7prw

The glucocorticoid receptor in complex with velsecorat, a PGC1a coactivator fragment and sgk 23bp

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glucocorticoid receptor

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 3 DNA 2	;DNA (5'-D(TPCPGPAPCPGPGPAPCPAPAPAPAPTPGPTPTPCPTPGPTPAPC)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(GPTPAPCPAPGPAPAPCPAPTPTPTPTPGPTPCPCPGPTPCPGPA)-3') ; × 1 Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha × 1 （Q9UBK2） ZINC ION × 4 1,2-ETHANEDIOL × 6 Velsecorat × 2 water × 4	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GCR_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–393； UniProt 385–777 作者链 B； PDB构建体 1–393； UniProt 385–777

Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha

物种未注明

UniProt Q9UBK2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 3 DNA 2	Glucocorticoid receptor × 2 （P04150） ;DNA (5'-D(TPCPGPAPCPGPGPAPCPAPAPAPAPTPGPTPTPCPTPGPTPAPC)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(GPTPAPCPAPGPAPAPCPAPTPTPTPTPGPTPCPCPGPTPCPGPA)-3') ; × 1 ZINC ION × 4 1,2-ETHANEDIOL × 6 Velsecorat × 2 water × 4	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PRGC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–21； UniProt 134–154

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7prw
沉积日期 deposition_date	2021-09-22
结构标题 title	The glucocorticoid receptor in complex with velsecorat, a PGC1a coactivator fragment and sgk 23bp
关键词 keywords	nuclear receptor, ligand-activated transcription factor, multi-domain, complex, agonist, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7prw__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7prw__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7prw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.48 Å
Rg（电子密度）	29.13 Å
总 Rg	29.90 Å
原子数	6354
残基数	705
排除体积	111390 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7prw__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Glucocorticoid receptor
分子量 formula_weight	44511.5 kDa
突变 mutation	S404A, N517D, V571M, F602S, C638D
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	6429

GRTVFSNGYSSPSMRPDVSAPPSSSSTATTGPPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTCGSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQAGMNLEARKTKKKIKGIQQATTGVSQETSENPGDKTIVPATLPQLTPTLVSLLEVIEPEVLYAGYDSSVPDSTWRIMTTLNMLGGRQMIAAVKWAKAIPGFRNLHLDDQMTLLQYSWMSLMAFALGWRSYRQSSANLLCFAPDLIINEQRMTLPDMYDQCKHMLYVSSELHRLQVSYEEYLCMKTLLLLSSVPKDGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTKLLDSMHEVVENLLNYCFQTFLDKTMSIEFPEMLAEIITNQIPKYSNGNIKKLLFHQK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(TPCPGPAPCPGPGPAPCPAPAPAPAPTPGPTPTPCPTPGPTPAP*C)-3') ;
分子量 formula_weight	7064.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	C

TCGACGGACAAAATGTTCTGTAC

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(GPTPAPCPAPGPAPAPCPAPTPTPTPTPGPTPCPCPGPTPCPGP*A)-3') ;
分子量 formula_weight	7055.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	D

GTACAGAACATTTTGTCCGTCGA

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha
分子量 formula_weight	2261.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

PPQEAEEPSLLKKLLLAPANT

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	Velsecorat
分子量 formula_weight	606.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 8 Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	64

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晶胞边长 a length_a	80.210 Å
晶胞边长 b length_b	122.724 Å
晶胞边长 c length_c	130.449 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.502 Å
最低分辨率 resolution_low	89.390 Å
R 因子 r_factor	0.2048
R_work r_work	0.2018
R_free r_free	0.2632

The glucocorticoid receptor in complex with velsecorat, a PGC1a coactivator fragment and sgk 23bp

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glucocorticoid receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7prw__assembly_1__model_1

7prw__assembly_1__model_1 | I(q)

7prw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

7. 引用文献 (1)

The glucocorticoid receptor in complex with velsecorat, a PGC1a coactivator fragment and sgk 23bp

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Glucocorticoid receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7prw__assembly_1__model_1

7prw__assembly_1__model_1 | I(q)

7prw__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

7. 引用文献 (1)