8caz

empty 30S head

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Large ribosomal subunit protein bL31A

物种未注明

UniProt P0A7M9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 9 RNA 1 16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S2 × 1 (P0A7V0) Small ribosomal subunit protein uS3 × 1 (P0A7V3) 30S ribosomal protein S7 × 1 (P02359) Small ribosomal subunit protein uS9 × 1 (P0A7X3) Small ribosomal subunit protein uS10 × 1 (P0A7R5) Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 (P0A7S9) Small ribosomal subunit protein uS14 × 1 (P0AG59) Small ribosomal subunit protein uS19 × 1 (P0A7U3) POTASSIUM ION × 13 MAGNESIUM ION × 29 water × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RL31_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 4; PDB构建体 1–70; UniProt 1–70

30S ribosomal protein S2

物种未注明

UniProt P0A7V0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 9 RNA 1 Large ribosomal subunit protein bL31A × 1 (P0A7M9) 16S rRNA × 1 Small ribosomal subunit protein uS3 × 1 (P0A7V3) 30S ribosomal protein S7 × 1 (P02359) Small ribosomal subunit protein uS9 × 1 (P0A7X3) Small ribosomal subunit protein uS10 × 1 (P0A7R5) Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 (P0A7S9) Small ribosomal subunit protein uS14 × 1 (P0AG59) Small ribosomal subunit protein uS19 × 1 (P0A7U3) POTASSIUM ION × 13 MAGNESIUM ION × 29 water × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS2_ECOLI
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–241; UniProt 1–241

Small ribosomal subunit protein uS3

物种未注明

UniProt P0A7V3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 9 RNA 1 Large ribosomal subunit protein bL31A × 1 (P0A7M9) 16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S2 × 1 (P0A7V0) 30S ribosomal protein S7 × 1 (P02359) Small ribosomal subunit protein uS9 × 1 (P0A7X3) Small ribosomal subunit protein uS10 × 1 (P0A7R5) Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 (P0A7S9) Small ribosomal subunit protein uS14 × 1 (P0AG59) Small ribosomal subunit protein uS19 × 1 (P0A7U3) POTASSIUM ION × 13 MAGNESIUM ION × 29 water × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS3_ECOLI
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–233; UniProt 1–233

30S ribosomal protein S7

物种未注明

UniProt P02359

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 9 RNA 1 Large ribosomal subunit protein bL31A × 1 (P0A7M9) 16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S2 × 1 (P0A7V0) Small ribosomal subunit protein uS3 × 1 (P0A7V3) Small ribosomal subunit protein uS9 × 1 (P0A7X3) Small ribosomal subunit protein uS10 × 1 (P0A7R5) Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 (P0A7S9) Small ribosomal subunit protein uS14 × 1 (P0AG59) Small ribosomal subunit protein uS19 × 1 (P0A7U3) POTASSIUM ION × 13 MAGNESIUM ION × 29 water × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS7_ECOLI
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–179; UniProt 1–179

Small ribosomal subunit protein uS9

物种未注明

UniProt P0A7X3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 9 RNA 1 Large ribosomal subunit protein bL31A × 1 (P0A7M9) 16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S2 × 1 (P0A7V0) Small ribosomal subunit protein uS3 × 1 (P0A7V3) 30S ribosomal protein S7 × 1 (P02359) Small ribosomal subunit protein uS10 × 1 (P0A7R5) Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 (P0A7S9) Small ribosomal subunit protein uS14 × 1 (P0AG59) Small ribosomal subunit protein uS19 × 1 (P0A7U3) POTASSIUM ION × 13 MAGNESIUM ION × 29 water × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RS9_ECOLI
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–130; UniProt 1–130

Small ribosomal subunit protein uS10

物种未注明

UniProt P0A7R5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 9 RNA 1 Large ribosomal subunit protein bL31A × 1 (P0A7M9) 16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S2 × 1 (P0A7V0) Small ribosomal subunit protein uS3 × 1 (P0A7V3) 30S ribosomal protein S7 × 1 (P02359) Small ribosomal subunit protein uS9 × 1 (P0A7X3) Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 (P0A7S9) Small ribosomal subunit protein uS14 × 1 (P0AG59) Small ribosomal subunit protein uS19 × 1 (P0A7U3) POTASSIUM ION × 13 MAGNESIUM ION × 29 water × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RS10_ECOLI
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103

Small ribosomal subunit protein uS13

物种未注明

UniProt P0A7S9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 9 RNA 1 Large ribosomal subunit protein bL31A × 1 (P0A7M9) 16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S2 × 1 (P0A7V0) Small ribosomal subunit protein uS3 × 1 (P0A7V3) 30S ribosomal protein S7 × 1 (P02359) Small ribosomal subunit protein uS9 × 1 (P0A7X3) Small ribosomal subunit protein uS10 × 1 (P0A7R5) Small ribosomal subunit protein uS14 × 1 (P0AG59) Small ribosomal subunit protein uS19 × 1 (P0A7U3) POTASSIUM ION × 13 MAGNESIUM ION × 29 water × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS13_ECOLI
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–118; UniProt 1–118

Small ribosomal subunit protein uS14

物种未注明

UniProt P0AG59

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 9 RNA 1 Large ribosomal subunit protein bL31A × 1 (P0A7M9) 16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S2 × 1 (P0A7V0) Small ribosomal subunit protein uS3 × 1 (P0A7V3) 30S ribosomal protein S7 × 1 (P02359) Small ribosomal subunit protein uS9 × 1 (P0A7X3) Small ribosomal subunit protein uS10 × 1 (P0A7R5) Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 (P0A7S9) Small ribosomal subunit protein uS19 × 1 (P0A7U3) POTASSIUM ION × 13 MAGNESIUM ION × 29 water × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS14_ECOLI
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–101; UniProt 1–101

Small ribosomal subunit protein uS19

物种未注明

UniProt P0A7U3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 9 RNA 1 Large ribosomal subunit protein bL31A × 1 (P0A7M9) 16S rRNA × 1 30S ribosomal protein S2 × 1 (P0A7V0) Small ribosomal subunit protein uS3 × 1 (P0A7V3) 30S ribosomal protein S7 × 1 (P02359) Small ribosomal subunit protein uS9 × 1 (P0A7X3) Small ribosomal subunit protein uS10 × 1 (P0A7R5) Small ribosomal subunit protein uS13 × 1 (P0A7S9) Small ribosomal subunit protein uS14 × 1 (P0AG59) POTASSIUM ION × 13 MAGNESIUM ION × 29 water × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RS19_ECOLI
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 S; PDB构建体 1–92; UniProt 1–92

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8caz
沉积日期 deposition_date2023-01-24
结构标题 titleempty 30S head
关键词 keywordsAntibiotic, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8caz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8caz__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8caz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)41.45 Å
Rg(电子密度)42.70 Å
总 Rg42.73 Å
原子数18575
残基数1552
排除体积296050 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8caz__assembly_1__model_1 decameric (10) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id8cazB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily610 — Helix hairpin bin
结构域编号 domain_id8cazG01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology455 — Ribosomal Protein S7
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribosomal protein S7/S5
结构域编号 domain_id8cazM01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 —
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7. 引用文献 (1)