Thiol:disulfide interchange protein DsbA
Escherichia coli (strain K12)
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 20–208 | 未记录 | 648 1-[3-(thiophen-3-yl)benzyl]piperidin-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate | 分辨率 1.59 Å R-free 0.194 |
| 2 | 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 | 链 B; UniProt 20–208 | 未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate | 分辨率 1.59 Å R-free 0.194 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 7S1D | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2B3S structure of the DSBA mutant (P31G-C33A) 提交 2005-09-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
片段:enzyme DsbA
|
突变:P31G , C33A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;PEG 400, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K, pH 7.50
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.257 |
| 2B3S structure of the DSBA mutant (P31G-C33A) 提交 2005-09-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
片段:enzyme DsbA
|
突变:P31G , C33A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;PEG 400, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K, pH 7.50
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.257 |
| 2B3S structure of the DSBA mutant (P31G-C33A) 提交 2005-09-21 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
20–208(189 aa)
片段:enzyme DsbA
链 B
20–208(189 aa)
片段:enzyme DsbA
|
突变:P31G , C33A 突变:P31G , C33A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;PEG 400, Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K, pH 7.50
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.257 |
| 2B6M Structure of the DsbA mutant (P31A-C33A) 提交 2005-10-03 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:P31A, C33A | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.2;293 K;PEG 3350, ammonium phosphate, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.258 |
| 2B6M Structure of the DsbA mutant (P31A-C33A) 提交 2005-10-03 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
突变:P31A, C33A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.2;293 K;PEG 3350, ammonium phosphate, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.65 Å R-free 0.258 |
| 2HI7 Crystal structure of DsbA-DsbB-ubiquinone complex 提交 2006-06-29 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:C33A | ZN ZINC ION × 1 UQ1 UBIQUINONE-1 × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;JeffamimeED2001, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.362 |
| 2HI7 Crystal structure of DsbA-DsbB-ubiquinone complex 提交 2006-06-29 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:C33A | ZN ZINC ION × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;293 K;JeffamimeED2001, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.362 |
| 2LEG Membrane protein complex DsbB-DsbA structure by joint calculations with solid-state NMR and X-ray experimental data 提交 2011-06-15 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:C33A | ZN ZINC ION × 1 UQ1 UBIQUINONE-1 × 1 |
SOLID-STATE NMR
NMR测量条件
pH 7;270 K;压力 ambient
NMR测量条件
pH 7.8;261 K;压力 ambient
NMR样品组成
15 mg [U-100% 13C; U-100% 15N] DsbA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
10 mg [2-13C-glycerol; U-15N] DsbA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
10 mg [1,3-13C-glycerol; U-15N] DsbA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
7 mg [U-100% 13C; U-100% 15N] DsbB, 2 mg DDM, 7 mg E. coli lipids, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
5 mg [2-13C-glycerol; U-15N] DsbB, 2 mg DDM, 7 mg E. coli lipids, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
4 mg [1,3-13C-glycerol; U-15N] DsbB, 2 mg DDM, 7 mg E. coli lipids, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2NDO Structure of EcDsbA-sulfonamide1 complex 提交 2016-08-22 | 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | SFQ 2-{[(4-iodophenyl)sulfonyl]amino}benzoic acid × 1 |
SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8;300 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8;300 K;离子强度(mmCIF原始值)50;压力 ambient
NMR样品组成
0.35 mM Isotopomer sample Oxidised EcDsbA, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] Oxidised EcDsbA, 1.5 mM Sulfonamide1, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2ZUP Updated crystal structure of DsbB-DsbA complex from E. coli 提交 2008-10-28 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:C33A | ZN ZINC ION × 1 UQ1 UBIQUINONE-1 × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
EVAPORATION;pH 7;293 K;23% Jeffamine ED2001, 80mM HEPES, 14.4% glycerol, 2mM ZnCl2, pH 7.0, EVAPORATION, temperature 293K
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.334 |
| 3E9J Structure of the charge-transfer intermediate of the transmembrane redox catalyst DsbB 提交 2008-08-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
突变:C33A | UQ1 UBIQUINONE-1 × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.9;277 K;23% PEG550 MME, 50 mM Tris pH 8.9, 1.0 M ammonium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.379 |
| 3E9J Structure of the charge-transfer intermediate of the transmembrane redox catalyst DsbB 提交 2008-08-22 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
20–208(189 aa)
|
突变:C33A | UQ1 UBIQUINONE-1 × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.9;277 K;23% PEG550 MME, 50 mM Tris pH 8.9, 1.0 M ammonium formate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 3.70 Å R-free 0.379 |
| 4TKY The complex structure of E. coli DsbA bound to a peptide at the DsbA/DsbB interface 提交 2014-05-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
20–208(189 aa)
片段:UNP residues 20-208
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;Ammonium sulfate, BIS-TRIS, Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.237 |
| 4TKY The complex structure of E. coli DsbA bound to a peptide at the DsbA/DsbB interface 提交 2014-05-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
20–208(189 aa)
片段:UNP residues 20-208
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;Ammonium sulfate, BIS-TRIS, Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.237 |
| 4TKY The complex structure of E. coli DsbA bound to a peptide at the DsbA/DsbB interface 提交 2014-05-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
20–208(189 aa)
片段:UNP residues 20-208
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;Ammonium sulfate, BIS-TRIS, Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.237 |
| 4TKY The complex structure of E. coli DsbA bound to a peptide at the DsbA/DsbB interface 提交 2014-05-28 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
20–208(189 aa)
片段:UNP residues 20-208
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;Ammonium sulfate, BIS-TRIS, Pentaerythritol ethoxylate
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.237 |
| 4ZIJ Crystal structure of E.Coli DsbA in complex with 2-(4-iodophenylsulfonamido) benzoic acid 提交 2015-04-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–207(188 aa)
片段:UNP residues 20-207
|
未记录 | SFQ 2-{[(4-iodophenyl)sulfonyl]amino}benzoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;100-200 mM KBr, 22-27% PEG 2000 MME
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.217 |
| 4ZIJ Crystal structure of E.Coli DsbA in complex with 2-(4-iodophenylsulfonamido) benzoic acid 提交 2015-04-28 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–207(188 aa)
片段:UNP residues 20-207
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;100-200 mM KBr, 22-27% PEG 2000 MME
|
分辨率 1.78 Å R-free 0.217 |
| 6BQX Crystal structure of Escherichia coli DsbA in complex with N-methyl-1-(4-phenoxyphenyl)methanamine 提交 2017-11-29 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | 9AG N-methyl-1-(4-phenoxyphenyl)methanamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.2;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.244 |
| 6BQX Crystal structure of Escherichia coli DsbA in complex with N-methyl-1-(4-phenoxyphenyl)methanamine 提交 2017-11-29 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.2;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.244 |
| 6BR4 Crystal structure of Escherichia coli DsbA in complex with {N}-methyl-1-(3-thiophen-2-ylphenyl)methanamine 提交 2017-11-29 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | 60L ~{N}-methyl-1-(3-thiophen-2-ylphenyl)methanamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.2;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.215 |
| 6BR4 Crystal structure of Escherichia coli DsbA in complex with {N}-methyl-1-(3-thiophen-2-ylphenyl)methanamine 提交 2017-11-29 | 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.2;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.215 |
| 6PBI Crystal Structure of EcDsbA in a complex with purified morpholine 8 提交 2019-06-13 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | O6Y 2-methyl-4-{4-[2-(morpholin-4-yl)-2-oxoethyl]phenoxy}benzonitrile × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;25-35 % PEG MME 2000,
100-300 mM KBr
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.228 |
| 6PBI Crystal Structure of EcDsbA in a complex with purified morpholine 8 提交 2019-06-13 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;25-35 % PEG MME 2000,
100-300 mM KBr
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.228 |
| 6PC9 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with purified methylpiperazinone 6 提交 2019-06-17 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | O7P 2-methyl-4-{4-[2-(4-methyl-3-oxopiperazin-1-yl)-2-oxoethyl]phenoxy}benzonitrile × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;25-35 % PEG MME 2000,
100-300 mM KBr
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.244 |
| 6PC9 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with purified methylpiperazinone 6 提交 2019-06-17 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;25-35 % PEG MME 2000,
100-300 mM KBr
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.244 |
| 6PD7 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with purified morpholine carboxylic acid 7 提交 2019-06-18 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | OAJ (3R)-4-{[4-(4-cyano-3-methylphenoxy)phenyl]acetyl}morpholine-3-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;25-35 % PEG MME 2000,
100-300 mM KBr
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.231 |
| 6PD7 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with purified morpholine carboxylic acid 7 提交 2019-06-18 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;25-35 % PEG MME 2000,
100-300 mM KBr
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.231 |
| 6PDH Crystal Structure of EcDsbA in a complex with purified pyrazole 9 提交 2019-06-19 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | OAV 2-[4-(4-cyano-3-methylphenoxy)phenyl]-N-ethyl-N-[2-(1H-pyrazol-1-yl)ethyl]acetamide × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;25-35 % PEG MME 2000,
100-300 mM KBr
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.245 |
| 6PDH Crystal Structure of EcDsbA in a complex with purified pyrazole 9 提交 2019-06-19 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293.15 K;25-35 % PEG MME 2000,
100-300 mM KBr
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.245 |
| 6PG1 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with unpurified reaction product F1 (methylpiperazinone 6) 提交 2019-06-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | O7P 2-methyl-4-{4-[2-(4-methyl-3-oxopiperazin-1-yl)-2-oxoethyl]phenoxy}benzonitrile × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.264 |
| 6PG1 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with unpurified reaction product F1 (methylpiperazinone 6) 提交 2019-06-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.264 |
| 6PG2 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with unpurified reaction product H5 (morpholine 8) 提交 2019-06-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | O6Y 2-methyl-4-{4-[2-(morpholin-4-yl)-2-oxoethyl]phenoxy}benzonitrile × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.223 |
| 6PG2 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with unpurified reaction product H5 (morpholine 8) 提交 2019-06-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.223 |
| 6PGJ Crystal Structure of EcDsbA in a complex with unpurified reaction product A5 (Morpholine carboxylic acid 7) 提交 2019-06-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | OMJ (3S)-4-{[4-(4-cyano-3-methylphenoxy)phenyl]acetyl}morpholine-3-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.226 |
| 6PGJ Crystal Structure of EcDsbA in a complex with unpurified reaction product A5 (Morpholine carboxylic acid 7) 提交 2019-06-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 OAJ (3R)-4-{[4-(4-cyano-3-methylphenoxy)phenyl]acetyl}morpholine-3-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.226 |
| 6PIQ Crystal Structure of EcDsbA in a complex with unpurified reaction product G6 (pyrazole 9) 提交 2019-06-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | OAV 2-[4-(4-cyano-3-methylphenoxy)phenyl]-N-ethyl-N-[2-(1H-pyrazol-1-yl)ethyl]acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.267 |
| 6PIQ Crystal Structure of EcDsbA in a complex with unpurified reaction product G6 (pyrazole 9) 提交 2019-06-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.267 |
| 6PLI Crystal Structure of EcDsbA in a complex with purified oxadiazole 11 提交 2019-07-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | ONY 2-[4-(4-cyano-3-methylphenoxy)phenyl]-N-methyl-N-[2-(5-methyl-1,2,4-oxadiazol-3-yl)ethyl]acetamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.228 |
| 6PLI Crystal Structure of EcDsbA in a complex with purified oxadiazole 11 提交 2019-07-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.228 |
| 6PMF Crystal Structure of EcDsbA in complex with aniline 15 提交 2019-07-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | LD9 [6-(phenylamino)-1-benzofuran-3-yl]acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.227 |
| 6PMF Crystal Structure of EcDsbA in complex with aniline 15 提交 2019-07-01 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.227 |
| 6PML Crystal Structure of EcDsbA in complex benzyl ether 23 提交 2019-07-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 OR4 [6-(benzyloxy)-1-benzofuran-3-yl]acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.221 |
| 6PML Crystal Structure of EcDsbA in complex benzyl ether 23 提交 2019-07-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.221 |
| 6POH Crystal Structure of EcDsbA in complex alkyl ether 21 提交 2019-07-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | OVG (6-butoxy-1-benzofuran-3-yl)acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.189 |
| 6POH Crystal Structure of EcDsbA in complex alkyl ether 21 提交 2019-07-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.67 Å R-free 0.189 |
| 6POI Crystal Structure of EcDsbA in complex phenyl ether 25 提交 2019-07-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | OVS (6-phenoxy-1-benzofuran-3-yl)acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.206 |
| 6POI Crystal Structure of EcDsbA in complex phenyl ether 25 提交 2019-07-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.206 |
| 6POQ Crystal Structure of EcDsbA in complex with anisidine 16 提交 2019-07-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | OVJ {6-[(4-methoxyphenyl)amino]-1-benzofuran-3-yl}acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.201 |
| 6POQ Crystal Structure of EcDsbA in complex with anisidine 16 提交 2019-07-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.201 |
| 6PVY E.coli DsbA in complex with benzofuran compound 26 ([6-(3-methoxyphenoxy)-1-benzofuran-3-yl]acetic acid) 提交 2019-07-21 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | OZG [6-(3-methoxyphenoxy)-1-benzofuran-3-yl]acetic acid × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.225 |
| 6PVY E.coli DsbA in complex with benzofuran compound 26 ([6-(3-methoxyphenoxy)-1-benzofuran-3-yl]acetic acid) 提交 2019-07-21 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.225 |
| 6PVZ E.coli DsbA in complex with benzofuran compound 28 ((6-benzyl-1-benzofuran-3-yl)acetic acid) 提交 2019-07-21 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | OZM (6-benzyl-1-benzofuran-3-yl)acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.200 |
| 6PVZ E.coli DsbA in complex with benzofuran compound 28 ((6-benzyl-1-benzofuran-3-yl)acetic acid) 提交 2019-07-21 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.200 |
| 6WHD Crystal structure of E.coli DsbA in complex with diaryl ether analogue 2 提交 2020-04-08 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | KFS [4-(4-cyano-3-methylphenoxy)phenyl]acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293 K;11-13% PEG8000, 5-7.5% glycerol, 1mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.221 |
| 6WHD Crystal structure of E.coli DsbA in complex with diaryl ether analogue 2 提交 2020-04-08 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | KFS [4-(4-cyano-3-methylphenoxy)phenyl]acetic acid × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293 K;11-13% PEG8000, 5-7.5% glycerol, 1mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.221 |
| 6XSP Crystal structure of E.coli DsbA in complex with 2-(2,6-bis(3-methoxyphenyl)benzofuran-3-yl)acetic acid 提交 2020-07-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | VCY [2,6-bis(3-methoxyphenyl)-1-benzofuran-3-yl]acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.246 |
| 6XSP Crystal structure of E.coli DsbA in complex with 2-(2,6-bis(3-methoxyphenyl)benzofuran-3-yl)acetic acid 提交 2020-07-15 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.246 |
| 6XSQ Crystal structure of E.coli DsbA in complex with 2-(6-(3-methoxyphenyl)-2-(4-methoxyphenyl)benzofuran-3-yl)acetic acid 提交 2020-07-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | VE7 [6-(3-methoxyphenyl)-2-(4-methoxyphenyl)-1-benzofuran-3-yl]acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.238 |
| 6XSQ Crystal structure of E.coli DsbA in complex with 2-(6-(3-methoxyphenyl)-2-(4-methoxyphenyl)benzofuran-3-yl)acetic acid 提交 2020-07-16 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.238 |
| 6XT3 Crystal structure of E.coli DsbA in complex with 3-(3-(carboxymethyl)-6-(3-methoxyphenyl)benzofuran-2-yl)benzoic acid 提交 2020-07-17 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | VED 3-[3-(carboxymethyl)-6-(3-methoxyphenyl)-1-benzofuran-2-yl]benzoic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.232 |
| 6XT3 Crystal structure of E.coli DsbA in complex with 3-(3-(carboxymethyl)-6-(3-methoxyphenyl)benzofuran-2-yl)benzoic acid 提交 2020-07-17 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.232 |
| 7L76 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 2-(6-Phenylbenzofuran-3-yl)acetic acid 提交 2020-12-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | XPV (6-phenyl-1-benzofuran-3-yl)acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.224 |
| 7L76 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 2-(6-Phenylbenzofuran-3-yl)acetic acid 提交 2020-12-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.224 |
| 7L7C Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 2-(6-(3-Methoxyphenyl)benzofuran-3-yl)acetic acid 提交 2020-12-28 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | XQ1 [6-(3-methoxyphenyl)-1-benzofuran-3-yl]acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.196 |
| 7L7C Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 2-(6-(3-Methoxyphenyl)benzofuran-3-yl)acetic acid 提交 2020-12-28 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.196 |
| 7LHP Crystal Structure of EcDsbA in a complex with methyl 2-(6-bromo-2-phenylbenzofuran-3-yl)acetate 提交 2021-01-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | Y1G (6-bromo-2-phenyl-1-benzofuran-3-yl)acetic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.225 |
| 7LHP Crystal Structure of EcDsbA in a complex with methyl 2-(6-bromo-2-phenylbenzofuran-3-yl)acetate 提交 2021-01-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 100mM Na Cacodylate pH6.1, 1mM CuCl2
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.225 |
| 7LSM Crystal structure of E.coli DsbA in complex with bile salt taurocholate 提交 2021-02-18 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 TCH TAUROCHOLIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.207 |
| 7S1C Crystal structure of E.coli DsbA in complex with compound MIPS-0001897 (compound 1) 提交 2021-09-02 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | 5VA ~{N}-methyl-1-(3-thiophen-3-ylphenyl)methanamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.2;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.208 |
| 7S1C Crystal structure of E.coli DsbA in complex with compound MIPS-0001897 (compound 1) 提交 2021-09-02 | 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.2;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.208 |
| 7S1F Crystal structure of E.coli DsbA in complex with compound MIPS-0001886 (compound 38) 提交 2021-09-02 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | 5VB 1-[(3-thiophen-3-ylphenyl)methyl]-3~{H}-pyrrol-2-one × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.201 |
| 7S1F Crystal structure of E.coli DsbA in complex with compound MIPS-0001886 (compound 38) 提交 2021-09-02 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.201 |
| 7S1L Crystal structure of E.coli DsbA in complex with compound MIPS-0001896 (compound 72) 提交 2021-09-02 | 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | 62J methyl cis-4-({[3-(thiophen-3-yl)benzyl]amino}methyl)cyclohexanecarboxylate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.190 |
| 7S1L Crystal structure of E.coli DsbA in complex with compound MIPS-0001896 (compound 72) 提交 2021-09-02 | 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.2;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.190 |
| 7TTV E.coli DsbA in complex with 4-phenyl-2-(3-phenylpropyl)thiazole-5-carboxylic acid 提交 2022-02-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | QVP 4-phenyl-2-(3-phenylpropyl)-1,3-thiazole-5-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.227 |
| 7TTV E.coli DsbA in complex with 4-phenyl-2-(3-phenylpropyl)thiazole-5-carboxylic acid 提交 2022-02-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.227 |
| 8CXD Crystal Structure of EcDsbA in a complex with phenylmethanol 提交 2022-05-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 010 phenylmethanol × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.200 |
| 8CXD Crystal Structure of EcDsbA in a complex with phenylmethanol 提交 2022-05-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 010 phenylmethanol × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.200 |
| 8CXE Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 1H-imidazole 提交 2022-05-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | IMD IMIDAZOLE × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.203 |
| 8CXE Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 1H-imidazole 提交 2022-05-20 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | IMD IMIDAZOLE × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.203 |
| 8CZM Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 4-bromo-1H-pyrazole 提交 2022-05-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | BYZ 4-bromo-1H-pyrazole × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.221 |
| 8CZM Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 4-bromo-1H-pyrazole 提交 2022-05-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | BYZ 4-bromo-1H-pyrazole × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.221 |
| 8CZN Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 1H-pyrrole-3-carboxylic acid 提交 2022-05-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | PKN 1H-pyrrole-3-carboxylic acid × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.215 |
| 8CZN Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 1H-pyrrole-3-carboxylic acid 提交 2022-05-25 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | PKN 1H-pyrrole-3-carboxylic acid × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.215 |
| 8D10 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with (1-methyl-1H-pyrazol-5-yl)methanamine 提交 2022-05-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | Q2I 1-(1-methyl-1H-pyrazol-5-yl)methanamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.198 |
| 8D10 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with (1-methyl-1H-pyrazol-5-yl)methanamine 提交 2022-05-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | Q2I 1-(1-methyl-1H-pyrazol-5-yl)methanamine × 2 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.198 |
| 8D11 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 1-methyl-1H-pyrazol-5-amine 提交 2022-05-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | Q2O 1-methyl-1H-pyrazol-5-amine × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.220 |
| 8D11 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 1-methyl-1H-pyrazol-5-amine 提交 2022-05-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | Q2O 1-methyl-1H-pyrazol-5-amine × 3 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.220 |
| 8D12 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 1-methyl-1H-pyrazol-4-amine 提交 2022-05-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | Q3F 1-methyl-1H-pyrazol-4-amine × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.200 |
| 8D12 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with 1-methyl-1H-pyrazol-4-amine 提交 2022-05-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | Q3F 1-methyl-1H-pyrazol-4-amine × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.200 |
| 8DG0 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with Urea 提交 2022-06-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | URE UREA × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.257 |
| 8DG0 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with Urea 提交 2022-06-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | URE UREA × 1 CU COPPER (II) ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.257 |
| 8DG1 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with DMSO 提交 2022-06-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 11 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.221 |
| 8DG1 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with DMSO 提交 2022-06-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 9 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.221 |
| 8DG2 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with DMSO 提交 2022-06-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.222 |
| 8DG2 Crystal Structure of EcDsbA in a complex with DMSO 提交 2022-06-23 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 7 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293.15 K;11-13 % PEG 8000, 5-7.5% GLYCEROL, 100MM NA CACODYLATE PH6.1, 1MM CuCl2
|
分辨率 1.95 Å R-free 0.222 |
| 8DN0 E.coli DsbA in complex with N-(2-fluorophenyl)-5-methylisoxazole-3-carboxamide 提交 2022-07-10 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | SW0 N-(2-fluorophenyl)-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.194 |
| 8DN0 E.coli DsbA in complex with N-(2-fluorophenyl)-5-methylisoxazole-3-carboxamide 提交 2022-07-10 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | SW0 N-(2-fluorophenyl)-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.57 Å R-free 0.194 |
| 8EOC Crystal structure of E.coli DsbA mutant E24A/K58A 提交 2022-10-03 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:E24A, K58A | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.197 |
| 8EOC Crystal structure of E.coli DsbA mutant E24A/K58A 提交 2022-10-03 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
突变:E24A, K58A | GOL GLYCEROL × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.197 |
| 8EQO Crystal structure of E.coli DsbA mutant K58A 提交 2022-10-08 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:K58A | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.184 |
| 8EQO Crystal structure of E.coli DsbA mutant K58A 提交 2022-10-08 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
突变:K58A | GOL GLYCEROL × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.62 Å R-free 0.184 |
| 8EQP Crystal structure of E.coli DsbA mutant E24A/E37A/K58A 提交 2022-10-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:E24A, E37A, K58A | GOL GLYCEROL × 1 FLC CITRATE ANION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15-20% PEG8000, 0.1M phosphate-citrate, pH 3.8-4.4, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.253 |
| 8EQP Crystal structure of E.coli DsbA mutant E24A/E37A/K58A 提交 2022-10-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
突变:E24A, E37A, K58A | GOL GLYCEROL × 1 FLC CITRATE ANION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15-20% PEG8000, 0.1M phosphate-citrate, pH 3.8-4.4, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.253 |
| 8EQP Crystal structure of E.coli DsbA mutant E24A/E37A/K58A 提交 2022-10-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
20–208(189 aa)
|
突变:E24A, E37A, K58A | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15-20% PEG8000, 0.1M phosphate-citrate, pH 3.8-4.4, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.253 |
| 8EQP Crystal structure of E.coli DsbA mutant E24A/E37A/K58A 提交 2022-10-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
20–208(189 aa)
|
突变:E24A, E37A, K58A | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15-20% PEG8000, 0.1M phosphate-citrate, pH 3.8-4.4, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.253 |
| 8EQQ Crystal structure of E.coli DsbA mutant E37A 提交 2022-10-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:E37A | FLC CITRATE ANION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15-20% PEG8000, 0.1M phosphate-citrate, pH 3.8-4.4, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.231 |
| 8EQQ Crystal structure of E.coli DsbA mutant E37A 提交 2022-10-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
突变:E37A | FLC CITRATE ANION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15-20% PEG8000, 0.1M phosphate-citrate, pH 3.8-4.4, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.231 |
| 8EQQ Crystal structure of E.coli DsbA mutant E37A 提交 2022-10-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
20–208(189 aa)
|
突变:E37A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15-20% PEG8000, 0.1M phosphate-citrate, pH 3.8-4.4, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.231 |
| 8EQQ Crystal structure of E.coli DsbA mutant E37A 提交 2022-10-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
20–208(189 aa)
|
突变:E37A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15-20% PEG8000, 0.1M phosphate-citrate, pH 3.8-4.4, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.13 Å R-free 0.231 |
| 8EQR Crystal structure of E.coli DsbA mutant E24A 提交 2022-10-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:E24A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15-20% PEG8000, 0.1M phosphate-citrate, pH 3.8-4.4, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.259 |
| 8EQR Crystal structure of E.coli DsbA mutant E24A 提交 2022-10-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
突变:E24A | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15-20% PEG8000, 0.1M phosphate-citrate, pH 3.8-4.4, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.259 |
| 8EQR Crystal structure of E.coli DsbA mutant E24A 提交 2022-10-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
20–208(189 aa)
|
突变:E24A | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15-20% PEG8000, 0.1M phosphate-citrate, pH 3.8-4.4, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.259 |
| 8EQR Crystal structure of E.coli DsbA mutant E24A 提交 2022-10-09 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
20–208(189 aa)
|
突变:E24A | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;15-20% PEG8000, 0.1M phosphate-citrate, pH 3.8-4.4, 0.2M NaCl
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.259 |
| 8U1Y E.coli DsbA in complex with N-(4-(thiophen-3-yl)benzyl)cyclohexanamine 提交 2023-09-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | 5V9 ~{N}-[(4-thiophen-3-ylphenyl)methyl]cyclohexanamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.202 |
| 8U1Y E.coli DsbA in complex with N-(4-(thiophen-3-yl)benzyl)cyclohexanamine 提交 2023-09-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.74 Å R-free 0.202 |
| 8U59 EcDsbA soaked with N-(2-fluorophenyl)-5-methylisoxazole-3-carboxamide and N-(4-(thiophen-3-yl)benzyl)cyclohexanamine 提交 2023-09-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | 5V9 ~{N}-[(4-thiophen-3-ylphenyl)methyl]cyclohexanamine × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.222 |
| 8U59 EcDsbA soaked with N-(2-fluorophenyl)-5-methylisoxazole-3-carboxamide and N-(4-(thiophen-3-yl)benzyl)cyclohexanamine 提交 2023-09-12 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | SW0 N-(2-fluorophenyl)-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.77 Å R-free 0.222 |
| 8UBQ EcDsbA soaked with N-(2-fluorophenyl)-5-methylisoxazole-3-carboxamide and 2-benzyl-4-phenylthiazole-5-carboxylic acid 提交 2023-09-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | W9H 2-benzyl-4-phenyl-1,3-thiazole-5-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.223 |
| 8UBQ EcDsbA soaked with N-(2-fluorophenyl)-5-methylisoxazole-3-carboxamide and 2-benzyl-4-phenylthiazole-5-carboxylic acid 提交 2023-09-24 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 SW0 N-(2-fluorophenyl)-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.223 |
| 8UF9 EcDsbA in complex with 2-benzyl-4-phenylthiazole-5-carboxylic acid 提交 2023-10-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | W9H 2-benzyl-4-phenyl-1,3-thiazole-5-carboxylic acid × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.234 |
| 8UF9 EcDsbA in complex with 2-benzyl-4-phenylthiazole-5-carboxylic acid 提交 2023-10-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 2.16 Å R-free 0.234 |
| 9NHG E.coli DsbA in complex with N-(2-aminophenyl)-5-methylisoxazole-3-carboxamide 提交 2025-02-24 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
20–208(189 aa)
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | A1BX8 N-(2-aminophenyl)-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 2 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.221 |
| 9NIC E.coli DsbA in complex with N-(2-amino-3-fluorophenyl)-5-methylisoxazole-3-carboxamide 提交 2025-02-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
未记录 | A1BYA N-(2-amino-3-fluorophenyl)-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.236 |
| 9NIC E.coli DsbA in complex with N-(2-amino-3-fluorophenyl)-5-methylisoxazole-3-carboxamide 提交 2025-02-26 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
未记录 | A1BYA N-(2-amino-3-fluorophenyl)-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 CU COPPER (II) ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1 mM copper(II) chloride, 100 mM sodium cacodylate
|
分辨率 1.96 Å R-free 0.236 |
| 9PRE Crystal structure of oxidised E.coli DsbA in complex with propiolic acid 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–207(188 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1CJH 3-{3-[(5-methyl-1,2-oxazole-3-carbonyl)amino]phenyl}prop-2-ynoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1
mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate pH 6.1
|
分辨率 1.68 Å R-free 0.182 |
| 9PRF Crystal structure of E.coli DsbA in-complex with analogue 6 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–207(188 aa)
|
未记录 | A1CQW N-[3-(3-{[(2S)-2-hydroxybutyl]amino}-3-oxoprop-1-yn-1-yl)phenyl]-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1
mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate pH 6.1
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.215 |
| 9PRF Crystal structure of E.coli DsbA in-complex with analogue 6 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–207(188 aa)
|
未记录 | A1CQW N-[3-(3-{[(2S)-2-hydroxybutyl]amino}-3-oxoprop-1-yn-1-yl)phenyl]-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 A1CJJ N-[3-(3-{[(2R)-2-hydroxybutyl]amino}-3-oxoprop-1-yn-1-yl)phenyl]-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1
mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate pH 6.1
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.215 |
| 9PRG Crystal structure of E.coli DsbA in-complex with analogue 7 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–207(188 aa)
|
未记录 | LYS LYSINE × 1 A1CJK N-[3-(3-{[(1S)-2-hydroxy-1-phenylethyl]amino}-3-oxoprop-1-yn-1-yl)phenyl]-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1
mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate pH 6.1
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.218 |
| 9PRG Crystal structure of E.coli DsbA in-complex with analogue 7 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–207(188 aa)
|
未记录 | LYS LYSINE × 1 A1CJK N-[3-(3-{[(1S)-2-hydroxy-1-phenylethyl]amino}-3-oxoprop-1-yn-1-yl)phenyl]-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1
mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate pH 6.1
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.218 |
| 9PRH Crystal structure of E.coli DsbA in-complex with analogue 8 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–207(188 aa)
|
未记录 | A1CJL N-[3-(3-{[(2R)-2,3-dihydroxypropyl]amino}-3-oxoprop-1-yn-1-yl)phenyl]-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1
mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate pH 6.1
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.252 |
| 9PRI Crystal structure of oxidised E.coli DsbA in-complex with analogue 9 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–207(188 aa)
|
未记录 | A1CJM N-[3-(3-{[(2S)-1-hydroxy-3-(1H-imidazol-4-yl)propan-2-yl]amino}-3-oxoprop-1-yn-1-yl)phenyl]-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1
mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate pH 6.1
|
分辨率 1.27 Å R-free 0.194 |
| 9PRJ Crystal structure of E.coli DsbA in-complex with analogue 13 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–207(188 aa)
|
未记录 | A1CJN N-[3-(3-{[(2S)-1-hydroxy-3-phenylpropan-2-yl]amino}-3-oxoprop-1-yn-1-yl)phenyl]-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;11-13% PEG 8000, 5-7.5% glycerol, 1
mM CuCl2, 100 mM sodium cacodylate pH 6.1
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.233 |
| 9PRK Crystal structure of E.coli DsbA in complex with analogue 17 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–207(188 aa)
|
未记录 | A1CJO methyl {2,6-difluoro-4-[(2S)-3-hydroxy-2-(3-{3-[(5-methyl-1,2-oxazole-3-carbonyl)amino]phenyl}prop-2-ynamido)propyl]phenyl}acetate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG 3000, TRIS, sodium chloride
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.235 |
| 9PRK Crystal structure of E.coli DsbA in complex with analogue 17 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–207(188 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;PEG 3000, TRIS, sodium chloride
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.235 |
| 9PRL Crystal structure of E.coli DsbA in complex with analogue 18 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
21–207(187 aa)
|
未记录 | A1CJP methyl {2-chloro-4-[(2S)-3-hydroxy-2-(3-{3-[(5-methyl-1,2-oxazole-3-carbonyl)amino]phenyl}prop-2-ynamido)propyl]phenyl}acetate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Sodium phosphate, Potassium phosphate, Sodium acetate pH 4.5
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.225 |
| 9PRL Crystal structure of E.coli DsbA in complex with analogue 18 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
21–207(187 aa)
|
未记录 | A1CJP methyl {2-chloro-4-[(2S)-3-hydroxy-2-(3-{3-[(5-methyl-1,2-oxazole-3-carbonyl)amino]phenyl}prop-2-ynamido)propyl]phenyl}acetate × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;Sodium phosphate, Potassium phosphate, Sodium acetate pH 4.5
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.225 |
| 9PRM Crystal structure of E.coli DsbA in complex with analogue 20 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
21–207(187 aa)
|
未记录 | A1CJQ N-{3-[3-({(2S)-1-[4-(benzyloxy)-3-fluorophenyl]-3-hydroxypropan-2-yl}amino)-3-oxoprop-1-yn-1-yl]phenyl}-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG 3000, sodium chloride, TRIS
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.221 |
| 9PRM Crystal structure of E.coli DsbA in complex with analogue 20 提交 2025-07-24 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
21–207(187 aa)
|
未记录 | A1CJQ N-{3-[3-({(2S)-1-[4-(benzyloxy)-3-fluorophenyl]-3-hydroxypropan-2-yl}amino)-3-oxoprop-1-yn-1-yl]phenyl}-5-methyl-1,2-oxazole-3-carboxamide × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;PEG 3000, sodium chloride, TRIS
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.221 |
| 9Y0M Crystal structure of Escherichia coli DsbA P151T mutant 提交 2025-08-28 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:P151T | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1 M Ammonium sulphate
25% PEG 8000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.268 |
| 9Y0M Crystal structure of Escherichia coli DsbA P151T mutant 提交 2025-08-28 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
突变:P151T | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1 M Ammonium sulphate
25% PEG 8000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.268 |
| 9Y0M Crystal structure of Escherichia coli DsbA P151T mutant 提交 2025-08-28 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
20–208(189 aa)
|
突变:P151T | PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1 M Ammonium sulphate
25% PEG 8000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.268 |
| 9Y0M Crystal structure of Escherichia coli DsbA P151T mutant 提交 2025-08-28 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 D
20–208(189 aa)
|
突变:P151T | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;1 M Ammonium sulphate
25% PEG 8000
|
分辨率 2.88 Å R-free 0.268 |
| 9Y0N Crystal structure of Escherichia coli DsbA G149K mutant 提交 2025-08-28 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:G149K | GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;293 K;0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6,
2.0M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.243 |
| 9Y0N Crystal structure of Escherichia coli DsbA G149K mutant 提交 2025-08-28 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
突变:G149K | GOL GLYCEROL × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.6;293 K;0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6,
2.0M sodium chloride
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.243 |
| 9Y0O Crystal structure of Escherichia coli DsbA G149T mutant 提交 2025-08-28 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:G149T | GOL GLYCEROL × 9 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Ammonium sulphate, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.225 |
| 9Y0O Crystal structure of Escherichia coli DsbA G149T mutant 提交 2025-08-28 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
20–208(189 aa)
|
突变:G149T | GOL GLYCEROL × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Ammonium sulphate, 30% w/v Polyethylene glycol 4,000
|
分辨率 1.79 Å R-free 0.225 |
| 9Y0P Crystal structure of Escherichia coli DsbA C33A mutant in complex with a peptide derived from LptD - Binding mode I 提交 2025-08-28 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:C33A | GOL GLYCEROL × 1 NO3 NITRATE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Calcium acetate hydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.210 |
| 9Y0P Crystal structure of Escherichia coli DsbA C33A mutant in complex with a peptide derived from LptD - Binding mode I 提交 2025-08-28 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
20–208(189 aa)
|
突变:C33A | GOL GLYCEROL × 1 NO3 NITRATE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Calcium acetate hydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.210 |
| 9Y0Q Crystal structure of Escherichia coli DsbA C33A mutant in complex with a peptide derived from LptD - Binding mode II 提交 2025-08-28 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
20–208(189 aa)
|
突变:C33A | GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M Magnesium nitrate hexahydrate, 20% w/v Polyethylene glycol 3,350
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.213 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | DSBA_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–189; UniProt 20–208 作者链 B; PDB构建体 1–189; UniProt 20–208 |