8cbj

Cryo-EM structure of Otu2-bound cytoplasmic pre-40S ribosome biogenesis complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. Protein Identity and Related Structures Protein Identity & Related Structures

40S ribosomal protein S27-A

OrganismNot specified

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS27A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	1
Chains and sequence ranges	Author chain b； PDBConstruct 1–82； UniProt 1–82

40S ribosomal protein S28-A

OrganismNot specified

UniProt Q3E7X9

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS28A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	2
Chains and sequence ranges	Author chain c； PDBConstruct 1–67； UniProt 1–67

RPS29A isoform 1

OrganismNot specified

UniProt P41057

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS29A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	3
Chains and sequence ranges	Author chain d； PDBConstruct 1–56； UniProt 1–56

40S ribosomal protein S30-A

OrganismNot specified

UniProt P0CX33

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS30A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	4
Chains and sequence ranges	Author chain e； PDBConstruct 1–63； UniProt 1–63

Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein

OrganismNot specified

UniProt P38011

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	GBLP_YEAST
Isoform	—
PDB entities	5
Chains and sequence ranges	Author chain g； PDBConstruct 1–319； UniProt 1–319

Pre-rRNA-processing protein PNO1

OrganismNot specified

UniProt A0A8H4F7A6

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	A0A8H4F7A6_YEASX
Isoform	—
PDB entities	6
Chains and sequence ranges	Author chain h； PDBConstruct 1–274； UniProt 1–274

ENP1 isoform 1

OrganismNot specified

UniProt A0A8H4BTD0

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	A0A8H4BTD0_YEASX
Isoform	—
PDB entities	7
Chains and sequence ranges	Author chain i； PDBConstruct 1–483； UniProt 1–483

LTV1 isoform 1

OrganismNot specified

UniProt A0A8H4F8Z0

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	A0A8H4F8Z0_YEASX
Isoform	—
PDB entities	8
Chains and sequence ranges	Author chain j； PDBConstruct 1–463； UniProt 1–463

TSR1 isoform 1

OrganismNot specified

UniProt A0A8H8UMM1

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	A0A8H8UMM1_YEASX
Isoform	—
PDB entities	9
Chains and sequence ranges	Author chain k； PDBConstruct 1–788； UniProt 1–788

non-specific serine/threonine protein kinase

OrganismNot specified

UniProt A0A6A5Q8T7

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	A0A6A5Q8T7_YEASX
Isoform	—
PDB entities	10
Chains and sequence ranges	Author chain l； PDBConstruct 1–425； UniProt 1–425

40S ribosomal protein S0-A

OrganismNot specified

UniProt B3LI22

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RSSA1_YEAS1
Isoform	—
PDB entities	11
Chains and sequence ranges	Author chain A； PDBConstruct 1–252； UniProt 1–252

40S ribosomal protein S1-A

OrganismNot specified

UniProt P33442

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS3A1_YEAST
Isoform	—
PDB entities	12
Chains and sequence ranges	Author chain B； PDBConstruct 1–255； UniProt 1–255

40S ribosomal protein S2

OrganismNot specified

UniProt P25443

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS2_YEAST
Isoform	—
PDB entities	13
Chains and sequence ranges	Author chain C； PDBConstruct 1–254； UniProt 1–254

40S ribosomal protein S3

OrganismNot specified

UniProt P05750

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS3_YEAST
Isoform	—
PDB entities	14
Chains and sequence ranges	Author chain D； PDBConstruct 1–240； UniProt 1–240

40S ribosomal protein S4-B

OrganismNot specified

UniProt P0CX36

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS4B_YEAST
Isoform	—
PDB entities	15
Chains and sequence ranges	Author chain E； PDBConstruct 1–261； UniProt 1–261

40S ribosomal protein S5

OrganismNot specified

UniProt P26783

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS5_YEAST
Isoform	—
PDB entities	16
Chains and sequence ranges	Author chain F； PDBConstruct 1–225； UniProt 1–225

40S ribosomal protein S6-B

OrganismNot specified

UniProt P0CX38

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS6B_YEAST
Isoform	—
PDB entities	17
Chains and sequence ranges	Author chain G； PDBConstruct 1–236； UniProt 1–236

40S ribosomal protein S7-A

OrganismNot specified

UniProt P26786

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS7A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	18
Chains and sequence ranges	Author chain H； PDBConstruct 1–190； UniProt 1–190

40S ribosomal protein S8-A

OrganismNot specified

UniProt P0CX39

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS8A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	19
Chains and sequence ranges	Author chain I； PDBConstruct 1–200； UniProt 1–200

40S ribosomal protein S9-A

OrganismNot specified

UniProt O13516

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS9A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	20
Chains and sequence ranges	Author chain J； PDBConstruct 1–197； UniProt 1–197

40S ribosomal protein S11-A

OrganismNot specified

UniProt P0CX47

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS11A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	21
Chains and sequence ranges	Author chain L； PDBConstruct 1–156； UniProt 1–156

40S ribosomal protein S12

OrganismNot specified

UniProt P48589

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS12_YEAST
Isoform	—
PDB entities	22
Chains and sequence ranges	Author chain M； PDBConstruct 1–143； UniProt 1–143

40S ribosomal protein S13

OrganismNot specified

UniProt P05756

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS13_YEAST
Isoform	—
PDB entities	23
Chains and sequence ranges	Author chain N； PDBConstruct 1–151； UniProt 1–151

40S ribosomal protein S14-A

OrganismNot specified

UniProt P06367

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS14A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	24
Chains and sequence ranges	Author chain O； PDBConstruct 1–137； UniProt 1–137

RPS15 isoform 1

OrganismNot specified

UniProt Q01855

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS15_YEAST
Isoform	—
PDB entities	25
Chains and sequence ranges	Author chain P； PDBConstruct 1–142； UniProt 1–142

40S ribosomal protein S16-A

OrganismNot specified

UniProt P0CX51

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS16A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	26
Chains and sequence ranges	Author chain Q； PDBConstruct 1–143； UniProt 1–143

40S ribosomal protein S17-A

OrganismNot specified

UniProt P02407

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS17A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	27
Chains and sequence ranges	Author chain R； PDBConstruct 1–136； UniProt 1–136

40S ribosomal protein S18-A

OrganismNot specified

UniProt P0CX55

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS18A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	28
Chains and sequence ranges	Author chain S； PDBConstruct 1–146； UniProt 1–146

40S ribosomal protein S19-A

OrganismNot specified

UniProt P07280

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS19A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	29
Chains and sequence ranges	Author chain T； PDBConstruct 1–144； UniProt 1–144

40S ribosomal protein S20

OrganismNot specified

UniProt P38701

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS20_YEAST
Isoform	—
PDB entities	30
Chains and sequence ranges	Author chain U； PDBConstruct 1–121； UniProt 1–121

40S ribosomal protein S21-A

OrganismNot specified

UniProt P0C0V8

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS21A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	31
Chains and sequence ranges	Author chain V； PDBConstruct 1–87； UniProt 1–87

40S ribosomal protein S22-A

OrganismNot specified

UniProt P0C0W1

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS22A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	32
Chains and sequence ranges	Author chain W； PDBConstruct 1–130； UniProt 1–130

40S ribosomal protein S23-A

OrganismNot specified

UniProt P0CX29

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS23A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	33
Chains and sequence ranges	Author chain X； PDBConstruct 1–145； UniProt 1–145

40S ribosomal protein S24-A

OrganismNot specified

UniProt P0CX31

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS24A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	34
Chains and sequence ranges	Author chain Y； PDBConstruct 1–135； UniProt 1–135

40S ribosomal protein S25-A

OrganismNot specified

UniProt Q3E792

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RS25A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	35
Chains and sequence ranges	Author chain Z； PDBConstruct 1–108； UniProt 1–108

20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1

OrganismNot specified

UniProt A0A6A5Q3F3

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	A0A6A5Q3F3_YEASX
Isoform	—
PDB entities	36
Chains and sequence ranges	Author chain a； PDBConstruct 1–459； UniProt 1–459

rRNA adenine N(6)-methyltransferase

OrganismNot specified

UniProt A0A6A5Q6M3

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 OTU domain-containing protein 2 × 1 （P38747） ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	A0A6A5Q6M3_YEASX
Isoform	—
PDB entities	37
Chains and sequence ranges	Author chain y； PDBConstruct 1–318； UniProt 1–318

OTU domain-containing protein 2

Saccharomyces cerevisiae W303

UniProt P38747

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 38 RNA 1	40S ribosomal protein S27-A × 1 （P35997） 40S ribosomal protein S28-A × 1 （Q3E7X9） RPS29A isoform 1 × 1 （P41057） 40S ribosomal protein S30-A × 1 （P0CX33） Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein × 1 （P38011） Pre-rRNA-processing protein PNO1 × 1 （A0A8H4F7A6） ENP1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BTD0） LTV1 isoform 1 × 1 （A0A8H4F8Z0） TSR1 isoform 1 × 1 （A0A8H8UMM1） non-specific serine/threonine protein kinase × 1 （A0A6A5Q8T7） 40S ribosomal protein S0-A × 1 （B3LI22） 40S ribosomal protein S1-A × 1 （P33442） 40S ribosomal protein S2 × 1 （P25443） 40S ribosomal protein S3 × 1 （P05750） 40S ribosomal protein S4-B × 1 （P0CX36） 40S ribosomal protein S5 × 1 （P26783） 40S ribosomal protein S6-B × 1 （P0CX38） 40S ribosomal protein S7-A × 1 （P26786） 40S ribosomal protein S8-A × 1 （P0CX39） 40S ribosomal protein S9-A × 1 （O13516） 40S ribosomal protein S11-A × 1 （P0CX47） 40S ribosomal protein S12 × 1 （P48589） 40S ribosomal protein S13 × 1 （P05756） 40S ribosomal protein S14-A × 1 （P06367） RPS15 isoform 1 × 1 （Q01855） 40S ribosomal protein S16-A × 1 （P0CX51） 40S ribosomal protein S17-A × 1 （P02407） 40S ribosomal protein S18-A × 1 （P0CX55） 40S ribosomal protein S19-A × 1 （P07280） 40S ribosomal protein S20 × 1 （P38701） 40S ribosomal protein S21-A × 1 （P0C0V8） 40S ribosomal protein S22-A × 1 （P0C0W1） 40S ribosomal protein S23-A × 1 （P0CX29） 40S ribosomal protein S24-A × 1 （P0CX31） 40S ribosomal protein S25-A × 1 （Q3E792） 20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1 × 1 （A0A6A5Q3F3） rRNA adenine N(6)-methyltransferase × 1 （A0A6A5Q6M3） 20S pre-ribosomal RNA × 1 ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 46	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

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UniProt name	OTU2_YEAST
Isoform	—
PDB entities	39
Chains and sequence ranges	Author chain K； PDBConstruct 1–307； UniProt 1–307

The page prioritizes protein identity, the current assembly, associated components, oligomeric state and cross-PDB links. Chain mapping and sequence ranges are retained as data evidence. Internal IDs, import timestamps and assembly operation expressions are maintenance fields and are not shown here.

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2. Structure Basics 2. Structure Basics

Entry ID entry_id	8cbj
Deposition date deposition_date	2023-01-25
Structure title title	Cryo-EM structure of Otu2-bound cytoplasmic pre-40S ribosome biogenesis complex
Keywords keywords	Ribosome, Translation, Ubiquitin, Deubiquitinating enzyme, Biogenesis, Complex; RIBOSOME
Experimental Method method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model SAXS Official SAXS Profiles

This page reads only the latest assembly calculations. Every curve maps to an explicit PDB entry, official biological assembly and coordinate model.

8cbj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

Download this curve (.dat)

8cbj__assembly_1__model_1 | I(q)

100 plotted points; both axes use logarithmic scales.

8cbj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) will be calculated and displayed separately for the same assembly/model.

Rg（Guinier）	76.79 Å
Rg (electron density)	77.66 Å
Total Rg	77.61 Å
Atom count	87884
Residues	8236
Excluded volume	1428600 Å³
Maximum q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	Structure unit	Oligomeric description	Status	CRYSOL	Actions
1	1	`8cbj__assembly_1__model_1`	39-meric （39）	Success	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	View Download

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4. Crystallography and Experiment 4. Crystallography & Experiment

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5. Entities and Polymers Entities & Polymers (41)

Entity 1 Entity 1 polymer

Description description	40S ribosomal protein S27-A
Molecular weight formula_weight	8893.4 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	b
Atom count atom_count	87884

MVLVQDLLHPTAASEARKHKLKTLVQGPRSYFLDVKCPGCLNITTVFSHAQTAVTCESCSTILCTPTGGKAKLSEGTSFRRK

Entity 2 Entity 2 polymer

Description description	40S ribosomal protein S28-A
Molecular weight formula_weight	7605.8 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	c

MDNKTPVTLAKVIKVLGRTGSRGGVTQVRVEFLEDTSRTIVRNVKGPVRENDILVLMESEREARRLR

Entity 3 Entity 3 polymer

Description description	RPS29A isoform 1
Molecular weight formula_weight	6675.7 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	d

MAHENVWFSHPRRYGKGSRQCRVCSSHTGLIRKYGLNICRQCFREKANDIGFNKFR

Entity 4 Entity 4 polymer

Description description	40S ribosomal protein S30-A
Molecular weight formula_weight	7137.5 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	e

MAKVHGSLARAGKVKSQTPKVEKTEKPKKPKGRAYKRLLYTRRFVNVTLVNGKRRMNPGPSVQ

Entity 5 Entity 5 polymer

Description description	Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein
Molecular weight formula_weight	34841.2 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	g

MASNEVLVLRGTLEGHNGWVTSLATSAGQPNLLLSASRDKTLISWKLTGDDQKFGVPVRSFKGHSHIVQDCTLTADGAYALSASWDKTLRLWDVATGETYQRFVGHKSDVMSVDIDKKASMIISGSRDKTIKVWTIKGQCLATLLGHNDWVSQVRVVPNEKADDDSVTIISAGNDKMVKAWNLNQFQIEADFIGHNSNINTLTASPDGTLIASAGKDGEIMLWNLAAKKAMYTLSAQDEVFSLAFSPNRYWLAAATATGIKVFSLDPQYLVDDLRPEFAGYSKAAEPHAVSLAWSADGQTLFAGYTDNVIRVWQVMTAN

Entity 6 Entity 6 polymer

Description description	Pre-rRNA-processing protein PNO1
Molecular weight formula_weight	30380.6 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	h

MVAPTALKKATVTPVSGQDGGSSRIIGINNTESIDEDDDDDVLLDDSDNNTAKEEVEGEEGSRKTHESKTVVVDDQGKPRFTSASKTQGNKIKFESRKIMVPPHRMTPLRNSWTKIYPPLVEHLKLQVRMNLKTKSVELRTNPKFTTDPGALQKGADFIKAFTLGFDLDDSIALLRLDDLYIETFEVKDVKTLTGDHLSRAIGRIAGKDGKTKFAIENATRTRIVLADSKIHILGGFTHIRMARESVVSLILGSPPGKVYGNLRTVASRLKERY

Entity 7 Entity 7 polymer

Description description	ENP1 isoform 1
Molecular weight formula_weight	55207.4 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	i

MARASSTKARKQRHDPLLKDLDAAQGTLKKINKKKLAQNDAANHDAANEEDGYIDSKASRKILQLAKEQQDEIEGEELAESERNKQFEARFTTMSYDDEDEDEDEDEEAFGEDISDFEPEGDYKEEEEIVEIDEEDAAMFEQYFKKSDDFNSLSGSYNLADKIMASIREKESQVEDMQDDEPLANEQNTSRGNISSGLKSGEGVALPEKVIKAYTTVGSILKTWTHGKLPKLFKVIPSLRNWQDVIYVTNPEEWSPHVVYEATKLFVSNLTAKESQKFINLILLERFRDNIETSEDHSLNYHIYRAVKKSLYKPSAFFKGFLFPLVETGCNVREATIAGSVLAKVSVPALHSSAALSYLLRLPFSPPTTVFIKILLDKKYALPYQTVDDCVYYFMRFRILDDGSNGEDATRVLPVIWHKAFLTFAQRYKNDITQDQRDFLLETVRQRGHKDIGPEIRRELLAGASREFVDPQEANDDLMIDVN

Entity 8 Entity 8 polymer

Description description	LTV1 isoform 1
Molecular weight formula_weight	53463.3 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	j

MSKKFSSKNSQRYVVVHRPHDDPSFYDTDASAHVLVPVSNPNKTSPEADLRKKDVSSTKPKGRRAHVGEAALYGINFDDSEYDYTQHLKPIGLDPENSIFIASKGNEQKVEKKNIEDLFIEPKYRRDEIEKDDALPVFQRGMAKPEYLLHQQDTTDEIRGFKPDMNPALREVLEALEDEAYVVNDDVVVEDISKKTQLQGDNYGEEEKEDDIFAQLLGSGEAKDEDEFEDEFDEWDIDNVENFEDENYVKEMAQFDNIENLEDLENIDYQADVRRFQKDNSILEKHNSDDEFSNAGLDSVNPSEEEDVLGELPSIQDKSKTGKKKRKSRQKKGAMSDVSGFSMSSSAIARTETMTVLDDQYDQIINGYENYEEELEEDEEQNYQPFDMSAERSDFESMLDDFLDNYELESGGRKLAKKDKEIERLKEAADEVSKGKLSQRRNRERQEKKKLEKVTNTLSSLKF

Entity 9 Entity 9 polymer

Description description	TSR1 isoform 1
Molecular weight formula_weight	90876.5 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	k

MAGHSHRSSLKNGHKSYKSKHASKGALKRLYKGKVEKEPVGTGKPDKQVSKLQRKNKAKQLRAQRILDSIENRKLFEGKNGAAKIITIVPLVNDLDPLDILYKLLKCADDEGIMVQEVDSKRIFNVHIKKFKSNLKIIIPDMTNFLNILDCAKVADFVVFGLSGVQEVDEEFGEQIIRALELQGIASYIGVISNLSAVHEKEKFQLDVKQSLESYFKHFFPSEERVYNLEKNSDALNVLRTLCQRLPRSINWRDNRGYVVADFVDFVETSPDSGDLVIEGTVRGIGFNANRLVHIPDFGDFQLNKIEKISESSQKRKIIKEKATDSLSLELDLQTVFESNMNRDTLDEYAPEGTEDWSDYDEDFEYDGLTTARYDDHGFLPGREQTSKKAAVPKGTSDYQAKWYLDDVIDANEEEEAEQTNGKDETMMEIDDEMMVEQDNEEVAGDEEYDIEDNEGFEELSPEEEERQLREFRDMEKEDREFPDEIELEPSESAIERLKRYRGLKNLYNCDWQVDEKDPSSPAEWKRLLRIGNYKNTKNRIIKETKNEAQAIAGDRIRMFIRFPKFLLEKIQDPKQLLFAVYGLLLHEHKNAVVNFSLQRWEQYDKPVPSQEPIVVQYGVRRYTIQPLFSQGSNSPNNVHKYERFLHPDTVSVATCIAPVDFTQSPAIFFKPSPTDAKNIELIGHGTFLNADHSRILAKRAILTGHPFRFHKTVVTVRYMFFRPEDVEWFKSIPLFTKSGRSGFIKESLGTHGYFKATFDGKLSAQDVVAMSLYKRMWPMPSLPWNGM

Entity 10 Entity 10 polymer

Description description	non-specific serine/threonine protein kinase
Molecular weight formula_weight	49192.9 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	l

MKLDTSHMRYLTTDDFRVLQAVEQGSRSHEVVPTPLIHQISGMRSQSGTNRAISDLAKLSLISKMRNVKYDGYRLTYNGIDYLALKTMLNRDTVYSVGNTIGVGKESDIYKVSDKNGNPRVMKIHRLGRTSFHSVRNNRDYLKKSNQGANWMHLSRLAANKEYQFMSMLYSKGFKVPEPFDNSRHIVVMELIEGYPMRRLRKHKNIPKLYSDLMCFIVDLANSGLIHCDFNEFNIMIKDKLEDENDCGFVVIDFPQCISIQHQDADYYFQRDVDCIRRFFKKKLKYEPKPDSSMLDTEGFGDGYKYAYPDFKRDVKRTDNLDELVQASGFSKKHPGDRGLETAVESMRNAVYNSDDDMSNDEAEEENGEGDYSEEDEYYDSELDNESSEDDSEDAQEEENERIIEALSSGVENLKMDKLGNYILE

Entity 11 Entity 11 polymer

Description description	40S ribosomal protein S0-A
Molecular weight formula_weight	28083.4 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	A

MSLPATFDLTPEDAQLLLAANTHLGARNVQVHQEPYVFNARPDGVHVINVGKTWEKLVLAARIIAAIPNPEDVVAISSRTFGQRAVLKFAAHTGATPIAGRFTPGSFTNYITRSFKEPRLVIVTDPRSDAQAIKEASYVNIPVIALTDLDSPSEFVDVAIPCNNRGKHSIGLIWYLLAREVLRLRGALVDRTQPWSIMPDLYFYRFPEEVEQQVAEEATTEEAGEEEAKEEVTEEQAEATEWAEENADNVEW

Entity 12 Entity 12 polymer

Description description	40S ribosomal protein S1-A
Molecular weight formula_weight	28798.5 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	B

MAVGKNKRLSKGKKGQKKRVVDPFTRKEWFDIKAPSTFENRNVGKTLVNKSTGLKSASDALKGRVVEVCLADLQGSEDHSFRKIKLRVDEVQGKNLLTNFHGMDFTTDKLRSMVRKWQTLIEANVTVKTSDDYVLRIFAIAFTRKQANQVKRHSYAQSSHIRAIRKVISEILTKEVQGSTLAQLTSKLIPEVINKEIENATKDIFPLQNIHVRKVKLLKQPKFDVGALMALHGEGSGEEKGKKVTGFKDEVLETV

Entity 13 Entity 13 polymer

Description description	40S ribosomal protein S2
Molecular weight formula_weight	27490.8 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	C

MSAPEAQQQKRGGFGGRNRGRPNRRGPRNTEEKGWVPVTKLGRLVKAGKITTIEEIFLHSLPVKEFQIIDTLLPGLQDEVMNIKPVQKQTRAGQRTRFKAVVVVGDSNGHVGLGIKTAKEVAGAIRAGIIIAKLSVIPIRRGYWGTNLGQPHSLATKTTGKCGSVTVRLIPAPRGSGIVASPAVKKLLQLAGVEDVYTQSNGKTRTLENTLKAAFVAIGNTYGFLTPNLWAEQPLPVSPLDIYSDEASAQKKRF

Entity 14 Entity 14 polymer

Description description	40S ribosomal protein S3
Molecular weight formula_weight	26542.8 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	D

MVALISKKRKLVADGVFYAELNEFFTRELAEEGYSGVEVRVTPTKTEVIIRATRTQDVLGENGRRINELTLLVQKRFKYAPGTIVLYAERVQDRGLSAVAQAESMKFKLLNGLAIRRAAYGVVRYVMESGAKGCEVVVSGKLRAARAKAMKFADGFLIHSGQPVNDFIDTATRHVLMRQGVLGIKVKIMRDPAKSRTGPKALPDAVTIIEPKEEEPILAPSVKDYRPAEETEAQAEPVEA

Entity 15 Entity 15 polymer

Description description	40S ribosomal protein S4-B
Molecular weight formula_weight	29469.3 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	E

MARGPKKHLKRLAAPHHWLLDKLSGCYAPRPSAGPHKLRESLPLIVFLRNRLKYALNGREVKAILMQRHVKVDGKVRTDTTYPAGFMDVITLDATNENFRLVYDVKGRFAVHRITDEEASYKLGKVKKVQLGKKGVPYVVTHDGRTIRYPDPNIKVNDTVKIDLASGKITDFIKFDAGKLVYVTGGRNLGRIGTIVHKERHDGGFDLVHIKDSLDNTFVTRLNNVFVIGEQGKPYISLPKGKGIKLSIAEERDRRRAQQGL

Entity 16 Entity 16 polymer

Description description	40S ribosomal protein S5
Molecular weight formula_weight	25072.6 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	F

MSDTEAPVEVQEDFEVVEEFTPVVLATPIPEEVQQAQTEIKLFNKWSFEEVEVKDASLVDYVQVRQPIFVAHTAGRYANKRFRKAQCPIIERLTNSLMMNGRNNGKKLKAVRIIKHTLDIINVLTDQNPIQVVVDAITNTGPREDTTRVGGGGAARRQAVDVSPLRRVNQAIALLTIGAREAAFRNIKTIAETLAEELINAAKGSSTSYAIKKKDELERVAKSNR

Entity 17 Entity 17 polymer

Description description	40S ribosomal protein S6-B
Molecular weight formula_weight	27054.5 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	G

MKLNISYPVNGSQKTFEIDDEHRIRVFFDKRIGQEVDGEAVGDEFKGYVFKISGGNDKQGFPMKQGVLLPTRIKLLLTKNVSCYRPRRDGERKRKSVRGAIVGPDLAVLALVIVKKGEQELEGLTDTTVPKRLGPKRANNIRKFFGLSKEDDVRDFVIRREVTKGEKTYTKAPKIQRLVTPQRLQRKRHQRALKVRNAQAQREAAAEYAQLLAKRLSERKAEKAEIRKRRASSLKA

Entity 18 Entity 18 polymer

Description description	40S ribosomal protein S7-A
Molecular weight formula_weight	21658.2 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	H

MSAPQAKILSQAPTELELQVAQAFVELENSSPELKAELRPLQFKSIREIDVAGGKKALAIFVPVPSLAGFHKVQTKLTRELEKKFQDRHVIFLAERRILPKPSRTSRQVQKRPRSRTLTAVHDKILEDLVFPTEIVGKRVRYLVGGNKIQKVLLDSKDVQQIDYKLESFQAVYNKLTGKQIVFEIPSETH

Entity 19 Entity 19 polymer

Description description	40S ribosomal protein S8-A
Molecular weight formula_weight	22537.8 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	I

MGISRDSRHKRSATGAKRAQFRKKRKFELGRQPANTKIGAKRIHSVRTRGGNKKYRALRIETGNFSWASEGISKKTRIAGVVYHPSNNELVRTNTLTKAAIVQIDATPFRQWFEAHYGQTLGKKKNVKEEETVAKSKNAERKWAARAASAKIESSVESQFSAGRLYACISSRPGQSGRCDGYILEGEELAFYLRRLTAKK

Entity 20 Entity 20 polymer

Description description	40S ribosomal protein S9-A
Molecular weight formula_weight	22487.9 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	J

MPRAPRTYSKTYSTPKRPYESSRLDAELKLAGEFGLKNKKEIYRISFQLSKIRRAARDLLTRDEKDPKRLFEGNALIRRLVRVGVLSEDKKKLDYVLALKVEDFLERRLQTQVYKLGLAKSVHHARVLITQRHIAVGKQIVNIPSFMVRLDSEKHIDFAPTSPFGGARPGRVARRNAARKAEASGEAADEADEADEE

Entity 21 Entity 21 polymer

Description description	40S ribosomal protein S11-A
Molecular weight formula_weight	17785.9 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	L

MSTELTVQSERAFQKQPHIFNNPKVKTSKRTKRWYKNAGLGFKTPKTAIEGSYIDKKCPFTGLVSIRGKILTGTVVSTKMHRTIVIRRAYLHYIPKYNRYEKRHKNVPVHVSPAFRVQVGDIVTVGQCRPISKTVRFNVVKVSAAAGKANKQFAKF

Entity 22 Entity 22 polymer

Description description	40S ribosomal protein S12
Molecular weight formula_weight	15488.6 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	M

MSDVEEVVEVQEETVVEQTAEVTIEDALKVVLRTALVHDGLARGLRESTKALTRGEALLVVLVSSVTEANIIKLVEGLANDPENKVPLIKVADAKQLGEWAGLGKIDREGNARKVVGASVVVVKNWGAETDELSMIMEHFSQQ

Entity 23 Entity 23 polymer

Description description	40S ribosomal protein S13
Molecular weight formula_weight	17059.9 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	N

MGRMHSAGKGISSSAIPYSRNAPAWFKLSSESVIEQIVKYARKGLTPSQIGVLLRDAHGVTQARVITGNKIMRILKSNGLAPEIPEDLYYLIKKAVSVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYRTVAVLPPNWKYESATASALVN

Entity 24 Entity 24 polymer

Description description	40S ribosomal protein S14-A
Molecular weight formula_weight	14562.7 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	O

MSNVVQARDNSQVFGVARIYASFNDTFVHVTDLSGKETIARVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVAAKCKEVGITAVHVKIRATGGTRTKTPGPGGQAALRALARSGLRIGRIEDVTPVPSDSTRKKGGRRGRRL

Entity 25 Entity 25 polymer

Description description	RPS15 isoform 1
Molecular weight formula_weight	16031.9 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	P

MSQAVNAKKRVFKTHSYRGVDLEKLLEMSTEDFVKLAPARVRRRFARGMTSKPAGFMKKLRAAKLAAPENEKPAPVRTHMRNMIIVPEMIGSVVGIYNGKAFNQVEIRPEMLGHYLGEFSITYTPVRHGRAGATTSRFIPLK

Entity 26 Entity 26 polymer

Description description	40S ribosomal protein S16-A
Molecular weight formula_weight	15877.5 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	Q

MSAVPSVQTFGKKKSATAVAHVKAGKGLIKVNGSPITLVEPEILRFKVYEPLLLVGLDKFSNIDIRVRVTGGGHVSQVYAIRQAIAKGLVAYHQKYVDEQSKNELKKAFTSYDRTLLIADSRRPEPKKFGGKGARSRFQKSYR

Entity 27 Entity 27 polymer

Description description	40S ribosomal protein S17-A
Molecular weight formula_weight	15820.4 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	R

MGRVRTKTVKRASKALIERYYPKLTLDFQTNKRLCDEIATIQSKRLRNKIAGYTTHLMKRIQKGPVRGISFKLQEEERERKDQYVPEVSALDLSRSNGVLNVDNQTSDLVKSLGLKLPLSVINVSAQRDRRYRKRV

Entity 28 Entity 28 polymer

Description description	40S ribosomal protein S18-A
Molecular weight formula_weight	17071.6 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	S

MSLVVQEQGSFQHILRLLNTNVDGNIKIVYALTTIKGVGRRYSNLVCKKADVDLHKRAGELTQEELERIVQIMQNPTHYKIPAWFLNRQNDITDGKDYHTLANNVESKLRDDLERLKKIRAHRGIRHFWGLRVRGQHTKTTGRRRA

Entity 29 Entity 29 polymer

Description description	40S ribosomal protein S19-A
Molecular weight formula_weight	15942.1 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	T

MPGVSVRDVAAQDFINAYASFLQRQGKLEVPGYVDIVKTSSGNEMPPQDAEGWFYKRAASVARHIYMRKQVGVGKLNKLYGGAKSRGVRPYKHIDASGSINRKVLQALEKIGIVEISPKGGRRISENGQRDLDRIAAQTLEEDE

Entity 30 Entity 30 polymer

Description description	40S ribosomal protein S20
Molecular weight formula_weight	13929.0 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	U

MSDFQKEKVEEQEQQQQQIIKIRITLTSTKVKQLENVSSNIVKNAEQHNLVKKGPVRLPTKVLKISTRKTPNGEGSKTWETYEMRIHKRYIDLEAPVQIVKRITQITIEPGVDVEVVVASN

Entity 31 Entity 31 polymer

Description description	40S ribosomal protein S21-A
Molecular weight formula_weight	9758.8 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	V

MENDKGQLVELYVPRKCSATNRIIKADDHASVQINVAKVDEEGRAIPGEYVTYALSGYVRSRGESDDSLNRLAQNDGLLKNVWSYSR

Entity 32 Entity 32 polymer

Description description	40S ribosomal protein S22-A
Molecular weight formula_weight	14650.1 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	W

MTRSSVLADALNAINNAEKTGKRQVLIRPSSKVIIKFLQVMQKHGYIGEFEYIDDHRSGKIVVQLNGRLNKCGVISPRFNVKIGDIEKWTANLLPARQFGYVILTTSAGIMDHEEARRKHVSGKILGFVY

Entity 33 Entity 33 polymer

Description description	40S ribosomal protein S23-A
Molecular weight formula_weight	16073.9 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	X

MGKGKPRGLNSARKLRVHRRNNRWAENNYKKRLLGTAFKSSPFGGSSHAKGIVLEKLGIESKQPNSAIRKCVRVQLIKNGKKVTAFVPNDGCLNFVDENDEVLLAGFGRKGKAKGDIPGVRFKVVKVSGVSLLALWKEKKEKPRS

Entity 34 Entity 34 polymer

Description description	40S ribosomal protein S24-A
Molecular weight formula_weight	15362.8 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	Y

MSDAVTIRTRKVISNPLLARKQFVVDVLHPNRANVSKDELREKLAEVYKAEKDAVSVFGFRTQFGGGKSVGFGLVYNSVAEAKKFEPTYRLVRYGLAEKVEKASRQQRKQKKNRDKKIFGTGKRLAKKVARRNAD

Entity 35 Entity 35 polymer

Description description	40S ribosomal protein S25-A
Molecular weight formula_weight	12067.3 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	Z

MPPKQQLSKAAKAAAALAGGKKSKKKWSKKSMKDRAQHAVILDQEKYDRILKEVPTYRYVSVSVLVDRLKIGGSLARIALRHLEKEGIIKPISKHSKQAIYTRATASE

Entity 36 Entity 36 polymer

Description description	20S-pre-rRNA D-site endonuclease NOB1
Molecular weight formula_weight	51824.9 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	a

MTENQTAHVRALILDATPLITQSYTHYQNYAQSFYTTPTVFQEIKDAQARKNLEIWQSLGTLKLVHPSENSIAKVSTFAKLTGDYSVLSANDLHILALTYELEIKLNNGDWRLRKKPGDALDASKADVGTDGKQKLTEDNKKEEDSESVPKKKNKRRGGKKQKAKREAREAREAENANLELESKAEEHVEEAGSKEQICNDENIKESSDLNEVFEDADDDGDWITPENLTEAIIKDSGEDTTGSLGVEASEEDRHVALNRPENQVALATGDFAVQNVALQMNLNLMNFMSGLKIKRIRNYMLRCHACFKIFPLPKDGKPKHFCASCGGQGTLLRCAVSVDSRTGNVTPHLKSNFQWNNRGNRYSVASPLSKNSQKRYGKKGHVHSKPQENVILREDQKEYEKVIKQEEWTRRHNEKILNNWIGGGSADNYISPFAITGLKQHNVRIGKGRYVNSSKRRS

Entity 37 Entity 37 polymer

Description description	rRNA adenine N(6)-methyltransferase
Molecular weight formula_weight	36003.8 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	y

MGKAAKKKYSGATSSKQVSAEKHLSSVFKFNTDLGQHILKNPLVAQGIVDKAQIRPSDVVLEVGPGTGNLTVRILEQAKNVVAVEMDPRMAAELTKRVRGTPVEKKLEIMLGDFMKTELPYFDICISNTPYQISSPLVFKLINQPRPPRVSILMFQREFALRLLARPGDSLYCRLSANVQMWANVTHIMKVGKNNFRPPPQVESSVVRLEIKNPRPQVDYNEWDGLLRIVFVRKNRTISAGFKSTTVMDILEKNYKTFLAMNNEMVDDTKGSMHDVVKEKIDTVLKETDLGDKRAGKCDQNDFLRLLYAFHQVGIHFS

Entity 38 Entity 38 polymer

Description description	20S pre-ribosomal RNA
Molecular weight formula_weight	647990.4 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polyribonucleotide
Chain IDs strand_id	2

UAUCUGGUUGAUCCUGCCAGUAGUCAUAUGCUUGUCUCAAAGAUUAAGCCAUGCAUGUCUAAGUAUAAGCAAUUUAUACAGUGAAACUGCGAAUGGCUCAUUAAAUCAGUUAUCGUUUAUUUGAUAGUUCCUUUACUACAUGGUAUAACUGUGGUAAUUCUAGAGCUAAUACAUGCUUAAAAUCUCGACCCUUUGGAAGAGAUGUAUUUAUUAGAUAAAAAAUCAAUGUCUUCGGACUCUUUGAUGAUUCAUAAUAACUUUUCGAAUCGCAUGGCCUUGUGCUGGCGAUGGUUCAUUCAAAUUUCUGCCCUAUCAACUUUCGAUGGUAGGAUAGUGGCCUACCAUGGUUUCAACGGGUAACGGGGAAUAAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAAUUACCCAAUCCUAAUUCAGGGAGGUAGUGACAAUAAAUAACGAUACAGGGCCCAUUCGGGUCUUGUAAUUGGAAUGAGUACAAUGUAAAUACCUUAACGAGGAACAAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCAAUAGCGUAUAUUAAAGUUGUUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGAACUUUGGGCCCGGUUGGCCGGUCCGAUUUUUUCGUGUACUGGAUUUCCAACGGGGCCUUUCCUUCUGGCUAACCUUGAGUCCUUGUGGCUCUUGGCGAACCAGGACUUUUACUUUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCGUAUUGCUCGAAUAUAUUAGCAUGGAAUAAUAGAAUAGGACGUUUGGUUCUAUUUUGUUGGUUUCUAGGACCAUCGUAAUGAUUAAUAGGGACGGUCGGGGGCAUCAGUAUUCAAUUGUCAGAGGUGAAAUUCUUGGAUUUAUUGAAGACUAACUACUGCGAAAGCAUUUGCCAAGGACGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUUAGGGGAUCGAAGAUGAUCAGAUACCGUCGUAGUCUUAACCAUAAACUAUGCCGACUAGGGAUCGGGUGGUGUUUUUUUAAUGACCCACUCGGCACCUUACGAGAAAUCAAAGUCUUUGGGUUCUGGGGGGAGUAUGGUCGCAAGGCUGAAACUUAAAGGAAUUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGGAAACUCACCAGGUCCAGACACAAUAAGGAUUGACAGAUUGAGAGCUCUUUCUUGAUUUUGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGUGAUUUGUCUGCUUAAUUGCGAUAACGAACGAGACCUUAACCUACUAAAUAGUGGUGCUAGCAUUUGCUGGUUAUCCACUUCUUAGAGGGACUAUCGGUUUCAAGCCGAUGGAAGUUUGAGGCAAUAACAGGUCUGUGAUGCCCUUAGACGUUCUGGGCCGCACGCGCGCUACACUGACGGAGCCAGCGAGUCUAACCUUGGCCGAGAGGUCUUGGUAAUCUUGUGAAACUCCGUCGUGCUGGGGAUAGAGCAUUGUAAUUAUUGCUCUUCAACGAGGAAUUCCUAGUAAGCGCAAGUCAUCAGCUUGCGUUGAUUACGUCCCUGCCCUUUGUACACACCGCCCGUCGCUAGUACCGAUUGAAUGGCUUAGUGAGGCCUCAGGAUCUGCUUAGAGAAGGGGGCAACUCCAUCUCAGAGCGGAGAAUUUGGACAAACUUGGUCAUUUAGAGGAACUAAAAGUCGUAACAAGGUUUCCGUAGGUGAACCUGCGGAAGGAUCAUUAAAGAAAUUUAAUAAUUUUGAAAAUGGAUUUUUUUGUUUUGGCAAGAGCAUGAGAGCUUUUACUGGGCAAGAAGACAAGAGAUGGAGAGUCCAGCCGGGCCUGCGCUUAAGUGCGCGGUCUUGCUAGGCUUGUAAGUUUCUUUCUUGCUAUUCCAAACGGUGAGAGAUUUCUGUGCUUUUGUUAUAGGACAAUUAAAACCGUUUCAAUACAAC

Entity 39 Entity 39 polymer

Description description	OTU domain-containing protein 2
Molecular weight formula_weight	36157.0 kDa
Source method src_method	man
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	K

MTGMESGENLENMEDILARHRKENKDLQNKITGMKKQATKSKRKEVNSKCLDLQDKLKTKQENEIRDWKIANNEVFDAEQEDEVTPEKLLEQLSISRDEKEQQNVPVQQQQQGQTKKRRNRQKERLAKRDAAIAKMKEEAALEASKQPDLKKMEQESIDQLCELKKLKQFDIQPDGHSLFASILDQLKLRHDPKKLDQDMDVMKLRWLSCNYVQEHRDDFIPYLFDEETMKMKDIDEYTKEMEHTAQWGGEIEILALSHVFDCPISILMSGRPIQVYNECGKNPELKLVYYKHSYALGEHYNSLHDS

Source Source

Source organism organism	Saccharomyces cerevisiae W303
NCBI taxonomy ID ncbi_taxonomy_id	580240
Host organism host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

Entity 40 Entity 40 non-polymer

Description description	ZINC ION
Molecular weight formula_weight	65.4 kDa
Source method src_method	syn
Copy count entity_count	2

Entity 41 Entity 41 non-polymer

Description description	MAGNESIUM ION
Molecular weight formula_weight	24.3 kDa
Source method src_method	syn
Copy count entity_count	46

▶

Unit-cell length a length_a	1.000 Å
Unit-cell length b length_b	1.000 Å
Unit-cell length c length_c	1.000 Å
Unit-cell angle α angle_alpha	90.00 °
Unit-cell angle β angle_beta	90.00 °
Unit-cell angle γ angle_gamma	90.00 °
Molecules per unit cell Z z_pdb	—

Space group space_group	P 1
Space-group number int_tables_number	1
Crystal system crystal_system	—

Resolution resolution	3.80 Å
Resolution测定Method resolution_method	—
颗粒数 num_particles	4908

Cryo-EM structure of Otu2-bound cytoplasmic pre-40S ribosome biogenesis complex

1. Protein Identity and Related Structures Protein Identity & Related Structures

40S ribosomal protein S27-A

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

40S ribosomal protein S28-A

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

RPS29A isoform 1

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

40S ribosomal protein S30-A

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

Pre-rRNA-processing protein PNO1

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

ENP1 isoform 1

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

LTV1 isoform 1

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

TSR1 isoform 1

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

non-specific serine/threonine protein kinase

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer