SAXSdb — 8izm

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phosphoprotein

Mumps virus strain Jeryl Lynn

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	RNA-directed RNA polymerase L × 1 （Q9J4L0） ZINC ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9J4L6_MUMPJ
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 C； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 D； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391 作者链 E； PDB构建体 1–391； UniProt 1–391

RNA-directed RNA polymerase L

Mumps virus strain Jeryl Lynn

UniProt Q9J4L0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 5	Phosphoprotein × 4 （Q9J4L6） ZINC ION × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9J4L0_MUMPJ
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–2261； UniProt 1–2261

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8izm
沉积日期 deposition_date	2023-04-07
最后修订 last_revision	2024-04-17
结构标题 title	Structure of the Mumps Virus L Protein (state2) Bound by Phosphoprotein Tetramer
关键词 keywords	Mumps virus polymerase complex, RNA-dependent RNA synthesis, Large protein, phosphoprotein., VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8izm__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8izm__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8izm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	41.75 Å
Rg（电子密度）	41.70 Å
总 Rg	42.17 Å
原子数	12742
残基数	1608
排除体积	229070 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8izm__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Phosphoprotein
分子量 formula_weight	41651.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,C,D,E
原子数 atom_count	12742

MDQFIKQDETGDLIETGMNVANHFLSTPIQGTNSLSKASILPGVAPVLIGNPEQKNIQHPTASHQGSKTKGRGSGVRSIIVSPSEAGNGGTQIPEPLFAQTGQGGIVTTVYQDPTIQPTGSYRSVELAKIGKERMINRFVEKPRTSTPVTEFKRGGPGAAAQGQTIQEEGIDGNGASAGSKERSGSLSGATLYAHLSLPQQDSTPANVGIAPQSAISANEIMDLLRGMDARLQHLEQKVDKVLAQGSMVTQIKNELSTVKTTLATIEGMMATVKIMDPGNPTGVPVDELRRSFSDHVTIVSGPGDVSFSSSEKPTLYLDELARPVSKPRPAKQTKSQPVKDLAGQKVMITKMITDCVANPQMKQAFEQRLAKASTEDALNDIKRDIIRSAI

来源 Source

来源生物 organism	Mumps virus strain Jeryl Lynn
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11168
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	RNA-directed RNA polymerase L
分子量 formula_weight	256833.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.48,3.6.1.-,2.7.7.88,2.1.1.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A

MAGLNEILLPEVHLNSPIVRYKLFYYILHGQLPNDLEPDDLGPLANQNWKAIRAEESQVHARLKQIRVELIARIPSLRWTRSQREIAILIWPRILPILQAYDLRQSMQLPTVWEKLTQSTVNLISDGLERVVLHISNQLTGKPNLFTRSRAGQDTKDYSIPSTRELSQIWFNNEWSGSVKTWLMIKYRMRQLITNQKTGELTDLVTIVDTRSTLCIITPELVALYSSEHKALTYLTFEMVLMVTDMLEGRLNVSSLCTASHYLSPLKKRIEVLLTLVDDLALLMGDKVYGIVSSLESFVYAQLQYGDPVIDIKGTFYGFICNEILDLLTEDNIFTEEEANKVLLDLTSQFDNLSPDLTAELLCIMRLWGHPTLTASQAASKVRESMCAPKVLDFQTIMKTLAFFHAILINGYRRSHNGIWPPTTLHGNAPKSLIEMRHDNSELKYEYVLKNWKSISMLRIHKCFDASPDEDLSIFMKDKAISCPRQDWMGVFRRSLIKQRYRDANRPLPQPFNRRLLLNFLEDDRFDPIKELEYVTSGEYLRDPEFCASYSLKEKEIKATGRIFAKMTKRMRSCQVIAESLLANHAGKLMRENGVVLDQLKLTKSLLTMNQIGIISEHSRRSTADNMTLAHSGSNKHRINNSQFKKNKDNKHEMPDDGFEIAACFLTTDLTKYCLNWRYQVIIPFARTLNSMYGIPHLFEWIHLRLMRSTLYVGDPFNPPSDPTQLDLDTALNDDIFIVSPRGGIEGLCQKLWTMISISTIILSATEANTRVMSMVQGDNQAIAITTRVVRSLSHSEKKEQAYKASKLFFERLRANNHGIGHHLKEQETILSSDFFIYSKRVFYKGRILTQALKNVSKMCLTADILGDCSQASCSNLATTVMRLTENGVEKDLCYFLNAFMTIRQLCYDLVFPQTKSLSQDITNAYLNHPILISRLCLLPSQLGGLNFLSCSRLFNRNIGDPLVSAIADVKRLIKAGCLDIWVLYNILGRRPGKGKWSTLAADPYTLNIDYLVPSTTFLKKHAQYTLMERSVNPMLRGVFSENAAEEEEELAQYLLDREVVMPRVAHVILAQSSCGRRKQIQGYLDSTRTIIRYSLEVRPLSAKKLNTVIEYNLLYLSYNLEIIEKPNIVQPFLNAINVDTCSIDIARSLRKLSWATLLNGRPIEGLETPDPIELVHGCLIIGSDECEHCSSGDDKFTWFFLPKGIRLDDDPASNPPIRVPYIGSKTDERRVASMAYIKGASVSLKSALRLAGVYIWAFGDTEESWQDAYELASTRVNLTLEQLQSLTPLPTSANLVHRLDDGTTQLKFTPASSYAFSSFVHISNDCQILEIDDQVTDSNLIYQQVMITGLALIETWNNPPINFSVYETTLHLHTGSSCCIRPVESCVVNPPLLPVPLINVPQMNKFVYDPEPLSLLEMEKIEDIAYQTRIGGLDQIPLLEKIPLLAHLTAKQMVNSITGLDEATSIMNDAVVQADYTSNWISECCYTYIDSVFVYSGWALLLELSYQMYYLRIQGIQGILDYVYMTLRRIPGMAITGISSTISHPRILRRCINLDVIAPINSPHIASLDYTKLSIDAVMWGTKQVLTNISQGIDYEIVVPSESQLTLSDRVLNLVARKLSLLAIIWANYNYPPKVKGMSPEDKCQALTTHLLQTVEYVEYIQIEKTNIRRMIIEPKLTAYPSNLFYLSRKLLNAIRDSEEGQFLIASYYNSFGYLEPILMESKIFNLSSSESASLTEFDFILNLELSDASLEKYSLPSLLMTAENMDNPFPQPPLHHVLRPLGLSSTSWYKTISVLNYISHMKISDGAHLYLAEGSGASMSLIETFLPGETIWYNSLFNSGENPPQRNFAPLPTQFIESVPYRLIQAGIAAGNGIVQSFYPLWNGNSDITDLSTKTSVEYIIHKVGADTCALVHVDLEGVPGSMNSMLERAQVHALLITVTVLKPGGLLILKASWEPFNRFSFLLTVLWQFFSTIRILRSSYSDPNNHEVYIIATLAVDPTTSSFTTALNRARTLNEQGFSLIPPELVSEYWRKRVEQGQIIQDCIDKVISECVRDQYLADNNIILQAGGTPSTRKWLDLPDYSSFNELQSEMARLITIHLKEVIEILKGQASDHDTLLFTSYNVGPLGKINTILRLIVERILMYTVRNWCILPTQTRLTLRQSIELGEFRLRDVITPMEILKLSPNRKYLKSALNQSTFNHLMGETSDILLNRAYQKRIWKAIGCVIYCFGLLTPDVEGSERIDVDNDIPDYDIHGDII

来源 Source

来源生物 organism	Mumps virus strain Jeryl Lynn
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11168
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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分辨率 resolution	3.01 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	477568

Structure of the Mumps Virus L Protein (state2) Bound by Phosphoprotein Tetramer

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phosphoprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

RNA-directed RNA polymerase L

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8izm__assembly_1__model_1

8izm__assembly_1__model_1 | I(q)

8izm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Structure of the Mumps Virus L Protein (state2) Bound by Phosphoprotein Tetramer

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phosphoprotein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA-directed RNA polymerase L

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8izm__assembly_1__model_1

8izm__assembly_1__model_1 | I(q)

8izm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)