Oryctolagus cuniculus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 12 | Alpha-catenin-like protein hmp-1 × 6 （P90947） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MAGNESIUM ION × 6 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | ACTS_RABIT |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 B； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 C； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 D； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 E； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 作者链 F； PDB构建体 1–377； UniProt 1–377 |
Caenorhabditis elegans
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 12 | Actin, alpha skeletal muscle × 6 （P68135） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MAGNESIUM ION × 6 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | HMP1_CAEEL |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 G； PDB构建体 1–251； UniProt 677–927 作者链 H； PDB构建体 1–251； UniProt 677–927 作者链 I； PDB构建体 1–251； UniProt 677–927 作者链 K； PDB构建体 1–251； UniProt 677–927 作者链 L； PDB构建体 1–251； UniProt 677–927 作者链 Z； PDB构建体 1–251； UniProt 677–927 |
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| 条目编号 entry_id | 7uuw |
| 沉积日期 deposition_date | 2022-04-29 |
| 结构标题 title | Cryogenic electron microscopy 3D map of F-actin bound by the Actin Binding Domain of alpha-catenin ortholog, HMP1 |
| 关键词 keywords | alpha-catenin, HMP1, Actin Binding Domain, F-actin, F-actin binding protein, cell-cell junction, CELL ADHESION; CELL ADHESION |
| 实验方法 method | ELECTRON MICROSCOPY |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 56.81 Å |
| Rg（电子密度） | 57.33 Å |
| 总 Rg | 57.31 Å |
| 原子数 | 24852 |
| 残基数 | 3168 |
| 排除体积 | 444350 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 7uuwG01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 230 — Alpha-catenin/vinculin-like |
| 结构域编号 domain_id | 7uuwH01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 230 — Alpha-catenin/vinculin-like |
| 结构域编号 domain_id | 7uuwI01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 230 — Alpha-catenin/vinculin-like |
| 结构域编号 domain_id | 7uuwK01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 230 — Alpha-catenin/vinculin-like |
| 结构域编号 domain_id | 7uuwL01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 230 — Alpha-catenin/vinculin-like |
| 结构域编号 domain_id | 7uuwZ01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 230 — Alpha-catenin/vinculin-like |