SAXSdb — 8da1

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Alpha-bungarotoxin

Bungarus multicinctus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 I； UniProt 22–95	未记录	Centi-LNX-D09 Fab light chain × 1 Centi-LNX-D09 Fab heavy chain × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；293 K；40% PEG 400, 5% PEG 3350, 0.1M sodium acetate pH 5.5	分辨率 2.67 Å R-free 0.253

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8DA1	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1ABT NMR SOLUTION STRUCTURE OF AN ALPHA-BUNGAROTOXIN(SLASH)NICOTINIC RECEPTOR PEPTIDE COMPLEX 提交 1993-11-17	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1BXP SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE COMPLEX OF ALPHA-BUNGAROTOXIN WITH A LIBRARY DERIVED PEPTIDE, 20 STRUCTURES 提交 1998-08-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.8；303 K	分辨率未提供
1HC9 alpha-bungarotoxin complexed with high affinity peptide 提交 2001-05-02	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 22–95（74 aa）	未记录	IOD IODIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；40% PEG 3350, 0.1M PIPES BUFFER PH 7.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.235
1HOY NMR STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN A-BUNGAROTOXIN AND A MIMOTOPE OF THE NICOTINIC ACETYLCHOLINE RECEPTOR 提交 2000-12-12	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.67；303 K；压力 ambient NMR样品组成 0.5mM a-bungarotoxin;0.5mM peptide; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1IDG THE NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE COMPLEX FORMED BETWEEN ALPHA-BUNGAROTOXIN AND AN 18MER COGNATE PEPTIDE 提交 2001-04-04	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4；308 K；压力 ambient NMR样品组成 2.1 mM alpha-Bungarotoxin/alpha18mer complex, alpha18mer is 15N labeled, 50 mM perdeuterated potassium acetate buffer (pH 4.0) with 5% D2O and 0.05% sodium azide \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
1IDH THE NMR SOLUTION STRUCTURE OF THE COMPLEX FORMED BETWEEN ALPHA-BUNGAROTOXIN AND AN 18MER COGNATE PEPTIDE 提交 2001-04-04	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4；308 K；压力 ambient NMR样品组成 2.1 mM alpha-Bungarotoxin/alpha18mer complex, alpha18mer is 15N labeled, 50 mM perdeuterated potassium acetate buffer (pH 4.0) with 5% D2O and 0.05% sodium azide \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
1IDI THE NMR SOLUTION STRUCTURE OF ALPHA-BUNGAROTOXIN 提交 2001-04-04	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4；308 K；压力 ambient NMR样品组成 2.0 mM free alpha-Bungarotoxin, 50 mM perdeuterated potassium acetate buffer (pH 4.0) with 5% D2O and 0.05% SODIUM azide \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
1IDL THE NMR SOLUTION STRUCTURE OF ALPHA-BUNGAROTOXIN 提交 2001-04-04	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4；308 K；离子强度（mmCIF原始值）29 mM；压力 ambient NMR样品组成 2.0 mM free alpha-Bungarotoxin, 50 mM perdeuterated potassium acetate buffer (pH 4.0) with 5% D2O and 0.05% sodium azide \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
1IK8 NMR structure of Alpha-Bungarotoxin 提交 2001-05-03	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.67；303 K NMR样品组成 0.5mM alpha-bungarotoxin; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1IKC NMR Structure of alpha-Bungarotoxin 提交 2001-05-03	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.67；303 K NMR样品组成 0.5mM alpha-bungarotoxin; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1JBD NMR Structure of the Complex Between alpha-bungarotoxin and a Mimotope of the Nicotinic Acetylcholine Receptor 提交 2001-06-04	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.67；300 K；压力 ambient NMR样品组成 0.5MM ALPHA-BUNGAROTOXIN; 90% H2O, 10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1KC4 NMR Structural Analysis of the Complex Formed Between alpha-Bungarotoxin and the Principal alpha-Neurotoxin Binding Sequence on the alpha7 Subunit of a Neuronal Nicotinic Acetylcholine Receptor 提交 2001-11-07	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；308 K；压力 ambient NMR样品组成 1.6 mM alpha-bungarotoxin/[U-15N]-alpha 7 19mer complex 30 mM sodium phosphate, pH 5.5 50 micromolar sodium azide 50 micromolar TMSP \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 1.6 mM alpha-bungarotoxin/[U-15N]-alpha 7 19mer complex 30 mM sodium phosphate, pH 5.5 50 micromolar sodium azide 50 micromolar TMSP \| 99.9% D2O	分辨率未提供
1KFH Solution Structure of alpha-Bungarotoxin by NMR Spectroscopy 提交 2001-11-20	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.79；298 K；离子强度（mmCIF原始值）no buffers, pH adjusted w/HCl and NaOH；压力 ambient NMR测量条件 pH 5.79；308 K；离子强度（mmCIF原始值）no buffers, pH adjusted w/DCl and NaOD；压力 ambient NMR样品组成 4mM alpha-Bungarotoxin pH 5.79 at 288, 298, and 308 degrees K \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 4mM alpha-Bungarotoxin pH 5.79 \| 99.9% D2O	分辨率未提供
1KL8 NMR STRUCTURAL ANALYSIS OF THE COMPLEX FORMED BETWEEN ALPHA-BUNGAROTOXIN AND THE PRINCIPAL ALPHA-NEUROTOXIN BINDING SEQUENCE ON THE ALPHA7 SUBUNIT OF A NEURONAL NICOTINIC ACETYLCHOLINE RECEPTOR 提交 2001-12-11	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.5；308 K；压力 AMBIENT NMR样品组成 1.6 MM ALPHA-BUNGAROTOXIN 15N]-ALPHA 7 19MER COMPLEX MM SODIUM PHOSPHATE, PH 5. MICROMOLAR SODIUM AZIDE 50 MICROMOLAR TMSP \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
1L4W NMR structure of an AChR-peptide (Torpedo Californica, alpha-subunit residues 182-202) in complex with alpha-Bungarotoxin 提交 2002-03-06	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM Ac；压力 ambient NMR样品组成 1.8 mM alpha-Bungarotoxin/AChR-peptide, buffer,pH 4 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.8 mM alpha-Bungarotoxin/AChR-peptide, buffer,pH 4 \| 100% D2O	分辨率未提供
1LJZ NMR structure of an AChR-peptide (Torpedo Californica, alpha-subunit residues 182-202) in complex with alpha-Bungarotoxin 提交 2002-04-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NH4Ac；压力 ambient NMR测量条件 pH 4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50 mM NH4Ac；压力 ambient NMR样品组成 acetylcholine receptor peptide/alpha-bungarotoxin \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 acetylcholine receptor peptide/alpha-bungarotoxin \| 100% D2O	分辨率未提供
1RGJ NMR STRUCTURE OF THE COMPLEX BETWEEN ALPHA-BUNGAROTOXIN AND MIMOTOPE OF THE NICOTINIC ACETYLCHOLINE RECEPTOR WITH ENHANCED ACTIVITY 提交 2003-11-12	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.6；303 K；压力 AMBIENT NMR样品组成 2MM ALPHA-BUNGAROTOXIN, 2MM PEPTIDE \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2ABX THE CRYSTAL STRUCTURE OF ALPHA-BUNGAROTOXIN AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION. RELATION TO SOLUTION STRUCTURE AND BINDING TO ACETYLCHOLINE RECEPTOR 提交 1986-02-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–74（74 aa）链 B 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.50 Å
2BTX SOLUTION NMR STRUCTURE OF THE COMPLEX OF ALPHA-BUNGAROTOXIN WITH A LIBRARY DERIVED PEPTIDE, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1998-08-23	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.8；303 K	分辨率未提供
6UWZ Cryo-EM structure of Torpedo acetylcholine receptor in complex with alpha-bungarotoxin 提交 2019-11-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 F 22–95（74 aa）链 G 22–95（74 aa）	未记录	POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 5 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 OCT N-OCTANE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.69 Å
9FYS D11 mAbs bound to alpha-Bungarotoxin 提交 2024-07-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 X 1–95（95 aa）链 Z 1–95（95 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；0.1 M MES: NaOH, 12 % PEG 20000, pH 6.5	分辨率 1.32 Å R-free 0.192
9GU0 Human adult muscle nAChR in resting state in detergent with alpha-bungarotoxin 提交 2024-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric	链 I 22–95（74 aa）链 J 22–95（74 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl, 0.013% DDM, 0.0013% CHS cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；blot time 2s, blot force -10	分辨率 2.96 Å
9GU1 Human adult muscle nAChR in resting state in nanodisc with alpha-bungarotoxin 提交 2024-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：11-meric	链 I 22–95（74 aa）链 J 22–95（74 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CU COPPER (II) ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 150 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；2.5 uL of sample was frozen; blot time 4.5 s, blot force -10	分辨率 2.48 Å
9HUB D11 mAbs bound to alpha-Bungarotoxin at pH 7.5 提交 2024-12-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 X 1–95（95 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 70% (v/v) MPD)	分辨率 1.33 Å R-free 0.195
9HUB D11 mAbs bound to alpha-Bungarotoxin at pH 7.5 提交 2024-12-21	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 Z 1–95（95 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 70% (v/v) MPD)	分辨率 1.33 Å R-free 0.195

共 24 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	3L21A_BUNMU
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–74； UniProt 22–95

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8da1
沉积日期 deposition_date	2022-06-12
结构标题 title	Crystal structure of Krait alpha-neurotoxin in complex with Centi-LNX-D09 antibody
关键词 keywords	antivenom, 3-finger toxin, alpha-neurotoxin, long neurotoxin 1, antibody, ANTITOXIN, IMMUNE SYSTEM, ANTITOXIN-TOXIN complex; IMMUNE SYSTEM, ANTITOXIN/TOXIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	28.25 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	27.50 Å
零角强度 I(0) i0	52561200.00
分子量 molecular_weight	55198.0 kDa
排除体积 excluded_volume	68462 Å³
包络体积 envelope_volume	89659 Å³
水化壳体积 shell_volume	28135 Å³
包络直径 envelope_diameter	100.4 Å
壳层 Rg shell_rg	33.87 Å
包络 Rg envelope_rg	27.25 Å
形状 Rg shape_rg	27.43 Å
总 Rg total_rg	28.39 Å
总原子数 total_atoms	3879
残基数 n_residues	501
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	96.2 Å
Rg (实空间) rg_real	28.36 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.83 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.2560e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	8.3590e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	28.33 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	52560000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7066
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	30.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.408
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.296
角度范围 angular_range	— – 0.2800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	6241000.0000
实空间数据点数 n_real_points	57
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.864; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.242; Positv: 1.000; Valcen: 0.909; Smooth: 0.954

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Centi-LNX-D09 Fab light chain
分子量 formula_weight	23339.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3882

EIVLTQSPSSLSASVGDRVTITCQASQDISNYLNWYQQKPGKAPKLLIYAASSLESGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSQQPEDFATYYCQQANSFPYTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Centi-LNX-D09 Fab heavy chain
分子量 formula_weight	25133.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

EVQLVESGGGFVQPGGSLRLSCAASGFTFSNFDMHWVRQSPGKGLEWVSGLDHSGGAHYAGSVKGRFTISREDAKNSLDLQMNNLRVDDTAVYFCVRGTLYHYTSGSYYSDAFDIWGQGTLVTVSSASVKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTGLE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Alpha-bungarotoxin
分子量 formula_weight	8005.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

IVCHTTATSPISAVTCPPGENLCYRKMWCDAFCSSRGKVVELGCAATCPSKKPYEEVTCCSTDKCNPHPKQRPG

来源 Source

来源生物 organism	Bungarus multicinctus
通用名 common_name	many-banded krait
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8616
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	3

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	8da1A01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8da1A02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8da1B01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	148.326 Å
晶胞边长 b length_b	63.862 Å
晶胞边长 c length_c	77.437 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	101.57 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.670 Å
最低分辨率 resolution_low	29.510 Å
R 因子 r_factor	0.1987
R_work r_work	0.1957
R_free r_free	0.2528

fit	/app/data/saxs_computation/da/8da1/8da1.fit
pddf	/app/data/pr_computation/da/8da1/8da1.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/da/8da1/8da1.dat

Crystal structure of Krait alpha-neurotoxin in complex with Centi-LNX-D09 antibody

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Alpha-bungarotoxin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)