SAXSdb — 8dtu

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

B-cell lymphoma/leukemia 11A

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 799–826	未记录	Nanobody 5344N74D × 1 Nanobody 5344N74D × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；0.1 M HEPES, pH 7.5-8.2, 2.2M Li2SO4.	分辨率 2.45 Å R-free 0.288

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8DTU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5VTB Crystal structure of RBBP4 bound to BCL11a peptide 提交 2017-05-16	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 2–16（15 aa）片段：UNP residues 2-16	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG2000 MME, 0.1 M potassium thiocyanate	分辨率 2.40 Å R-free 0.244
6KI6 Crystal structure of BCL11A in complex with gamma-globin -115 HPFH region 提交 2019-07-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 731–835（105 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M calcium acetate hydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate (pH6.5), 18% w/v polyethylene glycol 8,000	分辨率 2.50 Å R-free 0.251
6KI6 Crystal structure of BCL11A in complex with gamma-globin -115 HPFH region 提交 2019-07-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 B 731–835（105 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M calcium acetate hydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate (pH6.5), 18% w/v polyethylene glycol 8,000	分辨率 2.50 Å R-free 0.251
6U9Q Crystal Structure Analysis of DNA-BCL11A Znf domain complex 提交 2019-09-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 730–835（106 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；NaMalate~8.0	分辨率 1.83 Å R-free 0.195
8DTN The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6 提交 2022-07-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 B 797–826（30 aa）链 D 797–826（30 aa）链 F 797–826（30 aa）链 H 797–826（30 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350	分辨率 2.20 Å R-free 0.232
8DTN The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6 提交 2022-07-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 797–826（30 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350	分辨率 2.20 Å R-free 0.232
8DTN The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6 提交 2022-07-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 797–826（30 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350	分辨率 2.20 Å R-free 0.232
8DTN The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6 提交 2022-07-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 797–826（30 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350	分辨率 2.20 Å R-free 0.232
8DTN The complex of nanobody 6101 with BCL11A ZF6 提交 2022-07-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 797–826（30 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；0.1 M Bis-Tris propane, pH 6.0-7.0, 0.2 M NaKPO4 and 18%-20% PEG 3350	分辨率 2.20 Å R-free 0.232
8THO Solution structure of the zinc finger repeat domain of BCL11A (ZnF456) 提交 2023-07-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 737–835（99 aa）片段：residues 737-835	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）163；压力 1 NMR样品组成 137 mM sodium chloride, 2.7 mM potassium chloride, 10 mM sodium phosphate, 1.8 mM potassium phosphate, 1 mM dithiothreitol, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
8TLO Crystal Structure Analysis of BCL11A in complex with DNA 提交 2023-07-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 730–835（106 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；30% PEG6K and 0.1M Na Citrate pH 5.0	分辨率 2.76 Å R-free 0.269
9B4P Tetramer Formation of the BCL11A ZF0 Domain 提交 2024-03-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 45–71（27 aa）片段：ZF0 domain 链 C 45–71（27 aa）片段：ZF0 domain	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.3；291.15 K；0.2M potassium nitrate, 0.1M Tris-HCl pH 7.3, 20% PEG3350	分辨率 2.56 Å R-free 0.294
9B4P Tetramer Formation of the BCL11A ZF0 Domain 提交 2024-03-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 45–71（27 aa）片段：ZF0 domain 链 D 45–71（27 aa）片段：ZF0 domain 链 E 45–71（27 aa）片段：ZF0 domain 链 F 45–71（27 aa）片段：ZF0 domain	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.3；291.15 K；0.2M potassium nitrate, 0.1M Tris-HCl pH 7.3, 20% PEG3350	分辨率 2.56 Å R-free 0.294
9B4P Tetramer Formation of the BCL11A ZF0 Domain 提交 2024-03-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 45–71（27 aa）片段：ZF0 domain 链 H 45–71（27 aa）片段：ZF0 domain 链 I 45–71（27 aa）片段：ZF0 domain 链 J 45–71（27 aa）片段：ZF0 domain	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 7.3；291.15 K；0.2M potassium nitrate, 0.1M Tris-HCl pH 7.3, 20% PEG3350	分辨率 2.56 Å R-free 0.294
9BV0 NMR structure of the Z0 CCHC zinc-finger of transcription repressor Bcl11A 提交 2024-05-18	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 46–72（27 aa）片段：B0 atypical C2HC zinc-finger domain, residues 46-72	未记录	ZN ZINC ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.6；压力 1 NMR测量条件 pH 5.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.6；压力 1 NMR样品组成 40 uM Bcl11A-Z0, 600 uM Zn2+, 90% H2O/10% D20 \| 90% H2O/10% D20 NMR样品组成 40 uM Bcl11A-Z0, 600 uM Zn2+, 100% D20 \| 100% D2O	分辨率未提供
9E6R BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGACCA 提交 2024-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 730–835（106 aa）片段：Zinc finger domains 4-6	未记录	ZN ZINC ION × 4 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；292 K；24 % v/v Ethanol, 0.1 M HEPES 7.8, 40 mM Magnesium chloride hexahydrate	分辨率 2.09 Å R-free 0.238
9E6R BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGACCA 提交 2024-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 730–835（106 aa）片段：Zinc finger domains 4-6	未记录	ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；292 K；24 % v/v Ethanol, 0.1 M HEPES 7.8, 40 mM Magnesium chloride hexahydrate	分辨率 2.09 Å R-free 0.238
9E6R BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGACCA 提交 2024-10-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 Y 730–835（106 aa）片段：Zinc finger domains 4-6	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；292 K；24 % v/v Ethanol, 0.1 M HEPES 7.8, 40 mM Magnesium chloride hexahydrate	分辨率 2.09 Å R-free 0.238
9E6S BCL11A ZF4-6 with K784T Mutation in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGACCA 提交 2024-10-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 730–835（106 aa）片段：Zinc finger domains 4-6 链 D 730–835（106 aa）片段：Zinc finger domains 4-6	突变：K784T 突变：K784T	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；292 K；18 % w/v PEG 3350, 17 % v/v PEG 400, 4.8 % v/v 2-Propanol, 0.1 M CAPSO 9.0	分辨率 2.20 Å R-free 0.275
9E6T BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGCCCA 提交 2024-10-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 A 730–835（106 aa）片段：Zinc finger domains 4-6 链 B 730–835（106 aa）片段：Zinc finger domains 4-6	未记录	ZN ZINC ION × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；15 % w/v PEG 1000, 30 % v/v PEG 300, 0.1 M Bis-Tris Propane 7.0	分辨率 2.78 Å R-free 0.281
9YLL BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGTCCA (20-mer) 提交 2025-10-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 730–835（106 aa）片段：Zinc finger domains 4-6	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；292 K；20% w/v Polyethylene glycol 3,350 0.2M sodium chloride	分辨率 2.38 Å R-free 0.247
9YLM BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGTCCA (12-mer) 提交 2025-10-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 730–835（106 aa）片段：Zinc finger domains 4-6	未记录	ZN ZINC ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；292 K；28 % w/v PEG 4000, 0.1 M Sodium citrate (pH 5.2), 0.2 M Ammonium acetate	分辨率 1.91 Å R-free 0.244
9YLN BCL11A ZF4-6 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGGCCA (12-mer) 提交 2025-10-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 730–835（106 aa）片段：Zinc finger domains 4-6	未记录	ZN ZINC ION × 3 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；292 K；28 % w/v PEG 4000, 0.1 M Sodium citrate (pH 5.2), 0.2 M Ammonium acetate	分辨率 2.15 Å R-free 0.247
9YLO BCL11A ZF2-3 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGTCCA (P21212 crystal form) 提交 2025-10-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 373–433（61 aa）片段：C2H2 zinc finger domains 2 and 3	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；292 K；10% w/v PEG 20 000, 20% v/v PEG MME 500, 60mM sodium fluoride, 60mM sodium bromide, 60mM sodium iodide, 0.1M Bicine- TRIS-base (pH 8.5)	分辨率 1.97 Å R-free 0.241
9YLP BCL11A ZF2-3 in Complex with a DNA Sequence Observed in the Human Globin Locus Containing Motif TGTCCA (C2221 Crystal Form) 提交 2025-10-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 373–433（61 aa）片段：C2H2 zinc finger domains 2 and 3	未记录	ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；278 K；28 % w/v PEG 4000, 0.1 M Sodium citrate (pH 6.5), 0.1 M Magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M Ammonium sulfate	分辨率 2.04 Å R-free 0.245

共 16 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BC11A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–28； UniProt 799–826

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8dtu
沉积日期 deposition_date	2022-07-26
结构标题 title	The complex of nanobody 5344N74D with BCL11A ZF6.
关键词 keywords	Nanobody, BCL11A, Transcription factor, Zinc finger domain, protein degradation, gamma globin, sickle cells, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	15.72 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	14.67 Å
零角强度 I(0) i0	5620420.00
分子量 molecular_weight	16350.0 kDa
排除体积 excluded_volume	20098 Å³
包络体积 envelope_volume	23108 Å³
水化壳体积 shell_volume	13291 Å³
包络直径 envelope_diameter	51.1 Å
壳层 Rg shell_rg	20.60 Å
包络 Rg envelope_rg	15.18 Å
形状 Rg shape_rg	14.67 Å
总 Rg total_rg	15.77 Å
总原子数 total_atoms	1137
残基数 n_residues	145
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	51.5 Å
Rg (实空间) rg_real	15.64 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.32 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.6200e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.8500e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	15.65 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	5620000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8055
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	20.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.210
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.304
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1621000.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.823; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Nanobody 5344N74D
分子量 formula_weight	714.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B
原子数 atom_count	1154

QVQLVK

来源 Source

来源生物 organism	Lama glama
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9844
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Nanobody 5344N74D
分子量 formula_weight	12152.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

SGGGLVQAGDSLRLSCAASGSTFSGYAMGWYRQAPGKERELVAAITSSGASTYYADSVRGRFTISRDDAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAALDEGYLDYDSWGQGTQVTVSS

来源 Source

来源生物 organism	Lama glama
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9844
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	B-cell lymphoma/leukemia 11A
分子量 formula_weight	3483.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

VYKCEICKMPFSVYSTLEKHMKKWHSDR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	17

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	8dtuA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	57.507 Å
晶胞边长 b length_b	57.507 Å
晶胞边长 c length_c	157.328 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 43 21 2
空间群编号 int_tables_number	96
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.447 Å
最低分辨率 resolution_low	40.660 Å
R 因子 r_factor	0.2639
R_work r_work	0.2613
R_free r_free	0.2876

fit	/app/data/saxs_computation/dt/8dtu/8dtu.fit
pddf	/app/data/pr_computation/dt/8dtu/8dtu.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/dt/8dtu/8dtu.dat

The complex of nanobody 5344N74D with BCL11A ZF6.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

B-cell lymphoma/leukemia 11A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)