7yg5

Structure of human R-type voltage-gated CaV2.3-alpha2/delta1-beta1 channel complex in the topiramate-bound state

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 188.0 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–2313	未记录	Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1 × 1 （Q02641） Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1 × 1 （P54289） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 9 R16 HEXADECANE × 6 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 CA CALCIUM ION × 2 TOR [(3aS,5aR,8aR,8bS)-2,2,7,7-tetramethyltetrahydro-3aH-bis[1,3]dioxolo[4,5-b:4',5'-d]pyran-3a-yl]methyl sulfamate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7YG5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7XLQ Structure of human R-type voltage-gated CaV2.3-alpha2/delta1-beta1 channel complex in the ligand-free (apo) state 提交 2022-04-22	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–2313（2313 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 6 R16 HEXADECANE × 7 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8EPL Human R-type voltage-gated calcium channel Cav2.3 at 3.1 Angstrom resolution 提交 2022-10-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–2313（2313 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 5 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8EPM Human R-type voltage-gated calcium channel Cav2.3 CH2II-deleted mutant at 3.1 Angstrom resolution 提交 2022-10-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–2313（2313 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CAC1E_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–2313； UniProt 1–2313

Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1

Homo sapiens

UniProt Q02641

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–598	未记录	Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E × 1 （Q15878） Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1 × 1 （P54289） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 9 R16 HEXADECANE × 6 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 CA CALCIUM ION × 2 TOR [(3aS,5aR,8aR,8bS)-2,2,7,7-tetramethyltetrahydro-3aH-bis[1,3]dioxolo[4,5-b:4',5'-d]pyran-3a-yl]methyl sulfamate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7YG5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7VFS Human N-type voltage gated calcium channel CaV2.2-alpha2/delta1-beta1 complex, apo state 提交 2021-09-13	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–598（598 aa）	未记录	R16 HEXADECANE × 18 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7VFU Human N-type voltage gated calcium channel CaV2.2-alpha2/delta1-beta1 complex, bound to ziconotide 提交 2021-09-13	聚集状态不同配体/离子不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–598（598 aa）	未记录	R16 HEXADECANE × 18 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7VFV Human N-type voltage gated calcium channel CaV2.2-alpha2/delta1-beta1 complex, bound to PD173212 提交 2021-09-13	配体/离子不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–598（598 aa）	未记录	R16 HEXADECANE × 16 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 6IX (2~{S})-~{N}-[(2~{S})-1-(~{tert}-butylamino)-1-oxidanylidene-3-(4-phenylmethoxyphenyl)propan-2-yl]-2-[(4-~{tert}-butylphenyl)methyl-methyl-amino]-4-methyl-pentanamide × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7VFW Human N-type voltage gated calcium channel CaV2.2-alpha2/delta1-beta1 complex, bound to CaV2.2-blocker1 提交 2021-09-13	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–598（598 aa）	未记录	R16 HEXADECANE × 15 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 6I7 5-(4-chlorophenyl)-1-(2-methoxyphenyl)-3-(2,2,6,6-tetramethyloxan-4-yl)pyrazole × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7XLQ Structure of human R-type voltage-gated CaV2.3-alpha2/delta1-beta1 channel complex in the ligand-free (apo) state 提交 2022-04-22	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–598（598 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 6 R16 HEXADECANE × 7 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CACB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–598； UniProt 1–598

Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1

Homo sapiens

UniProt P54289

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 3 其他聚合物 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 1–1103	未记录	Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E × 1 （Q15878） Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1 × 1 （Q02641） beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 9 R16 HEXADECANE × 6 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 CA CALCIUM ION × 2 TOR [(3aS,5aR,8aR,8bS)-2,2,7,7-tetramethyltetrahydro-3aH-bis[1,3]dioxolo[4,5-b:4',5'-d]pyran-3a-yl]methyl sulfamate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7YG5	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7MIX Human N-type voltage-gated calcium channel Cav2.2 in the presence of ziconotide at 3.0 Angstrom resolution 提交 2021-04-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–1103（1103 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 2 CLR CHOLESTEROL × 5 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 6 seconds before plunging	分辨率 3.00 Å
7MIY Human N-type voltage-gated calcium channel Cav2.2 at 3.1 Angstrom resolution 提交 2021-04-18	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–1103（1103 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 CLR CHOLESTEROL × 4 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot for 6 seconds before plunging	分辨率 3.10 Å
7UHF Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.3 in the presence of cinnarizine at 3.1 Angstrom resolution 提交 2022-03-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–1103（1103 aa）	未记录	N90 1-(diphenylmethyl)-4-[(2E)-3-phenylprop-2-en-1-yl]piperazine × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 CA CALCIUM ION × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7UHG Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.3 at 3.0 Angstrom resolution 提交 2022-03-26	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–1103（1103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 3 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7VFS Human N-type voltage gated calcium channel CaV2.2-alpha2/delta1-beta1 complex, apo state 提交 2021-09-13	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–1103（1103 aa）	未记录	R16 HEXADECANE × 18 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7VFU Human N-type voltage gated calcium channel CaV2.2-alpha2/delta1-beta1 complex, bound to ziconotide 提交 2021-09-13	聚集状态不同配体/离子不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–1103（1103 aa）	未记录	R16 HEXADECANE × 18 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7VFV Human N-type voltage gated calcium channel CaV2.2-alpha2/delta1-beta1 complex, bound to PD173212 提交 2021-09-13	配体/离子不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–1103（1103 aa）	未记录	R16 HEXADECANE × 16 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 6IX (2~{S})-~{N}-[(2~{S})-1-(~{tert}-butylamino)-1-oxidanylidene-3-(4-phenylmethoxyphenyl)propan-2-yl]-2-[(4-~{tert}-butylphenyl)methyl-methyl-amino]-4-methyl-pentanamide × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7VFW Human N-type voltage gated calcium channel CaV2.2-alpha2/delta1-beta1 complex, bound to CaV2.2-blocker1 提交 2021-09-13	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–1103（1103 aa）	未记录	R16 HEXADECANE × 15 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 6I7 5-(4-chlorophenyl)-1-(2-methoxyphenyl)-3-(2,2,6,6-tetramethyloxan-4-yl)pyrazole × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7XLQ Structure of human R-type voltage-gated CaV2.3-alpha2/delta1-beta1 channel complex in the ligand-free (apo) state 提交 2022-04-22	构建体不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 27–1103（1077 aa）	未记录	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 6 R16 HEXADECANE × 7 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8E59 Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.3 in the presence of Amiodarone at 3.1 Angstrom resolution 提交 2022-08-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–1103（1103 aa）	未记录	BBI (2-butyl-1-benzofuran-3-yl){4-[2-(diethylamino)ethoxy]-3,5-diiodophenyl}methanone × 1 CA CALCIUM ION × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8E5A Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.3 treated with 1.4 mM Sofosbuvir at 3.3 Angstrom resolution 提交 2022-08-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–1103（1103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8E5B Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.3 in the presence of Amiodarone and Sofosbuvir at 3.3 Angstrom resolution 提交 2022-08-20	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–1103（1103 aa）	未记录	BBI (2-butyl-1-benzofuran-3-yl){4-[2-(diethylamino)ethoxy]-3,5-diiodophenyl}methanone × 1 WG6 Sofosbuvir × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8EPL Human R-type voltage-gated calcium channel Cav2.3 at 3.1 Angstrom resolution 提交 2022-10-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–1103（1103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 5 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8EPM Human R-type voltage-gated calcium channel Cav2.3 CH2II-deleted mutant at 3.1 Angstrom resolution 提交 2022-10-06	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 1–1103（1103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
8FHS Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 in the presence of amiodarone and sofosbuvir at 3.3 Angstrom resolution 提交 2022-12-15	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–1103（1103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 BBI (2-butyl-1-benzofuran-3-yl){4-[2-(diethylamino)ethoxy]-3,5-diiodophenyl}methanone × 1 WG6 Sofosbuvir × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 CLR CHOLESTEROL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8HLP Cryo-EM structure of human high-voltage activated L-type calcium channel CaV1.2 (apo) 提交 2022-11-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–1071（1071 aa）	未记录	R16 HEXADECANE × 9 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8HMA Cryo-EM structure of human high-voltage activated L-type calcium channel CaV1.2 in complex with tetrandrine (TET) 提交 2022-12-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1–1071（1071 aa）	未记录	R16 HEXADECANE × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 3 A1AC9 6,6',7,12-tetramethoxy-2,2'-dimethyl-1beta-3,4-didehydroberbaman × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 11 BMA beta-D-mannopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8HMB Cryo-EM structure of human high-voltage activated L-type calcium channel CaV1.2 in complex with benidipine (BEN) 提交 2022-12-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1–1071（1071 aa）	未记录	R16 HEXADECANE × 8 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 3 A1AC8 (3R)-1-benzylpiperidin-3-yl methyl (4R)-2,6-dimethyl-4-(3-nitrophenyl)-1,4-dihydropyridine-3,5-dicarboxylate × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8IF3 Structure of human alpha-2/delta-1 with mirogabalin 提交 2023-02-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1091（1091 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 8X9 2-[(1R,5S,6S)-6-(aminomethyl)-3-ethyl-6-bicyclo[3.2.0]hept-3-enyl]acetic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
8IF4 Structure of human alpha-2/delta-1 without mirogabalin 提交 2023-02-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–1091（1091 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
8WE6 Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 at 2.9 Angstrom resolution 提交 2023-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–1103（1103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 CLR CHOLESTEROL × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8WE7 Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 in the presence of calciseptine at 3.2 Angstrom resolution 提交 2023-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–1103（1103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8WE8 Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 in the presence of calciseptine, amlodipine and pinaverium at 2.9 Angstrom resolution 提交 2023-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 1–1103（1103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 CLR CHOLESTEROL × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 6UB amlodipine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8WE9 Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 (Class I) in the presence of pinaverium at 3.0 Angstrom resolution 提交 2023-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1–1103（1103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1 CLR CHOLESTEROL × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
8WEA Human L-type voltage-gated calcium channel Cav1.2 (Class II) in the presence of pinaverium at 3.2 Angstrom resolution 提交 2023-09-17	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–1103（1103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 2 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 WB9 4-[(2-bromanyl-4,5-dimethoxy-phenyl)methyl]-4-[2-[2-[(1~{R},2~{S},5~{R})-6,6-dimethyl-2-bicyclo[3.1.1]heptanyl]ethoxy]ethyl]morpholin-4-ium × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8X90 P/Q type calcium channel 提交 2023-11-29	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–1103（1103 aa）	未记录	PS1 1,2-DIDECANOYL-SN-GLYCERO-3-[PHOSPHO-L-SERINE] × 1 CLR CHOLESTEROL × 5 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 CA CALCIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.95 Å
8X91 P/Q type calcium channel in complex with omega-conotoxin MVIIC 提交 2023-11-29	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–1103（1103 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 3 CLR CHOLESTEROL × 5 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.11 Å
8X93 P/Q type calcium channel in complex with omega-Agatoxin IVA 提交 2023-11-29	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–1103（1103 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CLR CHOLESTEROL × 5 PT5 [(2R)-1-octadecanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phospho ryl]oxy-propan-2-yl] (8Z)-icosa-5,8,11,14-tetraenoate × 1 Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 3 3PE 1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.92 Å
9VLG Structure of human alpha-2/delta-1 with crisugabalin 提交 2025-06-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 25–1064（1040 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 A1ESQ Crisugabalin × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.01 Å

共 29 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CA2D1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–1103； UniProt 1–1103

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7yg5
沉积日期 deposition_date	2022-07-11
结构标题 title	Structure of human R-type voltage-gated CaV2.3-alpha2/delta1-beta1 channel complex in the topiramate-bound state
关键词 keywords	Voltage-gated calcium channel, CaV2.3, Complex, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	54.54 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	54.39 Å
零角强度 I(0) i0	1055540000.00
分子量 molecular_weight	288290.0 kDa
排除体积 excluded_volume	367900 Å³
包络体积 envelope_volume	530690 Å³
水化壳体积 shell_volume	85058 Å³
包络直径 envelope_diameter	200.0 Å
壳层 Rg shell_rg	53.51 Å
包络 Rg envelope_rg	53.71 Å
形状 Rg shape_rg	54.37 Å
总 Rg total_rg	54.42 Å
总原子数 total_atoms	20308
残基数 n_residues	2436
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	188.0 Å
Rg (实空间) rg_real	54.86 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.13 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.0560e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	2.0190e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	54.27 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1055000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8464
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	58.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.521
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.167
角度范围 angular_range	— – 0.1450 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	70020000.0000
实空间数据点数 n_real_points	30
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.827; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.986; Smooth: 0.531

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E
分子量 formula_weight	262056.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	20308

MARFGEAVVARPGSGDGDSDQSRNRQGTPVPASGQAAAYKQTKAQRARTMALYNPIPVRQNCFTVNRSLFIFGEDNIVRKYAKKLIDWPPFEYMILATIIANCIVLALEQHLPEDDKTPMSRRLEKTEPYFIGIFCFEAGIKIVALGFIFHKGSYLRNGWNVMDFIVVLSGILATAGTHFNTHVDLRTLRAVRVLRPLKLVSGIPSLQIVLKSIMKAMVPLLQIGLLLFFAILMFAIIGLEFYSGKLHRACFMNNSGILEGFDPPHPCGVQGCPAGYECKDWIGPNDGITQFDNILFAVLTVFQCITMEGWTTVLYNTNDALGATWNWLYFIPLIIIGSFFVLNLVLGVLSGEFAKERERVENRRAFMKLRRQQQIERELNGYRAWIDKAEEVMLAEENKNAGTSALEVLRRATIKRSRTEAMTRDSSDEHCVDISSVGTPLARASIKSAKVDGVSYFRHKERLLRISIRHMVKSQVFYWIVLSLVALNTACVAIVHHNQPQWLTHLLYYAEFLFLGLFLLEMSLKMYGMGPRLYFHSSFNCFDFGVTVGSIFEVVWAIFRPGTSFGISVLRALRLLRIFKITKYWASLRNLVVSLMSSMKSIISLLFLLFLFIVVFALLGMQLFGGRFNFNDGTPSANFDTFPAAIMTVFQILTGEDWNEVMYNGIRSQGGVSSGMWSAIYFIVLTLFGNYTLLNVFLAIAVDNLANAQELTKDEQEEEEAFNQKHALQKAKEVSPMSAPNMPSIERDRRRRHHMSMWEPRSSHLRERRRRHHMSVWEQRTSQLRKHMQMSSQEALNREEAPTMNPLNPLNPLSSLNPLNAHPSLYRRPRAIEGLALGLALEKFEEERISRGGSLKGDGGDRSSALDNQRTPLSLGQREPPWLARPCHGNCDPTQQEAGGGEAVVTFEDRARHRQSQRRSRHRRVRTEGKESSSASRSRSASQERSLDEAMPTEGEKDHELRGNHGAKEPTIQEERAQDLRRTNSLMVSRGSGLAGGLDEADTPLVLPHPELEVGKHVVLTEQEPEGSSEQALLGNVQLDMGRVISQSEPDLSCITANTDKATTESTSVTVAIPDVDPLVDSTVVHISNKTDGEASPLKEAEIREDEEEVEKKKQKKEKRETGKAMVPHSSMFIFSTTNPIRRACHYIVNLRYFEMCILLVIAASSIALAAEDPVLTNSERNKVLRYFDYVFTGVFTFEMVIKMIDQGLILQDGSYFRDLWNILDFVVVVGALVAFALANALGTNKGRDIKTIKSLRVLRVLRPLKTIKRLPKLKAVFDCVVTSLKNVFNILIVYKLFMFIFAVIAVQLFKGKFFYCTDSSKDTEKECIGNYVDHEKNKMEVKGREWKRHEFHYDNIIWALLTLFTVSTGEGWPQVLQHSVDVTEEDRGPSRSNRMEMSIFYVVYFVVFPFFFVNIFVALIIITFQEQGDKMMEECSLEKNERACIDFAISAKPLTRYMPQNRHTFQYRVWHFVVSPSFEYTIMAMIALNTVVLMMKYYSAPCTYELALKYLNIAFTMVFSLECVLKVIAFGFLNYFRDTWNIFDFITVIGSITEIILTDSKLVNTSGFNMSFLKLFRAARLIKLLRQGYTIRILLWTFVQSFKALPYVCLLIAMLFFIYAIIGMQVFGNIKLDEESHINRHNNFRSFFGSLMLLFRSATGEAWQEIMLSCLGEKGCEPDTTAPSGQNENERCGTDLAYVYFVSFIFFCSFLMLNLFVAVIMDNFEYLTRDSSILGPHHLDEFVRVWAEYDRAACGRIHYTEMYEMLTLMSPPLGLGKRCPSKVAYKRLVLMNMPVAEDMTVHFTSTLMALIRTALDIKIAKGGADRQQLDSELQKETLAIWPHLSQKMLDLLVPMPKASDLTVGKIYAAMMIMDYYKQSKVKKQRQQLEEQKNAPMFQRMEPSSLPQEIIANAKALPYLQQDPVSGLSGRSGYPSMSPLSPQDIFQLACMDPADDGQFQERQSLEPEVSELKSVQPSNHGIYLPSDTQEHAGSGRASSMPRLTVDPQVVTDPSSMRRSFSTIRDKRSNSSWLEEFSMERSSENTYKSRRRSYHSSLRLSAHRLNSDSGHKSDTHRSGGRERGRSKERKHLLSPDVSRCNSEERGTQADWESPERRQSRSPSEGRSQTPNRQGTGSLSESSIPSVSDTSTPRRSRRQLPPVPPKPRPLLSYSSLIRHAGSISPPADGSEEGSPLTSQALESNNACLTESSNSPHPQQSQHASPQRYISEPYLALHEDSHASDCGEEETLTFEAAVATSLGRSNTIGSAPPLRHSWQMPNGHYRRRRRGGPGPGMMCGAVNNLLSDTEEDDKC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1
分子量 formula_weight	65799.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MVQKTSMSRGPYPPSQEIPMEVFDPSPQGKYSKRKGRFKRSDGSTSSDTTSNSFVRQGSAESYTSRPSDSDVSLEEDREALRKEAERQALAQLEKAKTKPVAFAVRTNVGYNPSPGDEVPVQGVAITFEPKDFLHIKEKYNNDWWIGRLVKEGCEVGFIPSPVKLDSLRLLQEQKLRQNRLGSSKSGDNSSSSLGDVVTGTRRPTPPASAKQKQKSTEHVPPYDVVPSMRPIILVGPSLKGYEVTDMMQKALFDFLKHRFDGRISITRVTADISLAKRSVLNNPSKHIIIERSNTRSSLAEVQSEIERIFELARTLQLVALDADTINHPAQLSKTSLAPIIVYIKITSPKVLQRLIKSRGKSQSKHLNVQIAASEKLAQCPPEMFDIILDENQLEDACEHLAEYLEAYWKATHPPSSTPPNPLLNRTMATAALAASPAPVSNLQGPYLASGDQPLERATGEHASMHEYPGELGQPPGLYPSSHPPGRAGTLRALSRQDTFDADTPGSRNSAYTELGDSCVDMETDPSEGPGLGDPAGGGTPPARQGSWEDEEEDYEEELTDNRNRGRNKARYCAEGGGPVLGRNKNELEGWGRGVYIR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1
分子量 formula_weight	124692.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MAAGCLLALTLTLFQSLLIGPSSEEPFPSAVTIKSWVDKMQEDLVTLAKTASGVNQLVDIYEKYQDLYTVEPNNARQLVEIAARDIEKLLSNRSKALVRLALEAEKVQAAHQWREDFASNEVVYYNAKDDLDPEKNDSEPGSQRIKPVFIEDANFGRQISYQHAAVHIPTDIYEGSTIVLNELNWTSALDEVFKKNREEDPSLLWQVFGSATGLARYYPASPWVDNSRTPNKIDLYDVRRRPWYIQGAASPKDMLILVDVSGSVSGLTLKLIRTSVSEMLETLSDDDFVNVASFNSNAQDVSCFQHLVQANVRNKKVLKDAVNNITAKGITDYKKGFSFAFEQLLNYNVSRANCNKIIMLFTDGGEERAQEIFNKYNKDKKVRVFTFSVGQHNYDRGPIQWMACENKGYYYEIPSIGAIRINTQEYLDVLGRPMVLAGDKAKQVQWTNVYLDALELGLVITGTLPVFNITGQFENKTNLKNQLILGVMGVDVSLEDIKRLTPRFTLCPNGYYFAIDPNGYVLLHPNLQPKPIGVGIPTINLRKRRPNIQNPKSQEPVTLDFLDAELENDIKVEIRNKMIDGESGEKTFRTLVKSQDERYIDKGNRTYTWTPVNGTDYSLALVLPTYSFYYIKAKLEETITQARYSETLKPDNFEESGYTFIAPRDYCNDLKISDNNTEFLLNFNEFIDRKTPNNPSCNADLINRVLLDAGFTNELVQNYWSKQKNIKGVKARFVVTDGGITRVYPKEAGENWQENPETYEDSFYKRSLDNDNYVFTAPYFNKSGPGAYESGIMVSKAVEIYIQGKLLKPAVVGIKIDVNSWIENFTKTSIRDPCAGPVCDCKRNSDVMDCVILDDGGFLLMANHDDYTNQIGRFFGEIDPSLMRHLVNISVYAFNKSYDYQSVCEPGAAPKQGAGHRSAYVPSVADILQIGWWATAAAWSILQQFLLSLTFPRLLEAVEMEDDDFTASLSKQSCITEQTQYFFDNDSKSFSGVLDCGNCSRIFHGEKLMNTNLIFIMVESKGTCPCDTRLLIQAEQTSDGPNPCDMVKQPRYRKGPDVCFDNNVLEDYTDCGGVSGLNPSLWYIIGIQFLLLWLVSGSTHRLL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-3)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	CHOLESTEROL HEMISUCCINATE
分子量 formula_weight	486.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	9

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	HEXADECANE
分子量 formula_weight	226.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	1,2-Distearoyl-sn-glycerophosphoethanolamine
分子量 formula_weight	748.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 10 Entity 10 non-polymer

描述 description	;[(3aS,5aR,8aR,8bS)-2,2,7,7-tetramethyltetrahydro-3aH-bis[1,3]dioxolo[4,5-b:4',5'-d]pyran-3a-yl]methyl sulfamate ;
分子量 formula_weight	339.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	68522

fit	/app/data/saxs_computation/yg/7yg5/7yg5.fit
pddf	/app/data/pr_computation/yg/7yg5/7yg5.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/yg/7yg5/7yg5.dat

Structure of human R-type voltage-gated CaV2.3-alpha2/delta1-beta1 channel complex in the topiramate-bound state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

实体 10 Entity 10 non-polymer

实体 11 Entity 11 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)