SAXSdb — 7r2d

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

EGI

Thermoascus aurantiacus ATCC 26904

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 SULFATE ION × 4 water × 1	与蛋白数一致
2	其他组合	单体	蛋白 1 其他聚合物 1	beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 SULFATE ION × 3 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8TG26_THEAU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–305； UniProt 31–335 作者链 B； PDB构建体 1–305； UniProt 31–335

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7r2d
沉积日期 deposition_date	2022-02-04
结构标题 title	Crystal structure of TaCel5A E133A variant in complex with cellopentaose
关键词 keywords	Glycoside hydrolase, cellulase, GH5_5 family, GH-A clan, Thermoascus aurantiacus, (b/a)8 barrel, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7r2d__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7r2d__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7r2d__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	19.03 Å
Rg（电子密度）	17.74 Å
总 Rg	18.80 Å
原子数	2450
残基数	305
排除体积	43084 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7r2d__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`7r2d__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	EGI
分子量 formula_weight	33671.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.4
突变 mutation	E133A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5900

AKVFQWFGSNESGAEFGSQNLPGVEGKDYIWPDPNTIDTLISKGMNIFRVPFMMERLVPNSMTGSPDPNYLADLIATVNAITQKGAYAVVDPHNYGRYYNSIISSPSDFQTFWKTVASQFASNPLVIFDTNNAYHDMDQTLVLNLNQAAIDGIRSAGATSQYIFVEGNSWTGAWTWTNVNDNMKSLTDPSDKIIYEMHQYLDSDGSGTSATCVSSTIGQERITSATQWLRANGKKGIIGEFAGGANDVCETAITGMLDYMAQNTDVWTGAIWWAAGPWWGDYIFSMEPDNGIAYQQILPILTPYL

来源 Source

来源生物 organism	Thermoascus aurantiacus ATCC 26904
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1133049
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	828.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	838

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晶胞边长 a length_a	75.200 Å
晶胞边长 b length_b	84.940 Å
晶胞边长 c length_c	89.040 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.610 Å
最低分辨率 resolution_low	42.470 Å
R 因子 r_factor	0.1526
R_work r_work	0.1509
R_free r_free	0.1857

Crystal structure of TaCel5A E133A variant in complex with cellopentaose

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

EGI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7r2d__assembly_1__model_1

7r2d__assembly_1__model_1 | I(q)

7r2d__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of TaCel5A E133A variant in complex with cellopentaose

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

EGI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7r2d__assembly_1__model_1

7r2d__assembly_1__model_1 | I(q)

7r2d__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 branched

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

7. 引用文献 (1)