8cpg

Structure of the AT-Hook 1 peptide from the mammalian HMGA protein in complex with DNA

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

High mobility group protein HMG-I/HMG-Y

物种未注明

UniProt P17096

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 3 DNA 6 ;DNA (5'-D(*CP*GP*TP*TP*AP*AP*TP*TP*AP*AP*CP*G)-3') ; × 6 MAGNESIUM ION × 4 water × 9 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HMGA1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 2–10; UniProt 23–31 作者链 H; PDB构建体 2–10; UniProt 23–31 作者链 I; PDB构建体 2–10; UniProt 23–31

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8cpg
沉积日期 deposition_date2023-03-02
结构标题 titleStructure of the AT-Hook 1 peptide from the mammalian HMGA protein in complex with DNA
关键词 keywordsMammalian High Mobility Group protein (HMGA1) AT-hook peptides, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8cpg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8cpg__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8cpg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)20.63 Å
Rg(电子密度)19.83 Å
总 Rg20.50 Å
原子数1597
残基数90
排除体积23911 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8cpg__assembly_1__model_1 nonameric (9) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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7. 引用文献 (1)