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7ssh

Single chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein E7 peptide,Beta-2-microglobulin,MHC class I antigen chimera

Homo sapiens

UniProt A0A678ZGP6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
10 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
11 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
12 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
13 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
14 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
15 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
16 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
3 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
4 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
5 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
6 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
7 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
8 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
9 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
7sqp 7sqp 7sr0 7sr0 7sr3 7sr3 7sr4 7sr4 7sr5 7sr5 7ssh 7ssh

共 58 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A678ZGP6_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 C； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 E； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 G； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 I； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 K； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 M； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 O； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 Q； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 S； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 U； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 W； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 Y； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 a； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 c； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299 作者链 e； PDB构建体 149–423； UniProt 25–299

Protein E7 peptide,Beta-2-microglobulin,MHC class I antigen chimera

Homo sapiens

UniProt P03129

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
10 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
11 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
12 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
13 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
14 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
15 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
16 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
3 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
4 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
5 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
6 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
7 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
8 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
9 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
7sqp 7sqp 7sr0 7sr0 7sr3 7sr3 7sr4 7sr4 7ssh 7ssh 7ssh 7ssh

共 43 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VE7_HPV16
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 C； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 E； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 G； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 I； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 K； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 M； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 O； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 Q； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 S； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 U； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 W； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 Y； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 a； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 c； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24 作者链 e； PDB构建体 1–14； UniProt 11–24

Protein E7 peptide,Beta-2-microglobulin,MHC class I antigen chimera

Homo sapiens

UniProt P16213

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
10 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
11 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
12 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
13 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
14 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
15 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
16 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
2 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
3 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
4 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
5 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
6 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
7 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
8 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致
9 信息不足 异源复合物 蛋白 2 VHH × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
7sqp 7sqp 7sr0 7sr0 7sr3 7sr3 7sr4 7sr4 7sr5 7sr5 7srk 7srk

共 60 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 B2MG_PONPY
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 C； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 E； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 G； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 I； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 K； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 M； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 O； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 Q； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 S； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 U； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 W； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 Y； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 a； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 c； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119 作者链 e； PDB构建体 30–128； UniProt 21–119

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7ssh
沉积日期 deposition_date2021-11-11
结构标题 titleSingle chain trimer HLA-A*02:01 (Y108A) with HPV.16 E7 peptide YMLDLQPETTDLYC
关键词 keywordsHLA, VHH, HPV, SCT, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7ssh__assembly_16__model_1

Assembly 16 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7ssh__assembly_16__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7ssh__assembly_16__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）25.70 Å
Rg（电子密度）24.79 Å
总 Rg25.60 Å
原子数6400
残基数468
排除体积59605 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7ssh__assembly_1__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 7ssh__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 7ssh__assembly_3__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 7ssh__assembly_4__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
5 1 7ssh__assembly_5__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
6 1 7ssh__assembly_6__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
7 1 7ssh__assembly_7__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
8 1 7ssh__assembly_8__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
9 1 7ssh__assembly_9__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
10 1 7ssh__assembly_10__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
11 1 7ssh__assembly_11__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
12 1 7ssh__assembly_12__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
13 1 7ssh__assembly_13__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
14 1 7ssh__assembly_14__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
15 1 7ssh__assembly_15__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
16 1 7ssh__assembly_16__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 引用文献 (1)