Lactoylglutathione lyase
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–184 链 B; UniProt 1–184 | 未记录 | ZN ZINC ION × 2 GOL GLYCEROL × 4 BO3 BORIC ACID × 3 IMD IMIDAZOLE × 1 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.1 M MIB (sodium malonate, imidazole, and boric acid), 25% PEG1500 | 分辨率 1.52 Å R-free 0.187 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 7WSZ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1BH5 HUMAN GLYOXALASE I Q33E, E172Q DOUBLE MUTANT 提交 1998-06-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–183(183 aa)
链 B
1–183(183 aa)
|
突变:Q33E, E172Q 突变:Q33E, E172Q | ZN ZINC ION × 2 GTX S-HEXYLGLUTATHIONE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.8;PROTEIN WAS CRYSTALLISED FROM PEG 2000 MONOMETHLY ETHER 50 MM MES PH 5.8, 0.1M NACL
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.250 |
| 1BH5 HUMAN GLYOXALASE I Q33E, E172Q DOUBLE MUTANT 提交 1998-06-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–183(183 aa)
链 D
1–183(183 aa)
|
突变:Q33E, E172Q 突变:Q33E, E172Q | ZN ZINC ION × 2 GTX S-HEXYLGLUTATHIONE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.8;PROTEIN WAS CRYSTALLISED FROM PEG 2000 MONOMETHLY ETHER 50 MM MES PH 5.8, 0.1M NACL
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.250 |
| 1FRO HUMAN GLYOXALASE I WITH BENZYL-GLUTATHIONE INHIBITOR 提交 1997-02-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–184(183 aa)
链 B
2–184(183 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GSB S-BENZYL-GLUTATHIONE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.8;pH 5.8
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.234 |
| 1FRO HUMAN GLYOXALASE I WITH BENZYL-GLUTATHIONE INHIBITOR 提交 1997-02-25 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
2–184(183 aa)
链 D
2–184(183 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GSB S-BENZYL-GLUTATHIONE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.8;pH 5.8
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.234 |
| 1QIN HUMAN GLYOXALASE I COMPLEXED WITH S-(N-HYDROXY-N-P-IODOPHENYLCARBAMOYL) GLUTATHIONE 提交 1999-06-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–183(183 aa)
链 B
1–183(183 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GIP S-(N-HYDROXY-N-IODOPHENYLCARBAMOYL)GLUTATHIONE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.8;PROTEIN WAS CRYSTALLISED BY EQILLABRATION AGAINST PEG 2000 MONOMETHLY ETHER,
50 MM MES PH 5.8, 0.1M NACL. HIPC-GSH WAS PRESENT IN THE PROTEIN SOLUTION
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.210 |
| 1QIP HUMAN GLYOXALASE I COMPLEXED WITH S-P-NITROBENZYLOXYCARBONYLGLUTATHIONE 提交 1999-06-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–183(183 aa)
链 B
1–183(183 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GNB S-P-NITROBENZYLOXYCARBONYLGLUTATHIONE × 2 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.8;PROTEIN WAS CRYSTALLISED BY EQILLABRATION AGAINST PEG 2000 MONOMETHLY ETHER,
50 MM MES PH 5.8, 0.1M NACL THEN SOAKED IN 10MM NBC-GSH
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.210 |
| 1QIP HUMAN GLYOXALASE I COMPLEXED WITH S-P-NITROBENZYLOXYCARBONYLGLUTATHIONE 提交 1999-06-14 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–183(183 aa)
链 D
1–183(183 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 GNB S-P-NITROBENZYLOXYCARBONYLGLUTATHIONE × 2 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5.8;PROTEIN WAS CRYSTALLISED BY EQILLABRATION AGAINST PEG 2000 MONOMETHLY ETHER,
50 MM MES PH 5.8, 0.1M NACL THEN SOAKED IN 10MM NBC-GSH
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.210 |
| 3VW9 Human Glyoxalase I with an N-hydroxypyridone inhibitor 提交 2012-08-10 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–184(184 aa)
链 B
1–184(184 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 HPJ 1-hydroxy-6-[1-(3-methoxypropyl)-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl]-4-phenylpyridin-2(1H)-one × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;25%(w/v) PEG 2000 MME, 10%(v/v) Glycerol, 0.1M Na-HEPES (pH 7.0), vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.47 Å R-free 0.193 |
| 3W0T Human Glyoxalase I with an N-hydroxypyridone derivative inhibitor 提交 2012-11-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–184(184 aa)
链 B
1–184(184 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 HPU N-[3-(1-hydroxy-6-oxo-4-phenyl-1,6-dihydropyridin-2-yl)phenyl]methanesulfonamide × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;33% (w/v) PEG 2000 MME, 0.1M Na-HEPES (pH 7.0), vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.197 |
| 3W0T Human Glyoxalase I with an N-hydroxypyridone derivative inhibitor 提交 2012-11-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–184(184 aa)
链 D
1–184(184 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 HPU N-[3-(1-hydroxy-6-oxo-4-phenyl-1,6-dihydropyridin-2-yl)phenyl]methanesulfonamide × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;33% (w/v) PEG 2000 MME, 0.1M Na-HEPES (pH 7.0), vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.35 Å R-free 0.197 |
| 3W0U human Glyoxalase I with an N-hydroxypyridone inhibitor 提交 2012-11-02 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–184(184 aa)
链 B
1–184(184 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 HPW N-[3-(1-Hydroxy-6-oxo-4-phenyl-1,6-dihydro-pyridin-2-yl)-5-methanesulfonylamino-phenyl]-methanesulfonamide × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;25% (w/v) PEG 2000 MME, 10%(v/v) Glycerol, 0.1M Na-HEPES (pH 7.0), vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.242 |
| 7WT0 human glyoxalase I (with C-ter His tag) in complex with TLSC702 提交 2022-02-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–184(184 aa)
链 B
1–184(184 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 5ZO (~{E})-3-(1,3-benzothiazol-2-yl)-4-(4-methoxyphenyl)but-3-enoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M MgCl2, 0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.222 |
| 7WT1 human glyoxalase I (with C-ter His tag) in inhibitor-free form 提交 2022-02-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–184(184 aa)
链 B
1–184(184 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M NaCl, 0.1 M MES-NaOH, 25% PEG3350
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.230 |
| 7WT2 human glyoxalase I in complex with TLSC702 提交 2022-02-03 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–184(184 aa)
链 B
1–184(184 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 5ZO (~{E})-3-(1,3-benzothiazol-2-yl)-4-(4-methoxyphenyl)but-3-enoic acid × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;293 K;0.2 M NaCl, 0.1 M Bis-Tris, 25% PEG3350
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.228 |
| 9KEE human glyoxalase I (with C-ter His tag) in complex with licochalcone B, form 1 提交 2024-11-04 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–184(184 aa)
链 B
1–184(184 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1L5R 1-(4-hydroxyphenyl)-3-[2-methoxy-3,4-bis(oxidanyl)phenyl]prop-2-en-1-one × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Bis-Tris, 25%(w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.08 Å R-free 0.234 |
| 9KEG human glyoxalase I (with C-ter His tag) in complex with licochalcone B, form 2 提交 2024-11-05 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–184(184 aa)
链 B
1–184(184 aa)
|
未记录 | A1L5R 1-(4-hydroxyphenyl)-3-[2-methoxy-3,4-bis(oxidanyl)phenyl]prop-2-en-1-one × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 3 ZN ZINC ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.8;293 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M MES, 25%(w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.239 |
| 9KEH human glyoxalase I (with C-ter His tag) in complex with licochalcone B and GSH, form 3 提交 2024-11-05 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–184(184 aa)
链 B
1–184(184 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 A1L5R 1-(4-hydroxyphenyl)-3-[2-methoxy-3,4-bis(oxidanyl)phenyl]prop-2-en-1-one × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 GSH Glutathione × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Bis-Tris, 25%(w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.193 |
| 9KEI human glyoxalase I (with C-ter His tag) in complex with licochalcone B, form 4 提交 2024-11-05 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–184(184 aa)
链 B
1–184(184 aa)
|
未记录 | A1L5R 1-(4-hydroxyphenyl)-3-[2-methoxy-3,4-bis(oxidanyl)phenyl]prop-2-en-1-one × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2 ZN ZINC ION × 2 BME BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.8;293 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M MES, 25%(w/v) PEG 3350
|
分辨率 1.81 Å R-free 0.238 |
| 9KEK human glyoxalase I (with C-ter His tag) in complex with piceatannol 提交 2024-11-05 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–184(184 aa)
链 B
1–184(184 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 PIT PICEATANNOL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Bis-Tris, 25%(w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.233 |
| 9KEK human glyoxalase I (with C-ter His tag) in complex with piceatannol 提交 2024-11-05 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
1–184(184 aa)
链 D
1–184(184 aa)
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 PIT PICEATANNOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;0.2 M Sodium chloride, 0.1 M Bis-Tris, 25%(w/v) PEG 3350
|
分辨率 2.11 Å R-free 0.233 |
共 15 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | LGUL_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–184; UniProt 1–184 作者链 B; PDB构建体 1–184; UniProt 1–184 |