7y7b

Cryo-EM structure of cryptophyte photosystem I

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	ACPI-1 × 1 ACPI-2 × 1 ACPI-3 × 1 ACPI-4 × 1 ACPI-5 × 1 ACPI-6 × 1 ACPI-7 × 1 ACPI-8 × 1 ACPI-12 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A222AI95） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A0A222AI25） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （A0A222AIA6） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （A0A222AIF3） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （A0A222AI52） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A222AI78） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （A0A222AI55） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 1 （A0A222AI34） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （A0A222AI68） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （A0A222AI28） PsaO × 1 PsaR × 1 Unk1 × 1 ACPI-S × 1 ACPI-13/10 × 2 ACPI-14 × 1 ACPI-9 × 1 ACPI-11 × 1 CHLOROPHYLL A × 254 Chlorophyll c2 × 20 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15-heptaen-1,17-diynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 59 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1~{R},4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohex-2-en-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 3 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 12 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 23 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 (6'R,11cis,11'cis,13cis,15cis)-4',5'-didehydro-5',6'-dihydro-beta,beta-carotene × 25 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 5 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A222AIB4_9CRYP
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–752； UniProt 1–752

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

物种未注明

UniProt A0A222AI95

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	ACPI-1 × 1 ACPI-2 × 1 ACPI-3 × 1 ACPI-4 × 1 ACPI-5 × 1 ACPI-6 × 1 ACPI-7 × 1 ACPI-8 × 1 ACPI-12 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A222AIB4） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A0A222AI25） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （A0A222AIA6） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （A0A222AIF3） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （A0A222AI52） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A222AI78） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （A0A222AI55） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 1 （A0A222AI34） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （A0A222AI68） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （A0A222AI28） PsaO × 1 PsaR × 1 Unk1 × 1 ACPI-S × 1 ACPI-13/10 × 2 ACPI-14 × 1 ACPI-9 × 1 ACPI-11 × 1 CHLOROPHYLL A × 254 Chlorophyll c2 × 20 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15-heptaen-1,17-diynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 59 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1~{R},4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohex-2-en-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 3 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 12 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 23 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 (6'R,11cis,11'cis,13cis,15cis)-4',5'-didehydro-5',6'-dihydro-beta,beta-carotene × 25 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 5 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A222AI95_9CRYP
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–734； UniProt 1–734

Photosystem I iron-sulfur center

物种未注明

UniProt A0A222AI25

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	ACPI-1 × 1 ACPI-2 × 1 ACPI-3 × 1 ACPI-4 × 1 ACPI-5 × 1 ACPI-6 × 1 ACPI-7 × 1 ACPI-8 × 1 ACPI-12 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A222AIB4） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A222AI95） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （A0A222AIA6） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （A0A222AIF3） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （A0A222AI52） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A222AI78） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （A0A222AI55） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 1 （A0A222AI34） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （A0A222AI68） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （A0A222AI28） PsaO × 1 PsaR × 1 Unk1 × 1 ACPI-S × 1 ACPI-13/10 × 2 ACPI-14 × 1 ACPI-9 × 1 ACPI-11 × 1 CHLOROPHYLL A × 254 Chlorophyll c2 × 20 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15-heptaen-1,17-diynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 59 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1~{R},4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohex-2-en-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 3 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 12 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 23 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 (6'R,11cis,11'cis,13cis,15cis)-4',5'-didehydro-5',6'-dihydro-beta,beta-carotene × 25 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 5 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A222AI25_9CRYP
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–81； UniProt 1–81

Photosystem I reaction center subunit II

物种未注明

UniProt A0A222AIA6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	ACPI-1 × 1 ACPI-2 × 1 ACPI-3 × 1 ACPI-4 × 1 ACPI-5 × 1 ACPI-6 × 1 ACPI-7 × 1 ACPI-8 × 1 ACPI-12 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A222AIB4） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A222AI95） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A0A222AI25） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （A0A222AIF3） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （A0A222AI52） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A222AI78） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （A0A222AI55） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 1 （A0A222AI34） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （A0A222AI68） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （A0A222AI28） PsaO × 1 PsaR × 1 Unk1 × 1 ACPI-S × 1 ACPI-13/10 × 2 ACPI-14 × 1 ACPI-9 × 1 ACPI-11 × 1 CHLOROPHYLL A × 254 Chlorophyll c2 × 20 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15-heptaen-1,17-diynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 59 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1~{R},4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohex-2-en-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 3 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 12 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 23 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 (6'R,11cis,11'cis,13cis,15cis)-4',5'-didehydro-5',6'-dihydro-beta,beta-carotene × 25 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 5 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A222AIA6_9CRYP
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–141； UniProt 1–141

Photosystem I reaction center subunit IV

物种未注明

UniProt A0A222AIF3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	ACPI-1 × 1 ACPI-2 × 1 ACPI-3 × 1 ACPI-4 × 1 ACPI-5 × 1 ACPI-6 × 1 ACPI-7 × 1 ACPI-8 × 1 ACPI-12 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A222AIB4） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A222AI95） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A0A222AI25） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （A0A222AIA6） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （A0A222AI52） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A222AI78） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （A0A222AI55） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 1 （A0A222AI34） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （A0A222AI68） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （A0A222AI28） PsaO × 1 PsaR × 1 Unk1 × 1 ACPI-S × 1 ACPI-13/10 × 2 ACPI-14 × 1 ACPI-9 × 1 ACPI-11 × 1 CHLOROPHYLL A × 254 Chlorophyll c2 × 20 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15-heptaen-1,17-diynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 59 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1~{R},4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohex-2-en-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 3 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 12 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 23 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 (6'R,11cis,11'cis,13cis,15cis)-4',5'-didehydro-5',6'-dihydro-beta,beta-carotene × 25 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 5 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A222AIF3_9CRYP
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–64； UniProt 1–64

Photosystem I reaction center subunit III

物种未注明

UniProt A0A222AI52

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	ACPI-1 × 1 ACPI-2 × 1 ACPI-3 × 1 ACPI-4 × 1 ACPI-5 × 1 ACPI-6 × 1 ACPI-7 × 1 ACPI-8 × 1 ACPI-12 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A222AIB4） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A222AI95） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A0A222AI25） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （A0A222AIA6） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （A0A222AIF3） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A222AI78） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （A0A222AI55） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 1 （A0A222AI34） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （A0A222AI68） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （A0A222AI28） PsaO × 1 PsaR × 1 Unk1 × 1 ACPI-S × 1 ACPI-13/10 × 2 ACPI-14 × 1 ACPI-9 × 1 ACPI-11 × 1 CHLOROPHYLL A × 254 Chlorophyll c2 × 20 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15-heptaen-1,17-diynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 59 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1~{R},4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohex-2-en-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 3 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 12 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 23 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 (6'R,11cis,11'cis,13cis,15cis)-4',5'-didehydro-5',6'-dihydro-beta,beta-carotene × 25 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 5 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A222AI52_9CRYP
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–183； UniProt 1–183

Photosystem I reaction center subunit VIII

物种未注明

UniProt A0A222AI78

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	ACPI-1 × 1 ACPI-2 × 1 ACPI-3 × 1 ACPI-4 × 1 ACPI-5 × 1 ACPI-6 × 1 ACPI-7 × 1 ACPI-8 × 1 ACPI-12 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A222AIB4） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A222AI95） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A0A222AI25） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （A0A222AIA6） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （A0A222AIF3） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （A0A222AI52） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （A0A222AI55） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 1 （A0A222AI34） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （A0A222AI68） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （A0A222AI28） PsaO × 1 PsaR × 1 Unk1 × 1 ACPI-S × 1 ACPI-13/10 × 2 ACPI-14 × 1 ACPI-9 × 1 ACPI-11 × 1 CHLOROPHYLL A × 254 Chlorophyll c2 × 20 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15-heptaen-1,17-diynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 59 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1~{R},4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohex-2-en-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 3 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 12 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 23 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 (6'R,11cis,11'cis,13cis,15cis)-4',5'-didehydro-5',6'-dihydro-beta,beta-carotene × 25 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 5 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A222AI78_9CRYP
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–36； UniProt 1–36

Photosystem I reaction center subunit IX

物种未注明

UniProt A0A222AI55

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	ACPI-1 × 1 ACPI-2 × 1 ACPI-3 × 1 ACPI-4 × 1 ACPI-5 × 1 ACPI-6 × 1 ACPI-7 × 1 ACPI-8 × 1 ACPI-12 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A222AIB4） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A222AI95） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A0A222AI25） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （A0A222AIA6） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （A0A222AIF3） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （A0A222AI52） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A222AI78） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 1 （A0A222AI34） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （A0A222AI68） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （A0A222AI28） PsaO × 1 PsaR × 1 Unk1 × 1 ACPI-S × 1 ACPI-13/10 × 2 ACPI-14 × 1 ACPI-9 × 1 ACPI-11 × 1 CHLOROPHYLL A × 254 Chlorophyll c2 × 20 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15-heptaen-1,17-diynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 59 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1~{R},4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohex-2-en-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 3 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 12 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 23 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 (6'R,11cis,11'cis,13cis,15cis)-4',5'-didehydro-5',6'-dihydro-beta,beta-carotene × 25 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 5 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A222AI55_9CRYP
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–42； UniProt 1–42

Photosystem I reaction center subunit PsaK

物种未注明

UniProt A0A222AI34

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	ACPI-1 × 1 ACPI-2 × 1 ACPI-3 × 1 ACPI-4 × 1 ACPI-5 × 1 ACPI-6 × 1 ACPI-7 × 1 ACPI-8 × 1 ACPI-12 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A222AIB4） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A222AI95） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A0A222AI25） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （A0A222AIA6） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （A0A222AIF3） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （A0A222AI52） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A222AI78） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （A0A222AI55） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （A0A222AI68） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （A0A222AI28） PsaO × 1 PsaR × 1 Unk1 × 1 ACPI-S × 1 ACPI-13/10 × 2 ACPI-14 × 1 ACPI-9 × 1 ACPI-11 × 1 CHLOROPHYLL A × 254 Chlorophyll c2 × 20 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15-heptaen-1,17-diynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 59 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1~{R},4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohex-2-en-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 3 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 12 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 23 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 (6'R,11cis,11'cis,13cis,15cis)-4',5'-didehydro-5',6'-dihydro-beta,beta-carotene × 25 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 5 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A222AI34_9CRYP
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–87； UniProt 1–87

Photosystem I reaction center subunit XI

物种未注明

UniProt A0A222AI68

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	ACPI-1 × 1 ACPI-2 × 1 ACPI-3 × 1 ACPI-4 × 1 ACPI-5 × 1 ACPI-6 × 1 ACPI-7 × 1 ACPI-8 × 1 ACPI-12 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A222AIB4） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A222AI95） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A0A222AI25） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （A0A222AIA6） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （A0A222AIF3） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （A0A222AI52） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A222AI78） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （A0A222AI55） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 1 （A0A222AI34） Photosystem I reaction center subunit XII × 1 （A0A222AI28） PsaO × 1 PsaR × 1 Unk1 × 1 ACPI-S × 1 ACPI-13/10 × 2 ACPI-14 × 1 ACPI-9 × 1 ACPI-11 × 1 CHLOROPHYLL A × 254 Chlorophyll c2 × 20 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15-heptaen-1,17-diynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 59 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1~{R},4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohex-2-en-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 3 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 12 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 23 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 (6'R,11cis,11'cis,13cis,15cis)-4',5'-didehydro-5',6'-dihydro-beta,beta-carotene × 25 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 5 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A222AI68_9CRYP
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–153； UniProt 1–153

Photosystem I reaction center subunit XII

物种未注明

UniProt A0A222AI28

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 29	ACPI-1 × 1 ACPI-2 × 1 ACPI-3 × 1 ACPI-4 × 1 ACPI-5 × 1 ACPI-6 × 1 ACPI-7 × 1 ACPI-8 × 1 ACPI-12 × 1 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 （A0A222AIB4） Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 （A0A222AI95） Photosystem I iron-sulfur center × 1 （A0A222AI25） Photosystem I reaction center subunit II × 1 （A0A222AIA6） Photosystem I reaction center subunit IV × 1 （A0A222AIF3） Photosystem I reaction center subunit III × 1 （A0A222AI52） Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 （A0A222AI78） Photosystem I reaction center subunit IX × 1 （A0A222AI55） Photosystem I reaction center subunit PsaK × 1 （A0A222AI34） Photosystem I reaction center subunit XI × 1 （A0A222AI68） PsaO × 1 PsaR × 1 Unk1 × 1 ACPI-S × 1 ACPI-13/10 × 2 ACPI-14 × 1 ACPI-9 × 1 ACPI-11 × 1 CHLOROPHYLL A × 254 Chlorophyll c2 × 20 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15-heptaen-1,17-diynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 59 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1~{R},4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohex-2-en-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 3 ;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ; × 12 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 7 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 23 1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL × 2 (6'R,11cis,11'cis,13cis,15cis)-4',5'-didehydro-5',6'-dihydro-beta,beta-carotene × 25 DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 5 PHYLLOQUINONE × 2 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A222AI28_9CRYP
Isoform	—
PDB实体	20
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–30； UniProt 1–30

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7y7b
沉积日期 deposition_date	2022-06-22
结构标题 title	Cryo-EM structure of cryptophyte photosystem I
关键词 keywords	Cryptophyte, Photosystem I, evolution, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7y7b__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7y7b__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7y7b__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	66.07 Å
Rg（电子密度）	65.95 Å
总 Rg	65.93 Å
原子数	60515
残基数	5227
排除体积	1138900 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`7y7b__assembly_1__model_1`	29-meric （29）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (41)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ACPI-1
分子量 formula_weight	23479.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1
原子数 atom_count	60515

MLRLSLLAAIVACASAFAPTSLPMGSMRKAATKGPSMQLFGAGKLQGEGVTAIPFAGRPKTPAFDGTWAGDTGFDPLTISAWLDIRFLREAELKHCRVAMLAAAGAIAQDAFTFPGTVETFGTGKMTALHDAAVKTGTMGQMLVWIGFAEIFSTAAILQWYTDGSTRKPGDFGFDPLGFSKGKDAARLELCELKNGRLAMIAIGGMIHHYLITGKGPLELLP

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ACPI-2
分子量 formula_weight	23400.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

MLRVALIAAILASASAFAPMGSLGLVKSARSGAAISPRMQSGDFSAAVPFLKRPSNLDGTLAGDVGFDPLGFSDVFDLRVLREAELKHGRFAMLAVLGFLVQEVYTFPFFPKMAPVDAHDYFVTQGGGSQIIFWISFVEIFGVVALFELIQGKRDAGDFAFDPLGLGKDEATLARYKVAEIKHARLAMIAIGGFIHQFWVTKQTVLEQLGNFQSLA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ACPI-3
分子量 formula_weight	24966.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

MLRTLALLAAVASASAFTAAPMLSTSTRAKAVSSVSGMRMQEKSASVPFLSKPEKLDGSMAGDVGFDPLGISYFIDVKWLREAELKHGRICMLATAGILVQEVIHLPGPAFSSKFALDAWSTAPRGGMVQILIAIGLIEMVSNRFAITATDMFANPNRKPGDLGFDPLSLGANPATRAKYELSEVIHGRAAMMGLSGMIHQMIVSKQPVIDQLLNFKPVDASFKLGGAAGTMGMGI

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	ACPI-4
分子量 formula_weight	23548.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

MLRSLALLCLVGAASAFAPGAAPLVRSNTRAAIARGPRMQEMSKAIPFAERPAKLDGKIPGDVGFDPLGFSDYYDLKYLREAEIKHGRICMLGALGWLFPEFAKLPQFASLSTNPLKAATELGPAGWAQIFIFVGALESFSYEKIYYGDSAPGDLGFDPLRLGKNPVSRAHYEVAEIKNGRLAMIGLGGMIHHSLLTKQGAIEQIMSQNFYPSGFPQ

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	ACPI-5
分子量 formula_weight	24055.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	5

MLRLSLLAACIAAASAFAPVALPGMGMRAATRRPAVSMQLWEDGKVQGKGLKAIPFSDPPESLPSDMVGYVGFDPLGFSTLFDIKFLREAELKHGRAAMLAAAGAIAQDIFTFPGVTSVIGDAKMTGAHDAFLKAAADGNPKANAMSQLFVWIGFFELVSMPALFETLNGGERAPGDFYFDPLGLGKGSGRARMELAEIKNGRLAMIGIGGMVHHYLLTGKGPIGTIVG

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	ACPI-6
分子量 formula_weight	22688.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	6

MLRVALISALVASASAFAPTALPAARASARAVSAGPKMQMSPSVPFLKRPVALDGSMVGDVGFDPLGLSSVGDIKFLREAELKHCRLAMLAAAGSMAQDLYTFPGVDKVIGDAKMTAVHDKLVSQGAMGQLLVWIGFAEVFATMALFETLDGKRAPGDFKFDPLGFGKNPEALKRYQLAEIKNGRLAMLGFGGMVHGYFVTGKGPLELLTNFQAA

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	ACPI-7
分子量 formula_weight	24550.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	7

MLRVALLSALVASAAAFTAPAALFKAPTRSSRAMSVKMQDNSAAVPFLSRPAALDGSMVGDVGFDPLGFTGKYDLKWLREAELKHGRVAMLASLGCLVQEFIHLPFEATSNPVASEAFFQVPSGGLWQIFTVIGVIEHVSNGFNMSGSTMFKSGRAPGNLGFDPLNFGKNPTARARYELAELKNGRLAMLGFAGMIHGCFITGKGPLAALTSLDWHQQIGRASCRERVGC

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	ACPI-8
分子量 formula_weight	23700.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	8

MFARTLLLAACAASASAFAPGSFAPMGLRGSTAAVSRPMARAGLSSVSMAANPMTNAIEEFAESAPELASRGLGVTTNAERWNGRHAMFGIFAIVMTAYFKGHGLIPDAEKILDVNQWGPLASAGQGQGITNERAIILIAHVHVLVVSVLAAFAPFQFQDTLVKEKGYTPEAPAGIIPPFKTGLTPEAELINGRLAMLGVISIIMASIFTGNSVIDVVNLGLGKILF

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	ACPI-12
分子量 formula_weight	23223.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	9

MFRALLVLAAVAGASAFTAPAVLPGRSTARAATKGPSMQLYKEGSLQGKGVNCIPIFKRPDSLKGDAVGDMGFDPFGFSSWVDMNYVREAEIKHGRIAMLAFAGIVVEVLGIKAPGAGKILGSSTDIFEIHNAAVEKGSMGQILLWCGFFEMTAGLPAMQQMLEGSGRTPGDFGFDPLGLGKKDFAQMQIKEIQNGRLAMLAVSGMVHHALINGKVQGLP

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1
分子量 formula_weight	83493.6 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MTVSSTEQEAKKVSITVDKDPVATSFEKWAQPGHFSRTLAKGPKTTTWIWNLHADAHDFDSHTSSLEDISRKIFSAHFGQLSIIFLWLSGMYFHGARFSNYSAWLSNPTAVKPSAQVVWPIVGQEVLNGDVGGGFQGVQITSGFFQIWRASGITSEVELYWCALAGLLMSGLMIFAGWFHYHKAAPKLEWFQNAESMLNHHLSGLLGLGCLSWAGHQIHVSLPINKLLDAGVAPQEIPLPHEFLVNRDLMAQLYPSFSKGLVPFFTLNWSEYSDFLTFKGGLNPVTGGLWLSDTAHHHLALAVLFIVAGHMYRTNWGIGHSMKEILEAHKGPFTGEGHKGLYEVLITSWHAQLSINLAMLGSLSIIIAHHMYAMPPYPYIATDYPTQLSLFTHHMWIGGFCVCGAAAHAGIFMVRDYNPAQNYNNLLDRVIRHRDAIISHLNWICIFLGFHSFGLYIHNDTMRALGRTQDMFSDTAIQLKPVFAQWVQNIHTVAPGNTTPNALATASYAFGGNVVSVGNKVAMMPISLGTADFMVHHIHAFTIHVTVLILLKGVLFSRNSRLIPDKANLGFRFPCDGPGRGGTCQSSAWDSVFLGLFWMYNCISVVIFHFSWKMQSDVWGTVQADNTVTHITGGNFAQSAITINGWLRDFLWAQASQVIQSYGSSLSAYGLIFLGAHFIWAFSLMFLFSGRGYWQELIESVVWAHNKLNFAPAIQPRALSITQGRAVGLAHYLLGGIGTTWAFFLARIISVG

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2
分子量 formula_weight	82219.8 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MATKFPKFSQALAQDPATRRIWYGLATAHDFESHDGMTEENLYQKIFASHFGHLAIIFLWTSGNLFHVAWQGNFEQWVLNPLKVKPVAHAIWDPHFGQPAVKAFTKGGVFYPVNIATSGVYHWWYTIGMRTNNDLYAGSLFLLFLSGVFLFAGWLHLQPKFRPGLSWFKNNESRLNHHLSGLFGFSSLAWAGHLIHIAIPEARGQHVGWDNFTKTLPHPAGLTPFFTGNWSLYADNPDTANHIFGTSEGSGSAILTFLGGFHPQTQALWLTDIAHHHLAIGVVFIFAGHMYRTNWGIGHSLKEILDAHRPPGGRLGAGHKGLFETITNSLHFQLGLALASIGVITSLVAQHMYALPAYAFIAKDYTTQAALYTHHQYIAGFLMVGAFAHGAIFFVRDYDPEQNKNNVLARMLEHKEAIISHLSWVSLFLGFHTLGLYIHNDVVVAFGTPEKQILVEPVFAQWIQASSGKALYGFDVLLSSSNSVATNASNNIWLPGWLDAINSGKNSLFLPIGPGDFLVHHAIALGLHTTALILVKGALDARGSKLMPDKKDFGYSFPCDGPGRGGTCDISAWDAFYLSMFWMLNTIGWVTFYWHWKHVTIWQGNAGQFNESSTYIMGWLRDYLWLNSSPLINGYNPFGMNSLAVWAWMFLFGHLIWATGFMFLISWRGYWQELIETLAWAHERTPLANLVRWKDKPVALSIVQARLVGLIHFTVGYVFTYAAFVIASTTGKFG

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Photosystem I iron-sulfur center
分子量 formula_weight	8743.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.97.1.12
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSHAVKVYDTCIGCTQCVRACPCDVLEMVSWDGCKAGQIASAPRTEDCIGCKRCETACPTDFLSVRVYLGGETTRSMGLAY

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit II
分子量 formula_weight	15590.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MSETLNLQIPSPTFEGSTGGWLRAAEVEEKYAITWTSGKEQVFEMPTGGAAIMRKGENLLYLARKEQCLALGTQLKTGFKITDYKIYRIFPSGEVQYLHPKDGVFPEKVNAGRIGVGNVSHSIGKNLNPSQIKFTNKSFNG

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IV
分子量 formula_weight	7352.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MVKRGSQVRILRKESYWYQDVGTVATIDTSGIRYPVVVRFEKVSYSGVNTNNFSLDEVVEVVKK

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit III
分子量 formula_weight	20393.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MKNWVSLVLIFSIVTTPYVAHADVAGLTPCKDSKDFQRRLDGSVKKLKTRLAKYEKGTPPALALEKQIERTQARFERYGKAGLLCGTDGLPHLITDGRWSHSGEFVIPGLFFLYIAGWIGWVGRSYVLFARESDKPTEKEIILDVPAALSFVSTGFIWPVSAFKEFTSGNLIADESEITVSPR

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit VIII
分子量 formula_weight	3975.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MTAAYLPSILVPLIGLIFPGFVMGFAFIYIEQEEIA

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit IX
分子量 formula_weight	4862.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MDSNFLKYLSTAPVLLTVWLSFTAGLVIEANRFFPDMLYFPM

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit PsaK
分子量 formula_weight	8836.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MNADLLLAVVPQTAAWSAKTCSVMVISNLLCIVAGRYVIQVKGSGPSLPLTGSFSNFGLPELLATTSLGHIVGSGAILGLSYVGLLS

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XI
分子量 formula_weight	16490.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MAQFVKPYNDDPFVGNLATPVSTSSFTRSFLSNLPAYRSGLSPLLRGLEIGMTHGYFLVGPFYKLGPLRNSDVALISGLFSSIGLIIILAACLAIYGVVSFNEDDNTDSLQTSRGWKQFTSGWLVGSIGGASFAYILISNIVFLQTSGLNLIK

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	Photosystem I reaction center subunit XII
分子量 formula_weight	3248.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MISDTQIFVALILALVSLVLAIRLGTALYQ

实体 21 Entity 21 polymer

描述 description	PsaO
分子量 formula_weight	10766.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

FEISDGVEFDLNPLVLAISFLGWSLPGLLPSNIPLYGGKGLTTALFAEIGEHLQTFPAPPPIGDPFWVILFIWHSGLFATMIFGTIGYNGYGPKSTTKY

实体 22 Entity 22 polymer

描述 description	PsaR
分子量 formula_weight	13867.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MVRALCFLALIASAAAFSTAPGLALRSSVRPATSTKTPMKMAGYSPVPSPDNTKETYWETKAPSSQVLGIGKDVSSGNYIVASVVAAVVGAACTGQCIPLTVSPNPVFILGSFLLPYSWALHVAAWIQRNNGK

实体 23 Entity 23 polymer

描述 description	Unk1
分子量 formula_weight	13975.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 24 Entity 24 polymer

描述 description	ACPI-S
分子量 formula_weight	25645.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

MAQAAPPSKLPENMAKKNALKVNKEQWGIEEAIKVDAKAAAPAPKAAAPAPKKAAPKKGAAPAEATVGFSGVPSDFCRPAPTAFPAEPAGMTVFGARGPRAEGHRDKFGSRHAAVSLACAALLWQPISQAGMYSIDSGSLAKKSFSEMEVPGFGDAKKVPTIESFFPFTKNGFDASPALFGKDSMIVFENPLGKCGAYASSCHTFLDEMGDMLKATPQEMPRSKAAPTYSFPWMYDHAAWKK

实体 25 Entity 25 polymer

描述 description	ACPI-13/10
分子量 formula_weight	22271.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,d

MIRAVILAGCVAAASAFAPGASLVGARAATRAVSAAGPKMQMSPSIPFLKKPDALDGTAAGDIGFDPLGFSSLADIKFLQEAEIKHCRIAMLAAAGSIAQDIFTFPGYSALTGGAKMTAAHDKLVATGTMGQILFWVSFAEVFGTVALFDTLDGKRAPGDFKFDPLGMGKKNMADMQLKEIKNGRLAMLGIAGMTHGYFISGKGPLELLGNFPTA

实体 26 Entity 26 polymer

描述 description	ACPI-14
分子量 formula_weight	23755.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MFRAALLLACLASASAFAPGSLMMPKSATRAAISRGPRMQANDDLAVPFLERPPMLDGSYAGDIGFDPVGFSNYFDLRWLREAELKHGRVCMLGVVGFLVQEFVTLPMFSNGVTPVDDFFVVPATGLWQIFFTIGFVEAFSNGFKLTPSDMFADDRAPGDLGFDPLGCGKDPAALARRQLVEVKNGRLAMIAFGGMLHQQLLTKQGVIEQLTNFKAIM

实体 27 Entity 27 polymer

描述 description	ACPI-9
分子量 formula_weight	27212.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MFRLSILAALVAAASAFAPGAMLPQGRAVARASAASGIRMQSKSAAIPFLEKPPMLDGSVPGDVGFDPLWVSSMLPDKGWYLFLQEAEIKHGRVAMLAAAGAIVQDIFTFPGVTDTIGNVKMTSAHDKFLSMEGAGGKVATMHQLLLWLGLLEVVSAFATIQMFGGTSSRMPGEFGFDPLGFGKSEAAMKTYRLKEVKNGRLAMIGIGGMVHHYLLTGKGPLQFLGGIPNYKSCIEHPASGLPYLMKAVGPVLPKIC

实体 28 Entity 28 polymer

描述 description	ACPI-11
分子量 formula_weight	22451.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

MLRTVAILACLASASAFAPLASLPMTGTRATKAVGPRMQEQMAVPFLQPPSKLSSSMQGYAGFDPLGFSEKFDVNWLREAEIKNGRVAMLGVVGLLIPEFITLPMYSAGATPYDSAFTVPAWALIQITLGCGAAEYYMHKGKMTPDNMFDGSRAPGDFGWGKADPVMATKEIKNGRLAMLAFGGIMHQQLITKMGTFAHLVDFKPLVF

实体 29 Entity 29 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	254

实体 30 Entity 30 non-polymer

描述 description	Chlorophyll c2
分子量 formula_weight	608.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	20

实体 31 Entity 31 non-polymer

描述 description	;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohexen-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15-heptaen-1,17-diynyl]cyclohex-3-en-1-ol ;
分子量 formula_weight	564.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	59

实体 32 Entity 32 non-polymer

描述 description	;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-[(1~{R},4~{R})-2,6,6-trimethyl-4-oxidanyl-cyclohex-2-en-1-yl]octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ;
分子量 formula_weight	566.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 33 Entity 33 non-polymer

描述 description	;(1~{R})-3,5,5-trimethyl-4-[(3~{E},5~{E},7~{E},9~{E},11~{E},13~{E},15~{E},17~{E})-3,7,12,16-tetramethyl-18-(2,6,6-trimethylcyclohexen-1-yl)octadeca-3,5,7,9,11,13,15,17-octaen-1-ynyl]cyclohex-3-en-1-ol ;
分子量 formula_weight	550.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 34 Entity 34 non-polymer

描述 description	1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE
分子量 formula_weight	787.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 35 Entity 35 non-polymer

描述 description	1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE
分子量 formula_weight	723.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	23

实体 36 Entity 36 non-polymer

描述 description	1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL
分子量 formula_weight	795.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 37 Entity 37 non-polymer

描述 description	(6'R,11cis,11'cis,13cis,15cis)-4',5'-didehydro-5',6'-dihydro-beta,beta-carotene
分子量 formula_weight	536.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	25

实体 38 Entity 38 non-polymer

描述 description	DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE
分子量 formula_weight	510.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 39 Entity 39 non-polymer

描述 description	PHYLLOQUINONE
分子量 formula_weight	450.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 40 Entity 40 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 41 Entity 41 non-polymer

描述 description	DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)
分子量 formula_weight	949.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	7y7bL01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1240 — Photosystem 1 Reaction Centre Subunit Xi; Chain: L;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI

▶

分辨率 resolution	2.66 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	133521

Cryo-EM structure of cryptophyte photosystem I

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I iron-sulfur center

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit II

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit IV

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit III

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit VIII

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit IX

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit PsaK

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem I reaction center subunit XI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体