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1H28
CDK2/CyclinA in complex with an 11-residue recruitment peptide from p107
提交 2002-07-31
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 E
653–663(11 aa)
片段:RB PEPTIDE, RESIDUES 653-663
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;0.8M KCL, 1.2M (NH4)2SO4, 40MM HEPES PH 7.0. PROTEIN CONCENTRATION = 10MG/ML
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分辨率 2.80 Å
R-free 0.323
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1H28
CDK2/CyclinA in complex with an 11-residue recruitment peptide from p107
提交 2002-07-31
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 F
653–663(11 aa)
片段:RB PEPTIDE, RESIDUES 653-663
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7;0.8M KCL, 1.2M (NH4)2SO4, 40MM HEPES PH 7.0. PROTEIN CONCENTRATION = 10MG/ML
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分辨率 2.80 Å
R-free 0.323
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4YOO
p107 pocket domain in complex with LIN52 P29A peptide
提交 2015-03-12
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
391–600(210 aa)
片段:unp residues 391-600,unp residues 781-972
链 A
781–972(192 aa)
片段:unp residues 391-600,unp residues 781-972
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未记录
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SO4 SULFATE ION × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;MES, PEG 400 4%, 1.6M ammonium sulfate
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分辨率 2.40 Å
R-free 0.242
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4YOS
p107 pocket domain complexed with LIN52 peptide
提交 2015-03-12
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
信息不足
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
391–600(210 aa)
片段:unp residues 391-600,unp residues 781-969,unp residues 391-600,unp residues 781-969
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未记录
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SO4 SULFATE ION × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;277 K;MES, PEG 400 4%, 1.6M ammonium sulfate
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分辨率 2.30 Å
R-free 0.242
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4YOZ
p107 pocket domain in complex with HPV E7 peptide
提交 2015-03-12
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
391–593(203 aa)
片段:unp residues 391-593,unp residues 391-593
链 A
777–972(196 aa)
片段:unp residues 391-593,unp residues 391-593
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未记录
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SO4 SULFATE ION × 4
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;277 K;Hepes, Ammonium Sulfate, PEG 400
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分辨率 2.25 Å
R-free 0.240
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5TUV
Crystal structure of the E2F5-DP1-p107 ternary complex
提交 2016-11-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 C
994–1031(38 aa)
片段:UNP residues 994-1031
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;100mM Hepes pH 7.0, 7% PEG 5000, 5% 1-propanol, 2% 2-propanol
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分辨率 2.90 Å
R-free 0.260
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5TUV
Crystal structure of the E2F5-DP1-p107 ternary complex
提交 2016-11-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 3
PDB 声明:trimeric
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链 F
994–1031(38 aa)
片段:UNP residues 994-1031
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;100mM Hepes pH 7.0, 7% PEG 5000, 5% 1-propanol, 2% 2-propanol
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分辨率 2.90 Å
R-free 0.260
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5TUV
Crystal structure of the E2F5-DP1-p107 ternary complex
提交 2016-11-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 C
994–1031(38 aa)
片段:UNP residues 994-1031
链 F
994–1031(38 aa)
片段:UNP residues 994-1031
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未记录
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;295 K;100mM Hepes pH 7.0, 7% PEG 5000, 5% 1-propanol, 2% 2-propanol
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分辨率 2.90 Å
R-free 0.260
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7SMD
p107 pocket domain complexed with EID1 peptide
提交 2021-10-25
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配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
391–601(211 aa)
片段:UNP residues 391-601,780-887,924-972
链 A
780–887(108 aa)
片段:UNP residues 391-601,780-887,924-972
链 A
924–972(49 aa)
片段:UNP residues 391-601,780-887,924-972
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未记录
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SO4 SULFATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;100 mM MES, pH 6.5, 4% PEG400, 1.6 M ammonium sulfate
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分辨率 2.15 Å
R-free 0.259
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7SME
p107 pocket domain complexed with HDAC1 peptide
提交 2021-10-25
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配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
391–601(211 aa)
片段:UNP residues 391-601,780-887,924-972
链 A
780–887(108 aa)
片段:UNP residues 391-601,780-887,924-972
链 A
924–972(49 aa)
片段:UNP residues 391-601,780-887,924-972
|
未记录
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SO4 SULFATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;100 mM MES, pH 6.5, 4% PEG400, 1.6 M ammonium sulfate
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分辨率 2.64 Å
R-free 0.277
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7SMF
p107 pocket domain complexed with mutated HDAC1-3X peptide
提交 2021-10-25
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配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 A
391–601(211 aa)
片段:UNP residues 391-601,780-887,924-972
链 A
780–887(108 aa)
片段:UNP residues 391-601,780-887,924-972
链 A
924–972(49 aa)
片段:UNP residues 391-601,780-887,924-972
|
未记录
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SO4 SULFATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;100 mM MES, pH 6.5, 4% PEG400, 1.6 M ammonium sulfate
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分辨率 3.00 Å
R-free 0.301
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7SMF
p107 pocket domain complexed with mutated HDAC1-3X peptide
提交 2021-10-25
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配体/离子不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
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链 C
391–601(211 aa)
片段:UNP residues 391-601,780-887,924-972
链 C
780–887(108 aa)
片段:UNP residues 391-601,780-887,924-972
链 C
924–972(49 aa)
片段:UNP residues 391-601,780-887,924-972
|
未记录
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SO4 SULFATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;277 K;100 mM MES, pH 6.5, 4% PEG400, 1.6 M ammonium sulfate
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分辨率 3.00 Å
R-free 0.301
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9C6B
PP2A:B55-p107 substrate complex
提交 2024-06-07
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
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链 D
612–687(76 aa)
片段:residues 612-687
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未记录
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FE2 FE (II) ION × 1
ZN ZINC ION × 1
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 2.60 Å
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