← 返回搜索
7pkg

C-reactive protein pentamer at pH 5

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 107.1 Å Quality: GOOD
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

C-reactive protein

Homo sapiens

UniProt P02741

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 19–224 链 B； UniProt 19–224 链 C； UniProt 19–224 链 D； UniProt 19–224 链 E； UniProt 19–224 未记录 CA CALCIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7PKG Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1B09 HUMAN C-REACTIVE PROTEIN COMPLEXED WITH PHOSPHOCHOLINE 提交 1998-11-18 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–224（206 aa）
链 B 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 10 PC PHOSPHOCHOLINE × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.6；pH 7.6
分辨率 2.50 Å R-free 0.242
1GNH HUMAN C-REACTIVE PROTEIN 提交 1996-03-01 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–224（206 aa）
链 B 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å R-free 0.273
1GNH HUMAN C-REACTIVE PROTEIN 提交 1996-03-01 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 19–224（206 aa）
链 G 19–224（206 aa）
链 H 19–224（206 aa）
链 I 19–224（206 aa）
链 J 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å R-free 0.273
1LJ7 Crystal structure of calcium-depleted human C-reactive protein from perfectly twinned data 提交 2002-04-19 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–224（206 aa）
链 B 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.15 Å R-free 0.199
1LJ7 Crystal structure of calcium-depleted human C-reactive protein from perfectly twinned data 提交 2002-04-19 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 19–224（206 aa）
链 G 19–224（206 aa）
链 H 19–224（206 aa）
链 I 19–224（206 aa）
链 J 19–224（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.15 Å R-free 0.199
3L2Y The structure of C-reactive protein bound to phosphoethanolamine 提交 2009-12-15 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–224（206 aa）
链 B 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 10 OPE PHOSPHORIC ACID MONO-(2-AMINO-ETHYL) ESTER × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；285.15 K；0.06M TRIS-HCL pH7.5, 10% MPD, 0.01M CaCl2, 0.14M NaCl, 0.1% NaN3, 0.1% LM AGAROSE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.246
3L2Y The structure of C-reactive protein bound to phosphoethanolamine 提交 2009-12-15 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 19–224（206 aa）
链 G 19–224（206 aa）
链 H 19–224（206 aa）
链 I 19–224（206 aa）
链 J 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 10 OPE PHOSPHORIC ACID MONO-(2-AMINO-ETHYL) ESTER × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；285.15 K；0.06M TRIS-HCL pH7.5, 10% MPD, 0.01M CaCl2, 0.14M NaCl, 0.1% NaN3, 0.1% LM AGAROSE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.246
3L2Y The structure of C-reactive protein bound to phosphoethanolamine 提交 2009-12-15 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 19–224（206 aa）
链 L 19–224（206 aa）
链 M 19–224（206 aa）
链 N 19–224（206 aa）
链 O 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 10 OPE PHOSPHORIC ACID MONO-(2-AMINO-ETHYL) ESTER × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；285.15 K；0.06M TRIS-HCL pH7.5, 10% MPD, 0.01M CaCl2, 0.14M NaCl, 0.1% NaN3, 0.1% LM AGAROSE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.246
3L2Y The structure of C-reactive protein bound to phosphoethanolamine 提交 2009-12-15 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 P 19–224（206 aa）
链 Q 19–224（206 aa）
链 R 19–224（206 aa）
链 S 19–224（206 aa）
链 T 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 10 OPE PHOSPHORIC ACID MONO-(2-AMINO-ETHYL) ESTER × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；285.15 K；0.06M TRIS-HCL pH7.5, 10% MPD, 0.01M CaCl2, 0.14M NaCl, 0.1% NaN3, 0.1% LM AGAROSE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 285.15K
分辨率 2.70 Å R-free 0.246
3PVN Triclinic form of Human C-Reactive Protein in complex with Zinc 提交 2010-12-07 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 B 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 C 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 D 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 E 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
未记录 CA CALCIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；12% PEG 4000, 0.1M Tris-Hcl, 0.2M MgCl2, 0.05M LiCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
分辨率 1.98 Å R-free 0.236
3PVN Triclinic form of Human C-Reactive Protein in complex with Zinc 提交 2010-12-07 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 G 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 H 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 I 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 J 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
未记录 CA CALCIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；12% PEG 4000, 0.1M Tris-Hcl, 0.2M MgCl2, 0.05M LiCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
分辨率 1.98 Å R-free 0.236
3PVN Triclinic form of Human C-Reactive Protein in complex with Zinc 提交 2010-12-07 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 L 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 M 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 N 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 O 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
未记录 CA CALCIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；12% PEG 4000, 0.1M Tris-Hcl, 0.2M MgCl2, 0.05M LiCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
分辨率 1.98 Å R-free 0.236
3PVN Triclinic form of Human C-Reactive Protein in complex with Zinc 提交 2010-12-07 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 P 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 Q 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 R 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 S 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 T 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
未记录 CA CALCIUM ION × 10 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；12% PEG 4000, 0.1M Tris-Hcl, 0.2M MgCl2, 0.05M LiCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
分辨率 1.98 Å R-free 0.236
3PVO Monoclinic form of Human C-Reactive Protein 提交 2010-12-07 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 B 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 C 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 D 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 E 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
未记录 CA CALCIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；12% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl, 0.2M MgCl2, 0.05M LiCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
3PVO Monoclinic form of Human C-Reactive Protein 提交 2010-12-07 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 G 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 H 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 I 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 J 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
未记录 CA CALCIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；12% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl, 0.2M MgCl2, 0.05M LiCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
3PVO Monoclinic form of Human C-Reactive Protein 提交 2010-12-07 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 L 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 M 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 N 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 O 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
未记录 CA CALCIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；12% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl, 0.2M MgCl2, 0.05M LiCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
3PVO Monoclinic form of Human C-Reactive Protein 提交 2010-12-07 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 P 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 Q 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 R 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 S 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
链 T 19–224（206 aa） 片段：UNP residues 19-224
未记录 CA CALCIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；289 K；12% PEG 4000, 0.1M Tris-HCl, 0.2M MgCl2, 0.05M LiCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 289K
分辨率 3.00 Å R-free 0.285
7PK9 C-reactive protein decamer at pH 7.5 提交 2021-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 19–224（206 aa）
链 B 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
链 F 19–224（206 aa）
链 G 19–224（206 aa）
链 H 19–224（206 aa）
链 I 19–224（206 aa）
链 J 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7PKB C-reactive protein pentamer at pH 7.5 提交 2021-08-25 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–224（206 aa）
链 B 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7PKD C-reactive protein decamer at pH 7.5 with phosphocholine ligand 提交 2021-08-25 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 19–224（206 aa）
链 G 19–224（206 aa）
链 H 19–224（206 aa）
链 I 19–224（206 aa）
链 J 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 10 PC PHOSPHOCHOLINE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7PKD C-reactive protein decamer at pH 7.5 with phosphocholine ligand 提交 2021-08-25 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–224（206 aa）
链 B 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 10 PC PHOSPHOCHOLINE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7PKE C-reactive protein pentamer at pH 7.5 with phosphocholine ligand 提交 2021-08-25 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–224（206 aa）
链 B 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 10 PC PHOSPHOCHOLINE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7PKF C-reactive protein decamer at pH 5 提交 2021-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 19–224（206 aa）
链 B 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
链 F 19–224（206 aa）
链 G 19–224（206 aa）
链 H 19–224（206 aa）
链 I 19–224（206 aa）
链 J 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7PKH C-reactive protein decamer at pH 5 with phosphocholine ligand 提交 2021-08-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 19–224（206 aa）
链 B 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
链 F 19–224（206 aa）
链 G 19–224（206 aa）
链 H 19–224（206 aa）
链 I 19–224（206 aa）
链 J 19–224（206 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 20 PC PHOSPHOCHOLINE × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7TBA Pentraxin - ligand complex 提交 2021-12-21 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–224（206 aa）
链 B 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
未记录 XQY [3-(dibutylamino)propyl]phosphonic acid × 5 CA CALCIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100mM Tris pH 9.0, 10% PEG 4000, 50mM lithium chloride, 200mM magnesium chloride
分辨率 3.50 Å R-free 0.260
7TBA Pentraxin - ligand complex 提交 2021-12-21 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 F 19–224（206 aa）
链 G 19–224（206 aa）
链 H 19–224（206 aa）
链 I 19–224（206 aa）
链 J 19–224（206 aa）
未记录 XQY [3-(dibutylamino)propyl]phosphonic acid × 5 CA CALCIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100mM Tris pH 9.0, 10% PEG 4000, 50mM lithium chloride, 200mM magnesium chloride
分辨率 3.50 Å R-free 0.260
7TBA Pentraxin - ligand complex 提交 2021-12-21 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 K 19–224（206 aa）
链 L 19–224（206 aa）
链 M 19–224（206 aa）
链 N 19–224（206 aa）
链 O 19–224（206 aa）
未记录 XQY [3-(dibutylamino)propyl]phosphonic acid × 5 CA CALCIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100mM Tris pH 9.0, 10% PEG 4000, 50mM lithium chloride, 200mM magnesium chloride
分辨率 3.50 Å R-free 0.260
7TBA Pentraxin - ligand complex 提交 2021-12-21 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 P 19–224（206 aa）
链 Q 19–224（206 aa）
链 R 19–224（206 aa）
链 S 19–224（206 aa）
链 T 19–224（206 aa）
未记录 XQY [3-(dibutylamino)propyl]phosphonic acid × 5 CA CALCIUM ION × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；100mM Tris pH 9.0, 10% PEG 4000, 50mM lithium chloride, 200mM magnesium chloride
分辨率 3.50 Å R-free 0.260
8WV4 C-reactive protein, pentamer 提交 2023-10-23 构建体不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–224（224 aa）
链 B 1–224（224 aa）
链 C 1–224（224 aa）
链 D 1–224（224 aa）
链 E 1–224（224 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force, 0
分辨率 3.30 Å
8WV5 C-reactive protein, decamer 提交 2023-10-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 1–224（224 aa）
链 B 1–224（224 aa）
链 C 1–224（224 aa）
链 D 1–224（224 aa）
链 E 1–224（224 aa）
链 F 1–224（224 aa）
链 G 1–224（224 aa）
链 H 1–224（224 aa）
链 I 1–224（224 aa）
链 J 1–224（224 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 20 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force, 0
分辨率 3.50 Å
9JNY C recatived protein pentamer 提交 2024-09-24 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 19–224（206 aa）
链 B 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.74 Å
9JO7 CRP-HCAb4 complex 提交 2024-09-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 19–224（206 aa）
链 B 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 F 19–224（206 aa）
链 H 19–224（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
9JO9 CRP-HCAb3 complex 提交 2024-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 B 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 F 19–224（206 aa）
链 H 19–224（206 aa）
链 J 19–224（206 aa）
链 L 19–224（206 aa）
链 N 19–224（206 aa）
链 Q 19–224（206 aa）
链 S 19–224（206 aa）
链 T 19–224（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.65 Å
9K94 CRP-HCAb2 complex 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 D 19–224（206 aa）
链 F 19–224（206 aa）
链 I 19–224（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCL
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.04 Å
9KMP CRP-HCAb1 complex 提交 2024-11-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
链 G 19–224（206 aa）
链 H 19–224（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9KMS CRP antigen-antibody2 complex 提交 2024-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 19–224（206 aa）
链 C 19–224（206 aa）
链 E 19–224（206 aa）
链 G 19–224（206 aa）
链 I 19–224（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9U4E Cryo-EM structure of the human CRP-CPS23F complex 提交 2025-03-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–224（224 aa）
链 B 1–224（224 aa）
链 C 1–224（224 aa）
链 D 1–224（224 aa）
链 E 1–224（224 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
9VCA Binding site between C-reactive protein and c2cc monoclonal antibody 提交 2025-06-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 19–224（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6；20 mM Tris-HCl buffer (pH 7.6), containing 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å

共 23 个其他 PDB 条目、38 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CRP_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–206； UniProt 19–224 作者链 B； PDB构建体 1–206； UniProt 19–224 作者链 C； PDB构建体 1–206； UniProt 19–224 作者链 D； PDB构建体 1–206； UniProt 19–224 作者链 E； PDB构建体 1–206； UniProt 19–224

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7pkg

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7pkg
下载 Download
▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7pkg
沉积日期 deposition_date2021-08-25
结构标题 titleC-reactive protein pentamer at pH 5
关键词 keywordsC-reactive protein, CRP, immune system, innate immunity; IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier36.00 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron35.07 Å
零角强度 I(0) i0187320000.00
分子量 molecular_weight115620.0 kDa
排除体积 excluded_volume146430 ų
包络体积 envelope_volume184080 ų
水化壳体积 shell_volume42643 ų
包络直径 envelope_diameter106.9 Å
壳层 Rg shell_rg43.17 Å
包络 Rg envelope_rg33.87 Å
形状 Rg shape_rg35.02 Å
总 Rg total_rg35.82 Å
总原子数 total_atoms16140
残基数 n_residues1030
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax107.1 Å
Rg (实空间) rg_real35.82 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.61 Å
I(0) (实空间) i0_real1.8730e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.7380e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal35.94 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal187300000.0000
解质量估计 total_estimate0.8348
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks3
主峰位置 r_peak_primary53.6 Å
偏度 Skewness skewness0.003
峰度 Kurtosis kurtosis-0.824
角度范围 angular_range— – 0.2200 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha155600000.0000
实空间数据点数 n_real_points45
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.950; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.000
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▶

8. 引用文献 (1)

▶

9. 文件与曲线 (10)