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8cau

human alpha7 nicotinic receptor in complex with the C4 nanobody and nicotine

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 115.8 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7

Homo sapiens

UniProt P36544

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 10 其他聚合物 5 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 24–502 链 B； UniProt 24–502 链 C； UniProt 24–502 链 D； UniProt 24–502 链 E； UniProt 24–502 未记录 Nanobody C4 × 5 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8CAU Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2MAW NMR structures of the alpha7 nAChR transmembrane domain. 提交 2013-07-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 228–326（99 aa） 片段：UNP residues 141-235, transmembrane domain
链 A 467–496（30 aa） 片段：UNP residues 141-235, transmembrane domain
突变：A195S, V200S, L202S 突变：A195S, V200S, L202S 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）0.01；压力 ambient
NMR样品组成 0.25 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
7EKI human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in apo-form 提交 2021-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CLR CHOLESTEROL × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
7EKP human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor bound to EVP-6124 提交 2021-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 I33 7-chloro-N-(quinuclidin-3-yl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CLR CHOLESTEROL × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
7EKT human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor bound to EVP-6124 and PNU-120596 提交 2021-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CLR CHOLESTEROL × 5 I33 7-chloro-N-(quinuclidin-3-yl)benzo[b]thiophene-2-carboxamide × 5 I34 N-(5-Chloro-2,4-dimethoxyphenyl)-N'-(5-methyl-3-isoxazolyl)-urea × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
7KOO Alpha-7 nicotinic acetylcholine receptor bound to alpha-bungarotoxin in a resting state 提交 2020-11-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 24–371（348 aa）
链 A 407–502（96 aa）
链 B 24–371（348 aa）
链 B 407–502（96 aa）
链 C 24–371（348 aa）
链 C 407–502（96 aa）
链 D 24–371（348 aa）
链 D 407–502（96 aa）
链 E 24–371（348 aa）
链 E 407–502（96 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CA CALCIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7KOQ Alpha-7 nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine in a desensitized state 提交 2020-11-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 24–371（348 aa）
链 A 407–502（96 aa）
链 B 24–371（348 aa）
链 B 407–502（96 aa）
链 C 24–371（348 aa）
链 C 407–502（96 aa）
链 D 24–371（348 aa）
链 D 407–502（96 aa）
链 E 24–371（348 aa）
链 E 407–502（96 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 EPJ EPIBATIDINE × 5 CA CALCIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7KOX Alpha-7 nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine and PNU-120596 in the activated state 提交 2020-11-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 24–371（348 aa）
链 A 407–502（96 aa）
链 B 24–371（348 aa）
链 B 407–502（96 aa）
链 C 24–371（348 aa）
链 C 407–502（96 aa）
链 D 24–371（348 aa）
链 D 407–502（96 aa）
链 E 24–371（348 aa）
链 E 407–502（96 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 EPJ EPIBATIDINE × 5 CA CALCIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7RPM Structures of the Intracellular Domain and Transmembrane Domain of the Human alpha7 Nicotinic Acetylcholine Receptors 提交 2021-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 231–496（266 aa） 片段：Transmembrane domain and intracellular domain residues 231-496
链 B 231–496（266 aa） 片段：Transmembrane domain and intracellular domain residues 231-496
链 C 231–496（266 aa） 片段：Transmembrane domain and intracellular domain residues 231-496
链 D 231–496（266 aa） 片段：Transmembrane domain and intracellular domain residues 231-496
链 E 231–496（266 aa） 片段：Transmembrane domain and intracellular domain residues 231-496
突变：A263S, V268S, L270S, A474E 突变：A263S, V268S, L270S, A474E 突变：A263S, V268S, L270S, A474E 突变：A263S, V268S, L270S, A474E 突变：A263S, V268S, L270S, A474E 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；308 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；308 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；308 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；308 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；308 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；308 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR样品组成 0.24 mM [U-13C; U-15N] alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 66 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] S358C-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] C375-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 66 mM LDAO, 20 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.22 mM [U-15N] C390-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 53 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] L415C-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] C427-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] C435-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.28 mM V311C-MTSL alpha7 TMD-ICD, 0.07 mM [U-15N] V311C alpha7 TMD-ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.24 mM C427-MTSL alpha7 TMD-ICD, 0.06 mM [U-15N] C427 alpha7 TMD-ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.28 mM V311C alpha7 TMD-ICD, 0.07 mM [U-15N] V311C-MTSL alpha7 TMD-ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.24 mM C427 alpha7 TMD-ICD, 0.06 mM [U-15N] C427-MTSL alpha7 TMD-ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-13C; U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] C427-EDTA-Lu3+ alpha7 TMD-ICD, 5 mM sodium acetate, 53 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-15N] C427-EDTA-Tm3+ alpha7 TMD-ICD, 5 mM sodium acetate, 66 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] C317-EDTA-Lu3+ alpha7 TMD-ICD, 5 mM sodium acetate, 66 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] C317-EDTA-Tm3+ alpha7 TMD-ICD, 5 mM sodium acetate, 53 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.24 mM [U-15N] C219-EDTA-Lu3+ alpha7 TMD-ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.22 mM [U-15N] C219-EDTA-Tm3+ alpha7 TMD-ICD, 5 mM sodium acetate, 53 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.35 mM [U-13C; U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-13C; U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.35 mM [U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 66 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.22 mM [U-15N] V311C-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.22 mM [U-15N] C317-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.3 mM [U-15N] C335-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 53 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.3 mM [U-15N] C342-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 66 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.3 mM [U-15N] S350C-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 53 mM LDAO, 25 mM NaCl, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
8C9X human alpha7 nicotinic receptor in complex with the C4 nanobody 提交 2023-01-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 24–347（324 aa）
链 A 455–502（48 aa）
链 B 24–347（324 aa）
链 B 455–502（48 aa）
链 C 24–347（324 aa）
链 C 455–502（48 aa）
链 D 24–347（324 aa）
链 D 455–502（48 aa）
链 E 24–347（324 aa）
链 E 455–502（48 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
8CE4 Human alpha7 nicotinic receptor in complex with the E3 nanobody 提交 2023-02-01 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 24–347（324 aa）
链 A 455–502（48 aa）
链 B 24–347（324 aa）
链 B 455–502（48 aa）
链 C 24–347（324 aa）
链 C 455–502（48 aa）
链 D 24–347（324 aa）
链 D 455–502（48 aa）
链 E 24–347（324 aa）
链 E 455–502（48 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8CI1 Human alpha7 nicotinic receptor in complex with the E3 nanobody and nicotine 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 24–347（324 aa）
链 A 455–502（48 aa）
链 B 24–347（324 aa）
链 B 455–502（48 aa）
链 C 24–347（324 aa）
链 C 455–502（48 aa）
链 D 24–347（324 aa）
链 D 455–502（48 aa）
链 E 24–347（324 aa）
链 E 455–502（48 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8CI2 human alpha7 nicotinic receptor in complex with the C4 nanobody under sub-saturating conditions 提交 2023-02-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 24–347（324 aa）
链 A 455–502（48 aa）
链 B 24–347（324 aa）
链 B 455–502（48 aa）
链 C 24–347（324 aa）
链 C 455–502（48 aa）
链 D 24–347（324 aa）
链 D 455–502（48 aa）
链 E 24–347（324 aa）
链 E 455–502（48 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8F4V Alpha7 nicotinic acetylcholine receptor intracellular and transmembrane domains bound to ivermectin in a desensitized state 提交 2022-11-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 231–496（266 aa） 片段：Transmembrane domain and intracellular domain residues 231-496
链 B 231–496（266 aa） 片段：Transmembrane domain and intracellular domain residues 231-496
链 C 231–496（266 aa） 片段：Transmembrane domain and intracellular domain residues 231-496
链 D 231–496（266 aa） 片段：Transmembrane domain and intracellular domain residues 231-496
链 E 231–496（266 aa） 片段：Transmembrane domain and intracellular domain residues 231-496
突变：A263S, V268S, L270S, A474E 突变：A263S, V268S, L270S, A474E 突变：A263S, V268S, L270S, A474E 突变：A263S, V268S, L270S, A474E 突变：A263S, V268S, L270S, A474E IVM (2aE,4E,5'S,6S,6'R,7S,8E,11R,13R,15S,17aR,20R,20aR,20bS)-6'-[(2S)-butan-2-yl]-20,20b-dihydroxy-5',6,8,19-tetramethyl-17 -oxo-3',4',5',6,6',10,11,14,15,17,17a,20,20a,20b-tetradecahydro-2H,7H-spiro[11,15-methanofuro[4,3,2-pq][2,6]benzodioxacy clooctadecine-13,2'-pyran]-7-yl 2,6-dideoxy-4-O-(2,6-dideoxy-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranosyl)-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranoside × 5 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 4.7；318 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.22 mM [U-15N] V311C-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 220 uM ivermectin, 0.4 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.22 mM [U-15N] V311C-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.22 mM [U-15N] C335-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 26 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 220 uM ivermectin, 0.4 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.22 mM [U-15N] C335-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 26 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-15N] C342-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 26 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 200 uM ivermectin, 0.4 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.2 % [U-15N] C342-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 26 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-15N] S350C-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 200 uM ivermectin, 0.4 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-15N] S350C-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-15N] C375-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 200 uM ivermectin, 0.4 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-15N] C375-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 30 uM ivermectin, 0.1 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] C390-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 250 uM ivermectin, 0.4 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] C390-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.24 mM [U-15N] L415C-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 240 uM ivermectin, 0.4 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.24 mM [U-15N] L415C-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-15N] C435-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 22 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 200 uM ivermectin, 0.4 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.2 mM [U-15N] C435-MTSL alpha7nAChR TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 22 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.22 mM [U-13C; U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 30 uM ivermectin, 30 uM PNU, 0.2 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.22 mM [U-13C; U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 44 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 100 uM ivermectin, 0.3 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 250 uM ivermectin, 0.55 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 500 uM ivermectin, 0.95 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 500 uM ivermectin, 0.8 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 500 uM ivermectin, 0.8 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.25 mM [U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 500 uM ivermectin, 0.8 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.20 mM [U-15N] alpha7nAChR C317 TMD+ICD, 5 mM sodium acetate, 35 mM LDAO, 25 mM sodium chloride, 5 % D2O, 20 uM DSS, 500 uM ivermectin, 0.8 % DMSO, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
8P1H Crystal structure of the chimera of human 14-3-3 zeta and phosphorylated cytoplasmic loop fragment of the alpha7 acetylcholine receptor 提交 2023-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 361–372（12 aa）
链 B 361–372（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 AZI AZIDE ION × 3 BEZ BENZOIC ACID × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；288 K；0.2 M Magnesium acetate tetrahydrate; 0.1 M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5; 20% w/v Polyethylene glycol 8,000
分辨率 1.95 Å R-free 0.253
8UT1 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine 提交 2023-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 24–412（389 aa）
链 A 413–502（90 aa）
链 B 24–412（389 aa）
链 B 413–502（90 aa）
链 C 24–412（389 aa）
链 C 413–502（90 aa）
链 D 24–412（389 aa）
链 D 413–502（90 aa）
链 E 24–412（389 aa）
链 E 413–502（90 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 15 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
8UTB Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine and NS-1738 提交 2023-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 24–412（389 aa）
链 A 413–502（90 aa）
链 B 24–412（389 aa）
链 B 413–502（90 aa）
链 C 24–412（389 aa）
链 C 413–502（90 aa）
链 D 24–412（389 aa）
链 D 413–502（90 aa）
链 E 24–412（389 aa）
链 E 413–502（90 aa）
未记录 XG3 N-(5-chloro-2-hydroxyphenyl)-N'-[2-chloro-5-(trifluoromethyl)phenyl]urea × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
8UZJ Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine and ivermectin 提交 2023-11-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 24–412（389 aa）
链 A 413–502（90 aa）
链 B 24–412（389 aa）
链 B 413–502（90 aa）
链 C 24–412（389 aa）
链 C 413–502（90 aa）
链 D 24–412（389 aa）
链 D 413–502（90 aa）
链 E 24–412（389 aa）
链 E 413–502（90 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 IVM (2aE,4E,5'S,6S,6'R,7S,8E,11R,13R,15S,17aR,20R,20aR,20bS)-6'-[(2S)-butan-2-yl]-20,20b-dihydroxy-5',6,8,19-tetramethyl-17 -oxo-3',4',5',6,6',10,11,14,15,17,17a,20,20a,20b-tetradecahydro-2H,7H-spiro[11,15-methanofuro[4,3,2-pq][2,6]benzodioxacy clooctadecine-13,2'-pyran]-7-yl 2,6-dideoxy-4-O-(2,6-dideoxy-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranosyl)-3-O-methyl-alpha-L-arabino-hexopyranoside × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
8V80 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine and (-)-TQS 提交 2023-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 24–412（389 aa）
链 A 413–502（90 aa）
链 B 24–412（389 aa）
链 B 413–502（90 aa）
链 C 24–412（389 aa）
链 C 413–502（90 aa）
链 D 24–412（389 aa）
链 D 413–502（90 aa）
链 E 24–412（389 aa）
链 E 413–502（90 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 10 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 YLR (3aR,4S,9bS)-4-(naphthalen-1-yl)-3a,4,5,9b-tetrahydro-3H-cyclopenta[c]quinoline-8-sulfonamide × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.34 Å
8V82 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine and PNU-120596 提交 2023-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 24–412（389 aa）
链 A 413–502（90 aa）
链 B 24–412（389 aa）
链 B 413–502（90 aa）
链 C 24–412（389 aa）
链 C 413–502（90 aa）
链 D 24–412（389 aa）
链 D 413–502（90 aa）
链 E 24–412（389 aa）
链 E 413–502（90 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 15 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 I34 N-(5-Chloro-2,4-dimethoxyphenyl)-N'-(5-methyl-3-isoxazolyl)-urea × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.61 Å
8V86 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to GAT107 提交 2023-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 24–412（389 aa）
链 A 413–502（90 aa）
链 B 24–412（389 aa）
链 B 413–502（90 aa）
链 C 24–412（389 aa）
链 C 413–502（90 aa）
链 D 24–412（389 aa）
链 D 413–502（90 aa）
链 E 24–412（389 aa）
链 E 413–502（90 aa）
未记录 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 10 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 YLI (3aR,4S,9bS)-4-(4-bromophenyl)-3a,4,5,9b-tetrahydro-3H-cyclopenta[c]quinoline-8-sulfonamide × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.47 Å
8V88 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to epibatidine and GAT107 提交 2023-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 24–412（389 aa）
链 A 413–502（90 aa）
链 B 24–412（389 aa）
链 B 413–502（90 aa）
链 C 24–412（389 aa）
链 C 413–502（90 aa）
链 D 24–412（389 aa）
链 D 413–502（90 aa）
链 E 24–412（389 aa）
链 E 413–502（90 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 10 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 YLI (3aR,4S,9bS)-4-(4-bromophenyl)-3a,4,5,9b-tetrahydro-3H-cyclopenta[c]quinoline-8-sulfonamide × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
8V89 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor time resolved resting state 提交 2023-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 24–412（389 aa）
链 A 413–502（90 aa）
链 B 24–412（389 aa）
链 B 413–502（90 aa）
链 C 24–412（389 aa）
链 C 413–502（90 aa）
链 D 24–412（389 aa）
链 D 413–502（90 aa）
链 E 24–412（389 aa）
链 E 413–502（90 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 R16 HEXADECANE × 5 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.53 Å
8V8A Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor time resolved bound to epibatidine and PNU-120596 desensitized intermediate state 提交 2023-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 24–412（389 aa）
链 A 413–502（90 aa）
链 B 24–412（389 aa）
链 B 413–502（90 aa）
链 C 24–412（389 aa）
链 C 413–502（90 aa）
链 D 24–412（389 aa）
链 D 413–502（90 aa）
链 E 24–412（389 aa）
链 E 413–502（90 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 15 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 5 EPJ EPIBATIDINE × 5 I34 N-(5-Chloro-2,4-dimethoxyphenyl)-N'-(5-methyl-3-isoxazolyl)-urea × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.19 Å
8V8C Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor time resolved bound to epibatidine and PNU-120596 asymmetric state 1 提交 2023-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 24–412（389 aa）
链 A 413–502（90 aa）
链 B 24–412（389 aa）
链 B 413–502（90 aa）
链 C 24–412（389 aa）
链 C 413–502（90 aa）
链 D 24–412（389 aa）
链 D 413–502（90 aa）
链 E 24–412（389 aa）
链 E 413–502（90 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 EPJ EPIBATIDINE × 5 I34 N-(5-Chloro-2,4-dimethoxyphenyl)-N'-(5-methyl-3-isoxazolyl)-urea × 5 CA CALCIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.29 Å
8V8D Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor time resolved bound to epibatidine and PNU-120596 asymmetric state 2 提交 2023-12-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 24–412（389 aa）
链 A 413–502（90 aa）
链 B 24–412（389 aa）
链 B 413–502（90 aa）
链 C 24–412（389 aa）
链 C 413–502（90 aa）
链 D 24–412（389 aa）
链 D 413–502（90 aa）
链 E 24–412（389 aa）
链 E 413–502（90 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 EPJ EPIBATIDINE × 5 I34 N-(5-Chloro-2,4-dimethoxyphenyl)-N'-(5-methyl-3-isoxazolyl)-urea × 5 CA CALCIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.31 Å
9IIR human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in complex with GAT107 and calcium (desensitized state) 提交 2024-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 YLI (3aR,4S,9bS)-4-(4-bromophenyl)-3a,4,5,9b-tetrahydro-3H-cyclopenta[c]quinoline-8-sulfonamide × 5 CA CALCIUM ION × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 CLR CHOLESTEROL × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.93 Å
9IIV human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in complex with GAT107 and calcium (open state) 提交 2024-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 CA CALCIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
9J37 Cryo-EM structure of human Alpha-7 nicotinic acetylcholine receptor 提交 2024-08-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 23–502（480 aa）
链 B 23–502（480 aa）
链 C 23–502（480 aa）
链 D 23–502（480 aa）
链 E 23–502（480 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CLR CHOLESTEROL × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9LH5 human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in complex with L-nicotine (open state) 提交 2025-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.61 Å
9LH6 human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in complex with L-nicotine (five-nicotine-bound desensitized state) 提交 2025-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
9LH8 human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in complex with L-nicotine (four-nicotine-bound desensitized state) 提交 2025-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.74 Å
9LH9 human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in complex with L-nicotine (ortho-three-nicotine-bound desensitized state) 提交 2025-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.98 Å
9LHA human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in complex with L-nicotine (meta-three-nicotine-bound desensitized state) 提交 2025-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
9LHB human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in complex with L-nicotine (ortho-two-nicotine-bound desensitized state) 提交 2025-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
9LHC human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in complex with L-nicotine (meta-two-nicotine-bound desensitized state) 提交 2025-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
9LHD human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in complex with L-nicotine (one-nicotine-bound desensitized state) 提交 2025-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
9LHE human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor in complex with L-nicotine (nicotine-free desensitized state) 提交 2025-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.25 Å
9LN7 Alpha-7 nicotinic acetylcholine receptor bound to inhibitory bicyclic peptide KP2007 in a resting state. 提交 2025-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
链 G 1–502（502 aa）
链 I 1–502（502 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
9NX0 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to conotoxin ImI 提交 2025-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 24–501（478 aa）
链 B 24–501（478 aa）
链 C 24–501（478 aa）
链 D 24–501（478 aa）
链 E 24–501（478 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
9NX1 Alpha7-nicotinic acetylcholine receptor bound to conotoxin ImII 提交 2025-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 24–501（478 aa）
链 C 24–501（478 aa）
链 D 24–501（478 aa）
链 E 24–501（478 aa）
链 F 24–501（478 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 10 EPJ EPIBATIDINE × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9QTN Human alpha7 nicotinic receptor in complex with the F1 nanobody 提交 2025-04-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 24–502（479 aa）
链 B 24–502（479 aa）
链 C 24–502（479 aa）
链 D 24–502（479 aa）
链 E 24–502（479 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.28 Å
9QTO Human alpha7 nicotinic receptor in complex with the E6 nanobody 提交 2025-04-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 24–349（326 aa）
链 B 24–349（326 aa）
链 C 24–349（326 aa）
链 D 24–349（326 aa）
链 E 24–349（326 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.16 Å
9VIQ human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor L277A mutant in complex with L-nicotine (desensitized state) 提交 2025-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
突变：L277A 突变：L277A 突变：L277A 突变：L277A 突变：L277A NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.24 Å
9VIX human alpha 7 nicotinic acetylcholine receptor L278A mutant in complex with L-nicotine (desensitized state) 提交 2025-06-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–502（502 aa）
链 B 1–502（502 aa）
链 C 1–502（502 aa）
链 D 1–502（502 aa）
链 E 1–502（502 aa）
突变：L278A 突变：L278A 突变：L278A 突变：L278A 突变：L278A NCT (S)-3-(1-METHYLPYRROLIDIN-2-YL)PYRIDINE × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å

共 44 个其他 PDB 条目、44 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACHA7_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–479； UniProt 24–502 作者链 B； PDB构建体 1–479； UniProt 24–502 作者链 C； PDB构建体 1–479； UniProt 24–502 作者链 D； PDB构建体 1–479； UniProt 24–502 作者链 E； PDB构建体 1–479； UniProt 24–502

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8cau

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8cau
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8cau
沉积日期 deposition_date2023-01-24
结构标题 titlehuman alpha7 nicotinic receptor in complex with the C4 nanobody and nicotine
关键词 keywordsion channel nanobody Nicotinic acetylcholine receptor, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier37.92 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron37.02 Å
零角强度 I(0) i0544315000.00
分子量 molecular_weight191150.0 kDa
排除体积 excluded_volume239480 ų
包络体积 envelope_volume333900 ų
水化壳体积 shell_volume72321 ų
包络直径 envelope_diameter124.2 Å
壳层 Rg shell_rg45.51 Å
包络 Rg envelope_rg36.01 Å
形状 Rg shape_rg36.97 Å
总 Rg total_rg37.74 Å
总原子数 total_atoms13580
残基数 n_residues1635
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax115.8 Å
Rg (实空间) rg_real37.61 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.70 Å
I(0) (实空间) i0_real5.4430e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.7790e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal37.81 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal544400000.0000
解质量估计 total_estimate0.8803
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary52.4 Å
偏度 Skewness skewness0.097
峰度 Kurtosis kurtosis-0.367
角度范围 angular_range— – 0.2100 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha194400000.0000
实空间数据点数 n_real_points43
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.863; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.958; Smooth: 0.893
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)