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7sa7

Crystal structure of the apo SH2 domains of Syk

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 130.3 Å Quality: REASONABLE
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tyrosine-protein kinase SYK

Homo sapiens

UniProt P43405

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 6–269 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Protein- 35mg/mL in 10mM HEPES pH 7.0, 50mM NaCl, 5% glycerol and 1mM TCEP Crystal conditions-0.2M sodium nitrate and 10% w/v PEG 3350 Cryoprotectant-0.2M sodium nitrate, 20% PEG 3350, and 20% glycerol 分辨率 3.20 Å R-free 0.304
2 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 6–269 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Protein- 35mg/mL in 10mM HEPES pH 7.0, 50mM NaCl, 5% glycerol and 1mM TCEP Crystal conditions-0.2M sodium nitrate and 10% w/v PEG 3350 Cryoprotectant-0.2M sodium nitrate, 20% PEG 3350, and 20% glycerol 分辨率 3.20 Å R-free 0.304
3 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 6–269 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Protein- 35mg/mL in 10mM HEPES pH 7.0, 50mM NaCl, 5% glycerol and 1mM TCEP Crystal conditions-0.2M sodium nitrate and 10% w/v PEG 3350 Cryoprotectant-0.2M sodium nitrate, 20% PEG 3350, and 20% glycerol 分辨率 3.20 Å R-free 0.304
4 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 6–269 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Protein- 35mg/mL in 10mM HEPES pH 7.0, 50mM NaCl, 5% glycerol and 1mM TCEP Crystal conditions-0.2M sodium nitrate and 10% w/v PEG 3350 Cryoprotectant-0.2M sodium nitrate, 20% PEG 3350, and 20% glycerol 分辨率 3.20 Å R-free 0.304
5 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 6–269 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Protein- 35mg/mL in 10mM HEPES pH 7.0, 50mM NaCl, 5% glycerol and 1mM TCEP Crystal conditions-0.2M sodium nitrate and 10% w/v PEG 3350 Cryoprotectant-0.2M sodium nitrate, 20% PEG 3350, and 20% glycerol 分辨率 3.20 Å R-free 0.304
6 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白拷贝数一致 链 F； UniProt 6–269 未记录 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Protein- 35mg/mL in 10mM HEPES pH 7.0, 50mM NaCl, 5% glycerol and 1mM TCEP Crystal conditions-0.2M sodium nitrate and 10% w/v PEG 3350 Cryoprotectant-0.2M sodium nitrate, 20% PEG 3350, and 20% glycerol 分辨率 3.20 Å R-free 0.304

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7SA7 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1A81 CRYSTAL STRUCTURE OF THE TANDEM SH2 DOMAIN OF THE SYK KINASE BOUND TO A DUALLY TYROSINE-PHOSPHORYLATED ITAM 提交 1998-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 9–262（254 aa） 片段：TANDEM SH2 DOMAIN
链 I 9–262（254 aa） 片段：TANDEM SH2 DOMAIN
链 K 9–262（254 aa） 片段：TANDEM SH2 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；10% (W/V) PEG800, 10% (V/V) PEG 200, 0.1M TRIS HCL PH 8.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.317
1A81 CRYSTAL STRUCTURE OF THE TANDEM SH2 DOMAIN OF THE SYK KINASE BOUND TO A DUALLY TYROSINE-PHOSPHORYLATED ITAM 提交 1998-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 9–262（254 aa） 片段：TANDEM SH2 DOMAIN
链 C 9–262（254 aa） 片段：TANDEM SH2 DOMAIN
链 E 9–262（254 aa） 片段：TANDEM SH2 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；10% (W/V) PEG800, 10% (V/V) PEG 200, 0.1M TRIS HCL PH 8.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.317
1A81 CRYSTAL STRUCTURE OF THE TANDEM SH2 DOMAIN OF THE SYK KINASE BOUND TO A DUALLY TYROSINE-PHOSPHORYLATED ITAM 提交 1998-03-31 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 9–262（254 aa） 片段：TANDEM SH2 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；10% (W/V) PEG800, 10% (V/V) PEG 200, 0.1M TRIS HCL PH 8.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.317
1A81 CRYSTAL STRUCTURE OF THE TANDEM SH2 DOMAIN OF THE SYK KINASE BOUND TO A DUALLY TYROSINE-PHOSPHORYLATED ITAM 提交 1998-03-31 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 K 9–262（254 aa） 片段：TANDEM SH2 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；10% (W/V) PEG800, 10% (V/V) PEG 200, 0.1M TRIS HCL PH 8.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.317
1A81 CRYSTAL STRUCTURE OF THE TANDEM SH2 DOMAIN OF THE SYK KINASE BOUND TO A DUALLY TYROSINE-PHOSPHORYLATED ITAM 提交 1998-03-31 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 9–262（254 aa） 片段：TANDEM SH2 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；10% (W/V) PEG800, 10% (V/V) PEG 200, 0.1M TRIS HCL PH 8.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.317
1A81 CRYSTAL STRUCTURE OF THE TANDEM SH2 DOMAIN OF THE SYK KINASE BOUND TO A DUALLY TYROSINE-PHOSPHORYLATED ITAM 提交 1998-03-31 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 9–262（254 aa） 片段：TANDEM SH2 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；10% (W/V) PEG800, 10% (V/V) PEG 200, 0.1M TRIS HCL PH 8.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.317
1A81 CRYSTAL STRUCTURE OF THE TANDEM SH2 DOMAIN OF THE SYK KINASE BOUND TO A DUALLY TYROSINE-PHOSPHORYLATED ITAM 提交 1998-03-31 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 I 9–262（254 aa） 片段：TANDEM SH2 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；10% (W/V) PEG800, 10% (V/V) PEG 200, 0.1M TRIS HCL PH 8.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.317
1A81 CRYSTAL STRUCTURE OF THE TANDEM SH2 DOMAIN OF THE SYK KINASE BOUND TO A DUALLY TYROSINE-PHOSPHORYLATED ITAM 提交 1998-03-31 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 9–262（254 aa） 片段：TANDEM SH2 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；10% (W/V) PEG800, 10% (V/V) PEG 200, 0.1M TRIS HCL PH 8.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.317
1CSY SYK TYROSINE KINASE C-TERMINAL SH2 DOMAIN COMPLEXED WITH A PHOSPHOPEPTIDEFROM THE GAMMA CHAIN OF THE HIGH AFFINITY IMMUNOGLOBIN G RECEPTOR, NMR 提交 1995-10-03 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 163–265（103 aa） 片段：C-TERMINAL SH2 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1CSZ SYK TYROSINE KINASE C-TERMINAL SH2 DOMAIN COMPLEXED WITH A PHOSPHOPEPTIDEFROM THE GAMMA CHAIN OF THE HIGH AFFINITY IMMUNOGLOBIN G RECEPTOR, NMR 提交 1995-10-03 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 163–265（103 aa） 片段：C-TERMINAL SH2 DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1XBA Crystal structure of apo syk tyrosine kinase domain 提交 2004-08-30 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 353–635（283 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；15% peg 3350, 100mM Tris HCl (pH 8.5)
分辨率 2.00 Å R-free 0.278
1XBB Crystal structure of the syk tyrosine kinase domain with Gleevec 提交 2004-08-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 353–635（283 aa）
未记录 STI 4-(4-METHYL-PIPERAZIN-1-YLMETHYL)-N-[4-METHYL-3-(4-PYRIDIN-3-YL-PYRIMIDIN-2-YLAMINO)-PHENYL]-BENZAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；15% peg 3350, 100mM Tris HCl (pH 8.5)
分辨率 1.57 Å R-free 0.221
1XBC Crystal structure of the syk tyrosine kinase domain with Staurosporin 提交 2004-08-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 353–635（283 aa）
未记录 STU STAUROSPORINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.5；15% peg 3350, 100mM Tris HCl (pH 8.5)
分辨率 2.00 Å R-free 0.294
3BUW Crystal structure of c-Cbl-TKB domain complexed with its binding motif in Syk 提交 2008-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 317–329（13 aa） 片段：UNP residues 317-329, pTyr-323 phosphopeptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.12M ammonium acetate, 18% PEG 3350, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 1.45 Å R-free 0.238
3BUW Crystal structure of c-Cbl-TKB domain complexed with its binding motif in Syk 提交 2008-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 317–329（13 aa） 片段：UNP residues 317-329, pTyr-323 phosphopeptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.12M ammonium acetate, 18% PEG 3350, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 1.45 Å R-free 0.238
3BUW Crystal structure of c-Cbl-TKB domain complexed with its binding motif in Syk 提交 2008-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 317–329（13 aa） 片段：UNP residues 317-329, pTyr-323 phosphopeptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.12M ammonium acetate, 18% PEG 3350, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 1.45 Å R-free 0.238
3BUW Crystal structure of c-Cbl-TKB domain complexed with its binding motif in Syk 提交 2008-01-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 317–329（13 aa） 片段：UNP residues 317-329, pTyr-323 phosphopeptide
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；0.12M ammonium acetate, 18% PEG 3350, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 1.45 Å R-free 0.238
3EMG Discovery and SAR of novel 4-thiazolyl-2-phenylaminopyrimidines as potent inhibitors of spleen tyrosine kinase (SYK) 提交 2008-09-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 349–635（287 aa） 片段：Kinase domain: Residues 349-635
未记录 685 2-{2-[(3,5-dimethylphenyl)amino]pyrimidin-4-yl}-N-[(1S)-2-hydroxy-1-methylethyl]-4-methyl-1,3-thiazole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；10 mg/mL Protein, 15-20% PEG 8000, 100 mM Sodium nitrate, 100 mM HEPES pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
分辨率 2.60 Å R-free 0.222
3FQE Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with YM193306 提交 2009-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 365-635, Protein kinase domain
未记录 P5C 2-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-4-[(3-methylphenyl)amino]pyrimidine-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；28% PEG 4000, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 2.50 Å R-free 0.253
3FQH Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with a 2-substituted 7-azaindole 提交 2009-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 365-635, Protein kinase domain
未记录 057 N-(2-hydroxy-1,1-dimethylethyl)-1-methyl-3-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-2-yl)-1H-indole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；25% PEG 4000, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 2.26 Å R-free 0.259
3FQH Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with a 2-substituted 7-azaindole 提交 2009-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 365-635, Protein kinase domain
未记录 057 N-(2-hydroxy-1,1-dimethylethyl)-1-methyl-3-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-2-yl)-1H-indole-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；25% PEG 4000, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 2.26 Å R-free 0.259
3FQS Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with R406 提交 2009-01-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 365-635, Protein kinase domain
未记录 585 6-({5-fluoro-2-[(3,4,5-trimethoxyphenyl)amino]pyrimidin-4-yl}amino)-2,2-dimethyl-2H-pyrido[3,2-b][1,4]oxazin-3(4H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；24% PEG 4000, 0.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
3SRV Crystal structure of spleen tyrosine kinase (SYK) in complex with a diaminopyrimidine carboxamide inhibitor 提交 2011-07-07 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 360–635（276 aa） 片段：KINASE DOMAIN (UNP Residues 360-635)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） S19 2-{[(3R,4R)-3-aminotetrahydro-2H-pyran-4-yl]amino}-4-[(4-methylphenyl)amino]pyrimidine-5-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；20% PEG3350, 0.2M Na-K-Phosphate, 0.1M Bis-Tris-Propane pH 6.5, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.241
3SRV Crystal structure of spleen tyrosine kinase (SYK) in complex with a diaminopyrimidine carboxamide inhibitor 提交 2011-07-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 360–635（276 aa） 片段：KINASE DOMAIN (UNP Residues 360-635)
未记录 S19 2-{[(3R,4R)-3-aminotetrahydro-2H-pyran-4-yl]amino}-4-[(4-methylphenyl)amino]pyrimidine-5-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；20% PEG3350, 0.2M Na-K-Phosphate, 0.1M Bis-Tris-Propane pH 6.5, 5mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.95 Å R-free 0.241
3TUB Crystal structure of SYK kinase domain with 1-(5-(6,7-dimethoxyquinolin-4-yloxy)pyridin-2-yl)-3-((1R,2S)-2-phenylcyclopropyl)urea 提交 2011-09-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa） 片段：Spleen Tyrosine Kinase
未记录 FPU 1-{5-[(6,7-dimethoxyquinolin-4-yl)oxy]pyridin-2-yl}-3-[(1R,2S)-2-phenylcyclopropyl]urea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；25% PEG 3350, 0.2M NaCl, 0.1M bis-Tris pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.23 Å R-free 0.232
3TUC Crystal structure of SYK kinase domain with 1-benzyl-N-(5-(6,7-dimethoxyquinolin-4-yloxy)pyridin-2-yl)-2-oxo-1,2-dihydropyridine-3-carboxamide 提交 2011-09-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa） 片段：Spleen Tyrosine Kinase
未记录 FPW 1-benzyl-N-{5-[(6,7-dimethoxyquinolin-4-yl)oxy]pyridin-2-yl}-2-oxo-1,2-dihydropyridine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；25% PEG 1500, 0.1M bis-Tris pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.10 Å R-free 0.285
3TUD Crystal structure of SYK kinase domain with N-(4-methyl-3-(8-methyl-7-oxo-2-(phenylamino)-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-6-yl)phenyl)-3-(trifluoromethyl)benzamide 提交 2011-09-16 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa） 片段：Spleen Tyrosine Kinase
未记录 FPX N-{4-methyl-3-[8-methyl-7-oxo-2-(phenylamino)-7,8-dihydropyrido[2,3-d]pyrimidin-6-yl]phenyl}-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；291 K；30% PEG MME 2000, 0.1M bis-Tris pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K
分辨率 2.33 Å R-free 0.263
3VF8 Crystal Structure of Spleen Tyrosine Kinase Syk Catalytic Domain with Pyrazolylbenzimidazole Inhibitor 416 提交 2012-01-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa） 片段：unp residues 343-635
未记录 0JE 3-[5-(5-ethoxy-6-fluoro-1H-benzimidazol-2-yl)-1H-pyrazol-4-yl]-1,1-diethylurea × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.7；292 K；20% PEG3350, 0.1 M Na-citrate, 0.175 M K-phosphate, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K
分辨率 2.08 Å R-free 0.241
3VF9 Crystal Structure of Spleen Tyrosine Kinase Syk Catalytic Domain with Thienopyrazolylindole Inhibitor 027 提交 2012-01-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa） 片段：unp residues 343-635
未记录 477 3-{2-[5-(difluoromethyl)-2H-thieno[3,2-c]pyrazol-3-yl]-1H-indol-6-yl}pentan-3-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.7；292 K；19% PEG3350, 0.1 M Na-citrate, 0.175 M K-phosphate, pH 4.7, VAPOR DIFFUSION, temperature 292K
分辨率 2.30 Å R-free 0.267
4DFL Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with a sulfonamidopyrazine piperidine inhibitor 提交 2012-01-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 363–635（273 aa）
未记录 0K0 3-amino-6-{3-[(methylsulfonyl)amino]phenyl}-N-(piperidin-4-ylmethyl)pyrazine-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.98 Å R-free 0.243
4DFN Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with an adamantylpyrazine inhibitor 提交 2012-01-24 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 363–635（273 aa）
未记录 0K1 3-amino-6-[3-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)phenyl]-N-[(1R,2r,3S,5s,7s)-5-hydroxyadamantan-2-yl]pyrazine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.48 Å R-free 0.273
4F4P SYK in COMPLEX WITH LIGAND LASW836 提交 2012-05-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 365–635（271 aa）
未记录 0SB N-{6-[3-(piperazin-1-yl)phenyl]pyridin-2-yl}-4-(trifluoromethyl)pyridin-2-amine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.37 Å R-free 0.285
4FL1 Structural and Biophysical Characterization of the Syk Activation Switch 提交 2012-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa）
未记录 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M HEPES, 28% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.79 Å R-free 0.225
4FL2 Structural and Biophysical Characterization of the Syk Activation Switch 提交 2012-06-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–635（635 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；12% PEG 3350, 100 mM Hepes, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.19 Å R-free 0.228
4FL3 Structural and Biophysical Characterization of the Syk Activation Switch 提交 2012-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–635（635 aa）
突变：Y348F, Y352F ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；8% PEG 3350, 100 mM Hepes, 200 mM proline, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.208
4FYN Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with 3-(8-{4-[Ethyl-(2-hydroxy-ethyl)-amino]-phenylamino}-imidazo[1,2-a]pyrazin-5-yl)-phenol 提交 2012-07-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：RESIDUES 356-635, PROTEIN KINASE DOMAIN
未记录 0VE 3-[8-({4-[ethyl(2-hydroxyethyl)amino]phenyl}amino)imidazo[1,2-a]pyrazin-5-yl]phenol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；28% PEG 4000, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 2.32 Å R-free 0.269
4FYO Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with N-{(S)-1-[7-(3,4-Dimethoxy-phenylamino)-thiazolo[5,4-d]pyrimidin-5-yl]-pyrrolidin-3-yl}-terephthalamic acid 提交 2012-07-05 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：RESIDUES 356-635, PROTEIN KINASE DOMAIN
未记录 0VF 4-{[(3S)-1-{7-[(3,4-dimethoxyphenyl)amino][1,3]thiazolo[5,4-d]pyrimidin-5-yl}pyrrolidin-3-yl]carbamoyl}benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；28% PEG 4000, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 1.40 Å R-free 0.240
4FZ6 Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with [6-((S)-2-Methyl-pyrrolidin-1-yl)-pyridin-2-yl]-(6-phenyl-imidazo[1,2-b]pyridazin-8-yl)-amine 提交 2012-07-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：RESIDUES 356-635, PROTEIN KINASE DOMAIN
未记录 0VG N-{6-[(2S)-2-methylpyrrolidin-1-yl]pyridin-2-yl}-6-phenylimidazo[1,2-b]pyridazin-8-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；28% PEG 4000, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 1.85 Å R-free 0.253
4FZ7 Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with 6-((1R,2S)-2-Amino-cyclohexylamino)-4-(6-ethyl-pyridin-2-ylamino)-pyridazine-3-carboxylic acid amide 提交 2012-07-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：RESIDUES 365-635, PROTEIN KINASE DOMAIN
未记录 0VH 6-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-4-[(6-ethylpyridin-2-yl)amino]pyridazine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；28% PEG 4000, 0.2M ammonium sulfate, 0.1M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 1.75 Å R-free 0.250
4GFG Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with r9021 提交 2012-08-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：Kinase domain
未记录 0XF 6-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-4-[(5,6-dimethylpyridin-2-yl)amino]pyridazine-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；278 K；12% PEG 3350, 0.1M sodium malonate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 278K
分辨率 2.35 Å R-free 0.246
4I0R Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with 2-(3,4,5-Trimethoxy-phenyl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxylic acid isopropylamide 提交 2012-11-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：protein kinase domain (UNP residues 356-635)
未记录 1B4 N-(propan-2-yl)-2-(3,4,5-trimethoxyphenyl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；28% PEG4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 2.10 Å R-free 0.272
4I0S Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with 2-(6-Chloro-1-methyl-1H-indazol-3-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxylic acid isopropylamide 提交 2012-11-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：protein kinase domain (UNP residues 356-635)
未记录 1B5 2-(6-chloro-1-methyl-1H-indazol-3-yl)-N-(propan-2-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；28% PEG4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 1.98 Å R-free 0.236
4I0T Crystal structure of spleen tyrosine kinase complexed with 2-(5,6,7,8-Tetrahydro-imidazo[1,5-a]pyridin-1-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxylic acid tert-butylamide 提交 2012-11-19 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：protein kinase domain (UNP residues 356-635)
未记录 1B6 N-tert-butyl-2-(5,6,7,8-tetrahydroimidazo[1,5-a]pyridin-1-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；283 K；28% PEG4000, 0.2 M ammonium sulfate, 0.1 M HEPES, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
分辨率 1.70 Å R-free 0.268
4PUZ Crystal structure of spleen tyrosine kinase (Syk) in complex with GS-9973 提交 2014-03-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 353–635（283 aa） 片段：Syk kinase domain, UNP residues 356-635
未记录 CG9 6-(1H-indazol-6-yl)-N-[4-(morpholin-4-yl)phenyl]imidazo[1,2-a]pyrazin-8-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；15% PEG 3350, 100mM Tris pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.08 Å R-free 0.261
4PUZ Crystal structure of spleen tyrosine kinase (Syk) in complex with GS-9973 提交 2014-03-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 353–635（283 aa） 片段：Syk kinase domain, UNP residues 356-635
未记录 CG9 6-(1H-indazol-6-yl)-N-[4-(morpholin-4-yl)phenyl]imidazo[1,2-a]pyrazin-8-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；15% PEG 3350, 100mM Tris pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.08 Å R-free 0.261
4PV0 Crystal structure of spleen tyrosine kinase (Syk) in complex with an imidazopyrazine inhibitor 提交 2014-03-14 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 363–635（273 aa） 片段：Syk kinase domain, UNP residues 363-635
未记录 CG4 4-[(3-{8-[(3,4-dimethoxyphenyl)amino]imidazo[1,2-a]pyrazin-6-yl}benzoyl)amino]benzoic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.00 Å R-free 0.282
4PX6 SYK catalytic domain in complex with a potent pyridopyrimidinone inhibitor 提交 2014-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：Catalytic Domain
突变：K467T 2X6 7-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-5-(1H-indol-7-ylamino)pyrido[4,3-d]pyrimidin-4(3H)-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.2；293 K；20% PEG3350, 0.2M ammonium fluoride, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.202
4RSS Crystal structure of tyrosine-protein kinase SYK with an inhibitor 提交 2014-11-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：UNP RESIDUES 356-635
未记录 4MG 1-[(3-methyl-1-{2-[(1,2,3-trimethyl-1H-indol-5-yl)amino]pyrimidin-4-yl}-1H-pyrazol-4-yl)methyl]azetidin-3-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；10-20% (v/v) PEG 3350, 100mM Tris-HCl (pH 8.5) , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.83 Å R-free 0.249
4RX7 SYK Catalytic Domain Complexed with a Potent Triazine Inhibitor 提交 2014-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：Protein kinase domain residues 356-635
未记录 FMT FORMIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 3YV 3-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-5-{[3-(2H-1,2,3-triazol-2-yl)phenyl]amino}-1,2,4-triazine-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；20% PEG 3350, 0.2M ammonium formate, pH 6.0, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 1.80 Å R-free 0.203
4RX8 SYK Catalytic Domain Complexed with a Potent Triazine Inhibitor2 提交 2014-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：Protein kinase domain residues 356-635
未记录 GOL GLYCEROL × 2 3YX 3-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-5-(1H-indol-7-ylamino)-1,2,4-triazine-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.3；293 K；20% PEG 3350, 0.2M potassium formate, pH 7.3, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 1.59 Å R-free 0.207
4RX9 SYK Catalytic Domain Complexed with a Potent Pyrimidine Inhibitor 提交 2014-12-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 3YT 2-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-4-{[3-(2H-1,2,3-triazol-2-yl)phenyl]amino}pyrimidine-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6；293 K；20% PEG 3350, 0.2M ammonium formate, pH 6.0, vapor diffusion, temperature 293K
分辨率 1.75 Å R-free 0.197
4WNM SYK catalytic domain in complex with a potent triazolopyridine inhibitor 提交 2014-10-13 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa）
未记录 3RT N~3~-(tetrahydro-2H-pyran-4-yl)-N~6~-[5-(tetrahydro-2H-pyran-4-ylmethyl)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyridin-2-yl]-1H-indazole-3,6-diamine × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；278 K；100 mM MES pH 5.3, 150 mM Ammonium sulfate, and 22% PEG 3350
分辨率 2.50 Å R-free 0.260
4XG2 Crystal structure of ligand-free Syk 提交 2014-12-30 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：protein kinase domain, residues 356-635
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；10~20%(v/v) PEG3350, 100 mM Tris-HCl
分辨率 2.21 Å R-free 0.227
4XG3 Crystal structure of an inhibitor-bound Syk 提交 2014-12-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：protein kinase domain, residues 356-635
未记录 X3G 4-{[5-fluoro-4-(3-{[(3R)-3-hydroxypyrrolidin-1-yl]methyl}-4-methyl-1H-pyrrol-1-yl)pyrimidin-2-yl]amino}-2,6-dimethylphenyl methanesulfonate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；10~20% (v/v) PEG3350, 100 mM Tris-HCl
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
4XG3 Crystal structure of an inhibitor-bound Syk 提交 2014-12-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 356–635（280 aa） 片段：protein kinase domain, residues 356-635
未记录 X3G 4-{[5-fluoro-4-(3-{[(3R)-3-hydroxypyrrolidin-1-yl]methyl}-4-methyl-1H-pyrrol-1-yl)pyrimidin-2-yl]amino}-2,6-dimethylphenyl methanesulfonate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；10~20% (v/v) PEG3350, 100 mM Tris-HCl
分辨率 2.30 Å R-free 0.226
4XG4 Crystal structure of an inhibitor-bound Syk 提交 2014-12-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：protein kinase domain, residues 356-635
未记录 X4G (3R)-1-{[1-(5-fluoro-2-{[4-(2-hydroxyethoxy)-3,5-dimethylphenyl]amino}pyrimidin-4-yl)-4-methyl-1H-pyrrol-3-yl]methyl}pyrrolidin-3-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；10~20%(v/v) PEG3350, 100 mM Tris-HCl
分辨率 2.30 Å R-free 0.228
4XG6 Crystal structure of an inhibitor-bound Syk 提交 2014-12-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：protein kinase domain, residues 356-635
未记录 X6G 1-[(1-{2-[(3,5-dimethylphenyl)amino]pyrimidin-4-yl}-3-methyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]azetidin-3-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；10~20%(v/v) PEG3350, 100 mM Tris-HCl
分辨率 2.40 Å R-free 0.230
4XG7 Crystal structure of an inhibitor-bound Syk 提交 2014-12-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：protein kinase domain, residues 356-635
未记录 X7G 1-[(3-methyl-1-{2-[(1-methyl-1H-indazol-5-yl)amino]pyrimidin-4-yl}-1H-pyrazol-4-yl)methyl]azetidin-3-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；10~20%(v/v) PEG3350, 100 mM Tris-HCl
分辨率 1.76 Å R-free 0.242
4XG8 Crystal structure of an inhibitor-bound Syk 提交 2014-12-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：protein kinase domain, residues 356-635
未记录 X8G 1-[(1-{2-[(3-chloro-1-methyl-1H-indazol-5-yl)amino]pyrimidin-4-yl}-3-methyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]azetidin-3-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；10~20%(v/v) PEG3350, 100 mM Tris-HCl
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4XG8 Crystal structure of an inhibitor-bound Syk 提交 2014-12-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 356–635（280 aa） 片段：protein kinase domain, residues 356-635
未记录 X8G 1-[(1-{2-[(3-chloro-1-methyl-1H-indazol-5-yl)amino]pyrimidin-4-yl}-3-methyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]azetidin-3-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；10~20%(v/v) PEG3350, 100 mM Tris-HCl
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
4XG9 Crystal structure of an inhibitor-bound Syk 提交 2014-12-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：protein kinase domain, residues 356-635
未记录 X9G 1-[(1-{2-[(3-chloro-1,2-dimethyl-1H-indol-5-yl)amino]pyrimidin-4-yl}-3-methyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]azetidin-3-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；10~20%(v/v) PEG3350, 100 mM Tris-HCl
分辨率 2.91 Å R-free 0.241
4XG9 Crystal structure of an inhibitor-bound Syk 提交 2014-12-30 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 356–635（280 aa） 片段：protein kinase domain, residues 356-635
未记录 X9G 1-[(1-{2-[(3-chloro-1,2-dimethyl-1H-indol-5-yl)amino]pyrimidin-4-yl}-3-methyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]azetidin-3-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；10~20%(v/v) PEG3350, 100 mM Tris-HCl
分辨率 2.91 Å R-free 0.241
4YJO THE KINASE DOMAIN OF HUMAN SPLEEN TYROSINE (SYK) IN COMPLEX WITH GTC000222 提交 2015-03-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 355–635（281 aa） 片段：UNP residues 355-635
未记录 4DF 5-chloro-N~2~-(1,1-dioxido-2,3-dihydro-1,2-benzothiazol-6-yl)-N~4~-ethyl-N~4~-(1H-indazol-4-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；30% Jeffamine ED-2001, 10% Glycerol, 0.1M MES pH6.8, 5mM TCEP
分辨率 1.60 Å R-free 0.230
4YJP THE KINASE DOMAIN OF HUMAN SPLEEN TYROSINE (SYK) IN COMPLEX WITH GTC000223 提交 2015-03-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 355–635（281 aa） 片段：UNP residues 355-635
未记录 4DL 2-[{2-[(1,1-dioxido-2,3-dihydro-1,2-benzothiazol-6-yl)amino]pyrimidin-4-yl}(1H-indazol-4-yl)amino]ethanol × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；30% Jeffamine ED-2001, 10% Glycerol, 0.1M MES pH6.8, 5mM TCEP
分辨率 1.83 Å R-free 0.258
4YJQ SYK kinase domain in complex with inhibitor GTC000224 提交 2015-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 355–635（281 aa） 片段：UNP residues 355-635
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4DK 3-[1H-indazol-4-yl(2-{[3-(4-methyl-1,3-oxazol-5-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% Jeffamine ED-2001, 10% Glycerol, 0.1M MES pH6.0, 5mM TCEP
分辨率 1.34 Å R-free 0.183
4YJR SYK kinase domain in complex with inhibitor GTC000225 提交 2015-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 355–635（281 aa） 片段：UNP residues 355-635
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4DJ 3-(1H-indazol-4-yl{2-[(1-methyl-1H-indazol-5-yl)amino]pyrimidin-4-yl}amino)propan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% Jeffamine ED-2001, 10% Glycerol, 0.1M MES pH6.0, 5mM TCEP
分辨率 1.32 Å R-free 0.180
4YJS THE KINASE DOMAIN OF HUMAN SPLEEN TYROSINE (SYK) IN COMPLEX WITH GTC000226 提交 2015-03-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 355–635（281 aa） 片段：UNP residues 355-635
未记录 4DN 3-[{2-[(1,1-dioxido-2,3-dihydro-1,2-benzothiazol-6-yl)amino]pyrimidin-4-yl}(1H-indazol-4-yl)amino]propan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；32.5% Jeffamine ED-2001, 10% Glycerol, 0.1M MES pH6.8, 5mM DTT
分辨率 2.22 Å R-free 0.226
4YJT THE KINASE DOMAIN OF HUMAN SPLEEN TYROSINE (SYK) IN COMPLEX WITH GTC000233 提交 2015-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 355–635（281 aa） 片段：UNP residues 355-635
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 4DQ N~2~-(1,1-dioxido-2,3-dihydro-1,2-benzothiazol-6-yl)-N~4~-ethyl-5-fluoro-N~4~-(1H-indazol-4-yl)pyrimidine-2,4-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% Jeffamine ED-2001, 10% Glycerol, 0.1M MES pH6.0, 5mM TCEP
分辨率 1.52 Å R-free 0.208
4YJU THE KINASE DOMAIN OF HUMAN SPLEEN TYROSINE (SYK) IN COMPLEX WITH GTC000249 提交 2015-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 355–635（281 aa） 片段：UNP residues 355-635
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4DO N~2~-(1,1-dioxido-2,3-dihydro-1,2-benzothiazol-6-yl)-5-fluoro-N~4~-(1H-indazol-4-yl)-N~4~-methylpyrimidine-2,4-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；293 K；30% Jeffamine ED-2001, 10% Glycerol, 0.1M MES pH6.8, 5mM TCEP
分辨率 1.67 Å R-free 0.201
4YJV THE KINASE DOMAIN OF HUMAN SPLEEN TYROSINE (SYK) IN COMPLEX WITH GTC000250 提交 2015-03-03 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 355–635（281 aa） 片段：UNP residues 355-635
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 4DT 3-[6-({4-[ethyl(1H-indazol-4-yl)amino]-5-fluoropyrimidin-2-yl}amino)-2,4-dihydro-1H-indazol-1-yl]propan-1-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% Jeffamine ED-2001, 10% Glycerol, 0.1M MES pH6.0, 5mM TCEP
分辨率 1.65 Å R-free 0.222
5C26 Crystal structure of SYK in complex with compound 1 提交 2015-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 343–635（293 aa） 片段：UNP residues 343-635
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 50H 3-{8-[(3,4-dimethoxyphenyl)amino]imidazo[1,2-a]pyrazin-6-yl}benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；295 K；1.75 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate, 0.1 M sodium acetate pH 5.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.215
5C27 Crystal structure of SYK in complex with compound 2 提交 2015-06-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 343–635（293 aa） 片段：UNP residues 343-635
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 50J 3-{8-[(3,4-dimethoxyphenyl)amino]imidazo[1,2-a]pyrazin-6-yl}-N-[4-(methylcarbamoyl)phenyl]benzamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；298 K；1.75 M ammonium sulfate, 0.1 M sodium citrate, 0.1 M sodium acetate pH 5.5
分辨率 2.15 Å R-free 0.225
5CXH SYK catalytic domain complexed with a potent orally bioavailable thiazole inhibitor 提交 2015-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：Protein kinase domain residues 356-635
突变：K467T 55M (4R)-4-[(1R)-1-{[6-(3,4-dimethoxyphenyl)[1,3]thiazolo[5,4-c]pyridin-4-yl]oxy}ethyl]pyrrolidin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；277 K；20% PEG3350, 0.2M potassium fluoride, no buffer pH 7.3
分辨率 1.90 Å R-free 0.205
5CXZ SYK catalytic domain complexed with naphthyridine inhibitor 提交 2015-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 356-635
突变：K467T GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 55U N-{7-[4-(dimethylamino)phenyl]-1,6-naphthyridin-5-yl}propane-1,3-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350 15%, cesium chloride 0.15M
分辨率 1.70 Å R-free 0.208
5CY3 SYK catalytic domain complexed with a potent and orally bioavailable benzisothiazole inhibitor 提交 2015-07-30 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：residues 356-635
突变：K467T 55Y (5R)-5-[(1R)-1-{[6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-2,1-benzothiazol-4-yl]oxy}ethyl]-1,3-oxazolidin-2-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.1；293 K；PEG 3350 20%, ammonium acetate 0.2M
分辨率 1.76 Å R-free 0.195
5GHV Crystal structure of an inhibitor-bound Syk 提交 2016-06-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 356-635
未记录 X5G 1-({1-[2-({3,5-dimethyl-4-[2-(pyrrolidin-1-yl)ethoxy]phenyl}amino)pyrimidin-4-yl]-4-methyl-1H-pyrrol-3-yl}methyl)azetidin-3-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；10~20%(V/V) PEG3350, 100 MM TRIS-HCL
分辨率 2.80 Å R-free 0.227
5GHV Crystal structure of an inhibitor-bound Syk 提交 2016-06-20 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 356–635（280 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 356-635
未记录 X5G 1-({1-[2-({3,5-dimethyl-4-[2-(pyrrolidin-1-yl)ethoxy]phenyl}amino)pyrimidin-4-yl]-4-methyl-1H-pyrrol-3-yl}methyl)azetidin-3-ol × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；278 K；10~20%(V/V) PEG3350, 100 MM TRIS-HCL
分辨率 2.80 Å R-free 0.227
5LMA HUMAN SPLEEN TYROSINE KINASE KINASE DOMAIN IN COMPLEX WITH AZANAPHTHYRIDINE INHIBITOR 提交 2016-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 360–635（276 aa） 片段：UNP residues 360-635
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6ZG ~{N}'-[7-(4-methylphenyl)pyrido[3,4-b]pyrazin-5-yl]butane-1,4-diamine × 1 GOL GLYCEROL × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, Sodium formate.
分辨率 1.43 Å R-free 0.183
5LMB HUMAN SPLEEN TYROSINE KINASE KINASE DOMAIN IN COMPLEX WITH AZANAPHTHYRIDINE INHIBITOR 提交 2016-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 360–635（276 aa） 片段：UNP residues 360-635
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6ZF 7-[6-(dimethylamino)pyridin-3-yl]-~{N}-[[(3~{S})-piperidin-3-yl]methyl]pyrido[3,4-b]pyrazin-5-amine × 1 GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；PEG1500, HEPES, TACSIMATE, GLYCEROL
分辨率 1.95 Å R-free 0.228
5LMB HUMAN SPLEEN TYROSINE KINASE KINASE DOMAIN IN COMPLEX WITH AZANAPHTHYRIDINE INHIBITOR 提交 2016-07-29 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 360–635（276 aa） 片段：UNP residues 360-635
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 6ZF 7-[6-(dimethylamino)pyridin-3-yl]-~{N}-[[(3~{S})-piperidin-3-yl]methyl]pyrido[3,4-b]pyrazin-5-amine × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；293 K；PEG1500, HEPES, TACSIMATE, GLYCEROL
分辨率 1.95 Å R-free 0.228
5T68 Crystal structure of Syk catalytic domain in complex with a furo[3,2-d]pyrimidine 提交 2016-09-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 356-635
链 B 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 356-635
未记录 77V N~4~-cyclopropyl-N~2~-(3-methyl-1H-indazol-6-yl)furo[3,2-d]pyrimidine-2,4-diamine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；14-18% PEG3350, 100 mM Tris pH 8.5 using a seed stock that was grown in PEG 3350 13-20% and 100 mM Tris pH 8.5
分辨率 2.93 Å R-free 0.281
5TIU Crystal structure of SYK kinase domain with inhibitor 提交 2016-10-03 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 356-635
未记录 7CU 5-{[(2S)-2-aminopropyl]amino}-3-(1H-indol-2-yl)pyrazine-2-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；16% PEG3350, 0.1M Tris pH 7.1-7.4
分辨率 1.49 Å R-free 0.203
5TR6 Discovery of TAK-659, an Orally Available Investigational Inhibitor of Spleen Tyrosine Kinase (SYK) 提交 2016-10-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 356-635
未记录 7KG 6-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-7-fluoro-4-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,4-c]pyridin-3-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.1；293 K；0.7M Potassium Na Tartrate, 0.06M MES_Na, 0.04M MES
分辨率 1.93 Å R-free 0.217
5TT7 Discovery of TAK-659, an Orally Available Investigational Inhibitor of Spleen Tyrosine Kinase (SYK) 提交 2016-11-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 356-635
未记录 7KF 2-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-4-[(3-methylphenyl)amino]-6,7-dihydro-5H-pyrrolo[3,4-d]pyrimidin-5-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.7；293 K；1.2M Potassium Na Tartrate, 0.1M Tris pH 8.7
分辨率 1.77 Å R-free 0.234
5Y5T Crystal structures of spleen tyrosine kinase in complex with a novel inhibitor 提交 2017-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 356-635
未记录 8OR 2-[[(1S,2S)-2-azanylcyclohexyl]amino]-4-[(4-methylsulfonylphenyl)amino]-6H-pyrido[4,3-d]pyrimidin-5-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10-20% PEG 3350, 100mM Tris-HCl, pH 8.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.234
5Y5U Crystal structures of spleen tyrosine kinase in complex with a novel inhibitor 提交 2017-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 356-635
未记录 8OU 4-[(1-methylindazol-5-yl)amino]-2-(4-oxidanylpiperidin-1-yl)-8H-pyrido[4,3-d]pyrimidin-5-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10-20% PEG 3350, 100mM Tris-HCl, pH 8.5
分辨率 2.14 Å R-free 0.260
5Y5U Crystal structures of spleen tyrosine kinase in complex with a novel inhibitor 提交 2017-08-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 356-635
未记录 8OU 4-[(1-methylindazol-5-yl)amino]-2-(4-oxidanylpiperidin-1-yl)-8H-pyrido[4,3-d]pyrimidin-5-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；10-20% PEG 3350, 100mM Tris-HCl, pH 8.5
分辨率 2.14 Å R-free 0.260
6HM6 CRYSTAL STRUCTURE OF SPLEEN TYROSINE KINASE (SYK) IN COMPLEX WITH A 2-(PYRIDINYLOXYMETHYL)PYRIDINE INHIBITOR 提交 2018-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 337–612（276 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GDK 2-(4-methylphenyl)-3-(pyridin-2-ylmethoxy)pyridine × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 1500, HEPES, glycerol, tacsimate.
分辨率 2.10 Å R-free 0.290
6HM7 CRYSTAL STRUCTURE OF SPLEEN TYROSINE KINASE (SYK) IN COMPLEX WITH A 2-(PHENOXYMETHYL)PYRIDINE INHIBITOR 提交 2018-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 337–612（276 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GDH 7-[2-methoxy-6-[(4-methylpyridin-2-yl)methoxy]phenyl]-2,3,4,5-tetrahydro-1~{H}-3-benzazepine × 1 BR BROMIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；PEG 3350, bistrispropane, sodium bromide
分辨率 1.64 Å R-free 0.210
6SSB syk in complex with compound 30 提交 2019-09-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa）
未记录 LUE ~{N}-[4-[5-[(dimethylamino)methyl]-1-methyl-pyrazol-3-yl]pyrimidin-2-yl]-3-methyl-1-(5-methyl-1,3,4-oxadiazol-2-yl)imidazo[1,5-a]pyridin-7-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1M Na3Cit pH 6.4, 16% PEG3350, 0.2M KH2PO4
分辨率 2.08 Å R-free 0.225
6VOV Crystal structure of Syk in complex with GS-9876 提交 2020-01-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 363–635（273 aa） 片段：UNP Residues 363-635
未记录 R6D 6-(6-aminopyrazin-2-yl)-N-{4-[4-(oxetan-3-yl)piperazin-1-yl]phenyl}imidazo[1,2-a]pyrazin-8-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350, 100mM Tris pH 8.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.268
6VOV Crystal structure of Syk in complex with GS-9876 提交 2020-01-31 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 363–635（273 aa） 片段：UNP Residues 363-635
未记录 R6D 6-(6-aminopyrazin-2-yl)-N-{4-[4-(oxetan-3-yl)piperazin-1-yl]phenyl}imidazo[1,2-a]pyrazin-8-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20% PEG 3350, 100mM Tris pH 8.5
分辨率 1.95 Å R-free 0.268
6ZC0 SYK Kinase domain in complex with azabenzimidazole inhibitor 2b 提交 2020-06-09 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa）
未记录 QDZ ~{N},~{N}-dimethyl-1-[1-[2-(1-methylindol-4-yl)-3~{H}-imidazo[4,5-b]pyridin-7-yl]pyrazol-4-yl]methanamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M Na3Cit pH 6.4, 16% PEG3350, 0.2M KH2PO4
分辨率 1.97 Å R-free 0.229
6ZCP SYK Kinase domain in complex with azabenzimidazole inhibitor 2b 提交 2020-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa）
未记录 QFK 7-[[4-[4-[(dimethylamino)methyl]pyrazol-1-yl]pyrimidin-2-yl]amino]-~{N},3-dimethyl-imidazo[1,5-a]pyridine-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；278 K；0.1M Na3Cit pH 6.4, 16% PEG3350, 0.2M KH2PO4
分辨率 2.20 Å R-free 0.234
6ZCQ SYK Kinase domain in complex with diamine inhibitor 5 提交 2020-06-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa）
未记录 QFB 7-[[4-[4-[[(3~{R},4~{R})-3-azanyloxan-4-yl]amino]pyrazol-1-yl]pyrimidin-2-yl]amino]-~{N},3-dimethyl-imidazo[1,5-a]pyridine-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；278 K；0.1M Na3Cit pH 6.4, 16% PEG3350, 0.2M KH2PO4
分辨率 2.32 Å R-free 0.244
6ZCR SYK Kinase domain in complex with azabenzimidazole inhibitor 7 提交 2020-06-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa）
未记录 5JG 6-chloro-2-(2-fluoro-4,5-dimethoxyphenyl)-N-(piperidin-4-ylmethyl)-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-7-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；278 K；0.1M Na3Cit pH 6.4, 16% PEG3350, 0.2M KH2PO4
分辨率 1.73 Å R-free 0.218
6ZCS SYK Kinase domain in complex with azabenzimidazole inhibitor 3 提交 2020-06-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa）
未记录 QFE (3~{R},4~{R})-~{N}4-[1-[2-(1-methylindol-4-yl)-3~{H}-imidazo[4,5-b]pyridin-7-yl]pyrazol-4-yl]oxane-3,4-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；278 K；0.1M Na3Cit pH 6.4, 16% PEG3350, 0.2M KH2PO4
分辨率 1.47 Å R-free 0.208
6ZCU syk in complex with 57262_SYKB-AZ13344324-2 提交 2020-06-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa）
未记录 5JG 6-chloro-2-(2-fluoro-4,5-dimethoxyphenyl)-N-(piperidin-4-ylmethyl)-3H-imidazo[4,5-b]pyridin-7-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1M Na3Cit pH 6.4, 16% PEG3350, 0.2M KH2PO4
分辨率 1.73 Å R-free 0.218
6ZCX SYK Kinase domain in complex with azabenzimidazole inhibitor 18 提交 2020-06-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa）
未记录 QFQ ~{N},1-dimethyl-5-[[4-[3-methyl-4-[[(3~{R})-piperidin-3-yl]amino]pyrazol-1-yl]pyrimidin-2-yl]amino]indazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；278 K；0.1M Na3Cit pH 6.4, 16% PEG3350, 0.2M KH2PO4
分辨率 1.66 Å R-free 0.229
6ZCY SYK Kinase domain in complex with diamine inhibitor 16 提交 2020-06-12 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa）
未记录 QF8 ~{N},1-dimethyl-5-[[4-[3-methyl-4-[[(3~{R})-pyrrolidin-3-yl]amino]pyrazol-1-yl]pyrimidin-2-yl]amino]indazole-3-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；278 K；0.1M Na3Cit pH 6.4, 16% PEG3350, 0.2M KH2PO4
分辨率 1.81 Å R-free 0.223
7Q5T The tandem SH2 domains of SYK with a bound FCER1G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 AAA 6–269（264 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；30 mM sodium nitrate, 30 mM dibasic sodium phosphate, 30 mM ammonium sulphate, 100 mM Tris/BICINE, 10% PEG 20,000, 20% PEG 500 MME
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
7Q5T The tandem SH2 domains of SYK with a bound FCER1G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 BBB 6–269（264 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；30 mM sodium nitrate, 30 mM dibasic sodium phosphate, 30 mM ammonium sulphate, 100 mM Tris/BICINE, 10% PEG 20,000, 20% PEG 500 MME
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
7Q5T The tandem SH2 domains of SYK with a bound FCER1G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 CCC 6–269（264 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；30 mM sodium nitrate, 30 mM dibasic sodium phosphate, 30 mM ammonium sulphate, 100 mM Tris/BICINE, 10% PEG 20,000, 20% PEG 500 MME
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
7Q5T The tandem SH2 domains of SYK with a bound FCER1G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 DDD 6–269（264 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；30 mM sodium nitrate, 30 mM dibasic sodium phosphate, 30 mM ammonium sulphate, 100 mM Tris/BICINE, 10% PEG 20,000, 20% PEG 500 MME
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
7Q5T The tandem SH2 domains of SYK with a bound FCER1G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 EEE 6–269（264 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；30 mM sodium nitrate, 30 mM dibasic sodium phosphate, 30 mM ammonium sulphate, 100 mM Tris/BICINE, 10% PEG 20,000, 20% PEG 500 MME
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
7Q5T The tandem SH2 domains of SYK with a bound FCER1G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 FFF 6–269（264 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；30 mM sodium nitrate, 30 mM dibasic sodium phosphate, 30 mM ammonium sulphate, 100 mM Tris/BICINE, 10% PEG 20,000, 20% PEG 500 MME
分辨率 2.20 Å R-free 0.255
7Q5U The tandem SH2 domains of SYK with a bound CD3G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 AAA 6–269（264 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 P4G 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；100 mM MMT buffer, 30% PEG 1000
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7Q5U The tandem SH2 domains of SYK with a bound CD3G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 BBB 6–269（264 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；100 mM MMT buffer, 30% PEG 1000
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7Q5U The tandem SH2 domains of SYK with a bound CD3G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 CCC 6–269（264 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；100 mM MMT buffer, 30% PEG 1000
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7Q5U The tandem SH2 domains of SYK with a bound CD3G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 DDD 6–269（264 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；100 mM MMT buffer, 30% PEG 1000
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7Q5U The tandem SH2 domains of SYK with a bound CD3G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 EEE 6–269（264 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 P4G 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；100 mM MMT buffer, 30% PEG 1000
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7Q5U The tandem SH2 domains of SYK with a bound CD3G diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 FFF 6–269（264 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；100 mM MMT buffer, 30% PEG 1000
分辨率 2.40 Å R-free 0.259
7Q5W The tandem SH2 domains of SYK with a bound TYROBP diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 AAA 6–269（264 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；30 mM sodium nitrate, 30 mM dibasic sodium phosphate, 30 mM ammonium sulphate, 100 mM Tris/BICINE, 10% PEG 20,000, 20% PEG 500 MME
分辨率 2.20 Å R-free 0.266
7Q5W The tandem SH2 domains of SYK with a bound TYROBP diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 BBB 6–269（264 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；30 mM sodium nitrate, 30 mM dibasic sodium phosphate, 30 mM ammonium sulphate, 100 mM Tris/BICINE, 10% PEG 20,000, 20% PEG 500 MME
分辨率 2.20 Å R-free 0.266
7Q5W The tandem SH2 domains of SYK with a bound TYROBP diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 CCC 6–269（264 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；30 mM sodium nitrate, 30 mM dibasic sodium phosphate, 30 mM ammonium sulphate, 100 mM Tris/BICINE, 10% PEG 20,000, 20% PEG 500 MME
分辨率 2.20 Å R-free 0.266
7Q5W The tandem SH2 domains of SYK with a bound TYROBP diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 DDD 6–269（264 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；30 mM sodium nitrate, 30 mM dibasic sodium phosphate, 30 mM ammonium sulphate, 100 mM Tris/BICINE, 10% PEG 20,000, 20% PEG 500 MME
分辨率 2.20 Å R-free 0.266
7Q5W The tandem SH2 domains of SYK with a bound TYROBP diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 EEE 6–269（264 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 P4G 1-ETHOXY-2-(2-ETHOXYETHOXY)ETHANE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；30 mM sodium nitrate, 30 mM dibasic sodium phosphate, 30 mM ammonium sulphate, 100 mM Tris/BICINE, 10% PEG 20,000, 20% PEG 500 MME
分辨率 2.20 Å R-free 0.266
7Q5W The tandem SH2 domains of SYK with a bound TYROBP diphospho-ITAM peptide 提交 2021-11-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 FFF 6–269（264 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；30 mM sodium nitrate, 30 mM dibasic sodium phosphate, 30 mM ammonium sulphate, 100 mM Tris/BICINE, 10% PEG 20,000, 20% PEG 500 MME
分辨率 2.20 Å R-free 0.266
7Q63 The tandem SH2 domains of SYK 提交 2021-11-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 AAA 6–269（264 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SCN THIOCYANATE ION × 3 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM, potassium thiocyanate, 12.5% glycerol, 23% PEG3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.264
7Q63 The tandem SH2 domains of SYK 提交 2021-11-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 BBB 6–269（264 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM, potassium thiocyanate, 12.5% glycerol, 23% PEG3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.264
7Q63 The tandem SH2 domains of SYK 提交 2021-11-05 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 CCC 6–269（264 aa）
未记录 SCN THIOCYANATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；200 mM, potassium thiocyanate, 12.5% glycerol, 23% PEG3350
分辨率 1.90 Å R-free 0.264
8BI2 Syk kinase domain in complex with macrocyclic inhibitor 20a 提交 2022-11-01 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 343–635（293 aa）
未记录 QR7 10,13,23-trimethyl-16-oxa-2,4,8,9,13,19,23,30-octazapentacyclo[19.5.2.1^{3,7}.1^{8,11}.0^{24,28}]triaconta-1(27),3,5,7(30),9,11(29),21,24(28),25-nonaen-20-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；274 K；0.1M Na3Cit pH 6.4, 16% PEG3350, 0.2M KH2PO4
分辨率 1.51 Å R-free 0.235
8RRQ Crystal structure of human SYK in complex with compound 24 提交 2024-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 355–635（281 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1H2W N-[(1S,2R)-2-azanylcyclohexyl]-5-[2-[(3,5-dimethylphenyl)amino]pyrimidin-4-yl]-2-methyl-pyrazole-3-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG 3350, 0.1 M bis tris propane pH 6.5, 0.2 M Na formate
分辨率 1.60 Å R-free 0.211
8RRZ Crystal structure of SYK kinase in complex with compound 1 提交 2024-01-24 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 355–635（281 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） A1H2Y N-[(2S)-1-(azetidin-1-yl)propan-2-yl]-3-{2-[(3,5-dimethoxyphenyl)amino]pyrimidin-4-yl}-1-methyl-1H-pyrazole-5-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG 3350, 0.1 M bis tris propane pH 6.5, 0.2 M Na formate
分辨率 1.75 Å R-free 0.214
8WYW Crystal structure of spleen tyrosine kinase (SYK) in complex with SKI-O-592 (free form of SKI-O-703, cevidoplenib) 提交 2023-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 356-635
链 B 356–635（280 aa） 片段：UNP residues 356-635
未记录 XFB SKI-O-592 × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；100mM Sodium-HEPES 7.0, 15%(v/v)PEG 4000
分辨率 1.90 Å R-free 0.242
8X5K The Crystal Structure of SYK from Biortus. 提交 2023-11-17 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 356–635（280 aa）
未记录 3YT 2-{[(1R,2S)-2-aminocyclohexyl]amino}-4-{[3-(2H-1,2,3-triazol-2-yl)phenyl]amino}pyrimidine-5-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2M Li2SO4, 0.1M Bis-Tris pH6.5, 25% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.244
8XQ0 Crystal structure of spleen tyrosine kinase(SYK)in complex with SKI-G-1653 提交 2024-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 356–635（280 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 356-635
链 B 356–635（280 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 356-635
链 C 356–635（280 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 356-635
链 D 356–635（280 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 356-635
未记录 A1LV4 cyclopropyl-[5-[[4-[4-[[(3~{S},4~{S})-3-methoxy-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]methyl]-3-methyl-pyrazol-1-yl]pyrimidin-2-yl]amino]-1-methyl-indol-3-yl]methanone × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M HEPES pH 7.0, 10% PEG 6000
分辨率 1.95 Å R-free 0.265
8XQ1 Crystal structure of spleen tyrosine kinase(SYK) in complex with SKI-G-1673 提交 2024-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 356-635
链 B 356–635（280 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 356-635
未记录 A1LV6 cyclopropyl-[5-[[4-[4-[[(3~{R},4~{S})-3-methoxy-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]methyl]-3-methyl-pyrazol-1-yl]pyrimidin-2-yl]amino]-1-methyl-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl]methanone × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 20% PEG 1500
分辨率 1.50 Å R-free 0.209
8XQ2 Crystal structure of spleen tyrosine kinase(SYK)in complex with SKI-G-1693 提交 2024-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 356–635（280 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 356-635
链 B 356–635（280 aa） 片段：PROTEIN KINASE DOMAIN, RESIDUES 356-635
未记录 GOL GLYCEROL × 1 A1LV7 cyclopropyl-[1-(2-fluoranylethyl)-5-[[4-[4-[[(3~{R},4~{S})-3-methoxy-4-oxidanyl-pyrrolidin-1-yl]methyl]-3-methyl-pyrazol-1-yl]pyrimidin-2-yl]amino]indol-3-yl]methanone × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1M tris-HCl pH 8.5, 10% PEG 3350
分辨率 1.80 Å R-free 0.238

共 92 个其他 PDB 条目、129 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KSYK_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 4–267； UniProt 6–269 作者链 B； PDB构建体 4–267； UniProt 6–269 作者链 C； PDB构建体 4–267； UniProt 6–269 作者链 D； PDB构建体 4–267； UniProt 6–269 作者链 E； PDB构建体 4–267； UniProt 6–269 作者链 F； PDB构建体 4–267； UniProt 6–269

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7sa7

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7sa7
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7sa7
沉积日期 deposition_date2021-09-22
结构标题 titleCrystal structure of the apo SH2 domains of Syk
关键词 keywordskinase, SH2 domain, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier42.08 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron41.76 Å
零角强度 I(0) i0388291000.00
分子量 molecular_weight159920.0 kDa
排除体积 excluded_volume200080 ų
包络体积 envelope_volume312000 ų
水化壳体积 shell_volume62969 ų
包络直径 envelope_diameter139.3 Å
壳层 Rg shell_rg47.36 Å
包络 Rg envelope_rg39.61 Å
形状 Rg shape_rg41.73 Å
总 Rg total_rg42.20 Å
总原子数 total_atoms11296
残基数 n_residues1427
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax130.3 Å
Rg (实空间) rg_real41.83 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.98 Å
I(0) (实空间) i0_real3.8830e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.5930e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal42.08 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal388400000.0000
解质量估计 total_estimate0.6684
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary54.9 Å
偏度 Skewness skewness0.047
峰度 Kurtosis kurtosis-0.425
角度范围 angular_range— – 0.1900 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha17400000.0000
实空间数据点数 n_real_points39
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.891; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.046; Positv: 1.000; Valcen: 0.966; Smooth: 0.908
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id7sa7D01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology505 — SHC Adaptor Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — SH2 domain
结构域编号 domain_id7sa7E01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology930 — Syk Kinase; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Syk Kinase; Chain A, domain 2
结构域编号 domain_id7sa7E02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology505 — SHC Adaptor Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — SH2 domain
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8. 引用文献 (2)

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9. 文件与曲线 (10)