SAXSdb — 7qqn

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gamma-1-syntrophin,Annexin A2

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2	Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3 × 1 （Q8NET8） CALCIUM ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 2	Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3 × 1 （Q8NET8） CALCIUM ION × 5 GLYCEROL × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ANXA2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 97–414； UniProt 22–339 作者链 C； PDB构建体 97–414； UniProt 22–339

Gamma-1-syntrophin,Annexin A2

Homo sapiens

UniProt Q9NSN8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2	Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3 × 1 （Q8NET8） CALCIUM ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 2	Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3 × 1 （Q8NET8） CALCIUM ION × 5 GLYCEROL × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SNTG1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 6–95； UniProt 54–143 作者链 C； PDB构建体 6–95； UniProt 54–143

Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3

物种未注明

UniProt Q8NET8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 2	Gamma-1-syntrophin,Annexin A2 × 1 （P07355,Q9NSN8） CALCIUM ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	异源复合物	蛋白 2	Gamma-1-syntrophin,Annexin A2 × 1 （P07355,Q9NSN8） CALCIUM ION × 5 GLYCEROL × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRPV3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–10； UniProt 781–790 作者链 D； PDB构建体 1–10； UniProt 781–790

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7qqn
沉积日期 deposition_date	2022-01-10
结构标题 title	The PDZ domain of SNTG1 complexed with the acetylated PDZ-binding motif of TRPV3
关键词 keywords	PDZ, linear motif, crystallization chaperone, PEPTIDE BINDING PROTEIN; PEPTIDE BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7qqn__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7qqn__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7qqn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.41 Å
Rg（电子密度）	25.64 Å
总 Rg	26.40 Å
原子数	3317
残基数	418
排除体积	59306 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7qqn__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`7qqn__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Gamma-1-syntrophin,Annexin A2
分子量 formula_weight	46770.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	6870

GSHMGGERTVTIRRQTVGGFGLSIKGGAEHNIPVVVSKISKEQRAELSGLLFIGDAILQINGINVRKCRHEEVVQVLRNAGEEVTLTVSFLKRAPGSAYGSVKAYTNFDAERDALNIETAIKTKGVDEVTIVNILTNRSNEQRQDIAFAYQRRTKKELASALKSALSGHLETVILGLLKTPAQYDASELKASMKGLGTDEDSLIEIICSRTNQELQEINRVYKEMYKTDLEKDIISDTSGDFRKLMVALAKGRRAEDGSVIDYELIDQDARDLYDAGVKRKGTDVPKWISIMTERSVPHLQKVFDRYKSYSPYDMLESIRKEVKGDLENAFLNLVQCIQNKPLYFADRLYDSMKGKGTRDKVLIRIMVSRSEVDMLKIRSEFKRKYGKSLYYYIQQDTKGDYQKALLYLCGGDD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3
分子量 formula_weight	1165.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

EVEEFPETSV

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	214

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id	7qqnA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	42 — Pdz3 Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — PDZ domain

结构域编号 domain_id	7qqnA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	220 — Annexin V; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Annexin

结构域编号 domain_id	7qqnA03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	220 — Annexin V; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Annexin

结构域编号 domain_id	7qqnA04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	220 — Annexin V; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Annexin

结构域编号 domain_id	7qqnA05
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	220 — Annexin V; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Annexin

结构域编号 domain_id	7qqnC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	42 — Pdz3 Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — PDZ domain

结构域编号 domain_id	7qqnC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	220 — Annexin V; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Annexin

结构域编号 domain_id	7qqnC03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	220 — Annexin V; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Annexin

结构域编号 domain_id	7qqnC04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	220 — Annexin V; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Annexin

结构域编号 domain_id	7qqnC05
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	220 — Annexin V; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Annexin

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晶胞边长 a length_a	59.830 Å
晶胞边长 b length_b	132.440 Å
晶胞边长 c length_c	63.660 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	100.77 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.450 Å
最低分辨率 resolution_low	45.467 Å
R 因子 r_factor	0.2221
R_work r_work	0.2199
R_free r_free	0.2631

The PDZ domain of SNTG1 complexed with the acetylated PDZ-binding motif of TRPV3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gamma-1-syntrophin,Annexin A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Gamma-1-syntrophin,Annexin A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7qqn__assembly_1__model_1

7qqn__assembly_1__model_1 | I(q)

7qqn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)

The PDZ domain of SNTG1 complexed with the acetylated PDZ-binding motif of TRPV3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gamma-1-syntrophin,Annexin A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Gamma-1-syntrophin,Annexin A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7qqn__assembly_1__model_1

7qqn__assembly_1__model_1 | I(q)

7qqn__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)