Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 单体 | 蛋白 1 RNA 1 | ;RNA (5'-R(*AP*UP*CP*CP*AP*A)-3') ; × 1 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | NOP3_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–88； UniProt 114–201 |
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| 条目编号 entry_id | 7qdd |
| 沉积日期 deposition_date | 2021-11-26 |
| 结构标题 title | NMR structure of Npl3 RRM1 bound to the AUCCAA RNA |
| 关键词 keywords | splicing, U2 snRNA, RRM, split-iCRAC, yeast, protein-RNA complex, RNA BINDING PROTEIN; RNA BINDING PROTEIN |
| 实验方法 method | SOLUTION NMR |
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Assembly 1 · Model 9 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 14.48 Å |
| Rg（电子密度） | 12.92 Å |
| 总 Rg | 14.24 Å |
| 原子数 | 1606 |
| 残基数 | 94 |
| 排除体积 | 14475 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 7qdd__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 2 | 7qdd__assembly_1__model_2 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 3 | 7qdd__assembly_1__model_3 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 4 | 7qdd__assembly_1__model_4 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 5 | 7qdd__assembly_1__model_5 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 6 | 7qdd__assembly_1__model_6 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 7 | 7qdd__assembly_1__model_7 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 8 | 7qdd__assembly_1__model_8 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 9 | 7qdd__assembly_1__model_9 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 1 | 10 | 7qdd__assembly_1__model_10 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 结构域编号 domain_id | 7qddB01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 330 — RRM (RNA recognition motif) domain |