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7q40

Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 103.8 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

E3 ubiquitin-protein ligase HERC2

Homo sapiens

UniProt O95714

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 2938–3342 未记录 CIT CITRIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate 分辨率 2.35 Å R-free 0.230
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 2938–3342 未记录 CIT CITRIC ACID × 3 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate 分辨率 2.35 Å R-free 0.230
3 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 2938–3342 未记录 CIT CITRIC ACID × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate 分辨率 2.35 Å R-free 0.230

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7Q40 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2KEO Solution NMR structure of human protein HS00059, cytochrome-b5-like domain of the HERC2 E3 ligase. Northeast structural genomics consortium (NESG) target ht98a 提交 2009-01-30 构建体不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1203–1296（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）300；压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] hs00059-1, 10 mM TRIS-2, 300 mM sodium chloride-3, 10 uM ZnSO4-4, 10 mM DTT-5, 0.01 % NaN3-6, 10 mM benzamidine-7, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3KCI The third RLD domain of HERC2 提交 2009-10-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 3951–4321（371 aa） 片段：UNP RESIDUES 3951-4321, RCC1-LIKE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；290.9 K；20% PEG3350, 0.2mM MgCl2, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290.9K
分辨率 1.80 Å R-free 0.195
4L1M Structure of the first RCC1-like domain of HERC2 提交 2013-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 417–790（374 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 9 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；291 K；1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-hydrochloride, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.238
4L1M Structure of the first RCC1-like domain of HERC2 提交 2013-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 417–790（374 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 UNX UNKNOWN LIGAND × 12 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；291 K；1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-hydrochloride, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.238
4L1M Structure of the first RCC1-like domain of HERC2 提交 2013-06-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 417–790（374 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 3 UNX UNKNOWN LIGAND × 13 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；291 K；1.5 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-hydrochloride, pH 8.5, vapor diffusion, temperature 291K
分辨率 2.60 Å R-free 0.238
6WW3 Crystal structure of HERC2 ZZ domain in complex with SUMO1 tail 提交 2020-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2702–2755（54 aa） 片段：fusion protein
未记录 ZN ZINC ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M ammonium chloride, 0.1 M Tris, pH 8.0 and 20% PEG 6000
分辨率 2.10 Å R-free 0.227
6WW3 Crystal structure of HERC2 ZZ domain in complex with SUMO1 tail 提交 2020-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2702–2755（54 aa） 片段：fusion protein
未记录 ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.2 M ammonium chloride, 0.1 M Tris, pH 8.0 and 20% PEG 6000
分辨率 2.10 Å R-free 0.227
6WW4 Crystal structure of HERC2 ZZ domain in complex with histone H3 tail 提交 2020-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2702–2751（50 aa） 片段：fusion protein
未记录 ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, and 17% PEG 10000
分辨率 2.25 Å R-free 0.243
6WW4 Crystal structure of HERC2 ZZ domain in complex with histone H3 tail 提交 2020-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2702–2751（50 aa） 片段：fusion protein
未记录 ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, and 17% PEG 10000
分辨率 2.25 Å R-free 0.243
7Q41 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of ubiquitin-protein ligase E3A (E6AP) 提交 2021-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2938–3342（405 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；293.1500 hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 3.01 Å R-free 0.255
7Q41 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of ubiquitin-protein ligase E3A (E6AP) 提交 2021-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2938–3342（405 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；293.1500 hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 3.01 Å R-free 0.255
7Q41 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of ubiquitin-protein ligase E3A (E6AP) 提交 2021-10-29 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2938–3342（405 aa）
未记录 CIT CITRIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；293.1500 hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 3.01 Å R-free 0.255
7Q42 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of chromatin reader BAZ2B 提交 2021-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2938–3342（405 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 1.95 Å R-free 0.206
7Q42 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of chromatin reader BAZ2B 提交 2021-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2938–3342（405 aa）
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 1.95 Å R-free 0.206
7Q42 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of chromatin reader BAZ2B 提交 2021-10-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2938–3342（405 aa）
未记录 CIT CITRIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 1.95 Å R-free 0.206
7Q43 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of dedicator of cytokinesis protein 10 提交 2021-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2941–3342（402 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.40 Å R-free 0.265
7Q43 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of dedicator of cytokinesis protein 10 提交 2021-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2941–3342（402 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.40 Å R-free 0.265
7Q43 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of dedicator of cytokinesis protein 10 提交 2021-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2941–3342（402 aa）
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.40 Å R-free 0.265
7Q44 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of deubiquitinase USP35 提交 2021-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2941–3342（402 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.231
7Q44 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of deubiquitinase USP35 提交 2021-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2941–3342（402 aa）
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.231
7Q44 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of deubiquitinase USP35 提交 2021-10-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2941–3342（402 aa）
未记录 CIT CITRIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.20 Å R-free 0.231
7Q45 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of Myelin transcription factor 1 提交 2021-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2938–3342（405 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.10 Å R-free 0.224
7Q45 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of Myelin transcription factor 1 提交 2021-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2938–3342（405 aa）
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.10 Å R-free 0.224
7Q45 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of Myelin transcription factor 1 提交 2021-10-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2938–3342（405 aa）
未记录 CIT CITRIC ACID × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.10 Å R-free 0.224
7Q46 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of pericentriolar material 1 protein 提交 2021-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2941–3342（402 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.46 Å R-free 0.245
7Q46 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of pericentriolar material 1 protein 提交 2021-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2941–3342（402 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.46 Å R-free 0.245
7Q46 Crystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2 in complex with DXDKDED motif of pericentriolar material 1 protein 提交 2021-10-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2941–3342（402 aa）
未记录 CIT CITRIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；hanging drop 20% PEG 3350 0.18M tris amonium citrate
分辨率 2.46 Å R-free 0.245
7RGW Crystal structure of HERC2 DOC domain 提交 2021-07-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2759–2914（156 aa） 片段：DOC domain (UNP residues 2759-2914)
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 25% PEG3350
分辨率 1.99 Å R-free 0.213
9L8Y Crystal structure of HERC2 提交 2024-12-28 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2539–2700（162 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；289 K；0.02 M Citric acid, 0.08 M BIS-TRIS propane (pH 8.8), 16% w/v Polyethylene glycol 3,350
分辨率 1.92 Å R-free 0.206
9L93 Crystal structure of NCOA4 in complex with HERC2 提交 2024-12-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2539–2700（162 aa）
未记录 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289 K；18% v/v 2-Propanol, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.5), 20% w/v Polyethylene glycol 4000
分辨率 1.73 Å R-free 0.207
9L93 Crystal structure of NCOA4 in complex with HERC2 提交 2024-12-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2539–2700（162 aa）
未记录 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；289 K；18% v/v 2-Propanol, 0.1 M Sodium citrate tribasic dihydrate (pH 5.5), 20% w/v Polyethylene glycol 4000
分辨率 1.73 Å R-free 0.207

共 14 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HERC2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–405； UniProt 2938–3342 作者链 C； PDB构建体 1–405； UniProt 2938–3342 作者链 E； PDB构建体 1–405； UniProt 2938–3342

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7q40

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7q40
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7q40
沉积日期 deposition_date2021-10-29
结构标题 titleCrystal structure of RCC1-Like domain 2 of ubiquitin ligase HERC2
关键词 keywords7-bladed beta-propeller HERC2 RCC1-like Domain 2 RLD2 ubiquitin ligase DXDKDED motif, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier34.19 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron33.93 Å
零角强度 I(0) i0230437000.00
分子量 molecular_weight119020.0 kDa
排除体积 excluded_volume147780 ų
包络体积 envelope_volume178630 ų
水化壳体积 shell_volume43423 ų
包络直径 envelope_diameter107.5 Å
壳层 Rg shell_rg40.72 Å
包络 Rg envelope_rg33.78 Å
形状 Rg shape_rg33.89 Å
总 Rg total_rg34.51 Å
总原子数 total_atoms8411
残基数 n_residues1108
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax103.8 Å
Rg (实空间) rg_real34.09 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.65 Å
I(0) (实空间) i0_real2.3040e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.3780e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal34.15 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal230400000.0000
解质量估计 total_estimate0.9016
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary33.9 Å
偏度 Skewness skewness0.129
峰度 Kurtosis kurtosis-0.758
角度范围 angular_range— – 0.2300 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha55640000.0000
实空间数据点数 n_real_points47
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.966; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.818
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)