SAXSdb — 7rfp

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18,Enhanced green fluorescent protein

Muromegalovirus G4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	DTA-1 (heavy chain) × 2 DTA-1 (light chain) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A7G8ZY66_MUHV1
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 240–482； UniProt 1–243 作者链 B； PDB构建体 240–482； UniProt 1–243

Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18,Enhanced green fluorescent protein

Muromegalovirus G4

UniProt O35714

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 6	DTA-1 (heavy chain) × 2 DTA-1 (light chain) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNR18_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–228； UniProt 1–228 作者链 B； PDB构建体 1–228； UniProt 1–228

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7rfp
沉积日期 deposition_date	2021-07-14
结构标题 title	Mouse GITR (mGITR) with DTA-1 Fab fragment
关键词 keywords	Mouse glucocorticoid-induced tumor necrosis factor receptor, mGITR, TNF receptor, DTA-1, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7rfp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7rfp__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7rfp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	47.37 Å
Rg（电子密度）	48.21 Å
总 Rg	48.02 Å
原子数	5532
残基数	1114
排除体积	89218 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7rfp__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18,Enhanced green fluorescent protein
分子量 formula_weight	54848.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5532

MGAWAMLYGVSMLCVLDLGQPSVVEEPGCGPGKVQNGSGNNTRCCSLYAPGKEDCPKERCICVTPEYHCGDPQCKICKHYPCQPGQRVESQGDIVFGFRCVACAMGTFSAGRDGHCRLWTNCSQFGFLTMFPGNKTHNAVCIPEPLPTEQYGHLTVIFLVMAACIFFLTTVQLGLHIWQLRRQHMCPRETQPFAEVQLSAEDACSFQFPEEERGEQTEEKCHLGGRWPAGLVPRGSAAAMVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLTYGVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNGIKVNFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSKLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLGMDELYKSGLRHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Muromegalovirus G4
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	524650
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DTA-1 (heavy chain)
分子量 formula_weight	51014.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,I

MGWSCIILFLVATATGVHSELQLVESGGGLVQPGRSLKLSCSASGFIFSNSYMAWVRQAPKKGLEWVATINPSGSRTYYPDSVKGRFTISRDTAKSSLYLQMNSLKSEDTATYYCARHDLSFDYWGQGVMVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DTA-1 (light chain)
分子量 formula_weight	26320.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,M

MGWSCIILFLVATATGVHSQFTLTQPKSVSGSLRSTITIPCDRSSGGIRDSYVSWYQQHLGRPPLNVIYADDQRPSEVSDRFSGSIDSSSNSASLTITNLQMDDEADYFCQSYDSDFDVYIFGGGTKLTVLGQRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

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分辨率 resolution	4.40 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	423425

Mouse GITR (mGITR) with DTA-1 Fab fragment

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18,Enhanced green fluorescent protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18,Enhanced green fluorescent protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7rfp__assembly_1__model_1

7rfp__assembly_1__model_1 | I(q)

7rfp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Mouse GITR (mGITR) with DTA-1 Fab fragment

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18,Enhanced green fluorescent protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18,Enhanced green fluorescent protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7rfp__assembly_1__model_1

7rfp__assembly_1__model_1 | I(q)

7rfp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)