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8bhk

GABA-A receptor a5 homomer - a5V3 - Diazepam

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 127.7 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5

Homo sapiens

UniProt P31644

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 32–315 链 A； UniProt 424–450 链 B； UniProt 32–315 链 B； UniProt 424–450 链 C； UniProt 32–315 链 C； UniProt 424–450 链 D； UniProt 32–315 链 D； UniProt 424–450 链 E； UniProt 32–315 链 E； UniProt 424–450 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 DZP 7-CHLORO-1-METHYL-5-PHENYL-1,3-DIHYDRO-2H-1,4-BENZODIAZEPIN-2-ONE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8BHK Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5O8F Structure of a chimaeric beta3-alpha5 GABAA receptor in complex with nanobody Nb25 and pregnanolone 提交 2017-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 261–346（86 aa）
链 A 424–462（39 aa）
链 B 261–346（86 aa）
链 B 424–462（39 aa）
链 C 261–346（86 aa）
链 C 424–462（39 aa）
链 D 261–346（86 aa）
链 D 424–462（39 aa）
链 E 261–346（86 aa）
链 E 424–462（39 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 P9N Pregnanolone × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；14% PEG 6000, 0.1M N-(2-Acetamido)iminodiacetic acid (ADA), 7.6 mM 4-Cyclohexyl-1-Butyl-beta-D-Maltoside (CYMAL-4)
分辨率 3.20 Å R-free 0.242
5OJM Structure of a chimaeric beta3-alpha5 GABAA receptor in complex with nanobody Nb25 提交 2017-07-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 257–346（90 aa）
链 A 424–462（39 aa）
链 B 257–346（90 aa）
链 B 424–462（39 aa）
链 C 257–346（90 aa）
链 C 424–462（39 aa）
链 D 257–346（90 aa）
链 D 424–462（39 aa）
链 E 257–346（90 aa）
链 E 424–462（39 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；277.15 K；14% poly-ethylene glycol (PEG) 5000, 0.08M magnesium acetate, 0.1M sodium citrate, 1mM ethylene glycol-bis(beta-aminoethyl ether)-N,N,N',N'-tetraacetic acid (EGTA)
分辨率 3.30 Å R-free 0.250
6A96 Cryo-EM structure of the human alpha5beta3 GABAA receptor in complex with GABA and Nb25 提交 2018-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–346（346 aa）
链 A 424–462（39 aa）
未记录 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
8BEJ GABA-A receptor a5 homomer - a5V3 - APO 提交 2022-10-21 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 32–345（314 aa）
链 A 424–450（27 aa）
链 B 32–345（314 aa）
链 B 424–450（27 aa）
链 C 32–345（314 aa）
链 C 424–450（27 aa）
链 D 32–345（314 aa）
链 D 424–450（27 aa）
链 E 32–345（314 aa）
链 E 424–450（27 aa）
突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
8BGI GABA-A receptor a5 homomer - a5V1 - Flumazenil 提交 2022-10-27 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 32–346（315 aa）
链 A 424–450（27 aa）
链 B 32–346（315 aa）
链 B 424–450（27 aa）
链 C 32–346（315 aa）
链 C 424–450（27 aa）
链 D 32–346（315 aa）
链 D 424–450（27 aa）
链 E 32–346（315 aa）
链 E 424–450（27 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 29 FYP ethyl 8-fluoro-5-methyl-6-oxo-5,6-dihydro-4H-imidazo[1,5-a][1,4]benzodiazepine-3-carboxylate × 5 P9N Pregnanolone × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；279 K；19 % PEG 1000 0.1 M sodium chloride 0.15 M ammonium sulfate 0.1 M 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES) pH 6.5 25 mM Sucrose monodecanoate detergent (sucrose monocaprate)
分辨率 2.56 Å R-free 0.277
8BHA GABA-A receptor a5 homomer - a5V3 - Basmisanil - HR 提交 2022-10-30 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 32–315（284 aa）
链 A 424–450（27 aa）
链 B 32–315（284 aa）
链 B 424–450（27 aa）
链 C 32–315（284 aa）
链 C 424–450（27 aa）
链 D 32–315（284 aa）
链 D 424–450（27 aa）
链 E 32–315（284 aa）
链 E 424–450（27 aa）
突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 QI0 Basmisanil × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.67 Å
8BHB GABA-A receptor a5 homomer - a5V3 - RO154513 提交 2022-10-30 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 32–315（284 aa）
链 A 424–450（27 aa）
链 B 32–315（284 aa）
链 B 424–450（27 aa）
链 C 32–315（284 aa）
链 C 424–450（27 aa）
链 D 32–315（284 aa）
链 D 424–450（27 aa）
链 E 32–315（284 aa）
链 E 424–450（27 aa）
突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 EIE ethyl 8-[(azanylidene-$l^{4}-azanylidene)amino]-5-methyl-6-oxidanylidene-4~{H}-imidazo[1,5-a][1,4]benzodiazepine-3-carboxylate × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.54 Å
8BHG GABA-A receptor a5 heteromer - a5V2 - Bretazenil 提交 2022-10-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 32–451（420 aa）
链 C 32–451（420 aa）
链 D 32–451（420 aa）
链 E 32–451（420 aa）
突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,N121D,L123R,L124V,S126D,K127Q,G138D,I142F,N145W,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,N121D,L123R,L124V,S126D,K127Q,G138D,I142F,N145W,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,N121D,L123R,L124V,S126D,K127Q,G138D,I142F,N145W,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,N121D,L123R,L124V,S126D,K127Q,G138D,I142F,N145W,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; QMU Bretazenil × 5 DMU DECYL-BETA-D-MALTOPYRANOSIDE × 5 NO3 NITRATE ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；279 K；22% PEG 400 0.37M potassium nitrate 0.1 M 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES) pH 6.5
分辨率 2.39 Å R-free 0.283
8BHI GABA-A receptor a5 homomer - a5V3 - RO5211223 提交 2022-10-31 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 32–315（284 aa）
链 A 424–450（27 aa）
链 B 32–315（284 aa）
链 B 424–450（27 aa）
链 C 32–315（284 aa）
链 C 424–450（27 aa）
链 D 32–315（284 aa）
链 D 424–450（27 aa）
链 E 32–315（284 aa）
链 E 424–450（27 aa）
突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 QKF [1,1-bis(oxidanylidene)-1,4-thiazinan-4-yl]-[6-[[5-methyl-3-(6-methylpyridin-3-yl)-1,2-oxazol-4-yl]methoxy]pyridin-3-yl]methanone × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.67 Å
8BHM GABA-A receptor a5 homomer - a5V3 - DMCM 提交 2022-10-31 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 32–315（284 aa）
链 A 424–450（27 aa）
链 B 32–315（284 aa）
链 B 424–450（27 aa）
链 C 32–315（284 aa）
链 C 424–450（27 aa）
链 D 32–315（284 aa）
链 D 424–450（27 aa）
链 E 32–315（284 aa）
链 E 424–450（27 aa）
突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 R63 methyl 4-ethyl-6,7-dimethoxy-9H-pyrido[3,4-b]indole-3-carboxylate × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.95 Å
8BHO GABA-A receptor a5 homomer - a5V3 - L655708 提交 2022-10-31 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 32–315（284 aa）
链 A 424–450（27 aa）
链 B 32–315（284 aa）
链 B 424–450（27 aa）
链 C 32–315（284 aa）
链 C 424–450（27 aa）
链 D 32–315（284 aa）
链 D 424–450（27 aa）
链 E 32–315（284 aa）
链 E 424–450（27 aa）
突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 QMJ ethyl (7~{S})-15-methoxy-12-oxidanylidene-2,4,11-triazatetracyclo[11.4.0.0^{2,6}.0^{7,11}]heptadeca-1(17),3,5,13,15-pentaene-5-carboxylate × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
8BHQ GABA-A receptor a5 homomer - a5V3 - RO7172670 提交 2022-10-31 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 32–315（284 aa）
链 A 424–450（27 aa）
链 B 32–315（284 aa）
链 B 424–450（27 aa）
链 C 32–315（284 aa）
链 C 424–450（27 aa）
链 D 32–315（284 aa）
链 D 424–450（27 aa）
链 E 32–315（284 aa）
链 E 424–450（27 aa）
突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 QR3 2-[[5-methyl-3-(6-methylpyridazin-3-yl)-1,2-oxazol-4-yl]methyl]-5-(5-oxa-2-azaspiro[3.5]nonan-2-yl)pyridazin-3-one × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8BHR GABA-A receptor a5 homomer - a5V3 - RO7015738 提交 2022-10-31 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 32–315（284 aa）
链 A 424–450（27 aa）
链 B 32–315（284 aa）
链 B 424–450（27 aa）
链 C 32–315（284 aa）
链 C 424–450（27 aa）
链 D 32–315（284 aa）
链 D 424–450（27 aa）
链 E 32–315（284 aa）
链 E 424–450（27 aa）
突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 QM7 6-[[5-methyl-3-(6-methylpyridin-3-yl)-1,2-oxazol-4-yl]methoxy]-~{N}-[(2~{S})-1-oxidanylpentan-2-yl]pyridine-3-carboxamide × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.38 Å
8BHS GABA-A receptor a5 homomer - a5V3 - RO4938581 提交 2022-10-31 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 32–346（315 aa）
链 A 424–450（27 aa）
链 B 32–346（315 aa）
链 B 424–450（27 aa）
链 C 32–346（315 aa）
链 C 424–450（27 aa）
链 D 32–346（315 aa）
链 D 424–450（27 aa）
链 E 32–346（315 aa）
链 E 424–450（27 aa）
突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; 突变：;I79M,T82N,V98I,R101A,S103T,I142F,N145W,K151R,L152M,L155I,E156W,D157N,T160R,L161V,M165L,Q176D,A184E,H185Q,A186N,P287A,I336L,T340F,F344I,V335I ; NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 QK9 5-[bis(fluoranyl)methyl]-15-bromanyl-2,4,8,9,11-pentazatetracyclo[11.4.0.0^{2,6}.0^{8,12}]heptadeca-1(13),3,5,9,11,14,16-heptaene × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
9HAA a5b3 GABAA Receptor resting state 提交 2024-11-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 33–346（314 aa）
链 A 421–462（42 aa）
链 D 33–346（314 aa）
链 D 421–462（42 aa）
未记录 BUA butanoic acid × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 2 mM Fluorinated Fos-choline 8, 0.005% LMNG, 0.0005% CHS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å
9HNQ a5b3 GABAA Receptor bound to GABA and Mb25 in desensitized state in detergent micelles 提交 2024-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 33–346（314 aa）
链 A 421–462（42 aa）
链 D 33–346（314 aa）
链 D 421–462（42 aa）
未记录 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES, 100 mM NaCl, 0.005% LMNG, 0.0005% CHS
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.81 Å
9HNR a5b3 GABAA Receptor in 1 a5 to 4 b3 stoichiometry in desensitized state 提交 2024-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 33–346（314 aa）
链 A 421–462（42 aa）
未记录 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
9HNS a5b3 GABAAR bound to GABA and Mb25 in a desensitized state in saposin nanodiscs after long GABA treatment 提交 2024-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 33–346（314 aa）
链 A 421–462（42 aa）
链 D 33–346（314 aa）
链 D 421–462（42 aa）
未记录 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9HNT a5b3 GABAAR bound to Etomidate, GABA, and Mb25 in a desensitized state in saposin nanodiscs 提交 2024-12-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 33–346（314 aa）
链 A 421–462（42 aa）
链 D 33–346（314 aa）
链 D 421–462（42 aa）
未记录 V8D Etomidate × 2 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å
9HUM a5b3 GABAAR bound to GABA and Mb25 in a desensitized state in saposin nanodiscs after short GABA treatment 提交 2024-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 33–345（313 aa）
链 A 421–462（42 aa）
链 D 33–345（313 aa）
链 D 421–462（42 aa）
未记录 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
9RL5 a5b3 GABAAR bound to Topiramate, GABA, and Mb25 in a desensitized state in saposin nanodiscs 提交 2025-06-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 33–346（314 aa）
链 A 421–462（42 aa）
链 D 33–346（314 aa）
链 D 421–462（42 aa）
未记录 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 TOR [(3aS,5aR,8aR,8bS)-2,2,7,7-tetramethyltetrahydro-3aH-bis[1,3]dioxolo[4,5-b:4',5'-d]pyran-3a-yl]methyl sulfamate × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9RPB a5b3 GABAAR bound to GABA, and Mb25 in a desensitized state in saposin nanodiscs, topiramate-free 提交 2025-06-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 33–346（314 aa）
链 A 421–462（42 aa）
链 D 33–346（314 aa）
链 D 421–462（42 aa）
未记录 ABU GAMMA-AMINO-BUTANOIC ACID × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 22 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GBRA5_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–284； UniProt 32–315 作者链 A； PDB构建体 323–349； UniProt 424–450 作者链 B； PDB构建体 1–284； UniProt 32–315 作者链 B； PDB构建体 323–349； UniProt 424–450 作者链 C； PDB构建体 1–284； UniProt 32–315 作者链 C； PDB构建体 323–349； UniProt 424–450 作者链 D； PDB构建体 1–284； UniProt 32–315 作者链 D； PDB构建体 323–349； UniProt 424–450 作者链 E； PDB构建体 1–284； UniProt 32–315 作者链 E； PDB构建体 323–349； UniProt 424–450

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8bhk

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8bhk
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8bhk
沉积日期 deposition_date2022-10-31
结构标题 titleGABA-A receptor a5 homomer - a5V3 - Diazepam
关键词 keywordspLGIC GABA Neurotransmission, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier39.29 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron38.89 Å
零角强度 I(0) i0527176000.00
分子量 molecular_weight195100.0 kDa
排除体积 excluded_volume246990 ų
包络体积 envelope_volume326880 ų
水化壳体积 shell_volume68959 ų
包络直径 envelope_diameter127.0 Å
壳层 Rg shell_rg45.84 Å
包络 Rg envelope_rg38.19 Å
形状 Rg shape_rg38.88 Å
总 Rg total_rg39.35 Å
总原子数 total_atoms27295
残基数 n_residues1680
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax127.7 Å
Rg (实空间) rg_real39.17 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.26 Å
I(0) (实空间) i0_real5.2720e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error9.3580e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal39.25 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal527200000.0000
解质量估计 total_estimate0.8764
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary47.9 Å
偏度 Skewness skewness0.312
峰度 Kurtosis kurtosis-0.308
角度范围 angular_range— – 0.2000 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha84730000.0000
实空间数据点数 n_real_points41
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.841; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.871
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

▶

8. 引用文献 (1)

▶

9. 文件与曲线 (10)