7vvy

TRA module of NuA4

Method: ELECTRON MICROSCOPY
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chromatin modification-related protein EAF1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q06337

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Actin-related protein 4 × 1 (P80428) Actin × 1 (P60010) SWR1-complex protein 4 × 1 (P53201) Enhancer of polycomb-like protein 1 × 1 (P43572) Transcription-associated protein 1 × 1 (P38811) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EAF1_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–982; UniProt 1–982

Actin-related protein 4

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P80428

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 (Q06337) Actin × 1 (P60010) SWR1-complex protein 4 × 1 (P53201) Enhancer of polycomb-like protein 1 × 1 (P43572) Transcription-associated protein 1 × 1 (P38811) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARP4_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–489; UniProt 1–489

Actin

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P60010

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 (Q06337) Actin-related protein 4 × 1 (P80428) SWR1-complex protein 4 × 1 (P53201) Enhancer of polycomb-like protein 1 × 1 (P43572) Transcription-associated protein 1 × 1 (P38811) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACT_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375

SWR1-complex protein 4

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P53201

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 (Q06337) Actin-related protein 4 × 1 (P80428) Actin × 1 (P60010) Enhancer of polycomb-like protein 1 × 1 (P43572) Transcription-associated protein 1 × 1 (P38811) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SWC4_YEAST
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–476; UniProt 1–476

Enhancer of polycomb-like protein 1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P43572

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 (Q06337) Actin-related protein 4 × 1 (P80428) Actin × 1 (P60010) SWR1-complex protein 4 × 1 (P53201) Transcription-associated protein 1 × 1 (P38811) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EPL1_YEAST
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–832; UniProt 1–832

Transcription-associated protein 1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38811

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 6 Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 (Q06337) Actin-related protein 4 × 1 (P80428) Actin × 1 (P60010) SWR1-complex protein 4 × 1 (P53201) Enhancer of polycomb-like protein 1 × 1 (P43572) MAGNESIUM ION × 2 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TRA1_YEAST
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–3744; UniProt 1–3744

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7vvy
沉积日期 deposition_date2021-11-09
结构标题 titleTRA module of NuA4
关键词 keywordsNuA4 Tra1, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7vvy__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7vvy__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7vvy__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)70.79 Å
Rg(电子密度)71.05 Å
总 Rg71.01 Å
原子数42546
残基数5205
排除体积764080 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7vvy__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id7vvyG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4
▶

7. 引用文献 (1)