7znl

Structure of the human TREX core THO-UAP56 complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

THO complex subunit 1

Homo sapiens

UniProt Q96FV9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 28 THO complex subunit 2 × 4 (Q8NI27) THO complex subunit 3 × 4 (Q96J01) THO complex subunit 5 homolog × 4 (Q13769) THO complex subunit 6 homolog × 4 (Q86W42) THO complex subunit 7 homolog × 4 (Q6I9Y2) Spliceosome RNA helicase DDX39B × 4 (Q13838) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 THOC1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–657; UniProt 1–657 作者链 I; PDB构建体 1–657; UniProt 1–657 作者链 a; PDB构建体 1–657; UniProt 1–657 作者链 i; PDB构建体 1–657; UniProt 1–657

THO complex subunit 2

Homo sapiens

UniProt Q8NI27

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 28 THO complex subunit 1 × 4 (Q96FV9) THO complex subunit 3 × 4 (Q96J01) THO complex subunit 5 homolog × 4 (Q13769) THO complex subunit 6 homolog × 4 (Q86W42) THO complex subunit 7 homolog × 4 (Q6I9Y2) Spliceosome RNA helicase DDX39B × 4 (Q13838) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 THOC2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–1593; UniProt 1–1593 作者链 J; PDB构建体 1–1593; UniProt 1–1593 作者链 b; PDB构建体 1–1593; UniProt 1–1593 作者链 j; PDB构建体 1–1593; UniProt 1–1593

THO complex subunit 3

Homo sapiens

UniProt Q96J01

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 28 THO complex subunit 1 × 4 (Q96FV9) THO complex subunit 2 × 4 (Q8NI27) THO complex subunit 5 homolog × 4 (Q13769) THO complex subunit 6 homolog × 4 (Q86W42) THO complex subunit 7 homolog × 4 (Q6I9Y2) Spliceosome RNA helicase DDX39B × 4 (Q13838) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 THOC3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 K; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 c; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351 作者链 k; PDB构建体 1–351; UniProt 1–351

THO complex subunit 5 homolog

Homo sapiens

UniProt Q13769

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 28 THO complex subunit 1 × 4 (Q96FV9) THO complex subunit 2 × 4 (Q8NI27) THO complex subunit 3 × 4 (Q96J01) THO complex subunit 6 homolog × 4 (Q86W42) THO complex subunit 7 homolog × 4 (Q6I9Y2) Spliceosome RNA helicase DDX39B × 4 (Q13838) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 THOC5_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–683; UniProt 1–683 作者链 M; PDB构建体 1–683; UniProt 1–683 作者链 e; PDB构建体 1–683; UniProt 1–683 作者链 m; PDB构建体 1–683; UniProt 1–683

THO complex subunit 6 homolog

Homo sapiens

UniProt Q86W42

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 28 THO complex subunit 1 × 4 (Q96FV9) THO complex subunit 2 × 4 (Q8NI27) THO complex subunit 3 × 4 (Q96J01) THO complex subunit 5 homolog × 4 (Q13769) THO complex subunit 7 homolog × 4 (Q6I9Y2) Spliceosome RNA helicase DDX39B × 4 (Q13838) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 THOC6_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–341; UniProt 1–341 作者链 N; PDB构建体 1–341; UniProt 1–341 作者链 f; PDB构建体 1–341; UniProt 1–341 作者链 n; PDB构建体 1–341; UniProt 1–341

THO complex subunit 7 homolog

Homo sapiens

UniProt Q6I9Y2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 28 THO complex subunit 1 × 4 (Q96FV9) THO complex subunit 2 × 4 (Q8NI27) THO complex subunit 3 × 4 (Q96J01) THO complex subunit 5 homolog × 4 (Q13769) THO complex subunit 6 homolog × 4 (Q86W42) Spliceosome RNA helicase DDX39B × 4 (Q13838) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 THOC7_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–204; UniProt 1–204 作者链 O; PDB构建体 1–204; UniProt 1–204 作者链 g; PDB构建体 1–204; UniProt 1–204 作者链 o; PDB构建体 1–204; UniProt 1–204

Spliceosome RNA helicase DDX39B

Homo sapiens

UniProt Q13838

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 28 THO complex subunit 1 × 4 (Q96FV9) THO complex subunit 2 × 4 (Q8NI27) THO complex subunit 3 × 4 (Q96J01) THO complex subunit 5 homolog × 4 (Q13769) THO complex subunit 6 homolog × 4 (Q86W42) THO complex subunit 7 homolog × 4 (Q6I9Y2) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 DX39B_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–428; UniProt 1–428 作者链 P; PDB构建体 1–428; UniProt 1–428 作者链 h; PDB构建体 1–428; UniProt 1–428 作者链 p; PDB构建体 1–428; UniProt 1–428

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7znl
沉积日期 deposition_date2022-04-21
结构标题 titleStructure of the human TREX core THO-UAP56 complex
关键词 keywordstranscription and export complex, TREX, RNA export, RNA packaging, RNA binding protein, gene expression, GENE REGULATION; GENE REGULATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7znl__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7znl__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

7znl__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)118.20 Å
总 Rg117.70 Å
原子数84821
残基数11173
排除体积1504600 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7znl__assembly_1__model_1 28-meric (28) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id7znlF01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
结构域编号 domain_id7znlN01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
结构域编号 domain_id7znlf01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
结构域编号 domain_id7znln01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
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7. 引用文献 (1)