Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MAGNESIUM ION × 1 ;4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)naphthalen-2-ol ; × 2 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | RASK-2_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–170； UniProt 1–169 |
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| 条目编号 entry_id | 7rt1 |
| 沉积日期 deposition_date | 2021-08-12 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of KRAS G12D with compound 15 (4-(4-[(1R,5S)-3,8-diazabicyclo[3.2.1]octan-3-yl]-8-fluoro-2-{[(2S)-1-methylpyrrolidin-2-yl]methoxy}pyrido[4,3-d]pyrimidin-7-yl)naphthalen-2-ol) bound |
| 关键词 keywords | Oncoprotein, G12D, GTPase, KRAS, Oncology, KRAS4B, MRTX-1133, HYDROLASE-INHIBITOR complex; HYDROLASE/INHIBITOR |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 16.49 Å |
| Rg（电子密度） | 15.12 Å |
| 总 Rg | 16.22 Å |
| 原子数 | 1443 |
| 残基数 | 169 |
| 排除体积 | 25399 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 7rt1A01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases |