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7zrp

2.65 Angstrom crystal structure of Ca/CaM:CaMKIIdelta peptide complex

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Calmodulin-1

Homo sapiens

UniProt P0DP23

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta × 1 （Q13557） CALCIUM ION × 4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 IMIDAZOLE × 1 ZINC ION × 5 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta × 1 （Q13557） CALCIUM ION × 4 IMIDAZOLE × 1 ZINC ION × 4 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
2kug 6dah 6dah 6dah 6dah 6eeb 6gdk 6gdl 6m7h 6o5g 6os4 6y94

共 22 个 assembly，这里只显示前 12 个

同源二聚体
6eeb 6os4 7t2q

共 3 个 assembly

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
12dk 22rj 3evv 3o77 3o78 3o78 3o78 5oeo 5v02 5v7x 5wbx 5wbx

共 255 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CALM1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–148； UniProt 2–149 作者链 C； PDB构建体 1–148； UniProt 2–149

Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta

物种未注明

UniProt Q13557

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Calmodulin-1 × 1 （P0DP23） CALCIUM ION × 4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2 IMIDAZOLE × 1 ZINC ION × 5 water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Calmodulin-1 × 1 （P0DP23） CALCIUM ION × 4 IMIDAZOLE × 1 ZINC ION × 4 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
2vn9 2vn9 5vlo 5vlo 6ayw 6ayw 9blh 9blh

共 8 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
2w2c

共 1 个 assembly

异源或核酸复合物
2wel 3gp2 3gp2 7zrp 7zrp 7zrq

共 6 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KCC2D_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–22； UniProt 294–315 作者链 D； PDB构建体 1–22； UniProt 294–315

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7zrp
沉积日期 deposition_date2022-05-04
结构标题 title2.65 Angstrom crystal structure of Ca/CaM:CaMKIIdelta peptide complex
关键词 keywordscalcium-binding protein, calmodulin, CaM, CaMKII, kinase, METAL BINDING PROTEIN; METAL BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

7zrp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

7zrp__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

7zrp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）17.16 Å
Rg（电子密度）15.73 Å
总 Rg16.79 Å
原子数2653
残基数167
排除体积24062 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 7zrp__assembly_1__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 7zrp__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id7zrpA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id7zrpC01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
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7. 引用文献 (1)