SAXSdb — 8b9f

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Complement decay-accelerating factor

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Genome polyprotein × 1 （A0A6M5CIM5） Genome polyprotein × 1 （A0A7T7IN41） Genome polyprotein × 1 （A0A6M5CIM5） SPHINGOSINE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DAF_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 8–259； UniProt 34–285

Genome polyprotein

Echovirus E11

UniProt A0A6M5CIM5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Complement decay-accelerating factor × 1 （P08174） Genome polyprotein × 1 （A0A7T7IN41） SPHINGOSINE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A6M5CIM5_9ENTO
Isoform	—
PDB实体	2, 4
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–262； UniProt 70–331 作者链 A； PDB构建体 1–287； UniProt 570–856

Genome polyprotein

Echovirus E11

UniProt A0A7T7IN41

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Complement decay-accelerating factor × 1 （P08174） Genome polyprotein × 1 （A0A6M5CIM5） Genome polyprotein × 1 （A0A6M5CIM5） SPHINGOSINE × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A7T7IN41_9ENTO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–238； UniProt 332–569

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8b9f
沉积日期 deposition_date	2022-10-05
结构标题 title	Structure of Echovirus 11 complexed with DAF (CD55) calculated from symmetry expansion
关键词 keywords	Echovirus, receptor, CD55, DAF, VIRUS; VIRUS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8b9f__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8b9f__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8b9f__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	35.85 Å
Rg（电子密度）	36.79 Å
总 Rg	36.83 Å
原子数	5533
残基数	708
排除体积	98447 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8b9f__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Complement decay-accelerating factor
分子量 formula_weight	29771.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E
原子数 atom_count	5533

MGCVAETGDCGLPPDVPNAQPALEGRTSFPEDTVITYKCEESFVKIPGEKDSVICLKGSQWSDIEEFCNRSCEVPTRLNSASLKQPYITQNYFPVGTVVEYECRPGYRREPSLSPKLTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNPGEIRNGQIDVPGGILFGATISFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDNGIIQGERDHYGYRQSVTYACNKGFTMIGEHSIYCTVNNDEGEWSGPPPECRGGTKHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Genome polyprotein
分子量 formula_weight	28886.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.29,3.6.1.15,3.4.22.28,2.7.7.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SPSAEECGYSDRVRSITLGNSTITTQECANVVVAYGRWPEYLSDKEATAEDQPTQPDVATCRFYTLESVTWEKDSPGWWWKFPDALKDMGLFGQNMYYHYLGRAGYTIHVQCNASKFHQGCLLVVCVPEAEMGCSDVGGTVNEHAISEGEIAKKFSATATNGAHTVQSIVTNAGMGVGVGNLTIYPHQWVNLRTNNSATIVMPYINSVPMDNMFRHHNFTLMIIPFVSLDYSSDASTYVPITVTVAPMCAEYNGLRLATSLQ

来源 Source

来源生物 organism	Echovirus E11
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12078
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Genome polyprotein
分子量 formula_weight	26029.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.29,3.6.1.15,3.4.22.28,2.7.7.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GLPVMNTPGSNQFLTSDDFQSPSAMPQFDVTPELDIPGEVKNLMEIAEVDSVVPVNNVVGKLDTMDIFRIPVQSGNHQSTQVFGFQVQPGLDSVFKHTLLGEILNYYAHWSGSVKLTFVFCGSAMATGKFLLAYSPPGANAPKTRKDAMLGTHVIWDVGLQSSCVLCIPWISQTHYRLVHQDEYTSAGNVTCWYQTGIVVPAGTPTLCSIMCFVSACNDFSVRLLKDTPFIEQSALLQ

来源 Source

来源生物 organism	Echovirus E11
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12078
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Genome polyprotein
分子量 formula_weight	32284.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.22.29,3.6.1.15,3.4.22.28,2.7.7.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

GDVVEAIEGAVARVADTISSGPTNSQAVPALTAVETGHTSQVVPGDTMQTRHVKNYHSRSESTIENFLSRSACVYMGEYYTTNTDETKRFASWTINARRMVQMRRKLEMFTYVRFDVEVTFVITSKQDQGTQLGQDMPPLTHQIMYIPPGGPIPKSTTDYAWQTSTNPSIFWTEGNAPPRMSIPFVSIGNAYSNFYDGWSHFSQNGVYGYNTLNNMGQLYMRHVNGPSPLPMTSIVRVYFKPKHVKAWVPRPPRLCQYKNASTVNFSSTNITDKRDSITHVPDTVKP

来源 Source

来源生物 organism	Echovirus E11
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	12078
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SPHINGOSINE
分子量 formula_weight	299.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	8b9fE01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	8b9fE02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.93 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	201358

Structure of Echovirus 11 complexed with DAF (CD55) calculated from symmetry expansion

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Complement decay-accelerating factor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8b9f__assembly_1__model_1

8b9f__assembly_1__model_1 | I(q)

8b9f__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of Echovirus 11 complexed with DAF (CD55) calculated from symmetry expansion

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Complement decay-accelerating factor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Genome polyprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8b9f__assembly_1__model_1

8b9f__assembly_1__model_1 | I(q)

8b9f__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)