8b87

Crystal structure of Scribble PDZ1 with human papillomavirus strain 16 E6 peptide

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein scribble homolog

Homo sapiens

UniProt Q14160

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Protein E6 × 2 (A0A384KQK8) beta-D-talopyranose × 1 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 AMMONIUM ION × 1 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SCRIB_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 5–120; UniProt 700–815 作者链 B; PDB构建体 5–120; UniProt 700–815

Protein E6

物种未注明

UniProt A0A384KQK8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Protein scribble homolog × 2 (Q14160) beta-D-talopyranose × 1 DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 9 AMMONIUM ION × 1 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A384KQK8_HPV16
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–10; UniProt 149–158 作者链 D; PDB构建体 1–10; UniProt 149–158

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8b87
沉积日期 deposition_date2022-10-04
结构标题 titleCrystal structure of Scribble PDZ1 with human papillomavirus strain 16 E6 peptide
关键词 keywordsScribble, human papillomavirus, E6, PDZ domain, cell polarity, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8b87__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8b87__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8b87__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)20.17 Å
Rg(电子密度)19.43 Å
总 Rg20.30 Å
原子数3256
残基数205
排除体积28585 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8b87__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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7. 引用文献 (1)