8i5c

Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK)

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MHC class I antigen (Fragment)

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
10	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
9	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Beta-2-microglobulin × 1 （P61769） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	U5YJJ6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–274； UniProt 25–298 作者链 F； PDB构建体 1–274； UniProt 25–298 作者链 K； PDB构建体 1–274； UniProt 25–298 作者链 P； PDB构建体 1–274； UniProt 25–298 作者链 U； PDB构建体 1–274； UniProt 25–298 作者链 Z； PDB构建体 1–274； UniProt 25–298 作者链 e； PDB构建体 1–274； UniProt 25–298 作者链 j； PDB构建体 1–274； UniProt 25–298 作者链 o； PDB构建体 1–274； UniProt 25–298 作者链 t； PDB构建体 1–274； UniProt 25–298

Beta-2-microglobulin

Homo sapiens

UniProt P61769

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	MHC class I antigen (Fragment) × 1 （U5YJJ6） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
10	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	MHC class I antigen (Fragment) × 1 （U5YJJ6） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	MHC class I antigen (Fragment) × 1 （U5YJJ6） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	MHC class I antigen (Fragment) × 1 （U5YJJ6） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	MHC class I antigen (Fragment) × 1 （U5YJJ6） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
5	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	MHC class I antigen (Fragment) × 1 （U5YJJ6） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
6	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	MHC class I antigen (Fragment) × 1 （U5YJJ6） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
7	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	MHC class I antigen (Fragment) × 1 （U5YJJ6） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
8	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	MHC class I antigen (Fragment) × 1 （U5YJJ6） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致
9	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	MHC class I antigen (Fragment) × 1 （U5YJJ6） peptide KRAS-G12V-9 × 1 TCR alpha chain × 1 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	B2MG_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–99； UniProt 21–119 作者链 G； PDB构建体 1–99； UniProt 21–119 作者链 L； PDB构建体 1–99； UniProt 21–119 作者链 Q； PDB构建体 1–99； UniProt 21–119 作者链 V； PDB构建体 1–99； UniProt 21–119 作者链 a； PDB构建体 1–99； UniProt 21–119 作者链 f； PDB构建体 1–99； UniProt 21–119 作者链 k； PDB构建体 1–99； UniProt 21–119 作者链 p； PDB构建体 1–99； UniProt 21–119 作者链 u； PDB构建体 1–99； UniProt 21–119

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8i5c
沉积日期 deposition_date	2023-01-24
结构标题 title	Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK)
关键词 keywords	KRAS, TCR, IMMUNE SYSTEM; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8i5c__assembly_5__model_1

Assembly 5 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8i5c__assembly_5__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8i5c__assembly_5__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	37.07 Å
Rg（电子密度）	37.47 Å
总 Rg	37.61 Å
原子数	6574
残基数	820
排除体积	114890 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8i5c__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`8i5c__assembly_2__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`8i5c__assembly_3__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`8i5c__assembly_4__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`8i5c__assembly_5__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`8i5c__assembly_6__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`8i5c__assembly_7__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
8	1	`8i5c__assembly_8__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
9	1	`8i5c__assembly_9__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
10	1	`8i5c__assembly_10__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MHC class I antigen (Fragment)
分子量 formula_weight	31753.0 kDa
突变 mutation	A245V,E253Q
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,F,K,P,U,Z,e,j,o,t
原子数 atom_count	65732

GSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRFDSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDQETRNVKAQSQTDRVDLGTLRGYYNQSEDGSHTIQIMYGCDVGPDGRFLRGYRQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITKRKWEAAHAAEQQRAYLEGRCVEWLRRYLENGKETLQRTDPPKTHMTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWVAVVVPSGQEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRW

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Beta-2-microglobulin
分子量 formula_weight	11748.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,G,L,Q,V,a,f,k,p,u

IQRTPKIQVYSRHPAENGKSNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLKNGERIEKVEHSDLSFSKDWSFYLLYYTEFTPTEKDEYACRVNHVTLSQPKIVKWDRDM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	peptide KRAS-G12V-9
分子量 formula_weight	786.0 kDa
突变 mutation	G12V
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,H,M,R,W,b,g,l,q,v

VVGAVGVGK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	TCR alpha chain
分子量 formula_weight	22412.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,I,N,S,X,c,h,m,r,w

QQKVQQSPESLIVPEGGMASLNCTSSDRNVDYFWWYRQHSGKSPKMLMSIFSNGEKEEGRFTVHLNKASLHTSLHIRDSQPSDSALYLCAARDSNYQLIWGSGTKLIIKPDIQNPDPAVYQLRDSKSSDKSVCLFTDFDSQTNVSQSKDSDVYITDKCVLDMRSMDFKSNSAVAWSNKSDFACANAFNNSIIPEDTFFP

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	TCR beta chain
分子量 formula_weight	27028.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,J,O,T,Y,d,i,n,s,x

EAAVTQSPRNKVAVTGGKVTLSCNQTNNHNNMYWYRQDTGHGLRLIHYSYGAGSTEKGDIPDGYKASRPSQENFSLILELATPSQTSVYFCASGDTGGYEQYFGPGTRLTVLEDLKNVFPPEVAVFEPSEAEISHTQKATLVCLATGFYPDHVELSWWVNGKEVHSGVCTDPQPLKEQPALNDSRYALSSRLRVSATFWQDPRNHFRCQVQFYGLSENDEWTQDRAKPVTQIVSAEAWGRAD

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 40 domains

CATH v4.4 (40 domains)

结构域编号 domain_id	8i5cA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	8i5cA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cD01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	8i5cF02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cG01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cI01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cK01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	8i5cK02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cL01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cN01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cP01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	8i5cP02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cQ01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cS01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cU01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	8i5cU02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cV01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cX01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cZ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	8i5cZ02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5ca01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cc01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5ce01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	8i5ce02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cf01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5ch01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cj01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	8i5cj02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5ck01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cm01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5co01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	8i5co02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cp01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cr01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5ct01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	8i5ct02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cu01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i5cw01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

▶

晶胞边长 a length_a	156.864 Å
晶胞边长 b length_b	156.889 Å
晶胞边长 c length_c	191.966 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	77.37 °
晶胞夹角 β angle_beta	78.13 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	82.27 °
晶胞分子数 Z z_pdb	10

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.340 Å
最低分辨率 resolution_low	49.820 Å
R 因子 r_factor	0.2260
R_work r_work	0.2243
R_free r_free	0.2575

Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MHC class I antigen (Fragment)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Beta-2-microglobulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8i5c__assembly_5__model_1

8i5c__assembly_5__model_1 | I(q)

8i5c__assembly_5__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 40 domains

CATH v4.4 (40 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of a TCR in complex with HLA-A*11:01 bound to KRAS peptide (VVGAVGVGK)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MHC class I antigen (Fragment)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Beta-2-microglobulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8i5c__assembly_5__model_1

8i5c__assembly_5__model_1 | I(q)

8i5c__assembly_5__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 40 domains

CATH v4.4 (40 domains)

7. 引用文献 (1)