Capsid protein
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric（180） 与蛋白拷贝数一致 | 链 C； UniProt 1–190 链 D； UniProt 1–190 链 I； UniProt 1–190 | 未记录 | 无其他共同聚合物 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 4.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE | 分辨率 3.90 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 8CPY | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1CWP STRUCTURES OF THE NATIVE AND SWOLLEN FORMS OF COWPEA CHLOROTIC MOTTLE VIRUS DETERMINED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY AND CRYO-ELECTRON MICROSCOPY 提交 1995-05-22 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：360-MERIC |
链 A
1–189（189 aa）
链 B
1–189（189 aa）
链 C
1–189（189 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å |
| 1CWP STRUCTURES OF THE NATIVE AND SWOLLEN FORMS OF COWPEA CHLOROTIC MOTTLE VIRUS DETERMINED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY AND CRYO-ELECTRON MICROSCOPY 提交 1995-05-22 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–189（189 aa）
链 B
1–189（189 aa）
链 C
1–189（189 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å |
| 1CWP STRUCTURES OF THE NATIVE AND SWOLLEN FORMS OF COWPEA CHLOROTIC MOTTLE VIRUS DETERMINED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY AND CRYO-ELECTRON MICROSCOPY 提交 1995-05-22 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：30-meric |
链 A
1–189（189 aa）
链 B
1–189（189 aa）
链 C
1–189（189 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å |
| 1CWP STRUCTURES OF THE NATIVE AND SWOLLEN FORMS OF COWPEA CHLOROTIC MOTTLE VIRUS DETERMINED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY AND CRYO-ELECTRON MICROSCOPY 提交 1995-05-22 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：36-meric |
链 A
1–189（189 aa）
链 B
1–189（189 aa）
链 C
1–189（189 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å |
| 1CWP STRUCTURES OF THE NATIVE AND SWOLLEN FORMS OF COWPEA CHLOROTIC MOTTLE VIRUS DETERMINED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY AND CRYO-ELECTRON MICROSCOPY 提交 1995-05-22 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：hexameric |
链 A
1–189（189 aa）
链 B
1–189（189 aa）
链 C
1–189（189 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å |
| 1CWP STRUCTURES OF THE NATIVE AND SWOLLEN FORMS OF COWPEA CHLOROTIC MOTTLE VIRUS DETERMINED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY AND CRYO-ELECTRON MICROSCOPY 提交 1995-05-22 | 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：360-meric |
链 A
1–189（189 aa）
链 B
1–189（189 aa）
链 C
1–189（189 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.20 Å |
| 1ZA7 The crystal structure of salt stable cowpea cholorotic mottle virus at 2.7 angstroms resolution. 提交 2005-04-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-MERIC |
链 A
25–189（165 aa）
链 B
25–189（165 aa）
链 C
25–189（165 aa）
|
突变：K42R 突变：K42R 突变：K42R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.3；298 K；0.3M succinate, 4% PEG 8000, pH 3.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 3.30
|
分辨率 2.70 Å |
| 1ZA7 The crystal structure of salt stable cowpea cholorotic mottle virus at 2.7 angstroms resolution. 提交 2005-04-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
25–189（165 aa）
链 B
25–189（165 aa）
链 C
25–189（165 aa）
|
突变：K42R 突变：K42R 突变：K42R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.3；298 K；0.3M succinate, 4% PEG 8000, pH 3.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 3.30
|
分辨率 2.70 Å |
| 1ZA7 The crystal structure of salt stable cowpea cholorotic mottle virus at 2.7 angstroms resolution. 提交 2005-04-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric |
链 A
25–189（165 aa）
链 B
25–189（165 aa）
链 C
25–189（165 aa）
|
突变：K42R 突变：K42R 突变：K42R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.3；298 K；0.3M succinate, 4% PEG 8000, pH 3.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 3.30
|
分辨率 2.70 Å |
| 1ZA7 The crystal structure of salt stable cowpea cholorotic mottle virus at 2.7 angstroms resolution. 提交 2005-04-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric |
链 A
25–189（165 aa）
链 B
25–189（165 aa）
链 C
25–189（165 aa）
|
突变：K42R 突变：K42R 突变：K42R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.3；298 K；0.3M succinate, 4% PEG 8000, pH 3.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 3.30
|
分辨率 2.70 Å |
| 1ZA7 The crystal structure of salt stable cowpea cholorotic mottle virus at 2.7 angstroms resolution. 提交 2005-04-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric |
链 A
25–189（165 aa）
链 B
25–189（165 aa）
链 C
25–189（165 aa）
|
突变：K42R 突变：K42R 突变：K42R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.3；298 K；0.3M succinate, 4% PEG 8000, pH 3.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 3.30
|
分辨率 2.70 Å |
| 1ZA7 The crystal structure of salt stable cowpea cholorotic mottle virus at 2.7 angstroms resolution. 提交 2005-04-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric |
链 A
25–189（165 aa）
链 B
25–189（165 aa）
链 C
25–189（165 aa）
|
突变：K42R 突变：K42R 突变：K42R | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 3.3；298 K；0.3M succinate, 4% PEG 8000, pH 3.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K, pH 3.30
|
分辨率 2.70 Å |
| 8C38 Contracted cowpea chlorotic mottle virus 提交 2022-12-23 | 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 180 PDB 声明：180-meric |
链 C
1–190（190 aa）
链 D
1–190（190 aa）
链 I
1–190（190 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.64 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | CAPSD_CCMV |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 作者链 D； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 作者链 I； PDB构建体 1–190； UniProt 1–190 |
