SAXSdb — 7wlt

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白同源多聚体同源多聚体蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–2547 链 C； UniProt 1–2547 链 E； UniProt 1–2547	未记录	PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 21 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 3 P5S O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.46 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7WLT	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
11YE Curved structure of mPiezo1 in plasma membrane vesicles 提交 2026-03-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–2547（2547 aa）链 D 1–2547（2547 aa）链 E 1–2547（2547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
11ZC Flat structure of mPiezo1 in plasma membrane vesicles 提交 2026-03-19	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–2547（2547 aa）链 C 1–2547（2547 aa）链 E 1–2547（2547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.00 Å
3JAC Cryo-EM study of a channel 提交 2015-06-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1959–2547（589 aa）链 B 1959–2547（589 aa）链 C 1959–2547（589 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2；25 mM NaPIPES, 140 mM NaCl, 2 mM DTT and 0.026% (w/v) C12E10 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
4RAX A regulatory domain of an ion channel 提交 2014-09-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2214–2457（244 aa）片段：UNP residues 2214-2457	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.2M Magnesium chloride, 0.1M Hepes pH 7.5, 25% w/w PEG3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 291K	分辨率 1.45 Å R-free 0.176
5Z10 Structure of the mechanosensitive Piezo1 channel 提交 2017-12-22	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–2547（2547 aa）链 B 1–2547（2547 aa）链 C 1–2547（2547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；After a 15 sec waiting time, the grids were blotted for 3.5 sec and plunged into liquid ethane	分辨率 3.97 Å
6B3R Structure of the mechanosensitive channel Piezo1 提交 2017-09-22	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–2547（2547 aa）链 C 1–2547（2547 aa）链 E 1–2547（2547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 1 second with -1 force before plunging	分辨率 3.80 Å
6BPZ Structure of the mechanically activated ion channel Piezo1 提交 2017-11-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1137–1597（461 aa）链 A 1657–2547（891 aa）链 B 1137–1597（461 aa）链 B 1657–2547（891 aa）链 C 1137–1597（461 aa）链 C 1657–2547（891 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
6LQI Cryo-EM structure of the mouse Piezo1 isoform Piezo1.1 提交 2020-01-13	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–2547（2547 aa）链 B 1–2547（2547 aa）链 C 1–2547（2547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
7WLU The Flattened Structure of mPIEZO1 in Lipid Bilayer 提交 2022-01-13	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–2547（2547 aa）链 C 1–2547（2547 aa）链 E 1–2547（2547 aa）	未记录	PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.81 Å
8IMZ Cryo-EM structure of mouse Piezo1-MDFIC complex (composite map) 提交 2023-03-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–2547（2547 aa）链 B 1–2547（2547 aa）链 C 1–2547（2547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.66 Å
8IXN Curved structure of mPIEZO1-S2472E 提交 2023-04-01	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–2547（2547 aa）链 C 1–2547（2547 aa）链 D 1–2547（2547 aa）	突变：S2472E 突变：S2472E 突变：S2472E	PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 6 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 3 P5S O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.07 Å
8IXO Intermediate structure of mPIEZO1-S2472E 提交 2023-04-01	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–2547（2547 aa）链 B 1–2547（2547 aa）链 F 1–2547（2547 aa）	突变：S2472E 突变：S2472E 突变：S2472E	PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 6 P5S O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine × 6 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.3 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
9VED The cryo-EM structure of mouse Piezo1-MDFI complex 提交 2025-06-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–2547（2547 aa）链 B 1–2547（2547 aa）链 C 1–2547（2547 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.63 Å

共 13 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PIEZ1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–2547； UniProt 1–2547 作者链 C； PDB构建体 1–2547； UniProt 1–2547 作者链 E； PDB构建体 1–2547； UniProt 1–2547

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7wlt
沉积日期 deposition_date	2022-01-13
结构标题 title	the Curved Structure of mPIEZO1 in Lipid Bilayer
关键词 keywords	Force, Flexible, Complex, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	65.94 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	64.29 Å
零角强度 I(0) i0	2670390000.00
分子量 molecular_weight	480920.0 kDa
排除体积 excluded_volume	620080 Å³
包络体积 envelope_volume	1102700 Å³
水化壳体积 shell_volume	139750 Å³
包络直径 envelope_diameter	195.4 Å
壳层 Rg shell_rg	68.70 Å
包络 Rg envelope_rg	62.32 Å
形状 Rg shape_rg	64.32 Å
总 Rg total_rg	64.28 Å
总原子数 total_atoms	33912
残基数 n_residues	4059
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	179.8 Å
Rg (实空间) rg_real	65.44 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.17 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.6700e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.7820e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	66.33 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	2674000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8437
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	89.9 Å
偏度 Skewness skewness	-0.017
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.600
角度范围 angular_range	— – 0.1200 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	180100000.0000
实空间数据点数 n_real_points	25
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.991; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.993; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1
分子量 formula_weight	292320.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,E
原子数 atom_count	33912

MEPHVLGAGLYWLLLPCTLLAASLLRFNALSLVYLLFLLLLPWLPGPSRHSIPGHTGRLLRALLCLSLLFLVAHLAFQICLHTVPHLDQFLGQNGSLWVKVSQHIGVTRLDLKDIFNTTRLVAPDLGVLLASSLCLGLCGRLTRKAGQSRRTQELQDDDDDDDDDDEDIDAAPAVGLKGAPALATKRRLWLASRFRVTAHWLLMTSGRTLVIVLLALAGIAHPSAFSSIYLVVFLAICTWWSCHFPLSPLGFNTLCVMVSCFGAGHLICLYCYQTPFIQDMLPPGNIWARLFGLKNFVDLPNYSSPNALVLNTKHAWPIYVSPGILLLLYYTATSLLKLHKSCPSELRKETPREDEEHELELDHLEPEPQARDATQGEMPMTTEPDLDNCTVHVLTSQSPVRQRPVRPRLAELKEMSPLHGLGHLIMDQSYVCALIAMMVWSIMYHSWLTFVLLLWACLIWTVRSRHQLAMLCSPCILLYGLTLCCLRYVWAMELPELPTTLGPVSLHQLGLEHTRYPCLDLGAMLLYLLTFWLLLRQFVKEKLLKKQKVPAALLEVTVADTEPTQTQTLLRSLGELVTGIYVKYWIYVCAGMFIVVSFAGRLVVYKIVYMFLFLLCLTLFQVYYTLWRKLLRVFWWLVVAYTMLVLIAVYTFQFQDFPTYWRNLTGFTDEQLGDLGLEQFSVSELFSSILIPGFFLLACILQLHYFHRPFMQLTDLEHVPPPGTRHPRWAHRQDAVSEAPLLEHQEEEEVFREDGQSMDGPHQATQVPEGTASKWGLVADRLLDLAASFSAVLTRIQVFVRRLLELHVFKLVALYTVWVALKEVSVMNLLLVVLWAFALPYPRFRPMASCLSTVWTCIIIVCKMLYQLKIVNPHEYSSNCTEPFPNNTNLQPLEINQSLLYRGPVDPANWFGVRKGYPNLGYIQNHLQILLLLVFEAVVYRRQEHYRRQHQQAPLPAQAVCADGTRQRLDQDLLSCLKYFINFFFYKFGLEICFLMAVNVIGQRMNFMVILHGCWLVAILTRRRREAIARLWPNYCLFLTLFLLYQYLLCLGMPPALCIDYPWRWSKAIPMNSALIKWLYLPDFFRAPNSTNLISDFLLLLCASQQWQVFSAERTEEWQRMAGINTDHLEPLRGEPNPIPNFIHCRSYLDMLKVAVFRYLFWLVLVVVFVAGATRISIFGLGYLLACFYLLLFGTTLLQKDTRAQLVLWDCLILYNVTVIISKNMLSLLSCVFVEQMQSNFCWVIQLFSLVCTVKGYYDPKEMMTRDRDCLLPVEEAGIIWDSICFFFLLLQRRIFLSHYFLHVSADLKATALQASRGFALYNAANLKSINFHRQIEEKSLAQLKRQMKRIRAKQEKYRQSQASRGQLQSKDPQDPSQEPGPDSPGGSSPPRRQWWRPWLDHATVIHSGDYFLFESDSEEEEEALPEDPRPAAQSAFQMAYQAWVTNAQTVLRQRRERARQERAEQLASGGDLNPDVEPVDVPEDEMAGRSHMMQRVLSTMQFLWVLGQATVDGLTRWLRAFTKHHRTMSDVLCAERYLLTQELLRVGEVRRGVLDQLYVGEDEATLSGPVETRDGPSTASSGLGAEEPLSSMTDDTSSPLSTGYNTRSGSEEIVTDAGDLQAGTSLHGSQELLANARTRMRTASELLLDRRLHIPELEEAERFEAQQGRTLRLLRAGYQCVAAHSELLCYFIIILNHMVTASAASLVLPVLVFLWAMLTIPRPSKRFWMTAIVFTEVMVVTKYLFQFGFFPWNSYVVLRRYENKPYFPPRILGLEKTDSYIKYDLVQLMALFFHRSQLLCYGLWDHEEDRYPKDHCRSSVKDREAKEEPEAKLESQSETGTGHPKEPVLAGTPRDHIQGKGSIRSKDVIQDPPEDLKPRHTRHISIRFRRRKETPGPKGTAVMETEHEEGEGKETTERKRPRHTQEKSKFRERMKAAGRRLQSFCVSLAQSFYQPLQRFFHDILHTKYRAATDVYALMFLADIVDIIIIIFGFWAFGKHSAATDIASSLSDDQVPQAFLFMLLVQFGTMVIDRALYLRKTVLGKLAFQVVLVVAIHIWMFFILPAVTERMFSQNAVAQLWYFVKCIYFALSAYQIRCGYPTRILGNFLTKKYNHLNLFLFQGFRLVPFLVELRAVMDWVWTDTTLSLSNWMCVEDIYANIFIIKCSRETEKKYPQPKGQKKKKIVKYGMGGLIILFLIAIIWFPLLFMSLIRSVVGVVNQPIDVTVTLKLGGYEPLFTMSAQQPSIVPFTPQAYEELSQQFDPYPLAMQFISQYSPEDIVTAQIEGSSGALWRISPPSRAQMKQELYNGTADITLRFTWNFQRDLAKGGTVEYTNEKHTLELAPNSTARRQLAQLLEGRPDQSVVIPHLFPKYIRAPNGPEANPVKQLQPDEEEDYLGVRIQLRREQVGTGASGEQAGTKASDFLEWWVIELQDCKADCNLLPMVIFSDKVSPPSLGFLAGYGIVGLYVSIVLVVGKFVRGFFSEISHSIMFEELPCVDRILKLCQDIFLVRETRELELEEELYAKLIFLYRSPETMIKWTRERE

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	house mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	;(9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL ;
分子量 formula_weight	767.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	21

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine
分子量 formula_weight	744.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	O-[(R)-{[(2R)-2,3-bis(octadecanoyloxy)propyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]-L-serine
分子量 formula_weight	792.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.46 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	209166

fit	/app/data/saxs_computation/wl/7wlt/7wlt.fit
pddf	/app/data/pr_computation/wl/7wlt/7wlt.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/wl/7wlt/7wlt.dat

the Curved Structure of mPIEZO1 in Lipid Bilayer

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D