7ode

E. coli 50S ribosome LiCl core particle

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

50S ribosomal protein L2

物种未注明

UniProt P60422

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RL2_ECOLI
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–273; UniProt 1–273

50S ribosomal protein L3

物种未注明

UniProt P60438

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RL3_ECOLI
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–209; UniProt 1–209

50S ribosomal protein L4

物种未注明

UniProt P60723

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RL4_ECOLI
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–201; UniProt 1–201

50S ribosomal protein L13

物种未注明

UniProt P0AA10

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RL13_ECOLI
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–142; UniProt 1–142

50S ribosomal protein L14

物种未注明

UniProt P0ADY3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RL14_ECOLI
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 S; PDB构建体 1–123; UniProt 1–123

50S ribosomal protein L17

物种未注明

UniProt P0AG44

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

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UniProt名称 RL17_ECOLI
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 V; PDB构建体 1–127; UniProt 1–127

50S ribosomal protein L19

物种未注明

UniProt P0A7K6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

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UniProt名称 RL19_ECOLI
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 X; PDB构建体 1–115; UniProt 1–115

50S ribosomal protein L20

物种未注明

UniProt P0A7L3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

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UniProt名称 RL20_ECOLI
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 Y; PDB构建体 1–118; UniProt 1–118

50S ribosomal protein L21

物种未注明

UniProt P0AG48

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RL21_ECOLI
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 Z; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103

50S ribosomal protein L22

物种未注明

UniProt P61175

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

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UniProt名称 RL22_ECOLI
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 a; PDB构建体 1–110; UniProt 1–110

50S ribosomal protein L23

物种未注明

UniProt P0ADZ0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RL23_ECOLI
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 b; PDB构建体 1–100; UniProt 1–100

50S ribosomal protein L24

物种未注明

UniProt P60624

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RL24_ECOLI
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 c; PDB构建体 1–104; UniProt 1–104

50S ribosomal protein L29

物种未注明

UniProt P0A7M6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RL29_ECOLI
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 g; PDB构建体 1–63; UniProt 1–63

50S ribosomal protein L32

物种未注明

UniProt P0A7N4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L34 × 1 (P0A7P5) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RL32_ECOLI
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 i; PDB构建体 1–57; UniProt 1–57

50S ribosomal protein L34

物种未注明

UniProt P0A7P5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 15 RNA 1 23S rRNA × 1 50S ribosomal protein L2 × 1 (P60422) 50S ribosomal protein L3 × 1 (P60438) 50S ribosomal protein L4 × 1 (P60723) 50S ribosomal protein L13 × 1 (P0AA10) 50S ribosomal protein L14 × 1 (P0ADY3) 50S ribosomal protein L17 × 1 (P0AG44) 50S ribosomal protein L19 × 1 (P0A7K6) 50S ribosomal protein L20 × 1 (P0A7L3) 50S ribosomal protein L21 × 1 (P0AG48) 50S ribosomal protein L22 × 1 (P61175) 50S ribosomal protein L23 × 1 (P0ADZ0) 50S ribosomal protein L24 × 1 (P60624) 50S ribosomal protein L29 × 1 (P0A7M6) 50S ribosomal protein L32 × 1 (P0A7N4) 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RL34_ECOLI
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 k; PDB构建体 1–46; UniProt 1–46

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7ode
沉积日期 deposition_date2021-04-29
结构标题 titleE. coli 50S ribosome LiCl core particle
关键词 keywordsribosome assembly, folding, biogenesis, 50S, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7ode__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7ode__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7ode__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)62.05 Å
Rg(电子密度)62.19 Å
总 Rg62.29 Å
原子数92569
残基数3747
排除体积849080 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7ode__assembly_1__model_1 hexadecameric (16) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id7odea01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology470 — Ribosomal Protein L22; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribosomal protein L22/L17
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7. 引用文献 (1)