SAXSdb — 8ari

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

C-terminal-binding protein 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	Retinoic acid-induced protein 2 × 10 （Q9Y5P3） NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 24	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CTBP1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 B； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 C； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 D； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 E； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 F； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 G； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 H； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 I； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 J； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 K； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 L； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 M； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 N； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 O； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 P； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 Q； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 R； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 S； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 T； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 U； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 V； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 W； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440 作者链 X； PDB构建体 18–457； UniProt 1–440

Retinoic acid-induced protein 2

Homo sapiens

UniProt Q9Y5P3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 34	C-terminal-binding protein 1 × 24 （Q13363） NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE × 24	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RAI2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 81–129； UniProt 303–362 作者链 b； PDB构建体 81–129； UniProt 303–362 作者链 c； PDB构建体 81–129； UniProt 303–362 作者链 d； PDB构建体 81–129； UniProt 303–362 作者链 e； PDB构建体 81–129； UniProt 303–362 作者链 f； PDB构建体 81–129； UniProt 303–362 作者链 g； PDB构建体 81–129； UniProt 303–362 作者链 h； PDB构建体 81–129； UniProt 303–362 作者链 i； PDB构建体 81–129； UniProt 303–362 作者链 j； PDB构建体 81–129； UniProt 303–362

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8ari
沉积日期 deposition_date	2022-08-16
最后修订 last_revision	2023-08-23
结构标题 title	Cryo-EM structure of human CtBP1/RAI2(303-362) delta(331-341) filament
关键词 keywords	Complex, Tumor suppressor, oncogenic, filament assembly, ANTITUMOR PROTEIN; ANTITUMOR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8ari__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8ari__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8ari__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	91.04 Å
Rg（电子密度）	93.10 Å
总 Rg	92.89 Å
原子数	63756
残基数	8160
排除体积	1126400 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8ari__assembly_1__model_1`	34-meric （34）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	C-terminal-binding protein 1
分子量 formula_weight	49525.3 kDa
EC 编号 ec_number	1.1.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	24

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X
原子数 atom_count	63756

HHHHHHSAGLEVLFQGPMGSSHLLNKGLPLGVRPPIMNGPLHPRPLVALLDGRDCTVEMPILKDVATVAFCDAQSTQEIHEKVLNEAVGALMYHTITLTREDLEKFKALRIIVRIGSGFDNIDIKSAGDLGIAVCNVPAASVEETADSTLCHILNLYRRATWLHQALREGTRVQSVEQIREVASGAARIRGETLGIIGLGRVGQAVALRAKAFGFNVLFYDPYLSDGVERALGLQRVSTLQDLLFHSDCVTLHCGLNEHNHHLINDFTVKQMRQGAFLVNTARGGLVDEKALAQALKEGRIRGAALDVHESEPFSFSQGPLKDAPNLICTPHAAWYSEQASIEMREEAAREIRRAITGRIPDSLKNCVNKDHLTAATHWASMDPAVVHPELNGAAYRYPPGVVGVAPTGIPAAVEGIVPSAMSLSHGLPPVAHPPHAPSPGQTVKPEADRDHASDQL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Retinoic acid-induced protein 2
分子量 formula_weight	14252.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,b,c,d,e,f,g,h,i,j

HHHHHHPMKQYKLILNGKTLKGETTTEAVDAATAEKVFKQYANDNGVDGEWTYDDATKTFTVTEGSGSGSENLYFQGAMDSRHTVIKMGSENEALDLSMKSVPWLKAGALDLSVAAHRKSEPPPETLYD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE
分子量 formula_weight	663.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	24

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	189823

Cryo-EM structure of human CtBP1/RAI2(303-362) delta(331-341) filament

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

C-terminal-binding protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Retinoic acid-induced protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8ari__assembly_1__model_1

8ari__assembly_1__model_1 | I(q)

8ari__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Cryo-EM structure of human CtBP1/RAI2(303-362) delta(331-341) filament

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

C-terminal-binding protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Retinoic acid-induced protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8ari__assembly_1__model_1

8ari__assembly_1__model_1 | I(q)

8ari__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)