SAXSdb — 7yfp

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 4–375	未记录	ARP4 isoform 1 × 1 （A0A6A5PX31） Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 （A0A8H8UNQ6） SWR1-complex protein 4 × 1 （A0A8H4F9Y4） Enhancer of polycomb-like protein 1 × 1 （P43572） Transcription-associated protein 1 × 1 （P38811） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7YFP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1YAG STRUCTURE OF THE YEAST ACTIN-HUMAN GELSOLIN SEGMENT 1 COMPLEX 提交 1998-10-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–375（375 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.50	分辨率 1.90 Å R-free 0.231
1YAG STRUCTURE OF THE YEAST ACTIN-HUMAN GELSOLIN SEGMENT 1 COMPLEX 提交 1998-10-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–375（375 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.50	分辨率 1.90 Å R-free 0.231
1YVN THE YEAST ACTIN VAL 159 ASN MUTANT COMPLEX WITH HUMAN GELSOLIN SEGMENT 1. 提交 1999-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–375（375 aa）	突变：V159N	MG MAGNESIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.1 M HEPES, 1.60 M (NH4)2SO4, 2 MM MG-ATP, PH=8.0.	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
1YVN THE YEAST ACTIN VAL 159 ASN MUTANT COMPLEX WITH HUMAN GELSOLIN SEGMENT 1. 提交 1999-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–375（375 aa）	突变：V159N	MG MAGNESIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8；0.1 M HEPES, 1.60 M (NH4)2SO4, 2 MM MG-ATP, PH=8.0.	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
5NBL Crystal structure of the Arp4-N-actin(APO-state) heterodimer bound by a nanobody 提交 2017-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1 mM ADP, 0.2 mM CaCl2, 1.3-1.5 M sodium malonate at pH 6.0, Subtilisin (1/6000; w(subtilisin)/w(protein))	分辨率 2.80 Å R-free 0.204
5NBL Crystal structure of the Arp4-N-actin(APO-state) heterodimer bound by a nanobody 提交 2017-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1 mM ADP, 0.2 mM CaCl2, 1.3-1.5 M sodium malonate at pH 6.0, Subtilisin (1/6000; w(subtilisin)/w(protein))	分辨率 2.80 Å R-free 0.204
5NBM Crystal structure of the Arp4-N-actin(ATP-state) heterodimer bound by a nanobody 提交 2017-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1 mM ATP, 0.2 mM CaCl2, 1.3-1.5 M sodium malonate pH 6.0, Subtilisin (1/6000; w(subtilisin)/w(protein))	分辨率 3.40 Å R-free 0.193
5NBM Crystal structure of the Arp4-N-actin(ATP-state) heterodimer bound by a nanobody 提交 2017-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1 mM ATP, 0.2 mM CaCl2, 1.3-1.5 M sodium malonate pH 6.0, Subtilisin (1/6000; w(subtilisin)/w(protein))	分辨率 3.40 Å R-free 0.193
5NBN Crystal structure of the Arp4-N-actin-Arp8-Ino80HSA module of INO80 提交 2017-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 LAR LATRUNCULIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 18% (w/v) polyethylene glycol 3,350, latrunculin A solved in DMSO molar ration 1:1.5 (protein : latrunculin A)	分辨率 4.00 Å R-free 0.242
5NBN Crystal structure of the Arp4-N-actin-Arp8-Ino80HSA module of INO80 提交 2017-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–375（375 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 LAR LATRUNCULIN A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate, 18% (w/v) polyethylene glycol 3,350, latrunculin A solved in DMSO molar ration 1:1.5 (protein : latrunculin A)	分辨率 4.00 Å R-free 0.242
5Y81 NuA4 TEEAA sub-complex 提交 2017-08-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 G 1–375（375 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
7VVY TRA module of NuA4 提交 2021-11-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 1–375（375 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.10 Å
7VVZ NuA4 bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 G 1–375（375 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP* ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 8.80 Å
7YFN Core module of the NuA4 complex in S. cerevisiae 提交 2022-07-08	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 4–375（372 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8A5A Structure of Arp4-Ies4-N-actin-Arp8-Ino80HSA subcomplex (A-module) of INO80 提交 2022-06-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 V 1–375（375 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8A5O Structure of Arp4-Ies4-N-actin-Arp8-Ino80HSA subcomplex (A-module) of S. cerevisiae INO80 提交 2022-06-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 V 1–375（375 aa）	未记录	AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 3 MG MAGNESIUM ION × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8ESC Structure of the Yeast NuA4 Histone Acetyltransferase Complex 提交 2022-10-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–375（375 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9GO5 CryoEM Reconstruction of Yeast ADP-Actin Filament at 2.5 A resolution. 提交 2024-09-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 1–375（375 aa）链 B 1–375（375 aa）链 C 1–375（375 aa）链 D 1–375（375 aa）链 E 1–375（375 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8；50 mM KCl, 1 mM MgCl2, 1 mM EGTA, 10 mM Tris cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å

共 13 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACT_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–372； UniProt 4–375

ARP4 isoform 1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A6A5PX31

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 8–488	未记录	Actin × 1 （P60010） Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 （A0A8H8UNQ6） SWR1-complex protein 4 × 1 （A0A8H4F9Y4） Enhancer of polycomb-like protein 1 × 1 （P43572） Transcription-associated protein 1 × 1 （P38811） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7YFP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7YFN Core module of the NuA4 complex in S. cerevisiae 提交 2022-07-08	构建体不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–489（489 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A6A5PX31_YEASX
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–481； UniProt 8–488

Chromatin modification-related protein EAF1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A8H8UNQ6

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–982	未记录	Actin × 1 （P60010） ARP4 isoform 1 × 1 （A0A6A5PX31） SWR1-complex protein 4 × 1 （A0A8H4F9Y4） Enhancer of polycomb-like protein 1 × 1 （P43572） Transcription-associated protein 1 × 1 （P38811） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7YFP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7YFN Core module of the NuA4 complex in S. cerevisiae 提交 2022-07-08	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 D 1–982（982 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A8H8UNQ6_YEASX
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–982； UniProt 1–982

SWR1-complex protein 4

Saccharomyces cerevisiae

UniProt A0A8H4F9Y4

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 1–476	未记录	Actin × 1 （P60010） ARP4 isoform 1 × 1 （A0A6A5PX31） Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 （A0A8H8UNQ6） Enhancer of polycomb-like protein 1 × 1 （P43572） Transcription-associated protein 1 × 1 （P38811） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7YFP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7YFN Core module of the NuA4 complex in S. cerevisiae 提交 2022-07-08	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 1–476（476 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å

共 1 个其他 PDB 条目、1 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A8H4F9Y4_YEASX
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–476； UniProt 1–476

Enhancer of polycomb-like protein 1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P43572

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 1–832	未记录	Actin × 1 （P60010） ARP4 isoform 1 × 1 （A0A6A5PX31） Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 （A0A8H8UNQ6） SWR1-complex protein 4 × 1 （A0A8H4F9Y4） Transcription-associated protein 1 × 1 （P38811） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7YFP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5J9Q Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 50–400（351 aa）片段：UNP residues 50-400	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 3.25 Å R-free 0.273
5J9Q Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 50–400（351 aa）片段：UNP residues 50-400	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 3.25 Å R-free 0.273
5J9Q Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 N 50–400（351 aa）片段：UNP residues 50-400	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 3.25 Å R-free 0.273
5J9T Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 121–400（280 aa）片段：UNP residues 50-400	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM HEPES (pH 7.5), 6% 1,6-Hexanediol, 7% PEG 8000, 5% ethylene glycol, 10mM DTT.	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
5J9T Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 121–400（280 aa）片段：UNP residues 50-400	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM HEPES (pH 7.5), 6% 1,6-Hexanediol, 7% PEG 8000, 5% ethylene glycol, 10mM DTT.	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
5J9T Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 K 121–400（280 aa）片段：UNP residues 50-400	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100mM HEPES (pH 7.5), 6% 1,6-Hexanediol, 7% PEG 8000, 5% ethylene glycol, 10mM DTT.	分辨率 2.70 Å R-free 0.219
5J9U Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 50–400（351 aa）片段：UNP residues 50-400	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 2.95 Å R-free 0.246
5J9U Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 50–400（351 aa）片段：UNP residues 50-400	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 2.95 Å R-free 0.246
5J9U Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 N 50–400（351 aa）片段：UNP residues 50-400	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；298 K；100mM NaCitrate (pH 6.5), 1.79M ammonium sulfate, 5%(w/v) glycerol	分辨率 2.95 Å R-free 0.246
5J9W Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 121–400（280 aa）片段：UNP residues 121-400	未记录	ACO ACETYL COENZYME *A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100 mM HEPES (pH 7.5), 9% PEG 20000, 8% glycerol, 7% 2-Propanol, 10% 1,6-Hexanediol, 10 mM DTT	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
5J9W Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 121–400（280 aa）片段：UNP residues 121-400	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100 mM HEPES (pH 7.5), 9% PEG 20000, 8% glycerol, 7% 2-Propanol, 10% 1,6-Hexanediol, 10 mM DTT	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
5J9W Crystal structure of the NuA4 core complex 提交 2016-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 K 121–400（280 aa）片段：UNP residues 121-400	未记录	ACO ACETYL COENZYME *A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；289 K；100 mM HEPES (pH 7.5), 9% PEG 20000, 8% glycerol, 7% 2-Propanol, 10% 1,6-Hexanediol, 10 mM DTT	分辨率 2.80 Å R-free 0.271
7VVU NuA4 HAT module bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric	链 T 1–832（832 aa）链 X 1–832（832 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME *A × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.40 Å
7VVY TRA module of NuA4 提交 2021-11-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 H 1–832（832 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.10 Å
7VVZ NuA4 bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 H 1–832（832 aa）链 T 1–832（832 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP* ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 8.80 Å
7YFN Core module of the NuA4 complex in S. cerevisiae 提交 2022-07-08	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 F 1–832（832 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8ESC Structure of the Yeast NuA4 Histone Acetyltransferase Complex 提交 2022-10-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 P 1–832（832 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

共 9 个其他 PDB 条目、17 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EPL1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–832； UniProt 1–832

Transcription-associated protein 1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P38811

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6）与蛋白拷贝数一致	链 T； UniProt 1–3744	未记录	Actin × 1 （P60010） ARP4 isoform 1 × 1 （A0A6A5PX31） Chromatin modification-related protein EAF1 × 1 （A0A8H8UNQ6） SWR1-complex protein 4 × 1 （A0A8H4F9Y4） Enhancer of polycomb-like protein 1 × 1 （P43572） ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7YFP	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5OJS Cryo-EM structure of the SAGA and NuA4 coactivator subunit Tra1 提交 2017-07-24	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 T 1–3744（3744 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Two subsequent applications of protein were required to achieve the desired particle density on grids. Each application was followed by 20 sec waiting time, with a short 0.5 sec blotting after first application and 5 sec blotting after the second.	分辨率 3.70 Å
5Y81 NuA4 TEEAA sub-complex 提交 2017-08-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–2627（2627 aa）片段：UNP residues 1-2627 链 B 2630–3744（1115 aa）片段：UNP residues 2630-3744	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
6IG9 Tra1 subunit from Saccharomyces cerevisiae SAGA complex 提交 2018-09-25	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 T 1–3744（3744 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8.5；20mM HEPES pH 8.5 150mM Nacl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds and wait for 30 seconds before plunging	分辨率 4.60 Å
6T9I cryo-EM structure of transcription coactivator SAGA 提交 2019-10-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 T 1–3744（3744 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solution were made from stock solution cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds before plunging	分辨率 3.90 Å
6T9J SAGA Tra1 module 提交 2019-10-28	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 T 1–3744（3744 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；Solution were made from stock solution cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 4 seconds before plunging	分辨率 3.40 Å
7VVY TRA module of NuA4 提交 2021-11-09	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 L 1–3744（3744 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 3.10 Å
7VVZ NuA4 bound to the nucleosome 提交 2021-11-09	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：21-meric	链 L 1–3744（3744 aa）	未记录	CMC CARBOXYMETHYL COENZYME A × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP* ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 8.80 Å
7YFN Core module of the NuA4 complex in S. cerevisiae 提交 2022-07-08	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 T 1–3744（3744 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8ESC Structure of the Yeast NuA4 Histone Acetyltransferase Complex 提交 2022-10-13	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 Z 1–3744（3744 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TRA1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–3744； UniProt 1–3744

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7yfp
沉积日期 deposition_date	2022-07-08
结构标题 title	The NuA4 histone acetyltransferase complex from S. cerevisiae
关键词 keywords	histone acetyltransferase, H4, acetylation, NuA4, nucleosome, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	70.97 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	71.25 Å
零角强度 I(0) i0	4372260000.00
分子量 molecular_weight	580650.0 kDa
排除体积 excluded_volume	735570 Å³
包络体积 envelope_volume	1178400 Å³
水化壳体积 shell_volume	143220 Å³
包络直径 envelope_diameter	238.9 Å
壳层 Rg shell_rg	66.63 Å
包络 Rg envelope_rg	69.33 Å
形状 Rg shape_rg	71.25 Å
总 Rg total_rg	71.20 Å
总原子数 total_atoms	40949
残基数 n_residues	5028
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	263.7 Å
Rg (实空间) rg_real	71.27 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.92 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.3740e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0690e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal	70.23 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	4364000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8493
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	71.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.406
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.425
角度范围 angular_range	— – 0.1100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0188
最高正则化参数 α highest_alpha	311700000.0000
实空间数据点数 n_real_points	23
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.737; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.825

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Actin
分子量 formula_weight	41402.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	40949

EVAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGIMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLRYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPMNPKSNREKMTQIMFETFNVPAFYVSIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGVTHVVPIYAGFSLPHAILRIDLAGRDLTDYLMKILSERGYSFSTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMQTAAQSSSIEKSYELPDGQVITIGNERFRAPEALFHPSVLGLESAGIDQTTYNSIMKCDVDVRKELYGNIVMSGGTTMFPGIAERMQKEITALAPSSMKVKIIAPPERKYSVWIGGSILASLTTFQQMWISKQEYDESGPSIVHHKCF

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ARP4 isoform 1
分子量 formula_weight	54021.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

VYGGDEVSAVVIDPGSYTTNIGYSGSDFPQSILPSVYGKYTADEGNKKIFSEQSIGIPRKDYELKPIIENGLVIDWDTAQEQWQWALQNELYLNSNSGIPALLTEPVWNSTENRKKSLEVLLEGMQFEACYLAPTSTCVSFAAGRPNCLVVDIGHDTCSVSPIVDGMTLSKSTRRNFIAGKFINHLIKKALEPKEIIPLFAIKQRKPEFIKKTFDYEVDKSLYDYANNRGFFQECKETLCHICPTKTLEETKTELSSTAKRSIESPWNEEIVFDNETRYGFAEELFLPKEDDIPANWPRSNSGVVKTWRNDYVPLKRTKPSGVNKSDKKVTPTEEKEQEAVSKSTSPAANSADTPNETGKRPLEEEKPPKENNELIGLADLVYSSIMSSDVDLRATLAHNVVLTGGTSSIPGLSDRLMTELNKILPSLKFRILTTGHTIERQYQSWLGGSILTSLGTFHQLWVGKKEYEEVGVERLLNDRF

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Chromatin modification-related protein EAF1
分子量 formula_weight	112667.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MSSRPSSAVPNSASLSEDQSSDRSKFPKADDLIDERDRKLTELYCVSRLNQLLELTDENKLRKEIDAFLKKNDIRRGIRFDEASLPKLLHTAATPITKKKLKDVNLINVPNQRLSDSKMSRELPENSENVSVKSESHFVPSHDNSIRENMMDSLRPAEKTGGMWNKRPLESTMGGEEERHEKRQKMQSQSLESSNNSEMASLPISPRPPVPNALAHYTYYENIEYPPADPTEVQPAVKFKDPLIKNIMAKEIDTSDHYNENNVDALETVFLLMNDYIPSKIPQALPLAELKYMSQTLPLINLIPRAHKALTTNIINNALNEARITVVGSRIEELRRLGLWSLRQPKRFIDPWKQHNTHQNILLEEAKWMQADFKEGHKYKVAICTAMAQAIKDYWTYGEICCVKRKTLLPGKENKLSDDGRISEKSGRPSDTSRNDSDISIAGKDDIGIIANVDDITEKESAAANDNDENGKNEAGAKSDFDFADGLLSQEGAHDQIISSIDTKLLLKKPSSSSEVVLIQHEVAASSALIETEESKKELAPPFKLSIFVDELNTFEKTLIQDLPLYNGINEERPKKDDSLPFIPISKSVVSLDDNGFYKLLERQLIDEEPSISQLSKRRGMFYGNRRNHYLRPPAVPSLRYLQNRTPTIWLSEDDQELVKNINTYGYNWELISAHMTHRLTYSYLSNIERRTPWQCFERFVQLNERFNFSDLKGPRAHSAQQWLIEAHKFQQRQNRRISPLGVNTESIQRGHRRLRWASMFEAIRKCMKKRENTPRPNPTQPRKPLDCKNMKVPTPAEMSLLKAQRDEALRRDIQLRRTVKNRLQQRQQQSQQAHSSRAQSPIPSNGKSSSNLARNGQASAPRPNQKQYTEQDIIESYSRKLLEQKPDIGPEMALKAAKNYYRTLREQQQQLKQHQIQQQRQQLQEESSHVQQLQQLQPGSQAPPPKSSPSQSSLSNISNINSAPRIKSPTPQEILQRFQKQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	SWR1-complex protein 4
分子量 formula_weight	55297.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MSSSDIFDVLNIKQKSRSPTNGQVSVPSSSAANRPKPQVTGMQRELFNLLGENQPPVVIKSGNNFKEKMLSTSKPSPWSFVEFKANNSVTLRHWVKGSKELIGDTPKESPYSKFNQHLSIPSFTKEEYEAFMNENEGTQKSVESEKNHNENFTNEKKDESKNSWSFEEIEYLFNLCKKYDLRWFLIFDRYSYNNSRTLEDLKEKFYYTCRNYFKASDPSNPLLSSLNFSAEKEIERKKYLQRLLSRSAAEIAEEEALVVESKKFEMAAKRTLAERESLLRLLDSPHSDQTITQYLTSQGMSQLYNALLADKTRKRKHDLNIPENPWMKQQQQFAQHRQLQQLNVKKSEVKENLSPKKTKRQRQEMQTALKRKSESAYAEQLLKDFNSDERKALGVITHGEKLSPGVYLRSTKLSTFKPALQNKILAILQELSLPSRPVMPSFDVMERQEELLKKINTLIDLKKHVDKYEAGMSITK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Enhancer of polycomb-like protein 1
分子量 formula_weight	96889.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MPTPSNAIEINDGSHKSGRSTRRSGSRSAHDDGLDSFSKGDSGAGASAGSSNSRFRHRKISVKQHLKIYLPNDLKHLDKDELQQREVVEIETGVEKNEEKEVHLHRILQMGSGHTKHKDYIPTPDASMTWNEYDKFYTGSFQETTSYIKFSATVEDCCGTNYNMDERDETFLNEQVNKGSSDILTEDEFEILCSSFEHAIHERQPFLSMDPESILSFEELKPTLIKSDMADFNLRNQLNHEINSHKTHFITQFDPVSQMNTRPLIQLIEKFGSKIYDYWRERKIEVNGYEIFPQLKFERPGEKEEIDPYVCFRRREVRHPRKTRRIDILNSQRLRALHQELKNAKDLALLVAKRENVSLNWINDELKIFDQRVKIKNLKRSLNISGEDDDLINHKRKRPTIVTVEQREAELRKAELKRAAAAAAAAKAKNNKRNNQLEDKSSRLTKQQQQQLLQQQQQQQQNALKTENGKQLANASSSSTSQPITSHVYVKLPSSKIPDIVLEDVDALLNSKEKNARKFVQEKMEKRKIEDADVFFNLTDDPFNPVFDMSLPKNFSTSNVPFASIASSKFQIDRSFYSSHLPEYLKGISDDIRIYDSNGRSRNKDNYNLDTKRIKKTELYDPFQENLEIHSREYPIKFRKRVGRSNIKYVDRMPNFTTSSTKSACSLMDFVDFDSIEKEQYSREGSNDTDSINVYDSKYDEFVRLYDKWKYDSPQNEYGIKFSDEPARLNQISNDTQVIRFGTMLGTKSYEQLREATIKYRRDYITRLKQKHIQHLQQQQQQQQQQQQQAQQQKQKSQNNNSNSSNSLKKLNDSLINSEAKQNSSITQKNSS

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Transcription-associated protein 1
分子量 formula_weight	433677.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MSLTEQIEQFASRFRDDDATLQSRYSTLSELYDIMELLNSPEDYHFFLQAVIPLLLNQLKEVPISYDAHSPEQKLRNSMLDIFNRCLMNQTFQPYAMEVLEFLLSVLPKENEENGILCMKVLTTLFKSFKSILQDKLDSFIRIIIQIYKNTPNLINQTFYEAGKAEQGDLDSPKEPQADELLDEFSKNDEEKDFPSKQSSTEPRFENSTSSNGLRSSMFSFKILSECPITMVTLYSSYKQLTSTSLPEFTPLIMNLLNIQIKQQQEAREQAESRGEHFTSISTEIINRPAYCDFILAQIKATSFLAYVFIRGYAPEFLQDYVNFVPDLIIRLLQDCPSELSSARKELLHATRHILSTNYKKLFLPKLDYLFDERILIGNGFTMHETLRPLAYSTVADFIHNIRSELQLSEIEKTIKIYTGYLLDESLALTVQIMSAKLLLNLVERILKLGKENPQEAPRAKKLLMIIIDSYMNRFKTLNRQYDTIMKYYGRYETHKKEKAEKLKNSIQDNDKESEEFMRKVLEPSDDDHLMPQPKKEDINDSPDVEMTESDKVVKNDVEMFDIKNYAPILLLPTPTNDPIKDAFYLYRTLMSFLKTIIHDLKVFNPPPNEYTVANPKLWASVSRVFSYEEVIVFKDLFHECIIGLKFFKDHNEKLSPETTKKHFDISMPSLPVSATKDARELMDYLAFMFMQMDNATFNEIIEQELPFVYERMLEDSGLLHVAQSFLTSEITSPNFAGILLRFLKGKLKDLGNVDFNTSNVLIRLFKLSFMSVNLFPNINEVVLLPHLNDLILNSLKYSTTAEEPLVYFYLIRTLFRSIGGGRFENLYRSIKPILQVLLQSLNQMILTARLPHERELYVELCITVPVRLSVLAPYLPFLMKPLVFALQQYPDLVSQGLRTLELCIDNLTAEYFDPIIEPVIDDVSKALFNLLQPQPFNHAISHNVVRILGKLGGRNRQFLKPPTDLTEKTELDIDAIADFKINGMPEDVPLSVTPGIQSALNILQSYKSDIHYRKSAYKYLTCVLLLMTKSSAEFPTNYTELLKTAVNSIKLERIGIEKNFDLEPTVNKRDYSNQENLFLRLLESVFYATSIKELKDDAMDLLNNLLDHFCLLQVNTTLLNKRNYNGTFNIDLKNPNFMLDSSLILDAIPFALSYYIPEVREVGVLAYKRIYEKSCLIYGEELALSHSFIPELAKQFIHLCYDETYYNKRGGVLGIKVLIDNVKSSSVFLKKYQYNLANGLLFVLKDTQSEAPSAITDSAEKLLIDLLSITFADVKEEDLGNKVLENTLTDIVCELSNANPKVRNACQKSLHTISNLTGIPIVKLMDHSKQFLLSPIFAKPLRALPFTMQIGNVDAITFCLSLPNTFLTFNEELFRLLQESIVLADAEDESLSTNIQKTTEYSTSEQLVQLRIACIKLLAIALKNEEFATAQQGNIRIRILAVFFKTMLKTSPEIINTTYEALKGSLAENSKLPKELLQNGLKPLLMNLSDHQKLTVPGLDALSKLLELLIAYFKVEIGRKLLDHLTAWCRVEVLDTLFGQDLAEQMPTKIIVSIINIFHLLPPQADMFLNDLLLKVMLLERKLRLQLDSPFRTPLARYLNRFHNPVTEYFKKNMTLRQLVLFMCNIVQRPEAKELAEDFEKELDNFYDFYISNIPKNQVRVVSFFTNMVDLFNTMVITNGDEWLKKKGNMILKLKDMLNLTLKTIKENSFYIDHLQLNQSIAKFQALYLRFTELSERDQNPLLLDFIDFSFSNGIKASYSLKKFIFHNIIASSNKEKQNNFINDATLFVLSDKCLDARIFVLKNVINSTLIYEVATSGSLKSYLVEDKKPKWLELLHNKIWKNSNAILAYDVLDHHDLFRFELLQLSAIFIKADPEIIAEIKKDIIKFCWNFIKLEDTLIKQSAYLVTSYFISKFDFPIKVVTQVFVALLRSSHVEARYLVKQSLDVLTPVLHERMNAAGTPDTWINWVKRVMVENSSSQNNILYQFLISHPDLFFNSRDLFISNIIHHMNKITFMSNSNSDSHTLAIDLASLILYWENKTLEITNVNNTKTDSDGDVVMSDSKSDINPVEADTTAIIVDANNNSPISLHLREACTAFLIRYVCASNHRAIETELGLRAINILSELISDKHWTNVNVKLVYFEKFLIFQDLDSENILYYCMNALDVLYVFFKNKTKEWIMENLPTIQNLLEKCIKSDHHDVQEALQKVLQVIMKAIKAQGVSVIIEEESPGKTFIQMLTSVITQDLQETSSVTAGVTLAWVLFMNFPDNIVPLLTPLMKTFSKLCKDHLSISQPKDAMALEEARITTKLLEKVLYILSLKVSLLGDSRRPFLSTVALLIDHSMDQNFLRKIVNMSRSWIFNTEIFPTVKEKAAILTKMLAFEIRGEPSLSKLFYEIVLKLFDQEHFNNTEITVRMEQPFLVGTRVEDIGIRKRFMTILDNSLERDIKERLYYVIRDQNWEFIADYPWLNQALQLLYGSFNREKELSLKNIYCLSPPSILQEYLPENAEMVTEVNDLELSNFVKGHIASMQGLCRIISSDFIDSLIEIFYQDPKAIHRAWVTLFPQVYKSIPKNEKYGFVRSIITLLSKPYHTRQISSRTNVINMLLDSISKIESLELPPHLVKYLAISYNAWYQSINILESIQSNTSIDNTKIIEANEDALLELYVNLQEEDMFYGLWRRRAKYTETNIGLSYEQIGLWDKAQQLYEVAQVKARSGALPYSQSEYALWEDNWIQCAEKLQHWDVLTELAKHEGFTDLLLECGWRVADWNSDRDALEQSVKSVMDVPTPRRQMFKTFLALQNFAESRKGDQEVRKLCDEGIQLSLIKWVSLPIRYTPAHKWLLHGFQQYMEFLEATQIYANLHTTTVQNLDSKAQEIKRILQAWRDRLPNTWDDVNMWNDLVTWRQHAFQVINNAYLPLIPALQQSNSNSNINTHAYRGYHEIAWVINRFAHVARKHNMPDVCISQLARIYTLPNIEIQEAFLKLREQAKCHYQNMNELTTGLDVISNTNLVYFGTVQKAEFFTLKGMFLSKLRAYEEANQAFATAVQIDLNLAKAWAQWGFFNDRRLSEEPNNISFASNAISCYLQAAGLYKNSKIRELLCRILWLISIDDASGMLTNAFDSFRGEIPVWYWITFIPQLLTSLSHKEANMVRHILIRIAKSYPQALHFQLRTTKEDFAVIQRQTMAVMGDKPDTNDRNGRRQPWEYLQELNNILKTAYPLLALSLESLVAQINDRFKSTTDEDLFRLINVLLIDGTLNYNRLPFPRKNPKLPENTEKNLVKFSTTLLAPYIRPKFNADFIDNKPDYETYIKRLRYWRRRLENKLDRASKKENLEVLCPHLSNFHHQKFEDIEIPGQYLLNKDNNVHFIKIARFLPTVDFVRGTHSSYRRLMIRGHDGSVHSFAVQYPAVRHSRREERMFQLYRLFNKSLSKNVETRRRSIQFNLPIAIPLSPQVRIMNDSVSFTTLHEIHNEFCKKKGFDPDDIQDFMADKLNAAHDDALPAPDMTILKVEIFNSIQTMFVPSNVLKDHFTSLFTQFEDFWLFRKQFASQYSSFVFMSYMMMINNRTPHKIHVDKTSGNVFTLEMLPSRFPYERVKPLLKNHDLSLPPDSPIFHNNEPVPFRLTPNIQSLIGDSALEGIFAVNLFTISRALIEPDNELNTYLALFIRDEIISWFSNLHRPIIENPQLREMVQTNVDLIIRKVAQLGHLNSTPTVTTQFILDCIGSAVSPRNLARTDVNFMPWF

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	7yfpA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	197044

fit	/app/data/saxs_computation/yf/7yfp/7yfp.fit
pddf	/app/data/pr_computation/yf/7yfp/7yfp.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/yf/7yfp/7yfp.dat

The NuA4 histone acetyltransferase complex from S. cerevisiae

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ARP4 isoform 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Chromatin modification-related protein EAF1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SWR1-complex protein 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Enhancer of polycomb-like protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transcription-associated protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 7 Entity 7 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)