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7qc7

HisF-C9A-D11E-V33A_L50H_I52H mutant (apo) from T. maritima

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 56.5 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF

Thermotoga maritima (strain ATCC 43589 / DSM 3109 / JCM 10099 / NBRC 100826 / MSB8)

UniProt Q9X0C6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 2–253 突变：C9A, D11E, V33A, L50H, I52H MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；292 K；100 mM TRIS, 23% PEG 3350 分辨率 1.60 Å R-free 0.159

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 7QC7 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1GPW Structural evidence for ammonia tunneling across the (beta/alpha)8 barrel of the imidazole glycerol phosphate synthase bienzyme complex. 提交 2001-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–253（253 aa）
突变：YES PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；PROTEIN SOLUTION: 10 MM TRIS (PH 8.0), 1 MM DTT, 1 MM EDTA, 28.8 MG/ML PROTEIN COMPLEX. PRECIPITATE SOLUTION: 15 %[W/V] PEG-8000, 0.9 M AMMONIUM NITRATE, 0.1 M HEPES/HCL (PH 8.5), 10 MM DTT, 5% [V/V] MPD
分辨率 2.40 Å R-free 0.290
1GPW Structural evidence for ammonia tunneling across the (beta/alpha)8 barrel of the imidazole glycerol phosphate synthase bienzyme complex. 提交 2001-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–253（253 aa）
突变：YES PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；PROTEIN SOLUTION: 10 MM TRIS (PH 8.0), 1 MM DTT, 1 MM EDTA, 28.8 MG/ML PROTEIN COMPLEX. PRECIPITATE SOLUTION: 15 %[W/V] PEG-8000, 0.9 M AMMONIUM NITRATE, 0.1 M HEPES/HCL (PH 8.5), 10 MM DTT, 5% [V/V] MPD
分辨率 2.40 Å R-free 0.290
1GPW Structural evidence for ammonia tunneling across the (beta/alpha)8 barrel of the imidazole glycerol phosphate synthase bienzyme complex. 提交 2001-11-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–253（253 aa）
突变：YES PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；PROTEIN SOLUTION: 10 MM TRIS (PH 8.0), 1 MM DTT, 1 MM EDTA, 28.8 MG/ML PROTEIN COMPLEX. PRECIPITATE SOLUTION: 15 %[W/V] PEG-8000, 0.9 M AMMONIUM NITRATE, 0.1 M HEPES/HCL (PH 8.5), 10 MM DTT, 5% [V/V] MPD
分辨率 2.40 Å R-free 0.290
1THF CYCLASE SUBUNIT OF IMIDAZOLEGLYCEROLPHOSPHATE SYNTHASE FROM THERMOTOGA MARITIMA 提交 1998-09-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–253（253 aa） 片段：CYCLASE SUBUNIT
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.8；pH 4.80
分辨率 1.45 Å R-free 0.214
1VH7 Crystal structure of a cyclase subunit of imidazolglycerolphosphate synthase 提交 2003-12-01 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–253（252 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.224
2A0N Crystal structure of Imidazole glycerol phosphate synthase subunit hisF (EC 4.1.3.-) (tm1036) from Thermotoga maritima at 1.64 A resolution 提交 2005-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–253（253 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 1 UNL UNKNOWN LIGAND × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, NANODROP；pH 6.9；273 K；0.2None Nal, 20.0% PEG-3350, No Buffer, pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, NANODROP, temperature 273K
分辨率 1.64 Å R-free 0.192
2LLE Computational design of an eight-stranded (beta/alpha)-barrel from fragments of different folds 提交 2011-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 103–247（145 aa）
突变：R4I, D78G, I95L, L201A,V213G 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；313 K；离子强度（mmCIF原始值）350；压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 15N] CheYHisF-sfr_RM, 50 mM potassium phosphate, 300 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] CheYHisF-sfr_RM, 50 mM potassium phosphate, 300 mM potassium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2W6R Crystal structure of an artificial (ba)8-barrel protein designed from identical half barrels 提交 2008-12-18 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 123–245（123 aa） 片段：RESIDUES 123-245 AND 123-253
链 A 123–253（131 aa） 片段：RESIDUES 123-245 AND 123-253
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；0.1 M TRIS-HCL PH 8.0, 12% W/V PEG 8000
分辨率 2.10 Å R-free 0.285
2WJZ Crystal structure of (HisH) K181A Y138A mutant of imidazoleglycerolphosphate synthase (HisH HisF) which displays constitutive glutaminase activity 提交 2009-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–253（253 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；PEG8K 10-12%, 100 MM HEPES PH = 8.5 22.5MM NH4NO3 / NH4AC 5% (V/V) MPD 10 MM DTT 20 MM L-GLN PROT. CONC.= 12 MG/ML
分辨率 2.60 Å R-free 0.218
2WJZ Crystal structure of (HisH) K181A Y138A mutant of imidazoleglycerolphosphate synthase (HisH HisF) which displays constitutive glutaminase activity 提交 2009-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–253（253 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；PEG8K 10-12%, 100 MM HEPES PH = 8.5 22.5MM NH4NO3 / NH4AC 5% (V/V) MPD 10 MM DTT 20 MM L-GLN PROT. CONC.= 12 MG/ML
分辨率 2.60 Å R-free 0.218
2WJZ Crystal structure of (HisH) K181A Y138A mutant of imidazoleglycerolphosphate synthase (HisH HisF) which displays constitutive glutaminase activity 提交 2009-06-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–253（253 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；PEG8K 10-12%, 100 MM HEPES PH = 8.5 22.5MM NH4NO3 / NH4AC 5% (V/V) MPD 10 MM DTT 20 MM L-GLN PROT. CONC.= 12 MG/ML
分辨率 2.60 Å R-free 0.218
3OG3 Crystal structure of an artificial thermostable (BA)8-barrel protein from identical half barrels 提交 2010-08-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 123–219（97 aa）
链 A 99–219（121 aa）
链 A 99–122（24 aa）
突变：A3R, Y22H, Y143H 突变：A3R, Y22H, Y143H 突变：A3R, Y22H, Y143H SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.2 M ammonium sulfate, 18% PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.08 Å R-free 0.196
3ZR4 STRUCTURAL EVIDENCE FOR AMMONIA TUNNELING ACROSS THE (BETA-ALPHA)8 BARREL OF THE IMIDAZOLE GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE BIENZYME COMPLEX 提交 2011-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–253（253 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 GLN GLUTAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.41 Å R-free 0.258
3ZR4 STRUCTURAL EVIDENCE FOR AMMONIA TUNNELING ACROSS THE (BETA-ALPHA)8 BARREL OF THE IMIDAZOLE GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE BIENZYME COMPLEX 提交 2011-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–253（253 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 GLN GLUTAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.41 Å R-free 0.258
3ZR4 STRUCTURAL EVIDENCE FOR AMMONIA TUNNELING ACROSS THE (BETA-ALPHA)8 BARREL OF THE IMIDAZOLE GLYCEROL PHOSPHATE SYNTHASE BIENZYME COMPLEX 提交 2011-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–253（253 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.41 Å R-free 0.258
4EWN Structure of HisF-D130V+D176V with bound rCdRP 提交 2012-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–253（253 aa）
突变：D130V-D176V 0VR 1-(O-carboxy-phenylamino)-1-deoxy-D-ribulose-5-phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.236
4FX7 Structure of Sym2 D9V+D55V+D130V+D176V 提交 2012-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 123–219（97 aa）
链 A 99–219（121 aa）
链 A 99–122（24 aa）
突变：A3R, D9V, Y22H, D55V, D130V, Y143H, D176V 突变：A3R, D9V, Y22H, D55V, D130V, Y143H, D176V 突变：A3R, D9V, Y22H, D55V, D130V, Y143H, D176V PI HYDROGENPHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.08 Å R-free 0.233
4FX7 Structure of Sym2 D9V+D55V+D130V+D176V 提交 2012-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 123–219（97 aa）
链 B 99–219（121 aa）
链 B 99–122（24 aa）
突变：A3R, D9V, Y22H, D55V, D130V, Y143H, D176V 突变：A3R, D9V, Y22H, D55V, D130V, Y143H, D176V 突变：A3R, D9V, Y22H, D55V, D130V, Y143H, D176V PI HYDROGENPHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.08 Å R-free 0.233
4FX7 Structure of Sym2 D9V+D55V+D130V+D176V 提交 2012-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 123–219（97 aa）
链 C 99–219（121 aa）
链 C 99–122（24 aa）
突变：A3R, D9V, Y22H, D55V, D130V, Y143H, D176V 突变：A3R, D9V, Y22H, D55V, D130V, Y143H, D176V 突变：A3R, D9V, Y22H, D55V, D130V, Y143H, D176V PI HYDROGENPHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.08 Å R-free 0.233
4FX7 Structure of Sym2 D9V+D55V+D130V+D176V 提交 2012-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 123–219（97 aa）
链 D 99–219（121 aa）
链 D 99–122（24 aa）
突变：A3R, D9V, Y22H, D55V, D130V, Y143H, D176V 突变：A3R, D9V, Y22H, D55V, D130V, Y143H, D176V 突变：A3R, D9V, Y22H, D55V, D130V, Y143H, D176V PI HYDROGENPHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.08 Å R-free 0.233
4J9J Structure of designed HisF 提交 2013-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 97–216（120 aa） 片段：SEE REMARK 999
链 A 96–220（125 aa） 片段：SEE REMARK 999
突变：S6I,V45A,T76A,D81G,D156G,D202V 突变：S6I,V45A,T76A,D81G,D156G,D202V 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.30 Å R-free 0.297
5TQL Crystal structure of TIM-Barrel protein HisF-C9S 提交 2016-10-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–253（252 aa）
突变：C9S PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Tris, pH 7.5, 25% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.220
5TQL Crystal structure of TIM-Barrel protein HisF-C9S 提交 2016-10-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–253（252 aa）
突变：C9S PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M Tris, pH 7.5, 25% PEG 3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.220
6RTZ Light-Regulation of Imidazole Glycerol Phosphate Synthase by Interference with its Allosteric Machinery through Photo-Sensitive Unnatural Amino Acids 提交 2019-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–253（253 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG
分辨率 2.87 Å R-free 0.336
6RU0 Light-Regulation of Imidazole Glycerol Phosphate Synthase by Interference with its Allosteric Machinery through Photo-Sensitive Unnatural Amino Acids 提交 2019-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–253（253 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG
分辨率 2.65 Å R-free 0.272
6RU0 Light-Regulation of Imidazole Glycerol Phosphate Synthase by Interference with its Allosteric Machinery through Photo-Sensitive Unnatural Amino Acids 提交 2019-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–253（253 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG
分辨率 2.65 Å R-free 0.272
6RU0 Light-Regulation of Imidazole Glycerol Phosphate Synthase by Interference with its Allosteric Machinery through Photo-Sensitive Unnatural Amino Acids 提交 2019-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–253（253 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG
分辨率 2.65 Å R-free 0.272
6VDG Crystal Structure of the Y182A HisF Mutant from Thermotoga maritima 提交 2019-12-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–253（253 aa）
突变：Y182A PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291.15 K；23% PEG 3350, 20mM Potassium Phosphate
分辨率 2.79 Å R-free 0.263
6YMU Imidazole Glycerol Phosphate Synthase 提交 2020-04-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–253（253 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；PEG
分辨率 2.11 Å R-free 0.250
6YMU Imidazole Glycerol Phosphate Synthase 提交 2020-04-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–253（253 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；PEG
分辨率 2.11 Å R-free 0.250
6YMU Imidazole Glycerol Phosphate Synthase 提交 2020-04-09 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 1–253（253 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；PEG
分辨率 2.11 Å R-free 0.250
7AC8 Molecular basis for the unique allosteric activation mechanism of the heterodimeric imidazole glycerol phosphate synthase complex. 提交 2020-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–253（253 aa）
未记录 GUO [(2R,3S,4R,5R)-5-[4-aminocarbonyl-5-[(E)-[[(2R,3R,4S,5R)-3,4-bis(oxidanyl)-5-(phosphonooxymethyl)oxolan-2-yl]amino]methylideneamino]imidazol-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 GLN GLUTAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；Pentaerythritol (5/4 PO/OH), sodium thiocyanate, HEPES, L-glutamine, ProFAR
分辨率 2.06 Å R-free 0.186
7AC8 Molecular basis for the unique allosteric activation mechanism of the heterodimeric imidazole glycerol phosphate synthase complex. 提交 2020-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–253（253 aa）
未记录 GLN GLUTAMINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；Pentaerythritol (5/4 PO/OH), sodium thiocyanate, HEPES, L-glutamine, ProFAR
分辨率 2.06 Å R-free 0.186
7AC8 Molecular basis for the unique allosteric activation mechanism of the heterodimeric imidazole glycerol phosphate synthase complex. 提交 2020-09-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–253（253 aa）
未记录 GUO [(2R,3S,4R,5R)-5-[4-aminocarbonyl-5-[(E)-[[(2R,3R,4S,5R)-3,4-bis(oxidanyl)-5-(phosphonooxymethyl)oxolan-2-yl]amino]methylideneamino]imidazol-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 GLN GLUTAMINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；Pentaerythritol (5/4 PO/OH), sodium thiocyanate, HEPES, L-glutamine, ProFAR
分辨率 2.06 Å R-free 0.186
7QC3 HisF from T. maritima 提交 2021-11-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–253（252 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；292 K；100 mM TRIS, 23% PEG 3350
分辨率 1.65 Å R-free 0.157
7QC6 HisF_C9A_L50H_I52H mutant (apo) from T. maritima 提交 2021-11-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–253（252 aa）
突变：C9A, L50H, I52H DTT 2,3-DIHYDROXY-1,4-DITHIOBUTANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；292 K；100 mM TRIS, 23% PEG 3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.216
7QC8 HisF-C9A-D11E-V33A_L50H_I52H mutant in complex with Zn(II) from T. maritima 提交 2021-11-22 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–253（252 aa）
突变：C9A, D11E, V33A, L50H, I52H ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；292 K；100 mM TRIS, 23% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.159
7QC9 HisF-C9A-D11E-V33A_L50H_I52H mutant in complex with Ni(II) from T. maritima 提交 2021-11-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–253（252 aa）
突变：C9A, D11E, L50H, I52H NI NICKEL (II) ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.3；292 K；100 mM TRIS, 23% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.189
8S8R An induced-fit motion of a mobile loop 提交 2024-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–253（253 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；ammonium phosphate
分辨率 1.20 Å R-free 0.208
8S8S An induced-fit motion of a mobile loop 提交 2024-03-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–251（250 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；ammonium phosphate
分辨率 1.31 Å R-free 0.209

共 24 个其他 PDB 条目、40 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HIS6_THEMA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 2–253； UniProt 2–253

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7qc7

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7qc7
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7qc7
沉积日期 deposition_date2021-11-22
结构标题 titleHisF-C9A-D11E-V33A_L50H_I52H mutant (apo) from T. maritima
关键词 keywordsBETA BARREL, ARTIFICIAL METALLOENZYME, PROTEIN DESIGN, OXIDOREDUCTASE, METAL BINDING PROTEIN; METAL BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier18.66 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron17.42 Å
零角强度 I(0) i012950600.00
分子量 molecular_weight27461.0 kDa
排除体积 excluded_volume34648 ų
包络体积 envelope_volume39132 ų
水化壳体积 shell_volume18496 ų
包络直径 envelope_diameter56.1 Å
壳层 Rg shell_rg23.88 Å
包络 Rg envelope_rg17.56 Å
形状 Rg shape_rg17.41 Å
总 Rg total_rg18.45 Å
总原子数 total_atoms1935
残基数 n_residues249
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax56.5 Å
Rg (实空间) rg_real18.52 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.26 Å
I(0) (实空间) i0_real1.2950e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.6360e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal18.55 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal12950000.0000
解质量估计 total_estimate0.9038
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary24.0 Å
偏度 Skewness skewness0.081
峰度 Kurtosis kurtosis-0.509
角度范围 angular_range— – 0.4250 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha3370000.0000
实空间数据点数 n_real_points74
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.926; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.981; Smooth: 0.986
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)