8bhg

GABA-A receptor a5 heteromer - a5V2 - Bretazenil

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-2 × 1 （P18507） Bretazenil × 5 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 5 NITRATE ION × 3 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GBRA5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–350； UniProt 32–451 作者链 C； PDB构建体 1–350； UniProt 32–451 作者链 D； PDB构建体 1–350； UniProt 32–451 作者链 E； PDB构建体 1–350； UniProt 32–451

Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-2

Homo sapiens

UniProt P18507

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5 × 4 （P31644） Bretazenil × 5 DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 5 NITRATE ION × 3 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 water × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GBRG2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–379； UniProt 40–409

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8bhg
沉积日期 deposition_date	2022-10-31
结构标题 title	GABA-A receptor a5 heteromer - a5V2 - Bretazenil
关键词 keywords	pLGIC GABA Neurotransmission, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8bhg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8bhg__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8bhg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	38.03 Å
Rg（电子密度）	37.72 Å
总 Rg	38.12 Å
原子数	27654
残基数	1675
排除体积	250380 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8bhg__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5
分子量 formula_weight	40148.9 kDa
突变 mutation	;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,N121D,L123R,L124V,S126D,K127Q,G138D,I142F,N145W,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ;
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C,D,E
原子数 atom_count	27678

QMPTSSVKDETNDNITIFTRILDGLLDGYDNRLRPGLGERITQVRTDMYVNSFGPVSDTEMEYTIDIFFAQTWKDERLRFKGPMQRLPLDNRVADQIWTPDTFFHNDKKSFAHGMTTPNKMLRIWNDGRVLYTMRLTISAECPMDLEDFPMDEQNCPLKFGSYAYPNSEVVYVWTNGSTKSVVVAEDGSRLNQYHLMGQTVGTENISTSTGEYTIMTAHFHLKRKIGYFVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVAARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATAMDWFIAVCYAFVFSALLEFAFVNYITKSQPARAAKIDKMSRIVFPILFGTFNLVYWATYLNR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-2
分子量 formula_weight	43751.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

QKSDDDYEDYTSNKTWVLTPKVPEGDVTVILNNLLEGYDNKLRPDIGVKPTLIHTDMYVNSIGPVNAINMEYTIDIFFAQTWYDRRLKFNSTIKVLRLNSNMVGKIWIPDTFFRNSKKADAHWITTPNRMLRIWNDGRVLYTLRLTIDAECQLQLHNFPMDEHSCPLEFSSYGYPREEIVYQWKRSSVEVGDTRSWRLYQFSFVGLRNTTEVVKTTSGDYVVMSVYFDLSRRIGYFVIQTYLPCIMTVILSQVSFWLNRESVAARTVFGVTTVLTMTTLSISARNSLPKVAYATAMDWFIAVCYAFVFSALIEFATVNYFTKSQPARAAKIDRLSRIAFPLLFGIFNLVYWATYLNREPQLKAPTPHQGTTETSQVAPA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	Bretazenil
分子量 formula_weight	418.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE
分子量 formula_weight	482.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	NITRATE ION
分子量 formula_weight	62.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	14

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晶胞边长 a length_a	81.140 Å
晶胞边长 b length_b	137.637 Å
晶胞边长 c length_c	113.351 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	106.06 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	monoclinic

分辨率 resolution	2.390 Å
最低分辨率 resolution_low	48.560 Å
R 因子 r_factor	0.2586
R_work r_work	0.2573
R_free r_free	0.2835

GABA-A receptor a5 heteromer - a5V2 - Bretazenil

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8bhg__assembly_1__model_1

8bhg__assembly_1__model_1 | I(q)

8bhg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 引用文献 (1)

GABA-A receptor a5 heteromer - a5V2 - Bretazenil

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8bhg__assembly_1__model_1

8bhg__assembly_1__model_1 | I(q)

8bhg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 引用文献 (1)