7on1

Cenp-A nucleosome in complex with Cenp-C

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BJ4_G0006610.mRNA.1.CDS.1

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 10 DNA 2	Histone H4 × 2 （A0A6A5Q1V3） Histone H2B × 2 （A0A6A5PZQ7） BJ4_G0007000.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PV75） Histone H2A × 2 （A0A6A5Q1K4） DNA (152-MER) × 1 DNA (123-MER) × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A6A5PSM0_YEASX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–549； UniProt 1–549 作者链 D； PDB构建体 1–549； UniProt 1–549

Histone H4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q1V3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 10 DNA 2	BJ4_G0006610.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PSM0） Histone H2B × 2 （A0A6A5PZQ7） BJ4_G0007000.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PV75） Histone H2A × 2 （A0A6A5Q1K4） DNA (152-MER) × 1 DNA (123-MER) × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A6A5Q1V3_YEASX
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 3–105； UniProt 1–103 作者链 f； PDB构建体 3–105； UniProt 1–103

Histone H2B

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5PZQ7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 10 DNA 2	BJ4_G0006610.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PSM0） Histone H4 × 2 （A0A6A5Q1V3） BJ4_G0007000.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PV75） Histone H2A × 2 （A0A6A5Q1K4） DNA (152-MER) × 1 DNA (123-MER) × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A6A5PZQ7_YEASX
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 d； PDB构建体 3–133； UniProt 1–131 作者链 h； PDB构建体 3–133； UniProt 1–131

BJ4_G0007000.mRNA.1.CDS.1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5PV75

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 10 DNA 2	BJ4_G0006610.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PSM0） Histone H4 × 2 （A0A6A5Q1V3） Histone H2B × 2 （A0A6A5PZQ7） Histone H2A × 2 （A0A6A5Q1K4） DNA (152-MER) × 1 DNA (123-MER) × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A6A5PV75_YEASX
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 3–231； UniProt 1–229 作者链 e； PDB构建体 3–231； UniProt 1–229

Histone H2A

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5Q1K4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 10 DNA 2	BJ4_G0006610.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PSM0） Histone H4 × 2 （A0A6A5Q1V3） Histone H2B × 2 （A0A6A5PZQ7） BJ4_G0007000.mRNA.1.CDS.1 × 2 （A0A6A5PV75） DNA (152-MER) × 1 DNA (123-MER) × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A6A5Q1K4_YEASX
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 c； PDB构建体 3–134； UniProt 1–132 作者链 g； PDB构建体 3–134； UniProt 1–132

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7on1
沉积日期 deposition_date	2021-05-25
结构标题 title	Cenp-A nucleosome in complex with Cenp-C
关键词 keywords	Kinetochore, Nucleosome, Complex, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7on1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7on1__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7on1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	39.67 Å
Rg（电子密度）	36.72 Å
总 Rg	37.52 Å
原子数	11150
残基数	1023
排除体积	182620 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7on1__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	BJ4_G0006610.mRNA.1.CDS.1
分子量 formula_weight	62553.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D
原子数 atom_count	11150

MDYMKLGLKSRKTGIDVKQDIPKDEYSMENIDDFFKDDETSLISMRRKSRRKSSLFLPSTLNGDTKNVLPPFLQSYKSQDDEVVQSPSGKGDGSRRSSLLSHQSNFLSPANDFEPIEEEPEQEENDIRGNDFATPITQKLSKPTYKRKYSTRYSLDTSESPSVRLTPDRITNKNVYSDVPDLVADEDDDDRVNTSLNTSDNALLEDELEDDGFIPESEEDGDYIESDSSLDSGSDSASDSDGDNTYQEVEEEAEVNTNDNEDDYIRRQASDVVRTDSIIDRNGLRKSTRVKVAPLQYWRNEKIVYKRKSNKPVLDIDKIVTYDESEDEEEILAAQRRKKQKKKPTPTRPYNYVPTGRPRGRPKKDPNAKENLIPEDPNEDIIERIESGGIENGEWLKHGILEANVKISDTKEETKDEIIAFAPNLSQTEQVKDTKDENFALEIMFDKHKEYFASGILKLPAISGQKKLSNSFRTYITFHVIQGIVEVTVCKNKFLSVKGSTFQIPAFNEYAIANRGNDEAKMFFVQVTVSEDANDDNDKELDSTFDTFG

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	unidentified baculovirus

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	11523.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b,f

GAMSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKILRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEEVRAVLKSFLESVIRDSVTYTEHAKRKTVTSLDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Histone H2B
分子量 formula_weight	14408.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d,h

GAMSAKAEKKPASKAPAEKKPAAKKTSTSTDGKKRSKARKETYSSYIYKVLKQTHPDTGISQKSMSILNSFVNDIFERIATEASKLAAYNKKSTISAREIQTAVRLILPGELAKHAVSEGTRAVTKYSSSTQA

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	BJ4_G0007000.mRNA.1.CDS.1
分子量 formula_weight	27013.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e,a

GAMSSKQQWVSSAIQSDSSGRSLSNVNRLAGDQQSINDRALSLLQRTRATKNLFPRREERRRYESSKSDLDIETDYEDQAGNLEIETENEEEAEMETEVPAPVRTHSYALDRYVRQKRREKQRKQSLKRVEKKYTPSELALYEIRKYQRSTDLLISKIPFARLVKEVTDEFTTKDQDLRWQSMAIMALQEASEAYLVGLLEHTNLLALHAKRITIMKKDMQLARRIRGQFI

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Histone H2A
分子量 formula_weight	14141.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g,c

GAMSGGKGGKAGSAAKASQSRSAKAGLTFPVGRVHRLLRRGNYAQRIGSGAPVYLTAVLEYLAAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAIRNDDELNKLLGNVTIAQGGVLPNIHQNLLPKKSAKATKASQEL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA (152-MER)
分子量 formula_weight	45138.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	I

ATCGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCGAT

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA (123-MER)
分子量 formula_weight	38125.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	J

TATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACC

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.35 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	124953

Cenp-A nucleosome in complex with Cenp-C

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

BJ4_G0006610.mRNA.1.CDS.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

BJ4_G0007000.mRNA.1.CDS.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7on1__assembly_1__model_1

7on1__assembly_1__model_1 | I(q)

7on1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)