SAXSdb — 7rpj

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein dispatched homolog 1

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 14	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DISP1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–1352； UniProt 172–1521

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7rpj
沉积日期 deposition_date	2021-08-03
结构标题 title	Cryo-EM structure of murine Dispatched NNN mutant
关键词 keywords	RND transporter, Hedgehog binding, Sterol sensing domain, sodium binding, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7rpj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7rpj__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7rpj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	36.43 Å
Rg（电子密度）	35.59 Å
总 Rg	36.08 Å
原子数	7918
残基数	926
排除体积	145330 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7rpj__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Protein dispatched homolog 1
分子量 formula_weight	152068.2 kDa
突变 mutation	D402N, D403N, D880N
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	7926

MARPFKFPRSYAALLADWPVVVLGMCTLLIVVCALVGVLVPELPDFSDPLLGFEPRGTTIGQRLVTWNNMMRNTGYKATLANYPYKYAEEQARSHRDDRWSDDHHERERREVDWNFQKDSFFCDVPSDGYSRVVFASAGGETLWNLPAIKSMCDVDNSRIRSHPQFSDLCQRTTAVSCCPSWTLGNYIAILNNRSSCQKIVERDVSHTLKLLRTCAKHYQNGTLGPDCWDKAARRKDQLKCTNVPRKCTKYNAVYQILHYLVDKDFMTPKTADYAVPALKYSMLFSPTEKGESMMNIYLDNFENWNSSDGITTVTGIEFGIKHSLFQDYLLMDTVYPAIAIAIVLLIMCVYTKSMFITLMTMFAIISSLIVSYFLYRVVFNFEFFPFMNLTALIILVGIGANNAFVLCDVWNYTKFDKPRAETSEAVSVTLQHAALSMFVTSFTTAAAFYANYVSNITAIRCFGVYAGTAILVNYVLMVTWLPAVIVLHERYLLNIFTCFRKPQPQAYDKSCWAVLCQKCRRVLFAVSEASRIFFEKVLPCIVIKFRYLWLIWFLALTVGGAYIVCVNPKMKLPSLELSEFQVFRSSHPFERYDAEFKKLFMFERVHHGEELHMPITVIWGVSPEDSGDPLNPKSKGELTLDSTFNIASPASQAWILHFCQKLRNQTFFHQTEQQDFTSCFIETFKQWMENQDCDEPALYPCCSHCSFPYKQEVFELCIKKAIMELDRSTGYHLNNKTPGPRFDINDTIRAVVLEFQSTFLFTLAYEKMQQFYKEVDSWISHELSSAPEGLSRGWFVSNLEFYDLQDSLSDGTLIAMGLSVAVAFSVMLLTTWNIIISLYAIVSIAGTIFVTVGSLVLLGWELNVLESVTISVAVGLSVNFAVHYGVAYRLAPDPDREGKVIFSLSRMGSAIAMAALTTFVAGAMMMPSTVLAYTQLGTFMMLVMCVSWAFATFFFQCLCRCLGPQGTCGQIPFPTKLQCSPFSHTLSARPGDRGPSKTHAASAYSVDARGQKSQLEHEFYELQPLASHSCTSSEKTTYEEPHTCSEFFNGQAKNLRMPVPAAYSSELTKSPSSEPGSALLQSCLEQDTVCHFSLNPRCNCRDAYTHLQYGLPEIHCQQMGDSLCHKCASTAGGFVQIQSSVAPLKASHQAAEGLLHPAQHMLPPGMQNSRPRNFFLHSVQHFQAQENLGRTSTHSTDERLPRTAELSPPPSDSRSTESFQRACCHPENNQRRLCKSRDPGDTEGSGGTKSKVSGLPNQTDKEEKQVEPSLLQTDETVNSEHLNHNESNFTFSHLPGEAGCRSCPNSPQSCRSIMRSKCGTEDCQTPNLEANVPAVPTHSDLSGESLLIKTL

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHOLESTEROL HEMISUCCINATE
分子量 formula_weight	486.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

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分辨率 resolution	3.20 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	55982

Cryo-EM structure of murine Dispatched NNN mutant

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein dispatched homolog 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7rpj__assembly_1__model_1

7rpj__assembly_1__model_1 | I(q)

7rpj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of murine Dispatched NNN mutant

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein dispatched homolog 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7rpj__assembly_1__model_1

7rpj__assembly_1__model_1 | I(q)

7rpj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)