SAXSdb — 7v1m

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H3.3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone H4 × 1 （P62805） Histone chaperone ASF1B × 1 （Q9NVP2） Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein × 1 （P49321-2）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone H4 × 1 （P62805） Histone chaperone ASF1B × 1 （Q9NVP2） Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein × 1 （P49321-2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H33_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–135； UniProt 2–136 作者链 B； PDB构建体 1–135； UniProt 2–136

Histone H4

Homo sapiens

UniProt P62805

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone H3.3 × 1 （P84243） Histone chaperone ASF1B × 1 （Q9NVP2） Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein × 1 （P49321-2）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone H3.3 × 1 （P84243） Histone chaperone ASF1B × 1 （Q9NVP2） Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein × 1 （P49321-2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–102； UniProt 2–103 作者链 E； PDB构建体 1–102； UniProt 2–103

Histone chaperone ASF1B

Homo sapiens

UniProt Q9NVP2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone H3.3 × 1 （P84243） Histone H4 × 1 （P62805） Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein × 1 （P49321-2）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone H3.3 × 1 （P84243） Histone H4 × 1 （P62805） Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein × 1 （P49321-2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ASF1B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158 作者链 F； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158

Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein

Homo sapiens

UniProt P49321-2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone H3.3 × 1 （P84243） Histone H4 × 1 （P62805） Histone chaperone ASF1B × 1 （Q9NVP2）	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Histone H3.3 × 1 （P84243） Histone H4 × 1 （P62805） Histone chaperone ASF1B × 1 （Q9NVP2）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	NASP-2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–71； UniProt 30–100 作者链 G； PDB构建体 72–235； UniProt 160–323 作者链 H； PDB构建体 1–71； UniProt 30–100 作者链 H； PDB构建体 72–235； UniProt 160–323

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7v1m
沉积日期 deposition_date	2021-08-04
结构标题 title	Structural basis for the co-chaperone relationship of sNASP and ASF1b
关键词 keywords	histone chaperone, CHAPERONE; CHAPERONE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7v1m__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7v1m__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7v1m__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.67 Å
Rg（电子密度）	25.79 Å
总 Rg	26.60 Å
原子数	3888
残基数	502
排除体积	68731 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7v1m__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`7v1m__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Histone H3.3
分子量 formula_weight	15229.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,A
原子数 atom_count	7966

ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPSTGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSAAIGALQEASEAYLVGLFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ;

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	11263.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,E

SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ;

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Histone chaperone ASF1B
分子量 formula_weight	17915.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,F

MAKVSVLNVAVLENPSPFHSPFRFEISFECSEALADDLEWKIIYVGSAESEEFDQILDSVLVGPVPAGRHMFVFQADAPNPSLIPETDAVGVTVVLITCTYHGQEFIRVGYYVNNEYLNPELRENPPMKPDFSQLQRNILASNPRVTRFHINWDNNMD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ;

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein
分子量 formula_weight	26576.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,H

SADKVESLDVDSEAKKLLGLGQKHLVMGDIPAAVNAFQEAASLLGKKYGETANECGEAFFFYGKSLLELARLENKSLQENEEEEIGNLELAWDMLDLAKIIFKRQETKEAQLYAAQAHLKLGEVSVESENYVQAVEEFQSCLNLQEQYLEAHDRLLAETHYQLGLAYGYNSQYDEAVAQFSKSIEVIENRMAVLNEQVKEAEGSSAEYKKEIEELKELLPEIREKIEDAKESQRS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ;

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晶胞边长 a length_a	71.951 Å
晶胞边长 b length_b	71.896 Å
晶胞边长 c length_c	93.427 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	70.67 °
晶胞夹角 β angle_beta	70.64 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	83.61 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.834 Å
最低分辨率 resolution_low	35.588 Å
R 因子 r_factor	0.2097
R_work r_work	0.2023
R_free r_free	0.2403

Structural basis for the co-chaperone relationship of sNASP and ASF1b

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H3.3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone chaperone ASF1B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7v1m__assembly_2__model_1

7v1m__assembly_2__model_1 | I(q)

7v1m__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Structural basis for the co-chaperone relationship of sNASP and ASF1b

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H3.3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone chaperone ASF1B

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Isoform 2 of Nuclear autoantigenic sperm protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

7v1m__assembly_2__model_1

7v1m__assembly_2__model_1 | I(q)

7v1m__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)