7udc

cryo-EM structures of a synaptobrevin-Munc18-1-syntaxin-1 complex class1

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 107.4 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Syntaxin-binding protein 1

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–594	突变：D326K	Syntaxin-1A × 1 （P32851） Synaptobrevin-2 × 1 （P63027）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7UDC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3C98 Revised structure of the munc18a-syntaxin1 complex 提交 2008-02-15	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；294 K；PEG400, Ammonium Acetate, Sodium Acetate, EDTA, 2-mercaptoethanol, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.60 Å R-free 0.263
3PUJ Crystal structure of the MUNC18-1 and SYNTAXIN4 N-Peptide complex 提交 2010-12-05	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% Tascimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.31 Å R-free 0.258
3PUJ Crystal structure of the MUNC18-1 and SYNTAXIN4 N-Peptide complex 提交 2010-12-05	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–594（594 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% Tascimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.31 Å R-free 0.258
4JEH Crystal Structure of Munc18a and Syntaxin1 lacking N-peptide complex 提交 2013-02-27	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；27% PEG 400, 10 mM EDTA, 10 mM DTT, 224 mM ammonium acetate, and 100 mM sodium acetate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.223
4JEH Crystal Structure of Munc18a and Syntaxin1 lacking N-peptide complex 提交 2013-02-27	突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；27% PEG 400, 10 mM EDTA, 10 mM DTT, 224 mM ammonium acetate, and 100 mM sodium acetate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.223
4JEU Crystal Structure of Munc18a and Syntaxin1 with native N-terminus complex 提交 2013-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 3–592（590 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；298 K；27% PEG 400, 10 mM EDTA, 10 mM DTT, 224 mM ammonium acetate, and 100 mM sodium acetate , pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.263
6LPC Crystal Structure of rat Munc18-1 with K332E/K333E mutation 提交 2020-01-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–594（594 aa）链 B 1–594（594 aa）	突变：K332E, K333E 突变：K332E, K333E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；289.15 K；4 M ammonium acetate, 0.1 M sodium acetate trihydrate	分辨率 3.40 Å R-free 0.331
7UDB Cryo-EM structure of a synaptobrevin-Munc18-1-syntaxin-1 complex class 2 提交 2022-03-18	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–594（594 aa）	突变：D326K	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7XSJ The structure of the Mint1/Munc18-1/syntaxin-1 complex 提交 2022-05-14	突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–594（594 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；297 K；0.2M Sodium Malonate, pH 7.0, 20% (v/v) PEG 3350	分辨率 3.20 Å R-free 0.270

共 7 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	STXB1_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 14–607； UniProt 1–594

Syntaxin-1A

Rattus norvegicus

UniProt P32851

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 2–253	突变：C145A, L165A, E166A, L205C	Syntaxin-binding protein 1 × 1 （P61765） Synaptobrevin-2 × 1 （P63027）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7UDC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1BR0 THREE DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF SYNTAXIN 1A 提交 1998-08-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 27–146（120 aa）片段：N-TERMINAL	突变：C145S	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；305 K；离子强度（mmCIF原始值）60 mM phosphate；压力 1	分辨率未提供
1EZ3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE NEURONAL T-SNARE SYNTAXIN-1A 提交 2000-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–150（127 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296 K；PEG 1500, sodium acetate, DTT, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.286
1EZ3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE NEURONAL T-SNARE SYNTAXIN-1A 提交 2000-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 24–150（127 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296 K；PEG 1500, sodium acetate, DTT, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.286
1EZ3 CRYSTAL STRUCTURE OF THE NEURONAL T-SNARE SYNTAXIN-1A 提交 2000-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 24–150（127 aa）片段：N-TERMINAL DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296 K；PEG 1500, sodium acetate, DTT, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296.0K	分辨率 1.90 Å R-free 0.286
1HVV SELF-ASSOCIATION OF THE H3 REGION OF SYNTAXIN 1A: IMPLICATIONS FOR SNARE COMPLEX ASSEMBLY 提交 2001-01-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 190–264（75 aa）片段：RESIDUES 190-264 链 B 190–264（75 aa）片段：RESIDUES 190-264 链 C 190–264（75 aa）片段：RESIDUES 190-264 链 D 190–264（75 aa）片段：RESIDUES 190-264	未记录	TAR D(-)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；sodium potassium tartrate, sodium acetate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.273
1JTH Crystal structure and biophysical properties of a complex between the N-terminal region of SNAP25 and the SNARE region of syntaxin 1a 提交 2001-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 191–267（77 aa）片段：H3, SNARE motif 链 D 191–267（77 aa）片段：H3, SNARE motif	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；294 K；ammonium sulfate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 2.00 Å R-free 0.289
1KIL Three-dimensional structure of the complexin/SNARE complex 提交 2001-12-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 192–250（59 aa）片段：SNARE motif (191-253)	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；27%(v/v) Iso-Propanol, 200mM MgCl2, 100mM Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.305
1N7S High Resolution Structure of a Truncated Neuronal SNARE Complex 提交 2002-11-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 191–256（66 aa）片段：SXc	未记录	CA CALCIUM ION × 3 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；MPD, CaCl2, MES, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 4.0K	分辨率 1.45 Å R-free 0.224
1SFC NEURONAL SYNAPTIC FUSION COMPLEX 提交 1998-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 180–262（83 aa）片段：PROTEOLYTICALLY PROTECTED FRAGMENT	未记录	SR STRONTIUM ION × 6 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；35% MPD, 5% PEG350(MME), 25MM TRIS PH 7.0,. 70MM SRCL2, 250MM UREA, 7MM SARKOSYL	分辨率 2.40 Å R-free 0.303
1SFC NEURONAL SYNAPTIC FUSION COMPLEX 提交 1998-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 180–262（83 aa）片段：PROTEOLYTICALLY PROTECTED FRAGMENT	未记录	SR STRONTIUM ION × 5 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；35% MPD, 5% PEG350(MME), 25MM TRIS PH 7.0,. 70MM SRCL2, 250MM UREA, 7MM SARKOSYL	分辨率 2.40 Å R-free 0.303
1SFC NEURONAL SYNAPTIC FUSION COMPLEX 提交 1998-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 180–262（83 aa）片段：PROTEOLYTICALLY PROTECTED FRAGMENT	未记录	SR STRONTIUM ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；35% MPD, 5% PEG350(MME), 25MM TRIS PH 7.0,. 70MM SRCL2, 250MM UREA, 7MM SARKOSYL	分辨率 2.40 Å R-free 0.303
1URQ Crystal structure of neuronal Q-SNAREs in complex with R-SNARE motif of Tomosyn 提交 2003-10-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 188–259（72 aa）片段：T-SNARE COILED-COIL HOMOLOGY, RESIDUES 188-259	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；30% MPD, 50MM CACL2, 50MM MES PH 6.0	分辨率 2.00 Å R-free 0.225
2M8R Pre-Fusion Solution NMR Structure of Neuronal SNARE Syntaxin 1A 提交 2013-05-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 183–288（106 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；313 K；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-13C; U-15N; U-2H] syntaxin, 100 mM DPC, 10 mM HEPES, 10 mM MES, 10 mM sodium acetate, 150 mM sodium chloride, 5 mM DTT, 1 mM EDTA, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] syntaxin, 100 mM [U-99% 2H] DPC, 150 mM sodium chloride, 0.02 % sodium azide, 10 mM sodium phosphate, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2N1T Dynamic binding mode of a synaptotagmin-1-SNARE complex in solution 提交 2015-04-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 188–259（72 aa）片段：UNP residues 188-259	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.4；298 K；压力 ambient NMR样品组成 30 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 25 mM Tris-HCl, 125 mM KSCN, 1 mM CaCl2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3C98 Revised structure of the munc18a-syntaxin1 complex 提交 2008-02-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–267（267 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.3；294 K；PEG400, Ammonium Acetate, Sodium Acetate, EDTA, 2-mercaptoethanol, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.60 Å R-free 0.263
3HD7 HELICAL EXTENSION OF THE NEURONAL SNARE COMPLEX INTO THE MEMBRANE, spacegroup C 1 2 1 提交 2009-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 183–288（106 aa）片段：C-terminal fragment, UNP residues 183-288	未记录	GGG glycylglycylglycine × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；29% PEG 400, 0.1M HEPES, 0.2M lithium sulfate, 0.1M sodium chloride, 0.03M glycylglycylglycine, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.40 Å R-free 0.271
3HD7 HELICAL EXTENSION OF THE NEURONAL SNARE COMPLEX INTO THE MEMBRANE, spacegroup C 1 2 1 提交 2009-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 183–288（106 aa）片段：C-terminal fragment, UNP residues 183-288	未记录	GGG glycylglycylglycine × 1 SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；293 K；29% PEG 400, 0.1M HEPES, 0.2M lithium sulfate, 0.1M sodium chloride, 0.03M glycylglycylglycine, pH 7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.40 Å R-free 0.271
3IPD Helical extension of the neuronal SNARE complex into the membrane, spacegroup I 21 21 21 提交 2009-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 183–288（106 aa）片段：C-terminal fragment, UNP Residues 183-288	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；293 K；16% MPD, 0.1M TRIS, 0.05M MAGNESIUM CHLORIDE, 3% SORBITOL, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 4.80 Å R-free 0.332
3IPD Helical extension of the neuronal SNARE complex into the membrane, spacegroup I 21 21 21 提交 2009-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 183–288（106 aa）片段：C-terminal fragment, UNP Residues 183-288	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.8；293 K；16% MPD, 0.1M TRIS, 0.05M MAGNESIUM CHLORIDE, 3% SORBITOL, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 4.80 Å R-free 0.332
3J96 Structure of 20S supercomplex determined by single particle cryoelectron microscopy (State I) 提交 2014-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 L 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40；pH 8；50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40 cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3.5 seconds before plunging；90 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).	分辨率 7.60 Å R-free 0.303
3J97 Structure of 20S supercomplex determined by single particle cryoelectron microscopy (State II) 提交 2014-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 L 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40；pH 8；50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40 cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3.5 seconds before plunging；90 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).	分辨率 7.80 Å R-free 0.311
3J98 Structure of 20S supercomplex determined by single particle cryoelectron microscopy (State IIIa) 提交 2014-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 L 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40；pH 8；50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40 cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3.5 seconds before plunging.；90 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).	分辨率 8.40 Å R-free 0.328
3J99 Structure of 20S supercomplex determined by single particle cryoelectron microscopy (State IIIb) 提交 2014-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric	链 L 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40；pH 8；50 mM Tris-Cl, 150 mM NaCl, 1 mM AMPPNP, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.05% v/v Nonident P-40 cryo-EM玻璃化条件 Blot for 3.5 seconds before plunging.；77 K；冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK I).	分辨率 8.20 Å R-free 0.304
3RK2 Truncated SNARE complex 提交 2011-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 191–253（63 aa）片段：UNP residues 191-253	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；294 K；0.05 M calcium acetate, 27% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5-7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 2.20 Å R-free 0.268
3RK2 Truncated SNARE complex 提交 2011-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 191–253（63 aa）片段：UNP residues 191-253	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；294 K；0.05 M calcium acetate, 27% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5-7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 2.20 Å R-free 0.268
3RK3 Truncated SNARE complex with complexin 提交 2011-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 191–253（63 aa）片段：UNP residues 191-253	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.50 Å R-free 0.316
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 191–253（63 aa）片段：UNP residues 191-253	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 F 191–253（63 aa）片段：UNP residues 191-253	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 J 191–253（63 aa）片段：UNP residues 191-253	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 N 191–253（63 aa）片段：UNP residues 191-253	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 191–253（63 aa）片段：UNP residues 191-253	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 V 191–253（63 aa）片段：UNP residues 191-253	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 Z 191–253（63 aa）片段：UNP residues 191-253	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 d 191–253（63 aa）片段：UNP residues 191-253	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
4JEH Crystal Structure of Munc18a and Syntaxin1 lacking N-peptide complex 提交 2013-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–266（243 aa）片段：unp residues 24-266	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；27% PEG 400, 10 mM EDTA, 10 mM DTT, 224 mM ammonium acetate, and 100 mM sodium acetate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.223
4JEH Crystal Structure of Munc18a and Syntaxin1 lacking N-peptide complex 提交 2013-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 24–266（243 aa）片段：unp residues 24-266	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；27% PEG 400, 10 mM EDTA, 10 mM DTT, 224 mM ammonium acetate, and 100 mM sodium acetate , pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.50 Å R-free 0.223
4JEU Crystal Structure of Munc18a and Syntaxin1 with native N-terminus complex 提交 2013-02-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–243（242 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；298 K；27% PEG 400, 10 mM EDTA, 10 mM DTT, 224 mM ammonium acetate, and 100 mM sodium acetate , pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.20 Å R-free 0.263
5CCG Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) 提交 2015-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	CA CALCIUM ION × 18	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2	分辨率 3.50 Å R-free 0.352
5CCG Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) 提交 2015-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	CA CALCIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2	分辨率 3.50 Å R-free 0.352
5CCH Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (short unit cell form) 提交 2015-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	CA CALCIUM ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2	分辨率 3.60 Å R-free 0.289
5CCI Structure of the Mg2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (short unit cell form) 提交 2015-07-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	MG MAGNESIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.75% v/v PEG3350, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2	分辨率 4.10 Å R-free 0.323
5KJ7 Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) - from XFEL diffraction 提交 2016-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	CA CALCIUM ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2	分辨率 3.50 Å R-free 0.329
5KJ7 Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) - from XFEL diffraction 提交 2016-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	CA CALCIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2	分辨率 3.50 Å R-free 0.329
5KJ8 Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) - from synchrotron diffraction 提交 2016-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2	分辨率 4.10 Å R-free 0.297
5KJ8 Structure of the Ca2+-bound synaptotagmin-1 SNARE complex (long unit cell form) - from synchrotron diffraction 提交 2016-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；0.25% v/v PEG8000, 25 mM HEPES-Na, 75 mM NaCl, 25 mM MgCl2, 0.25 mM CaCl2	分辨率 4.10 Å R-free 0.297
5W5C Crystal structure of the primed SNARE-Complexin-Synaptotagmin-1 C2AB complex 提交 2017-06-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 B 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM HEPES, pH7.4, 15-20% PEG3350, 200 mM ammonium formate	分辨率 1.85 Å R-free 0.232
5W5D Crystal structure of the primed SNARE-Complexin-Synaptotagmin-1 C2B complex 提交 2017-06-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 B 191–256（66 aa）片段：UNP residues 191-256	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；100 mM HEPES, pH7.0, 15-17% PEG3350, 240 mM sodium malonate	分辨率 2.50 Å R-free 0.231
6IP1 alpha-SNAP-SNARE subcomplex in the whole 20S complex 提交 2018-11-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 2–253（252 aa）片段：UNP residues 2-253	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6MDM The 20S supercomplex engaging the SNAP-25 N-terminus (class 1) 提交 2018-09-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 I 1–256（256 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging.	分辨率 4.40 Å
6MDN The 20S supercomplex engaging the SNAP-25 N-terminus (class 2) 提交 2018-09-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 I 1–256（256 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 9 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 3.5 seconds before plunging.	分辨率 4.40 Å
6MTI Synaptotagmin-1 C2A, C2B domains and SNARE-pin proteins (5CCI) individually docked into Cryo-EM map of C2AB-SNARE complexes helically organized on lipid nanotube surface in presence of Mg2+ 提交 2018-10-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：30-meric	链 B 191–256（66 aa）片段：residues 191-256 链 F 191–256（66 aa）片段：residues 191-256 链 J 191–256（66 aa）片段：residues 191-256 链 N 191–256（66 aa）片段：residues 191-256 链 R 191–256（66 aa）片段：residues 191-256 链 V 191–256（66 aa）片段：residues 191-256	未记录	MG MAGNESIUM ION × 10	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.40 Å
6WVW Crystal structure of the R59P-SNAP25 containing SNARE complex 提交 2020-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 191–256（66 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM MES (pH 6.0), 100 mM CaCl2, 20-25% (v/v)	分辨率 2.11 Å R-free 0.244
6WVW Crystal structure of the R59P-SNAP25 containing SNARE complex 提交 2020-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 F 191–256（66 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；100 mM MES (pH 6.0), 100 mM CaCl2, 20-25% (v/v)	分辨率 2.11 Å R-free 0.244
7UDB Cryo-EM structure of a synaptobrevin-Munc18-1-syntaxin-1 complex class 2 提交 2022-03-18	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2–253（252 aa）	突变：C145A,L165A,E166A,L205C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
7XSJ The structure of the Mint1/Munc18-1/syntaxin-1 complex 提交 2022-05-14	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 25–267（243 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；297 K；0.2M Sodium Malonate, pH 7.0, 20% (v/v) PEG 3350	分辨率 3.20 Å R-free 0.270
9OJZ 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 5 提交 2025-05-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–267（267 aa）链 H 1–267（267 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.39 Å
9OK3 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), 3:2:1 alphaSNAP-syntaxin-1a-SNAP-25 subcomplex local refinement, non-hydrolyzing, class 13 提交 2025-05-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–267（267 aa）链 B 1–267（267 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.74 Å
9OLO 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 19 提交 2025-05-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 G 1–267（267 aa）链 H 1–267（267 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 10 PO4 PHOSPHATE ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.56 Å
9OM6 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), 4:2:2 alphaSNAP-syntaxin-1a-SNAP-25 subcomplex local refinement, hydrolyzing, class 23 提交 2025-05-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–267（267 aa）链 B 1–267（267 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.14 Å
9PAF 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 6 提交 2025-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–267（267 aa）链 H 1–267（267 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.82 Å
9PAG 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 7 提交 2025-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–267（267 aa）链 H 1–267（267 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.62 Å
9PB9 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 8 提交 2025-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–267（267 aa）链 H 1–267（267 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.45 Å
9PBA 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 9 提交 2025-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–267（267 aa）链 H 1–267（267 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
9PBF 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 10 提交 2025-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–267（267 aa）链 I 1–267（267 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.01 Å
9PBV 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 11 提交 2025-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–267（267 aa）链 L 1–267（267 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.91 Å
9PC3 21bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:1 syntaxin-1a:SNAP-25), non-hydrolyzing, class 12 提交 2025-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 1–267（267 aa）链 H 1–267（267 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.69 Å
9PCX 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 14 提交 2025-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 G 1–267（267 aa）链 H 1–267（267 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 PO4 PHOSPHATE ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.03 Å
9PCZ 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 15 提交 2025-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 I 1–267（267 aa）链 J 1–267（267 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 10 PO4 PHOSPHATE ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.65 Å
9PD1 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 20 提交 2025-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 G 1–267（267 aa）链 H 1–267（267 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9PD8 22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a:SNAP-25), hydrolyzing, class 21 提交 2025-06-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 G 1–267（267 aa）链 H 1–267（267 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.23 Å
9PFF Min22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a H3:SNAP-25 SN1), non-hydrolyzing, class 27 提交 2025-07-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 H 191–267（77 aa）链 J 191–267（77 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.09 Å
9PFG Min22bin20S complex (NSF-alphaSNAP-2:2 syntaxin-1a H3:SNAP-25 SN1), 4:2:2 alphaSNAP-syntaxin-1a H3-SNAP-25 SN1 subcomplex local refinement, non-hydrolyzing, class 28 提交 2025-07-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 B 191–267（77 aa）链 D 191–267（77 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.58 Å

共 53 个其他 PDB 条目、72 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	STX1A_RAT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–254； UniProt 2–253

Synaptobrevin-2

Rattus norvegicus

UniProt P63027

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 29–83	突变：Q36C	Syntaxin-binding protein 1 × 1 （P61765） Syntaxin-1A × 1 （P32851）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7UDC	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
3FIE Crystal structure of Clostridium botulinum neurotoxin serotype F catalytic domain with an inhibitor (inh1) 提交 2008-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 22–58（37 aa）片段：residues 22-58	突变：Q58DCY 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M Bis-tris, 25% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.279
3FIE Crystal structure of Clostridium botulinum neurotoxin serotype F catalytic domain with an inhibitor (inh1) 提交 2008-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 22–58（37 aa）片段：residues 22-58	突变：Q58DCY 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M Bis-tris, 25% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.279
3FII Crystal structure of Clostridium botulinum neurotoxin serotype F catalytic domain with an inhibitor (inh2) 提交 2008-12-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 22–53（32 aa）片段：residues 27-58	突变：Q58DCY 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；298 K；0.1M Bis-tris, 25% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.17 Å R-free 0.290
3RK2 Truncated SNARE complex 提交 2011-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 28–60（33 aa）片段：UNP residues 28-60	未记录	CA CALCIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；294 K；0.05 M calcium acetate, 27% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5-7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 2.20 Å R-free 0.268
3RK2 Truncated SNARE complex 提交 2011-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 28–60（33 aa）片段：UNP residues 28-60	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；294 K；0.05 M calcium acetate, 27% 2-methyl-2,4-pentanediol (MPD), 0.1 M sodium cacodylate pH 6.5-7.0, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 2.20 Å R-free 0.268
3RK3 Truncated SNARE complex with complexin 提交 2011-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 28–60（33 aa）片段：UNP residues 28-60	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.50 Å R-free 0.316
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 28–60（33 aa）片段：UNP residues 28-60	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 28–60（33 aa）片段：UNP residues 28-60	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 I 28–60（33 aa）片段：UNP residues 28-60	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 M 28–60（33 aa）片段：UNP residues 28-60	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 Q 28–60（33 aa）片段：UNP residues 28-60	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 U 28–60（33 aa）片段：UNP residues 28-60	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 Y 28–60（33 aa）片段：UNP residues 28-60	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
3RL0 Truncated SNARE complex with complexin (P1) 提交 2011-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 c 28–60（33 aa）片段：UNP residues 28-60	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；294 K；13-15% polyethyleneglycol (PEG) 5000MME, 0.2 M ammonium sulfate, 0.01 M EDTA, and 0.1 M Tris pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 294K	分辨率 3.80 Å R-free 0.345
9CKX Crystal structure of Dsk2 Sti1 domain bound to a transmembrane domain 提交 2024-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 95–114（20 aa）链 B 95–114（20 aa）	突变：I98A,I102A,I106A,I108A,I110A,I111A (Uniprot Vamp2 numbering) in the Vamp2 segment 突变：I98A,I102A,I106A,I108A,I110A,I111A (Uniprot Vamp2 numbering) in the Vamp2 segment	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；2.5% MPD, 100 mM Tris pH 8.5	分辨率 1.98 Å R-free 0.232

共 6 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VAMP2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 5–59； UniProt 29–83

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7udc
沉积日期 deposition_date	2022-03-18
结构标题 title	cryo-EM structures of a synaptobrevin-Munc18-1-syntaxin-1 complex class1
关键词 keywords	Munc18, syntaxin, synaptobrevin, SNARE, membrane fusion, neurotransmitter release, EXOCYTOSIS; EXOCYTOSIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	32.33 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	31.43 Å
零角强度 I(0) i0	135808000.00
分子量 molecular_weight	91616.0 kDa
排除体积 excluded_volume	114550 Å³
包络体积 envelope_volume	155280 Å³
水化壳体积 shell_volume	40925 Å³
包络直径 envelope_diameter	113.0 Å
壳层 Rg shell_rg	38.48 Å
包络 Rg envelope_rg	31.57 Å
形状 Rg shape_rg	31.43 Å
总 Rg total_rg	32.07 Å
总原子数 total_atoms	6425
残基数 n_residues	806
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	107.4 Å
Rg (实空间) rg_real	32.28 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.77 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3580e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.2720e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	32.31 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	135800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7206
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	37.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.270
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.465
角度范围 angular_range	— – 0.2450 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	37960000.0000
实空间数据点数 n_real_points	50
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.888; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.242; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.975

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Syntaxin-binding protein 1
分子量 formula_weight	68714.9 kDa
突变 mutation	D326K
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	6425

GSPGISGGGGGIHMAPIGLKAVVGEKIMHDVIKKVKKKGEWKVLVVDQLSMRMLSSCCKMTDIMTEGITIVEDINKRREPLPSLEAVYLITPSEKSVHSLISDFKDPPTAKYRAAHVFFTDSCPDALFNELVKSRAAKVIKTLTEINIAFLPYESQVYSLDSADSFQSFYSPHKAQMKNPILERLAEQIATLCATLKEYPAVRYRGEYKDNALLAQLIQDKLDAYKADDPTMGEGPDKARSQLLILDRGFDPSSPVLHELTFQAMSYDLLPIENDVYKYETSGIGEARVKEVLLDEDDDLWIALRHKHIAEVSQEVTRSLKDFSSSKRMNTGEKTTMRKLSQMLKKMPQYQKELSKYSTHLHLAEDCMKHYQGTVDKLCRVEQDLAMGTDAEGEKIKDPMRAIVPILLDANVSTYDKIRIILLYIFLKNGITEENLNKLIQHAQIPPEDSEIITNMAHLGVPIVTDSTLRRRSKPERKERISEQTYQLSRWTPIIKDIMEDTIEDKLDTKHYPYISTRSSASFSTTAVSARYGHWHKNKAPGEYRSGPRLIIFILGGVSLNEMRCAYEVTQANGKWEVLIGSTHILTPQKLLDTLKKLNKTDEEISS

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Syntaxin-1A
分子量 formula_weight	29221.5 kDa
突变 mutation	C145A, L165A, E166A, L205C
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

GSKDRTQELRTAKDSDDDDDVTVTVDRDRFMDEFFEQVEEIRGFIDKIAENVEEVKRKHSAILASPNPDEKTKEELEELMSDIKKTANKVRSKLKSIEQSIEQEEGLNRSSADLRIRKTQHSTLSRKFVEVMSEYNATQSDYRERAKGRIQRQLEITGRTTTSEEAADMLESGNPAIFASGIIMDSSISKQALSEIETRHSEIIKCENSIRELHDMFMDMAMLVESQGEMIDRIEYNVEHAVDYVERAVSDTKK

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Synaptobrevin-2
分子量 formula_weight	6645.4 kDa
突变 mutation	Q36C
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GSMWNRRLQQTCAQVDEVVDIMRVNVDKVLERDQKLSELDDRADALQAGASQFETSAAK

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	7udcA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2060 — Sec1/Munc18 (SM) protein, domain 1

结构域编号 domain_id	7udcA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	830 — Syntaxin Binding Protein 1; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Sec1/Munc18 (SM) protein, domain 3a

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.70 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	331649

fit	/app/data/saxs_computation/ud/7udc/7udc.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ud/7udc/7udc.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ud/7udc/7udc.dat

cryo-EM structures of a synaptobrevin-Munc18-1-syntaxin-1 complex class1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Syntaxin-binding protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Syntaxin-1A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Synaptobrevin-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)