Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 489–597 | 未记录 | Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 17 × 1 (P78536) NA SODIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277.15 K;20% w/v PEG 3350, 0.2 M NaSCN at pH 7 | 分辨率 1.70 Å R-free 0.203 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 8CQY | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2B49 Crystal Structure of the Catalytic Domain of Protein Tyrosine Phosphatase, non-receptor Type 3 提交 2005-09-23 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
628–913(286 aa)
片段:catalytic domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;293 K;Ammonium Sulphate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.54 Å R-free 0.230 |
| 4QUM Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) in complex with a dually phosphorylated MAPK12 peptide 提交 2014-07-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
628–909(282 aa)
片段:Catalytic domain (UNP RESIDUES 628-909)
|
突变:D811A, C842S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl, 30% PEG 8000, 5% glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.52 Å R-free 0.245 |
| 4QUN Crystal structure of the PTPN3 (PTPH1) catalytic domain C842S mutant 提交 2014-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
628–909(282 aa)
片段:Catalytic domain (UNP RESIDUES 628-909)
|
突变:C842S | PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M Hepes, 12% PEG 8000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.205 |
| 4QUN Crystal structure of the PTPN3 (PTPH1) catalytic domain C842S mutant 提交 2014-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
628–909(282 aa)
片段:Catalytic domain (UNP RESIDUES 628-909)
|
突变:C842S | PO4 PHOSPHATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;0.1M Hepes, 12% PEG 8000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.205 |
| 4RH5 Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) in complex with Eps15 pTyr849 peptide 提交 2014-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
628–909(282 aa)
片段:Catalytic domain (UNP RESIDUES 628-909)
|
突变:D811A, C842S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl, 21% PEG 8000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.203 |
| 4RH9 Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) H812F, M883G mutant in complex with Eps15 pTyr849 peptide 提交 2014-10-01 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
628–909(282 aa)
片段:Catalytic domain (UNP RESIDUES 628-909)
|
突变:D811A, H812F, C842S, M883G | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl, 21% PEG 8000, 5% glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.226 |
| 4RHG Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) D811E, C842S mutant in complex with Eps15 pTyr849 peptide 提交 2014-10-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
628–909(282 aa)
片段:Catalytic domain (UNP RESIDUES 628-909)
|
突变:D811E, C842S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl, 21% PEG 8000, 5% glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.58 Å R-free 0.209 |
| 4RI4 Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) Y676I mutant in complex with vanadate 提交 2014-10-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
628–909(282 aa)
片段:Catalytic domain (UNP RESIDUES 628-909)
|
突变:Y676I | VO4 VANADATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;100mM Tris-HCl, 25% PEG 8000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.189 |
| 4RI4 Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) Y676I mutant in complex with vanadate 提交 2014-10-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
628–909(282 aa)
片段:Catalytic domain (UNP RESIDUES 628-909)
|
突变:Y676I | VO4 VANADATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;293 K;100mM Tris-HCl, 25% PEG 8000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.189 |
| 4RI5 Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) D811E mutant in complex with metavanadate 提交 2014-10-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
628–909(282 aa)
片段:Catalytic domain (UNP RESIDUES 628-909)
|
突变:D811E | GOL GLYCEROL × 1 VN4 oxido(dioxo)vanadium × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl, 21% PEG 800, 5% glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.173 |
| 4RI5 Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) D811E mutant in complex with metavanadate 提交 2014-10-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
628–909(282 aa)
片段:Catalytic domain (UNP RESIDUES 628-909)
|
突变:D811E | GOL GLYCEROL × 1 VN4 oxido(dioxo)vanadium × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl, 21% PEG 800, 5% glycerol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.173 |
| 4S0G Crystal structure of PTPN3 (PTPH1) in complex with Eps15 pTyr849 P850V peptide 提交 2014-12-31 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
628–909(282 aa)
片段:Catalytic domain, UNP residues 628-909
|
突变:D811A, C842S | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.5;293 K;0.1M Tris-HCl, 26% PEG 8000, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.229 |
| 6HKS Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2018-09-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
489–597(109 aa)
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;20% w/v PEG 3350
0.2 mM KI
pH 7
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.247 |
| 6HKS Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2018-09-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
489–597(109 aa)
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;20% w/v PEG 3350
0.2 mM KI
pH 7
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.247 |
| 6HKS Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2018-09-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
489–597(109 aa)
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;20% w/v PEG 3350
0.2 mM KI
pH 7
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.247 |
| 6HKS Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2018-09-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 D
489–597(109 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;20% w/v PEG 3350
0.2 mM KI
pH 7
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.247 |
| 6HKS Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2018-09-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 E
489–597(109 aa)
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;20% w/v PEG 3350
0.2 mM KI
pH 7
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.247 |
| 6HKS Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV16 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2018-09-07 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 F
489–597(109 aa)
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277 K;20% w/v PEG 3350
0.2 mM KI
pH 7
|
分辨率 2.19 Å R-free 0.247 |
| 6T36 Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HBV core protein C-terminal peptide 提交 2019-10-10 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
1–913(913 aa)
|
未记录 | BR BROMIDE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;277.15 K;20% w/v PEG 3350, 0.2 M NaBr
|
分辨率 1.86 Å R-free 0.239 |
| 8OEP Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV18 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2023-03-11 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
489–597(109 aa)
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277.15 K;20% w/v PEG 3350, 0.2 M NaI at pH 7;
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.249 |
| 8OEP Crystal structure of the PTPN3 PDZ domain bound to the HPV18 E6 oncoprotein C-terminal peptide 提交 2023-03-11 | 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
489–597(109 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;277.15 K;20% w/v PEG 3350, 0.2 M NaI at pH 7;
|
分辨率 1.87 Å R-free 0.249 |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | PTN3_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 6–114; UniProt 489–597 |