SAXSdb — 7une

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type proton ATPase catalytic subunit A

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	V-type proton ATPase subunit D × 1 （A0A3Q1M4W9） KIAA1609 protein, isoform CRA_a × 1 （D3DUL8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P11019） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P31408） V-type proton ATPase subunit G × 3 （Q0VCV6）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VATA_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–617； UniProt 1–617 作者链 M； PDB构建体 1–617； UniProt 1–617 作者链 N； PDB构建体 1–617； UniProt 1–617

V-type proton ATPase subunit D

物种未注明

UniProt A0A3Q1M4W9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P31404） KIAA1609 protein, isoform CRA_a × 1 （D3DUL8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P11019） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P31408） V-type proton ATPase subunit G × 3 （Q0VCV6）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A3Q1M4W9_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–247； UniProt 1–247

KIAA1609 protein, isoform CRA_a

Homo sapiens

UniProt D3DUL8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P31404） V-type proton ATPase subunit D × 1 （A0A3Q1M4W9） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P11019） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P31408） V-type proton ATPase subunit G × 3 （Q0VCV6）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	D3DUL8_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 9–463； UniProt 2–456

V-type proton ATPase subunit E 1

物种未注明

UniProt P11019

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P31404） V-type proton ATPase subunit D × 1 （A0A3Q1M4W9） KIAA1609 protein, isoform CRA_a × 1 （D3DUL8） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P31408） V-type proton ATPase subunit G × 3 （Q0VCV6）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VATE1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–226； UniProt 1–226 作者链 c； PDB构建体 1–226； UniProt 1–226 作者链 d； PDB构建体 1–226； UniProt 1–226

V-type proton ATPase subunit B, brain isoform

物种未注明

UniProt P31408

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P31404） V-type proton ATPase subunit D × 1 （A0A3Q1M4W9） KIAA1609 protein, isoform CRA_a × 1 （D3DUL8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P11019） V-type proton ATPase subunit G × 3 （Q0VCV6）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	VATB2_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–511； UniProt 1–511 作者链 P； PDB构建体 1–511； UniProt 1–511 作者链 Q； PDB构建体 1–511； UniProt 1–511

V-type proton ATPase subunit G

物种未注明

UniProt Q0VCV6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	V-type proton ATPase catalytic subunit A × 3 （P31404） V-type proton ATPase subunit D × 1 （A0A3Q1M4W9） KIAA1609 protein, isoform CRA_a × 1 （D3DUL8） V-type proton ATPase subunit E 1 × 3 （P11019） V-type proton ATPase subunit B, brain isoform × 3 （P31408）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q0VCV6_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 e； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118 作者链 f； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118 作者链 g； PDB构建体 1–118； UniProt 1–118

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7une
沉积日期 deposition_date	2022-04-10
结构标题 title	The V1 region of bovine V-ATPase in complex with human mEAK7 (focused refinement)
关键词 keywords	proton transport, mTOR signaling; PROTON TRANSPORT
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7une__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7une__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7une__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	54.68 Å
Rg（电子密度）	54.15 Å
总 Rg	54.36 Å
原子数	36209
残基数	4663
排除体积	645420 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7une__assembly_1__model_1`	tetradecameric （14）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	V-type proton ATPase catalytic subunit A
分子量 formula_weight	68420.9 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.2.2
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,M,N
原子数 atom_count	36209

MDFSKLPKIRDEDKESTFGYVHGVSGPVVTACDMAGAAMYELVRVGHSELVGEIIRLEGDMATIQVYEETSGVSVGDPVLRTGKPLSVELGPGIMGAIFDGIQRPLSDISSQTQSIYIPRGVNVSALSRDVKWDFTPCKNLRVGSHITGGDIYGIVNENSLIKHKIMLPPRNRGTVTYIAPPGNYDTSDVVLELEFEGIKEKFSMVQVWPVRQVRPVTEKLPANHPLLTGQRVLDALFPCVQGGTTAIPGAFGCGKTVISQSLSKYSNSDVIIYVGCGERGNEMSEVLRDFPELTMEVDGKVESIMKRTALVANTSNMPVAAREASIYTGITLSEYFRDMGYHVSMMADSTSRWAEALREISGRLAEMPADSGYPAYLGARLASFYERAGRVKCLGNPEREGSVSIVGAVSPPGGDFSDPVTSATLGIVQVFWGLDKKLAQRKHFPSVNWLISYSKYMRALDEYYDKHFTEFVPLRTKAKEILQEEEDLAEIVQLVGKASLAETDKITLEVAKLIKDDFLQQNGYTPYDRFCPFYKTVGMLSNMIAFYDMARRAVETTAQSDNKITWSIIREHMGEILYKLSSMKFKDPVKDGEAKIKADYAQLLEDMQNAFRSLED

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit D
分子量 formula_weight	28297.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MSGKDRIEIFPSRMAQTIMKARLKGAQTGRNLLKKKSDALTLRFRQILKKIIETKMLMGEVMREAAFSLAEAKFTAGDFSTTVIQNVNKAQVKIRAKKDNVAGVTLPVFEHYHEGTDSYELTGLARGGEQLAKLKRNYAKAVELLVELASLQTSFVTLDEAIKITNRRVNAIEHVIIPRIERTLAYIITELDEREREEFYRLKKIQEKKKILKEKSDKDLEQRRAAGEVIEPANLLAEEKDEDLLFE

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	KIAA1609 protein, isoform CRA_a
分子量 formula_weight	51982.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MGHHHHHHGNSRSRVGRSFCSQFLPEEQAEIDQLFDALSSDKNSPNVSSKSFSLKALQNHVGEALPPEMVTRLYDGMRRVDLTGKAKGPSENVSQEQFTASMSHLLKGNSEEKSLMIMKMISATEGPVKAREVQKFTEDLVGSVVHVLSHRQELRGWTGKEAPGPNPRVQVLAAQLLSDMKLQDGKRLLGPQWLDYDCDRAVIEDWVFRVPHVAIFLSVVICKGFLVLCSSLDLTTLVPERQVDQGRGFESILDVLSVMYINAQLPREQRHRWRLLFSSELHGHSFSQLCGHITHRGPCVAVLEDHDKHVFGGFASCSWEVKPQFQGDNRCFLFSICPSMAVYTHTGYNDHYMYLNHGQQTIPNGLGMGGQHNYFGLWVDVDFGKGHSRAKPTCTTYNSPQLSAQENFQFDKMEVWAVGDPSEEQLAKGNKSILDADPEAQALLEISGHSRHSEGLREVPDDE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit E 1
分子量 formula_weight	26178.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d,b,c

MALSDADVQKQIKHMMAFIEQEANEKAEEIDAKAEEEFNIEKGRLVQTQRLKIMEYYEKKEKQIEQQKKIQMSNLMNQARLKVLRARDDLITDLLNEAKQRLSKVVKDTTRYQVLLDGLVLQGLYQLLEPRMIVRCRKQDFPLVKAAVQKAIPVYKVATKRDVDVQIDQEAYLPEEIAGGVEIYNGDRKIKVSNTLESRLDLIAQQMMPEVRGALFGANANRKFLD

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit B, brain isoform
分子量 formula_weight	56637.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q,O,P

MALRAMRGIVNGAAPELPVPTSGPLAGSREQALAVSRNYLSQPRLTYKTVSGVNGPLVILDHVKFPRYAEIVHLTLPDGTKRSGQVLEVSGSKAVVQVFEGTSGIDAKKTSCEFTGDILRTPVSEDMLGRVFNGSGKPIDRGPVVLAEDFLDIMGQPINPQCRIYPEEMIQTGISAIDGMNSIARGQKIPIFSAAGLPHNEIAAQICRQAGLVKKSKDVVDYSEENFAIVFAAMGVNMETARFFKSDFEENGSMDNVCLFLNLANDPTIERIITPRLALTTAEFLAYQCEKHVLVILTDMSSYAEALREVSAAREEVPGRRGFPGYMYTDLATIYERAGRVEGRNGSITQIPILTMPNDDITHPIPDLTGYITEGQIYVDRQLHNRQIYPPINVLPSLSRLMKSAIGEGMTRKDHADVSNQLYACYAIGKDVQAMKAVVGEEALTSDDLLYLEFLQKFERNFIAQGPYENRTVYETLDIGWQLLRIFPKEMLKRIPQSTLSEFYPRDSAKH

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	V-type proton ATPase subunit G
分子量 formula_weight	13588.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g,e,f

MASQSQGIQQLLQAEKRAAEKVADARKRKARRLKQAKEEAQMEVDQYRREREQEFQSKQQAAMGSQGNLSAEVEQATRRQVQGMQSSQQRNRERVLAQLLGMVCDVRPQVHPNYRIAA

▶

分辨率 resolution	3.73 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	13841

The V1 region of bovine V-ATPase in complex with human mEAK7 (focused refinement)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

V-type proton ATPase catalytic subunit A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

KIAA1609 protein, isoform CRA_a

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit E 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit B, brain isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

V-type proton ATPase subunit G

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7une__assembly_1__model_1

7une__assembly_1__model_1 | I(q)

7une__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)