixture, at a 1:10 volume, to produce the final concentrations 2.5 mM BeSO4 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.00 Å
7LC3 CryoEM Structure of KdpFABC in E1-ATP state 提交 2021-01-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；AMPPCP was added to the protein after size-exclusion chromatography and incubated 1 hr prior to freezing cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
7LC6 Cryo-EM Structure of KdpFABC in E2-P state with BeF3 提交 2021-01-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；The beryllium fluoride in the buffer was added to the protein mixture containing all other buffer components in the form of a pre-incubated mixture with the final concentrations 2.5 mM BeSO4 and 10 mM NaF. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 uL of protein mixture applied to grid. Blot time 4 seconds, blot force 0, no wait before plunging.	分辨率 3.70 Å
7NNP Rb-loaded cryo-EM structure of the E1-ATP KdpFABC complex. 提交 2021-02-25	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	RB RUBIDIUM ION × 8 CDL CARDIOLIPIN × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.20 Å
7ZRD Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P tight conformation, stabilised with the inhibitor orthovanadate 提交 2022-05-04	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 9 CDL CARDIOLIPIN × 2 VO4 VANADATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.30 Å
7ZRE Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P tight conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 9 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7ZRG Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1_ATPearly conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7ZRH Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.40 Å
7ZRI Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
7ZRJ Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in a nucleotide-free E1 conformation loaded with K+ 提交 2022-05-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 7 CDL CARDIOLIPIN × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
7ZRK Cryo-EM map of the WT KdpFABC complex in the E1-P_ADP conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 12 CDL CARDIOLIPIN × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
7ZRL Cryo-EM map of the unphosphorylated KdpFABC complex in the E2-P conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
7ZRM Cryo-EM map of the unphosphorylated KdpFABC complex in the E1-P_ADP conformation, under turnover conditions 提交 2022-05-04	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–27（27 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.70 Å
9OC4 High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1P-ADP state in lipid nanodisc 提交 2025-04-23	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.10 Å
9ZWK High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1 state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.34 Å
9ZWL High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1-ATP state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2mM MgCl2, 1mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.28 Å
9ZWM High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E1P state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.25 Å
9ZWN High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E2P state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 3 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.58 Å
9ZWO High-resolution cryo-EM structure of KdpFABC in the E2 state in lipid nanodisc 提交 2026-01-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–29（29 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 2 9Y0 (2R)-3-(((2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl)oxy)-2-(palmitoyloxy)propyl (E)-octadec-9-enoate × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM Tris pH 7.4, 100 mM KCl, and 0.5 mM TCEP, 2 mM MgCl2, 1 mM ATP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.72 Å

共 24 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	KDPF_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–27； UniProt 1–27

Potassium-transporting ATPase ATP-binding subunit

Escherichia coli

UniProt A0A024L5I2

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–682	突变：D307N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Potassium-transporting ATPase potassium-binding subunit × 1 （A0A2S5ZPF1） Potassium-transporting ATPase KdpC subunit × 1 （A0A037YI39） Potassium-transporting ATPase KdpF subunit × 1 （P36937） K POTASSIUM ION × 10 CDL CARDIOLIPIN × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7NNL	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7NNP Rb-loaded cryo-EM structure of the E1-ATP KdpFABC complex. 提交 2021-02-25	突变/修饰不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–682（682 aa）	突变：S162A	RB RUBIDIUM ION × 8 CDL CARDIOLIPIN × 2 ACP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；10 mM Tris-HCl pH 8, 10 mM MgCl2, 10 mM NaCl and 0.0125% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.20 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A024L5I2_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–682； UniProt 1–682

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7nnl
沉积日期 deposition_date	2021-02-25
结构标题 title	Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in an E1-ATP conformation loaded with K+
关键词 keywords	P-type ATPase, superfamily of K+ transporters (SKT), potassium uptake system, ATP analogue, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	41.58 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	40.70 Å
零角强度 I(0) i0	328804000.00
分子量 molecular_weight	158350.0 kDa
排除体积 excluded_volume	202640 Å³
包络体积 envelope_volume	247670 Å³
水化壳体积 shell_volume	53080 Å³
包络直径 envelope_diameter	151.9 Å
壳层 Rg shell_rg	43.50 Å
包络 Rg envelope_rg	41.50 Å
形状 Rg shape_rg	40.78 Å
总 Rg total_rg	40.57 Å
总原子数 total_atoms	11099
残基数 n_residues	1455
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	146.1 Å
Rg (实空间) rg_real	41.93 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.63 Å
I(0) (实空间) i0_real	3.2880e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.7720e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	41.59 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	328700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6027
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	38.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.561
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.253
角度范围 angular_range	— – 0.1900 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	49380000.0000
实空间数据点数 n_real_points	39
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.725; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.046; Positv: 1.000; Valcen: 0.856; Smooth: 0.661

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Potassium-transporting ATPase potassium-binding subunit
分子量 formula_weight	59218.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	11099

MAAQGFLLIATFLLVLMVLARPLGSGLARLINDIPLPGTTGVERVLFRALGVSDREMNWKQYLCAILGLNMLGLAVLFFMLLGQHYLPLNPQQLPGLSWDLALNTAVSFVTNTNWQSYSGETTLSYFSQMAGLTVQNFLSAASGIAVIFALIRAFTRQSMSTLGNAWVDLLRITLWVLVPVALLIALFFIQQGALQNFLPYQAVNTVEGAQQLLPMGPVASQEAIKMLGTNGGGFFNANSSHPFENPTALTNFVQMLAIFLIPTALCFAFGEVMGDRRQGRMLLWAMSVIFVICVGVVMWAEVQGNPHLLALGTDSSINMEGKESRFGVLVSSLFAVVTTAASCGAVIAMHDSFTALGGMVPMWLMQIGEVVFGGVGSGLYGMMLFVLLAVFIAGLMIGRTPEYLGKKIDVREMKLTALAILVTPTLVLMGAALAMMTDAGRSAMLNPGPHGFSEVLYAVSSAANNNGSAFAGLSANSPFWNCLLAFCMFVGRFGVIIPVMAIAGSLVSKKSQAASSGTLPTHGPLFVGLLIGTVLLVGALTFIPALALGPVAEYLS

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Potassium-transporting ATPase KdpC subunit
分子量 formula_weight	20281.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSGLRPALSTFIFLLLITGGVYPLLTTVLGQWWFPWQANGSLIREGDTVRGSALIGQNFTGNGYFHGRPSATAEMPYNPQASGGSNLAVSNPELDKLIAARVAALRAANPDASASVPVELVTASASGLDNNITPQAAAWQIPRVAKARNLSVEQLTQLIAKYSQQPLVKYIGQPVVNIVELNLALDKLDE

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Potassium-transporting ATPase KdpF subunit
分子量 formula_weight	2853.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MSAGVITGVLLVFLLLGYLVYALINAE

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Potassium-transporting ATPase ATP-binding subunit
分子量 formula_weight	72346.9 kDa
EC 编号 ec_number	7.2.2.6
突变 mutation	D307N
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSRKQLALFEPTLVVQALKEAVKKLNPQAQWRNPVMFIVWIGSLLTTCISIAMASGAMPGNALFSAAISGWLWITVLFANFAEALAEGRSKAQANSLKGVKKTAFARKLREPKYGAAADKVPADQLRKGDIVLVEAGDIIPCDGEVIEGGASVDESAITGESAPVIRESGGDFASVTGGTRILSDWLVIECSVNPGETFLDRMIAMVEGAQRRKTPNEIALTILLIALTIVFLLATATLWPFSAWGGNAVSVTVLVALLVCLIPTTIGGLLSAIGVAGMSRMLGANVIATSGRAVEAAGDVDVLLLNKTGTITLGNRQASEFIPAQGVDEKTLADAAQLASLADETPEGRSIVILAKQRFNLRERDVQSLHATFVPFTAQSRMSGINIDNRMIRKGSVDAIRRHVEANGGHFPTDVDQKVDQVARQGATPLVVVEGSRVLGVIALKDIVKGGIKERFAQLRKMGIKTVMITGDNRLTAAAIAAEAGVDDFLAEATPEAKLALIRQYQAEGRLVAMTGDGTNDAPALAQADVAVAMNSGTQAAKEAGNMVDLDSNPTKLIEVVHIGKQMLMTRGSLTTFSIANDVAKYFAIIPAAFAATYPQLNALNIMCLHSPDSAILSAVIFNALIIVFLIPLALKGVSYKPLTASAMLRRNLWIYGLGGLLVPFIGIKVIDLLLTVCGLV

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	CARDIOLIPIN
分子量 formula_weight	1464.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER
分子量 formula_weight	505.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	7nnlB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1110 — Calcium-transporting ATPase, cytoplasmic domain N
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Calcium-transporting ATPase, cytoplasmic domain N

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8. 引用文献 (2)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.10 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	160776

fit	/app/data/saxs_computation/nn/7nnl/7nnl.fit
pddf	/app/data/pr_computation/nn/7nnl/7nnl.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/nn/7nnl/7nnl.dat

Cryo-EM structure of the KdpFABC complex in an E1-ATP conformation loaded with K+

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Potassium-transporting ATPase potassium-binding subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Potassium-transporting ATPase KdpC subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Potassium-transporting ATPase KdpF subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Potassium-transporting ATPase ATP-binding subunit

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)